Datasets:

kngrg

/

rus-trec-covid

like 0

ug7v899j

Клинические особенности инфекций Mycoplasma pneumoniae, подтвержденных культуральным исследованием, в университетской больнице короля Абдулазиза, Джидда, Саудовская Аравия

ЦЕЛЬ: В этом ретроспективном обзоре историй болезни описываются эпидемиология и клинические особенности 40 пациентов с подтвержденными культуральным исследованием инфекциями Mycoplasma pneumoniae в университетской больнице короля Абдулазиза в Джидде, Саудовская Аравия. МЕТОДЫ: Пациенты с положительным результатом теста на M. Культуры pneumoniae из респираторных образцов с января 1997 года по декабрь 1998 года были идентифицированы с помощью микробиологических записей. Были просмотрены карты пациентов. РЕЗУЛЬТАТЫ: Выявлено 40 пациентов, 33 (82,5%) из которых потребовалась госпитализация. Большинство случаев заражения (92,5%) были внебольничными. Инфекция поразила все возрастные группы, но чаще всего встречалась среди младенцев (32,5%) и детей дошкольного возраста (22,5%). Заболевание наблюдалось круглый год, но чаще всего встречалось осенью (35%) и весной (30%). Более трех четвертей пациентов (77,5%) имели сопутствующие заболевания. Двадцать четыре изолята (60%) были связаны с пневмонией, 14 (35%) — с инфекциями верхних дыхательных путей и 2 (5%) — с бронхиолитом. Наиболее распространенными симптомами были кашель (82,5%), лихорадка (75%) и недомогание (58,8%), а наиболее распространенными признаками были крепитация (60%) и хрипы (40%). У большинства больных пневмонией отмечалась крепитация (79,2%), но только у 25% наблюдалось бронхиальное дыхание. У пациентов с иммунодефицитом пневмония развивалась чаще, чем у пациентов без иммунодефицита (8/9 против 16/31, P = 0,05). Из 24 пациентов с пневмонией у 14 (58,3%) наблюдалось бессимптомное выздоровление, у 4 (16,7%) наступило выздоровление после некоторых осложнений, 3 (12,5%) умерли из-за инфекции M. pneumoniae и 3 (12,5%) умерли из-за сопутствующих заболеваний. У 3 пациентов, умерших от пневмонии, вызванной M. pneumoniae, имелись другие сопутствующие заболевания. ВЫВОД: наши результаты были аналогичны опубликованным данным, за исключением того, что инфекции чаще встречались у младенцев и детей дошкольного возраста, а уровень смертности от пневмонии у пациентов с сопутствующими заболеваниями был высоким.

цель это ретроспективный обзор история болезнь описываться эпидемиология клинический особенность 40 пациент подтвердить культуральный исследование инфекция mycoplasma pneumoniae университетский больница король абдулазиз джидда саудовский аравия метод пациент положительный результат тест m культура pneumoniae респираторный образец январь 1997 год декабрь 1998 год идентифицировать помощь микробиологический запись просмотреть карта пациент результат выявить 40 пациент 33 82 5 потребоваться госпитализация большинство случай заражение 92 5 внебольничный инфекция поразить всё возрастной группа частый весь встречаться среди младенец 32 5 ребёнок дошкольный возраст 22 5 заболевание наблюдаться круглый год частый весь встречаться осень 35 весна 30 четверть пациент 77 5 иметь сопутствовать заболевание двадцать четыре изолят 60 связать пневмония 14 35 инфекция верхний дыхательный путь 2 5 бронхиолит наиболее распространить симптом кашель 82 5 лихорадка 75 недомогание 58 8 наиболее распространить признак крепитация 60 хрип 40 большинство больной пневмония отмечаться крепитация 79 2 25 наблюдаться бронхиальный дыхание пациент иммунодефицит пневмония развиваться частый пациент иммунодефицит 8 9 против 16 31 p 0 05 24 пациент пневмония 14 58 3 наблюдаться бессимптомный выздоровление 4 16 7 наступить выздоровление некоторый осложнение 3 12 5 умереть инфекция m pneumoniae 3 12 5 умереть сопутствовать заболевание 3 пациент умерший пневмония вызвать m pneumoniae иметься сопутствовать заболевание вывод наш результат аналогичный опубликовать данные исключение инфекция частый встречаться младенец ребёнок дошкольный возраст уровень смертность пневмония пациент сопутствовать заболевание высокий

клинический особенность инфекция mycoplasma pneumoniae подтвердить культуральный исследование университетский больница король абдулазиз джидда саудовский аравия

02tnwd4m

Оксид азота: провоспалительный медиатор при заболеваниях легких?

Воспалительные заболевания дыхательных путей обычно связаны с повышенной продукцией оксида азота (NO•) и повышением показателей NO•-зависимого окислительного стресса. Хотя известно, что NO• обладает антимикробными, противовоспалительными и антиоксидантными свойствами, различные данные подтверждают вклад NO• в повреждение легких в нескольких моделях заболеваний. На основании биохимических данных часто предполагается, что такие NO•-зависимые окисления обусловлены образованием окислителя пероксинитрита, хотя в условиях воспаления могут действовать альтернативные механизмы, включающие гемовые белки фагоцитарного происхождения — миелопероксидазу и эозинофильную пероксидазу. Ввиду обилия литературы по образованию и активности NO• в дыхательных путях, всесторонний обзор этой области выходит за рамки данного комментария. Вместо этого основное внимание уделяется последним данным и концепциям предполагаемого вклада NO• в воспалительные заболевания легких.

воспалительный заболевание дыхательный путь обычно связать повышенный продукция оксид азот no повышение показатель no зависимый окислительный стресс хотя известно no обладать антимикробный противовоспалительный антиоксидантный свойство различный дать подтверждать вклад no повреждение лёгкий несколько модель заболевание основание биохимический данные часто предполагаться no зависимый окисление обусловить образование окислитель пероксинитрит хотя условие воспаление мочь действовать альтернативный механизм включать гемовыя белка фагоцитарный происхождение миелопероксидаза эозинофильный пероксидаза ввиду обилие литература образование активность no дыхательный путь всесторонний обзор область выходить рамка данный комментарий вместо это основный внимание уделяться последний данные концепция предполагать вклад no воспалительный заболевание лёгкий

оксид азот провоспалительный медиатор заболевание лёгкий

ejv2xln0

Сурфактантный белок D и защита легких хозяина

Сурфактантный белок D (SP-D) участвует во врожденном ответе на вдыхаемые микроорганизмы и органические антигены, а также способствует регуляции иммунитета и воспаления в легких. SP-D синтезируется и секретируется альвеолярными и бронхиолярными эпителиальными клетками, но также экспрессируется эпителиальными клетками, выстилающими различные экзокринные протоки и слизистую оболочку желудочно-кишечного и мочеполового трактов. SP-D, коллагеновый кальций-зависимый лектин (или коллектин), связывается с поверхностными гликоконъюгатами, экспрессируемыми широким спектром микроорганизмов, а также с олигосахаридами, связанными с поверхностью различных сложных органических антигенов. SP-D также специфически взаимодействует с гликоконъюгатами и другими молекулами, экспрессируемыми на поверхности макрофагов, нейтрофилов и лимфоцитов. Кроме того, SP-D связывается со специфическими липидами, ассоциированными с поверхностно-активными веществами, и может влиять на организацию липидных смесей, содержащих фосфатидилинозитол in vitro. С этими разнообразными действиями in vitro согласуется наблюдение, что у трансгенных мышей с дефицитом SP-D наблюдается аномальное накопление поверхностно-активных липидов, а также аномальная реакция на воздействие респираторных вирусов и бактериальных липополисахаридов. Фенотип макрофагов, выделенных из легких мышей с дефицитом SP-D, изменен, и имеются косвенные доказательства того, что аномальный метаболизм оксидантов и/или повышенная экспрессия металлопротеиназ способствуют развитию эмфиземы. Экспрессия SP-D увеличивается в ответ на многие формы повреждения легких, а недостаточное накопление соответствующим образом олигомеризованного SP-D может способствовать патогенезу различных заболеваний легких у человека.

сурфактантный белок d sp d участвовать врождённый ответ вдыхать микроорганизм органический антиген также способствовать регуляция иммунитет воспаление лёгкий sp d синтезироваться секретироваться альвеолярный бронхиолярный эпителиальный клетка также экспрессироваться эпителиальный клетка выстилать различный экзокринный проток слизистая оболочка желудочный кишечный мочеполовой трактовый sp d коллагеновый кальций зависимый лектина коллектин связываться поверхностный гликоконъюгат экспрессируть широкий спектр микроорганизм также олигосахарид связанный поверхность различный сложный органический антиген sp d также специфически взаимодействовать гликоконъюгат молекула экспрессируть поверхность макрофаг нейтрофил лимфоцит кроме sp d связываться специфический липид ассоциированный поверхностно активный вещество мочь влиять организация липидный смесь содержать фосфатидилинозитола in vitro разнообразный действие in vitro согласоваться наблюдение трансгенный мышь дефицит sp d наблюдаться аномальный накопление поверхностно активный липид также аномальный реакция воздействие респираторный вирус бактериальный липополисахарид фенотип макрофаг выделить лёгкий мышь дефицит sp d изменить иметься косвенный доказательство аномальный метаболизм оксидант повышенный экспрессия металлопротеиназа способствовать развитие эмфизема экспрессия sp d увеличиваться ответ многие форма повреждение лёгкий недостаточный накопление соответствовать образ олигомеризованный sp d мочь способствовать патогенез различный заболевание лёгкий человек

сурфактантный белок d защита лёгкий хозяин

2b73a28n

Роль эндотелина-1 в заболеваниях легких

Эндотелин-1 (ЭТ-1) — это пептид из 21 аминокислоты с разнообразной биологической активностью, который участвует в развитии многочисленных заболеваний. ЭТ-1 является мощным митогенным регулятором тонуса гладких мышц и медиатором воспаления, который может играть ключевую роль в заболеваниях дыхательных путей, малого круга кровообращения и воспалительных заболеваниях легких, как острых, так и хронических. В этом обзоре основное внимание будет уделено биологии ЭТ-1 и его роли в заболеваниях легких.

эндотелин 1 эт 1 это пептид 21 аминокислота разнообразный биологический активность участвовать развитие многочисленный заболевание эт 1 являться мощный митогенный регулятор тонус гладкий мышца медиатор воспаление мочь играть ключевой роль заболевание дыхательный путь малое круг кровообращение воспалительный заболевание лёгкий острый хронический это обзор основный внимание уделить биология эт 1 роль заболевание лёгкий

роль эндотелин 1 заболевание лёгкий

9785vg6d

Экспрессия генов в эпителиальных клетках в ответ на пневмовирусную инфекцию

Респираторно-синцитиальный вирус (РСВ) и вирус пневмонии мышей (ВПМ) — вирусы семейства Paramyxoviridae, подсемейства пневмовирусов, которые вызывают клинически значимые респираторные инфекции у людей и грызунов соответственно. Клетки-мишени респираторного эпителия реагируют на вирусную инфекцию специфическими изменениями в экспрессии генов, включая выработку хемоаттрактантных цитокинов, молекул адгезии, элементов, связанных с реакцией апоптоза, и других, которые остаются не до конца изученными. Здесь мы рассмотрим наше современное понимание этих реакций слизистой оболочки и обсудим несколько геномных подходов, включая дифференциальную обратную транскрипцию-полимеразную цепную реакцию (ПЦР) и стратегии генной матрицы, которые позволят нам раскрыть природу этих реакций более полно и систематически.

респираторный синцитиальный вирус рсв вирус пневмония мышь впм вирус семейство paramyxoviridae подсемейство пневмовирус вызывать клинически значимый респираторный инфекция человек грызун соответственно клетка мишень респираторный эпителий реагировать вирусный инфекция специфический изменение экспрессия ген включая выработка хемоаттрактантный цитокин молекула адгезия элемент связанный реакция апоптоз оставаться конец изучить рассмотреть наш современный понимание реакция слизистый оболочка обсудить несколько геномный подход включая дифференциальный обратный транскрипция полимеразный цепной реакция пцр стратегия генный матрица позволить раскрыть природа реакция полно систематически

экспрессия ген эпителиальный клетка ответ пневмовирусный инфекция

zjufx4fo

Требования к последовательности для переноса цепи РНК во время прерывистого субгеномного синтеза РНК нидовируса

Субгеномные мРНК нидовирусов содержат лидерную последовательность, полученную из 5'-конца генома, слитую с различными последовательностями («телами»), полученными из 3'-конца. Их генерация включает уникальный механизм прерывистого синтеза субгеномной РНК, который напоминает рекомбинацию РНК с избирательным копированием. В ходе этого процесса зарождающаяся цепь РНК переносится из одного участка матрицы в другой в ходе синтеза плюс- или минус-цепи, в результате чего образуются субгеномные молекулы РНК. Центральное место в этом процессе занимают последовательности, регулирующие транскрипцию (TRS), которые присутствуют в обоих участках матрицы и обеспечивают точность переноса цепи. В данной работе представлены результаты комплексного исследования ковариационного мутагенеза TRS вируса артериита лошадей, демонстрирующие, что прерывистый синтез РНК зависит не только от спаривания оснований между смысловым лидером TRS и антисмысловым телом TRS, но и от первичной последовательности тела TRS. В то время как лидерный TRS играет лишь роль нацеливания для переноса цепи, телесный TRS выполняет несколько функций. Последовательности соединений лидер-тело мРНК мутантов TRS убедительно свидетельствуют о том, что прерывистый этап происходит во время синтеза минус-цепи.

субгеномный мрнк нидовирус содержать лидерновать последовательность получить 5 конец геном слить различный последовательность тело получить 3 конец генерация включать уникальный механизм прерывистый синтез субгеномный рнк напоминать рекомбинация рнк избирательный копирование ход это процесс зарождаться цепь рнк переноситься участок матрица ход синтез плюс минус цепь результат образоваться субгеномный молекула рнк центральный место это процесс занимать последовательность регулировать транскрипция trs присутствовать оба участок матрица обеспечивать точность перенос цепь дать работа представить результат комплексный исследование ковариационный мутагенез trs вирус артериит лошадь демонстрировать прерывистый синтез рнк зависеть спаривание основание смысловой лидер trs антисмысловой тело trs первичный последовательность тело trs время лидерный trs играть лишь роль нацеливание перенос цепь телесный trs выполнять несколько функция последовательность соединение лидер тело мрнк мутант trs убедительно свидетельствовать прерывистый этап происходить время синтез минус цепь

требование последовательность перенос цепь рнк время прерывистый субгеномный синтез рнк нидовирус

5yhe786e

Дебаты: переливание крови до нормального уровня гемоглобина не улучшит результат

Последние данные свидетельствуют о том, что тяжелобольные пациенты способны переносить более низкие уровни гемоглобина, чем считалось ранее. Наша цель — показать, что переливание крови до уровня 100 г/л не снижает смертность и другие клинически важные результаты в отделениях интенсивной терапии. Хотя остается еще много вопросов, многочисленные лабораторные и клинические исследования, включая недавнее рандомизированное контролируемое исследование (РКИ), установили, что переливание крови до нормальной концентрации гемоглобина не улучшает показатели органной недостаточности и смертности у пациентов в критическом состоянии. Кроме того, стратегия ограничения переливания крови позволит снизить риск аллогенных переливаний, приведет к более эффективному использованию эритроцитов (эритроцитов), экономии крови в целом и снижению расходов на здравоохранение.

последний дать свидетельствовать тяжелобольной пациент способный переносить низкий уровень гемоглобин считаться ранее наш цель показать переливание кровь уровень 100 г л снижать смертность клинически важный результат отделение интенсивный терапия хотя оставаться ещё вопрос многочисленный лабораторный клинический исследование включая недавний рандомизировать контролировать исследование рки установить переливание кровь нормальный концентрация гемоглобин улучшать показатель органный недостаточность смертность пациент критический состояние кроме стратегия ограничение переливание кровь позволить снизить риск аллогенный переливание привести эффективный использование эритроцит эритроцит экономия кровь целое снижение расход здравоохранение

дебаты переливание кровь нормальный уровень гемоглобин улучшить результат

8zchiykl

21-й Международный симпозиум по интенсивной терапии и неотложной медицине, Брюссель, Бельгия, 20-23 марта 2001 г.

Основное внимание на 21-м Международном симпозиуме по интенсивной терапии и неотложной медицине уделялось результатам недавних клинических испытаний при сепсисе и остром респираторном дистресс-синдроме (ОРДС). Другими областями интереса были перспективы экстракорпоральной заместительной терапии печени и неинвазивной вентиляции легких. Внимание также было уделено этическим вопросам. В целом, современные лекции, дебаты «за» и «против», семинары и практические занятия были на высоком уровне. Встреча прошла под знаком возрожденного энтузиазма по поводу позитивного прогресса в области интенсивной терапии.

основный внимание 21 м международный симпозиум интенсивный терапия неотложный медицина уделяться результат недавний клинический испытание сепсис острый респираторный дистресс синдром ордс область интерес перспектива экстракорпоральный заместительный терапия печень неинвазивный вентиляция лёгкий внимание также уделить этический вопрос целое современный лекция дебаты против семинар практический занятие высокий уровень встреча пройти знак возродить энтузиазм повод позитивный прогресс область интенсивный терапия

21 й международный симпозиум интенсивный терапия неотложный медицина брюссель бельгия 20 23 март 2001 г

8qnrcgnk

Гем-оксигеназа-1 и оксид углерода в пульмонологии

Гем-оксигеназа-1 (HO-1), индуцируемый стрессовый белок, обеспечивает цитопротекцию от окислительного стресса in vitro и in vivo. Помимо своей физиологической роли в деградации гема, HO-1 может влиять на ряд клеточных процессов, включая рост, воспаление и апоптоз. Благодаря противовоспалительному эффекту HO-1 ограничивает повреждение тканей в ответ на провоспалительные стимулы и предотвращает отторжение аллотрансплантата после трансплантации. Повышение транскрипции HO-1 происходит в ответ на многие факторы, такие как гипоксия, бактериальный липополисахарид и активные формы кислорода/азота. HO-1 и его конститутивно экспрессируемый изофермент, гемоксигеназа-2, катализируют лимитирующий скорость этап превращения гема в его метаболиты, билирубин IXα, двухвалентное железо и оксид углерода (CO). Механизмы, посредством которых HO-1 обеспечивает защиту, скорее всего, включают продукты его ферментативной реакции. Примечательно, что введение CO в низких концентрациях может заменить HO-1 в отношении противовоспалительного и антиапоптотического действия, что указывает на роль CO как ключевого медиатора функции HO-1. Хроническое, низкоуровневое, экзогенное воздействие CO в результате курения сигарет обусловливает важность CO в пульмонологии. В этом обзоре будет рассмотрено влияние системы HO-1/CO на заболевания легких с акцентом на воспалительные состояния.

гем оксигеназа 1 ho 1 индуцировать стрессовый белок обеспечивать цитопротекция окислительный стресс in vitro in vivo помимо свой физиологический роль деградация гем ho 1 мочь влиять ряд клеточный процесс включая рост воспаление апоптоз благодаря противовоспалительный эффект ho 1 ограничивать повреждение ткань ответ провоспалительный стимул предотвращать отторжение аллотрансплантат трансплантация повышение транскрипция ho 1 происходить ответ многие фактор гипоксия бактериальный липополисахарид активный форма кислород азот ho 1 конститутивный экспрессировать изофермент гемоксигеназа 2 катализировать лимитировать скорость этап превращение гем метаболит билирубин ixα двухвалентный железо оксид углерод co механизм посредством ho 1 обеспечивать защита скорее весь включать продукт ферментативный реакция примечательно введение co низкий концентрация мочь заменить ho 1 отношение противовоспалительный антиапоптотический действие указывать роль co ключевой медиатор функция ho 1 хронический низкоуровневый экзогенный воздействие co результат курение сигарета обусловливать важность co пульмонология это обзор рассмотреть влияние система ho 1 co заболевание лёгкий акцент воспалительный состояние

гем оксигеназа 1 оксид углерод пульмонология

jg13scgo

Техническое описание RODS: система наблюдения за общественным здоровьем в режиме реального времени

В отчете описывается разработка и внедрение системы наблюдения за вспышками заболеваний и болезнями в режиме реального времени (RODS), представляющей собой компьютерную систему наблюдения за общественным здравоохранением для раннего выявления вспышек заболеваний. Больницы отправляют данные RODS о клинических приемах по виртуальным частным сетям и выделенным линиям с использованием протокола сообщений Health Level 7 (HL7). Данные передаются в режиме реального времени. Система RODS автоматически классифицирует жалобу главного регистратора, полученную в ходе визита, по одной из семи категорий синдромов с использованием байесовских классификаторов. Он хранит данные в реляционной базе данных, объединяет их для анализа с использованием методов хранилищ данных, применяет к данным одномерные и многомерные статистические алгоритмы обнаружения и оповещает пользователей о случаях, когда алгоритмы выявляют аномальные закономерности в количестве синдромов. RODS также имеет веб-интерфейс пользователя, поддерживающий временной и пространственный анализ. RODS обрабатывает продажи безрецептурных медицинских товаров аналогичным образом, но получает такие данные в пакетном режиме ежедневно. Система RODS использовалась во время зимних Олимпийских игр 2002 года и в настоящее время действует в двух штатах — Пенсильвании и Юте. Он был и продолжает оставаться ресурсом для внедрения, оценки и применения новых методов надзора за общественным здравоохранением.

отчёт описываться разработка внедрение система наблюдение вспышка заболевание болезнь режим реальный время rods представлять компьютерный система наблюдение общественный здравоохранение ранний выявление вспышка заболевание больница отправлять дать rods клинический приём виртуальный частный сеть выделить линия использование протокол сообщение health level 7 hl7 дать передаваться режим реальный время система rods автоматически классифицировать жалоба главное регистратор получить ход визит семь категория синдром использование байесовский классификатор хранить дать реляционный база данные объединять анализ использование метод хранилище данные применять данные одномерный многомерный статистический алгоритм обнаружение оповещать пользователь случай алгоритм выявлять аномальный закономерность количество синдром rods также иметь веб интерфейс пользователь поддерживать временной пространственный анализ rods обрабатывать продажа безрецептурный медицинский товар аналогичный образ получать дать пакетный режим ежедневно система rods использоваться время зимний олимпийский игра 2002 год настоящий время действовать штат пенсильвания ют продолжать оставаться ресурс внедрение оценка применение новый метод надзор общественный здравоохранение

технический описание rods система наблюдение общественный здоровье режим реальный время

5tkvsudh

Сохранение регуляции полиаминов путем трансляционного сдвига рамки считывания от дрожжей к млекопитающим

Регуляция орнитиндекарбоксилазы у позвоночных включает механизм отрицательной обратной связи, требующий белка-антизима. Здесь мы показываем, что аналогичный механизм существует у делящихся дрожжей Schizosaccharomyces pombe. Экспрессия генов антизимов млекопитающих требует специфического сдвига рамки трансляции +1. Эффективность события сдвига рамки считывания отражает клеточные уровни полиаминов, создающие ауторегуляторный цикл обратной связи. Как показано здесь, ген антизима дрожжей и несколько недавно идентифицированных генов антизима из разных нематод также требуют для своей экспрессии события сдвига рамки считывания в рибосоме. Двенадцать нуклеотидов вокруг сайта сдвига рамки считывания идентичны у S.pombe и его аналогов у млекопитающих. Основной элемент этого сдвига рамки, вероятно, присутствовал у последнего общего предка дрожжей, нематод и млекопитающих.

регуляция орнитиндекарбоксилаза позвоночный включать механизм отрицательный обратный связь требовать белок антизима показывать аналогичный механизм существовать делиться дрожжи schizosaccharomyces pombe экспрессия ген антизим млекопитающее требовать специфический сдвиг рамка трансляция 1 эффективность событие сдвиг рамка считывание отражать клеточный уровень полиамин создавать ауторегуляторный цикл обратный связь показать ген антизима дрожжи несколько недавно идентифицировать ген антизима разный нематода также требовать свой экспрессия событие сдвиг рамка считывание рибосома двенадцать нуклеотид вокруг сайт сдвиг рамка считывание идентичный s pombe аналог млекопитающее основной элемент это сдвиг рамка вероятно присутствовать последний общий предок дрожжи нематода млекопитающее

сохранение регуляция полиамин путём трансляционный сдвиг рамка считывание дрожжи млекопитающее

6lvn10f4

Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин А1 регулирует синтез РНК цитоплазматического вируса

Гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин (hnRNP A1) участвует в сплайсинге пре-мРНК в ядре и регуляции трансляции в цитоплазме. В настоящем исследовании мы демонстрируем, что hnRNP A1 также участвует в транскрипции и репликации цитоплазматического РНК-вируса, вируса гепатита мышей (MHV). Сверхэкспрессия hnRNP A1 ускорила кинетику синтеза вирусной РНК, тогда как экспрессия в цитоплазме доминантно-негативного мутанта hnRNP A1, у которого отсутствует домен ядерного транспорта, значительно замедлила его. Мутант hnRNP A1 вызвал глобальное ингибирование транскрипции вирусной мРНК и геномной репликации, а также преимущественное ингибирование репликации дефектных интерферирующих РНК. Подобно дикому типу hnRNP A1, мутант hnRNP A1 образует комплекс с продуктом гена полимеразы MHV, белком нуклеокапсида и вирусной РНК. Однако, в отличие от дикого типа hnRNP A1, мутантный белок не смог связать клеточный белок массой 250 кДа, что позволяет предположить, что привлечение клеточных белков hnRNP A1 важно для синтеза РНК MHV. Наши результаты подтверждают важность клеточных факторов в вирусном РНК-зависимом синтезе РНК.

гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин hnrnp a1 участвовать сплайсинг пра мрнк ядро регуляция трансляция цитоплазма настоящий исследование демонстрировать hnrnp a1 также участвовать транскрипция репликация цитоплазматический рнк вирус вирус гепатит мышь mhv сверхэкспрессия hnrnp a1 ускорить кинетика синтез вирусный рнк экспрессия цитоплазма доминантный негативный мутант hnrnp a1 отсутствовать домен ядерный транспорт значительно замедлить мутант hnrnp a1 вызвать глобальный ингибирование транскрипция вирусный мрнк геномный репликация также преимущественный ингибирование репликация дефектный интерферировать рнк подобно дикий тип hnrnp a1 мутант hnrnp a1 образовать комплекс продукт ген полимераза mhv белок нуклеокапсида вирусный рнк однако отличие дикий тип hnrnp a1 мутантный белок смочь связать клеточный белок масса 250 кда позволять предположить привлечение клеточный белок hnrnp a1 важно синтез рнк mhv наш результат подтверждать важность клеточный фактор вирусный рнк зависимый синтез рнк

гетерогенный ядерный рибонуклеопротеин а1 регулировать синтез рнк цитоплазматический вирус

tvxpckxo

Метод идентификации белков, взаимодействующих с доменом UBA p62

Домен UBA представляет собой консервативный мотив последовательности среди полиубиквитин-связывающих белков. Впервые мы демонстрируем систематический, высокопроизводительный подход к идентификации белков, взаимодействующих с доменом UBA, с точки зрения всего протеома. Используя систему клонирования экспрессии in vitro лизата ретикулоцитов кролика, мы успешно идентифицировали одиннадцать белков, которые взаимодействуют с доменом UBA p62, и большинство из одиннадцати белков связаны с нейродегенеративными заболеваниями, такими как болезнь Альцгеймера. Таким образом, p62 может играть новую регуляторную роль через свой домен UBA. Наш подход обеспечивает простой путь к характеристике белков, взаимодействующих с доменом UBA, и его применение раскроет важные роли, которые играет домен UBA.

домен uba представлять консервативный мотив последовательность среди полиубиквитин связывать белок впервые демонстрировать систематический высокопроизводительный подход идентификация белок взаимодействовать домен uba точка зрение весь протеома использовать система клонирование экспрессия in vitro лизат ретикулоцит кролик успешно идентифицировать одиннадцать белок взаимодействовать домен uba p62 большинство одиннадцать белок связать нейродегенеративный заболевание болезнь альцгеймер образ p62 мочь играть новый регуляторный роль свой домен uba наш подход обеспечивать простой путь характеристика белок взаимодействовать домен uba применение раскрыть важный роль играть домен uba

метод идентификация белок взаимодействовать домен uba p62

mcuixluu

Инфекция вируса коровьей оспы нарушает организацию микротрубочек и функцию центросомы

Мы изучили роль микротрубочкового цитоскелета при инфицировании вирусом осповакцины. Мы обнаружили, что вновь собранные вирусные частицы накапливаются вблизи центра организации микротрубочек в зависимости от микротрубочек и комплекса динеин-динактин. Микротрубочки необходимы для эффективного формирования внутриклеточного зрелого вируса (IMV) и имеют решающее значение для сборки внутриклеточного оболочечного вируса (IEV). По мере развития инфекции микротрубочковый цитоскелет резко реорганизуется, что напоминает сверхэкспрессию белков, ассоциированных с микротрубочками (MAP). В соответствии с этим мы сообщаем, что белки коровьей оспы A10L и L4R обладают MAP-подобными свойствами и опосредуют прямое связывание вирусных ядер с микротрубочками in vitro. Кроме того, заражение коровьей оспой также приводит к значительному снижению количества белков в центросоме и потере эффективности зарождения центросомных микротрубочек. Это первый пример нарушения функции центросомы под воздействием вируса. Дальнейшие исследования вакцинии позволят лучше понять роль микротрубочек в патогенезе вируса и регуляции функции центросомы.

изучить роль микротрубочковый цитоскелет инфицирование вирус осповакцина обнаружить вновь собранный вирусный частица накапливаться вблизи центр организация микротрубочка зависимость микротрубочка комплекс динеин динактин микротрубочка необходимый эффективный формирование внутриклеточный зрелый вирус imv иметь решающий значение сборка внутриклеточный оболочечный вирус iev мера развитие инфекция микротрубочковый цитоскелет резко реорганизоваться напоминать сверхэкспрессия белок ассоциированный микротрубочка map соответствие это сообщать белка коровий оспа a10l l4r обладать map подобный свойство опосредовать прямой связывание вирусный ядро микротрубочка in vitro кроме заражение коровий оспа также приводить значительный снижение количество белок центросома потеря эффективность зарождение центросомный микротрубочка это первый пример нарушение функция центросома воздействие вирус дальнейший исследование вакцинии позволить хороший понять роль микротрубочка патогенез вирус регуляция функция центросома

инфекция вирус коровий оспа нарушать организация микротрубочка функция центросома

6iu1dtyl

Место возникновения пандемии гриппа 1918 года и ее последствия для общественного здравоохранения

место возникновение пандемия грипп 1918 год последствие общественный здравоохранение

t35n7bk9

Многогранный, многофункциональный микрочип: одновременное обнаружение множества вирусов и профилей их экспрессии

Существуют сотни вирусов, которые поражают различные органы человека и вызывают заболевания. Некоторые смертельные новые вирусные инфекции стали серьезными проблемами общественного здравоохранения во всем мире. Поэтому ранняя диагностика и последующее лечение имеют решающее значение для борьбы с вирусными инфекциями. Современные методы диагностики часто используют методы, основанные на полимеразной цепной реакции (ПЦР), для быстрого обнаружения патогенных вирусов и установления этиологии заболевания или патологии. Однако метод быстрой ПЦР имеет много недостатков, таких как высокий уровень ложноположительных результатов и способность обнаруживать только один или несколько генов-мишеней одновременно. Технология микрочипов решает проблемы ограничений ПЦР и может эффективно применяться во всех областях молекулярной медицины. Недавно в отчете журнала Retrovirology был описан мультивирусный ДНК-массив, содержащий более 250 открытых рамок считывания восьми человеческих вирусов, включая вирус иммунодефицита человека типа 1. Этот массив можно использовать для обнаружения множественных вирусных коинфекций в клетках и in vivo. Еще одним преимуществом такого типа мультивирусного массива является возможность изучения активности промотора и экспрессии вирусных генов, а также корреляции таких показаний с прогрессированием заболевания и реактивацией латентных инфекций. Таким образом, разработка вирусного ДНК-чипа, описанная в журнале Retrovirology, является важным достижением в диагностическом применении, которое может стать мощным клиническим инструментом для характеристики вирусных коинфекций у больных СПИДом, а также у других пациентов.

существовать сотня вирус поражать различный орган человек вызывать заболевание некоторый смертельный новый вирусный инфекция стать серьёзный проблема общественный здравоохранение весь мир поэтому ранний диагностика последующий лечение иметь решающий значение борьба вирусный инфекция современный метод диагностика часто использовать метод основать полимеразный цепной реакция пцр быстрый обнаружение патогенный вирус установление этиология заболевание патология однако метод быстрый пцр иметь недостаток высокий уровень ложноположительный результат способность обнаруживать несколько ген мишень одновременно технология микрочип решать проблема ограничение пцр мочь эффективно применяться весь область молекулярный медицина недавно отчёт журнал retrovirology описать мультивирусный днк массив содержать 250 открытый рамка считывание восемь человеческий вирус включая вирус иммунодефицит человек тип 1 массив использовать обнаружение множественный вирусный коинфекция клетка in vivo ещё преимущество тип мультивирусный массив являться возможность изучение активность промотор экспрессия вирусный ген также корреляция показание прогрессирование заболевание реактивация латентный инфекция образ разработка вирусный днк чип описать журнал retrovirology являться важный достижение диагностический применение мочь стать мощный клинический инструмент характеристика вирусный коинфекция больной спид также пациент

многогранный многофункциональный микрочип одновременный обнаружение множество вирус профиль экспрессия

eiqypt0m

Вирус простого герпеса 1-го типа и нормальная проницаемость белков в легких у пациентов в критическом состоянии: аргумент в пользу низкой патогенности?

ВВЕДЕНИЕ: Патогенность поздних респираторных инфекций, вызванных вирусом простого герпеса 1-го типа (ВПГ-1), у тяжелобольных неясна. МЕТОДЫ: У четырех пациентов в критическом состоянии с персистирующими легочными инфильтратами неизвестного происхождения и выделением вируса простого герпеса 1 типа из трахеального аспирата или бронхоальвеолярного лаважа через 7 (1–11) дней после начала искусственной вентиляции легких измерялся индекс легочной утечки (ИЛУ) для (67)галлия ((67)Ga)-трансферрина (верхняя граница нормы 14,1 × 10(-3)/мин). РЕЗУЛЬТАТЫ: У пациентов, принявших участие в исследовании, показатель PLI составил от 7,5 до 14,0 × 10(-3)/мин. Двое пациентов прошли курс лечения ацикловиром, и все выжили. ВЫВОДЫ: Нормальная проницаемость капилляров, наблюдаемая в легких, свидетельствует против патогенности ВПГ-1 у тяжелобольных и свидетельствует в пользу того, что выделение вируса отражает реактивацию в ходе тяжелого заболевания и иммунодепрессии, а не первичную или присоединившуюся инфекцию в легких.

введение патогенность поздний респираторный инфекция вызвать вирус простой герпес 1 го тип впг 1 тяжелобольной неясный метод четыре пациент критический состояние персистируть лёгочный инфильтрат неизвестный происхождение выделение вирус простой герпес 1 тип трахеальный аспирата бронхоальвеолярный лаважа 7 1 11 день начало искусственный вентиляция лёгкий измеряться индекс лёгочный утечка ил 67 галлия 67 ga трансферрина верхний граница норма 14 1 10 3 мина результат пациент принять участие исследование показатель pli составить 7 5 14 0 10 3 мина двое пациент пройти курс лечение ацикловир всё выжить вывод нормальный проницаемость капилляр наблюдать лёгкий свидетельствовать против патогенность впг 1 тяжелобольной свидетельствовать польза выделение вирус отражать реактивация ход тяжёлый заболевание иммунодепрессия первичный присоединиться инфекция лёгкий

вирус простой герпес 1 го тип нормальный проницаемость белок лёгкий пациент критический состояние аргумент польза низкий патогенность

sgmk96vr

Логистика контроля заболеваемости оспой в обществе посредством отслеживания контактов и кольцевой вакцинации: стохастическая сетевая модель

ПРЕДЫСТОРИЯ: Предыдущие модели кольцевой вакцинации против оспы, основанные на отслеживании контактов по сети, предполагали, что кольцевая вакцинация будет эффективной, но в них явно не учитывалась логистика реагирования и ограниченное количество вакцинаторов. МЕТОДЫ: Мы разработали непрерывную во времени стохастическую симуляцию передачи оспы, включая сетевую структуру, вакцинацию после контакта, вакцинацию контактов контактов, ограниченную способность реагирования, неоднородность симптомов и заразности, вакцинацию до прекращения плановой вакцинации, более быструю диагностику благодаря осведомленности населения, наблюдение за бессимптомными контактами и изоляцию случаев. РЕЗУЛЬТАТЫ: Мы обнаружили, что даже в случаях очень быстрого распространения оспы кольцевая вакцинация (в сочетании с надзором) в большинстве случаев достаточна для быстрой ликвидации оспы, при условии, что отслежено 95% бытовых контактов, отслежено 80% рабочих или социальных контактов и не отслежено ни одного случайного контакта, и что в большинстве случаев достаточно возможности отслеживать 1–5 человек в день на каждый индексный случай. Если предположить, что оспа передается очень быстро при контакте с больными, то иногда ее можно будет избежать с помощью кольцевой вакцинации, но в таких обстоятельствах ее можно будет контролировать с помощью массовой вакцинации. ВЫВОДЫ: Небольшие вспышки оспы, вероятно, можно легко сдержать с помощью кольцевой вакцинации, при условии возможности отслеживания контактов. Неопределенность в природе оспы, переносимой биотеррористами (заразность, эффективность вакцины), обусловливает необходимость дальнейшего планирования кольцевой вакцинации, а также массовой вакцинации. В случае начала кольцевой вакцинации ее следует проводить без задержек, включать контакты контактов (при наличии достаточных возможностей) и сопровождать повышением осведомленности населения и надзора.

предыстория предыдущий модель кольцевой вакцинация против оспа основать отслеживание контакт сеть предполагать кольцевой вакцинация эффективный явно учитываться логистика реагирование ограниченный количество вакцинатор метод разработать непрерывный время стохастический симуляция передача оспа включая сетевой структура вакцинация контакт вакцинация контакт контакт ограниченный способность реагирование неоднородность симптом заразность вакцинация прекращение плановый вакцинация быстрый диагностик благодаря осведомлённость население наблюдение бессимптомный контакт изоляция случай результат обнаружить случай очень быстрый распространение оспа кольцевой вакцинация сочетание надзор большинство случай достаточный быстрый ликвидация оспа условие отследить 95 бытовой контакт отследить 80 рабочий социальный контакт отследить случайный контакт большинство случай достаточно возможность отслеживать 1 5 человек день каждый индексный случай предположить оспа передаваться очень быстро контакт больной избежать помощь кольцевой вакцинация обстоятельство контролировать помощь массовый вакцинация вывод небольшой вспышка оспа вероятно легко сдержать помощь кольцевой вакцинация условие возможность отслеживание контакт неопределённость природа оспа переносить биотеррорист заразность эффективность вакцина обусловливать необходимость дальнейший планирование кольцевой вакцинация также массовый вакцинация случай начало кольцевой вакцинация следовать проводить задержка включать контакт контакт наличие достаточный возможность сопровождать повышение осведомлённость население надзор

логистика контроль заболеваемость оспа общество посредством отслеживание контакт кольцевой вакцинация стохастический сетевой модель

di0fcy0j

Защита клеток легочного эпителия от окислительного стресса с помощью аденингликозилазы hMYH

ПРЕДЫСТОРИЯ: Кислородная интоксикация является основной причиной повреждения легких. Путь эксцизионной репарации оснований является одним из важнейших механизмов клеточной защиты, который реагирует на окислительное повреждение ДНК. Ферменты репарации ДНК, специфичные для повреждений, включают hOgg1, hMYH, hNTH и hMTH. МЕТОДЫ: Вышеуказанные ферменты репарации ДНК, специфичные для повреждений, были экспрессированы в клетках альвеолярного эпителия человека (A549) с использованием ретровирусного вектора pSF91.1. Клетки подвергались воздействию 95%-ной кислородной среды, ионизирующего излучения (ИК) или H(2)O(2). Анализ роста клеток проводился в нетоксичных условиях. Для подтверждения сверхэкспрессии и оценки эндогенной экспрессии в токсичных и нетоксичных условиях был проведен анализ методом вестерн-блоттинга. Статистический анализ проводился с использованием парного t-критерия Стьюдента, при этом значимость принималась при p < 0,05. РЕЗУЛЬТАТЫ: Анализы гибели клеток показали, что клетки, сверхэкспрессирующие hMYH, демонстрируют лучшую выживаемость как при повышенном содержании кислорода, так и при ИР. Анализ роста клеток A549 в нетоксичных условиях показал, что клетки, сверхэкспрессирующие hMYH, также растут медленнее. Анализ вестерн-блоттинга продемонстрировал повышенную экспрессию каждого отдельного гена и не привел к изменению эндогенной экспрессии других. Однако было отмечено, что токсичность O(2) привела к снижению эндогенной экспрессии hNTH в клетках A549. ЗАКЛЮЧЕНИЕ: Повышенная экспрессия фермента репарации ДНК-гликозилазы hMYH в клетках A549, подвергнутых воздействию O(2) и IR, приводит к улучшению выживаемости клеток. Восстановление ДНК посредством пути эксцизионной репарации оснований может стать альтернативным способом компенсации повреждающего воздействия O(2) и его метаболитов.

предыстория кислородный интоксикация являться основной причина повреждение лёгкий путь эксцизионный репарация основание являться важный механизм клеточный защита реагировать окислительный повреждение днк фермент репарация днк специфичный повреждение включать hogg1 hmyh hnth hmth метод вышеуказанный фермент репарация днк специфичный повреждение экспрессировать клетка альвеолярный эпителий человек a549 использование ретровирусный вектор psf91 1 клетка подвергаться воздействие 95 ной кислородный среда ионизировать излучение ик h 2 o 2 анализ рост клетка проводиться нетоксичный условие подтверждение сверхэкспрессия оценка эндогенный экспрессия токсичный нетоксичный условие провести анализ метод вестерн блоттинг статистический анализ проводиться использование парный t критерий стьюдента это значимость приниматься p 0 05 результат анализ гибель клетка показать клетка сверхэкспрессировать hmyh демонстрировать хороший выживаемость повышенный содержание кислород ир анализ рост клетка a549 нетоксичный условие показать клетка сверхэкспрессировать hmyh также расти медленный анализ вестерн блоттинг продемонстрировать повышенный экспрессия каждый отдельный ген привести изменение эндогенный экспрессия однако отметить токсичность o 2 привести снижение эндогенный экспрессия hnth клетка a549 заключение повышенный экспрессия фермент репарация днк гликозилаза hmyh клетка a549 подвергнуть воздействие o 2 ir приводить улучшение выживаемость клетка восстановление днк посредством путь эксцизионный репарация основание мочь стать альтернативный способ компенсация повреждать воздействие o 2 метаболит

защита клетка лёгочный эпителий окислительный стресс помощь аденингликозилаза hmyh

4k8f7ou1

Биоинформатическое картирование доменов гомологии AlkB в вирусах

ПРЕДЫСТОРИЯ: Белки, подобные AlkB, являются членами суперсемейства 2-оксоглутарат- и Fe(II)-зависимых оксигеназ. В Escherichia coli этот белок защищает РНК и ДНК от повреждения метилирующими агентами. 1-метиладенин и 3-метилцитозин восстанавливаются путем окислительного деметилирования и прямого возврата метилированного основания обратно в его неметилированную форму. Гены гомологов AlkB широко распространены в природе, и эукариоты часто имеют несколько генов, кодирующих белки, подобные AlkB. Аналогичные домены были обнаружены также у некоторых вирусов растений. Функция вирусного домена неизвестна, но предполагается, что он может участвовать в защите вируса от системы посттранскрипционного подавления генов (PTGS), обнаруженной в растениях. Мы хотели провести филогеномное картирование вирусных доменов, подобных AlkB, в качестве основы для анализа функциональных аспектов этих доменов, поскольку это могло бы иметь некоторое значение для понимания возможных альтернативных ролей гомологов AlkB, например: у эукариот. РЕЗУЛЬТАТЫ: Поиски на основе профилей в библиотеках последовательностей белков показали, что домены, подобные AlkB, обнаружены по крайней мере в 22 различных одноцепочечных РНК-положительных вирусах растений, но в основном в подгруппе семейства Flexiviridae. Анализ последовательности показал, что домены AlkB, вероятно, функционально консервативны и что они, скорее всего, были сравнительно недавно интегрированы в несколько вирусных геномов в географически разных местах. Эта закономерность, по-видимому, более соответствует возросшему давлению на окружающую среду, например: от метилирующих пестицидов, чем при взаимодействии с системой PTGS. ВЫВОДЫ: Домен AlkB, обнаруженный в вирусных геномах, скорее всего, является обычным доменом репарации ДНК/РНК, который защищает вирусный РНК-геном от метилирующих соединений из окружающей среды.

предыстория белка подобный alkb являться член суперсемейство 2 оксоглутарат fe ii зависимый оксигеназа escherichia coli белок защищать рнк днк повреждение метилируть агент 1 метиладенин 3 метилцитозин восстанавливаться путём окислительный деметилирование прямой возврат метилированный основание обратно неметилировать форма ген гомолог alkb широко распространить природа эукариот часто иметь несколько ген кодировать белка подобный alkb аналогичный домен обнаружить также некоторый вирус растение функция вирусный домен неизвестный предполагаться мочь участвовать защита вирус система посттранскрипционный подавление ген ptgs обнаружить растение хотеть провести филогеномный картирование вирусный домен подобный alkb качество основа анализ функциональный аспект домен поскольку это мочь иметь некоторый значение понимание возможный альтернативный роль гомолог alkb например эукариот результат поиск основа профиль библиотека последовательность белок показать домен подобный alkb обнаружить крайний мера 22 различный одноцепочечный рнк положительный вирус растение основное подгруппа семейство flexiviridae анализ последовательность показать домен alkb вероятно функционально консервативный скорее весь сравнительно недавно интегрировать несколько вирусный геном географически разный место закономерность видимый соответствовать возрасти давление окружающий среда например метилировать пестицид взаимодействие система ptgs вывод домен alkb обнаружить вирусный геном скорее весь являться обычный домен репарация днк рнк защищать вирусный рнк геном метилировать соединение окружающий среда

биоинформатический картирование домен гомология alkb вирус

wnnsmx60

Борьба с новыми инфекционными заболеваниями: является ли федеральная система препятствием для эффективных законов?

В 1980-х и 1990-х годах ВИЧ/СПИД был новым инфекционным заболеванием. В 2003–2004 годах мы стали свидетелями появления атипичной пневмонии, птичьего гриппа и сибирской язвы в искусственно созданной форме, которая использовалась для биотерроризма. Законодательство о чрезвычайных полномочиях в Австралии представляет собой смесь карантинных законов Содружества и чрезвычайных полномочий штатов и территорий в законодательстве об общественном здравоохранении. Настало время пересмотреть такое законодательство и рассмотреть его эффективность с точки зрения всей страны в эпоху, когда нам приходится учитывать возможность массовых вспышек инфекционных заболеваний, которые игнорируют границы юрисдикций.

1980 х 1990 х год вич спид новый инфекционный заболевание 2003 2004 год стать свидетель появление атипичный пневмония птичий грипп сибирский язва искусственно создать форма использоваться биотерроризм законодательство чрезвычайный полномочие австралия представлять смесь карантинный закон содружество чрезвычайный полномочие штат территория законодательство общественный здравоохранение настать время пересмотреть законодательство рассмотреть эффективность точка зрение весь страна эпоха приходиться учитывать возможность массовый вспышка инфекционный заболевание игнорировать граница юрисдикция

борьба новый инфекционный заболевание являться федеральный система препятствие эффективный закон

gdsfkw1b

Секреция белка в Lactococcus lactis: эффективный способ увеличения общей продукции гетерологичного белка

Lactococcus lactis, модельная молочнокислая бактерия (МКБ), является пищевой и хорошо изученной грамположительной бактерией. Это хороший кандидат для доставки гетерологичного белка в пищевые продукты или в пищеварительный тракт. Л. lactis также может использоваться в качестве производителя белка в ферментере. Многие гетерологичные белки уже были получены в L. lactis, но только несколько отчетов позволяют сравнивать выходы продукции для данного белка, либо продуцируемого внутриклеточно, либо секретируемого в среду. Здесь мы рассмотрим несколько работ, оценивающих влияние локализации на выход продукции нескольких гетерологичных белков, продуцируемых в L. лактис. Вопросы ограничений по размеру, конформации и протеолиза рассматриваются и обсуждаются с учетом выхода белка. Эти данные показывают, что i) секреция предпочтительнее цитоплазматической продукции; ii) усиление секреции (путем оптимизации сигнального пептида и пропептида) приводит к увеличению выхода продукции; iii) конформация белка, а не его размер, может ухудшить секрецию и, таким образом, изменить выход продукции; и iv) слияние стабильного белка может стабилизировать лабильные белки. Обсуждается роль внутриклеточного протеолиза гетерологичных цитоплазматических белков и предшественников. Теперь новыми задачами являются разработка систем пищевого качества, а также идентификация и оптимизация факторов хозяина, влияющих на выработку гетерологичного белка не только в L. lactis, но и у других видов молочнокислых бактерий.

lactococcus lactis модельный молочнокислый бактерия мкб являться пищевой изучить грамположительный бактерия это хороший кандидат доставка гетерологичный белок пищевой продукт пищеварительный тракт л lactis также мочь использоваться качество производитель белок ферментёр многие гетерологичный белка получить l lactis несколько отчёт позволять сравнивать выход продукция данный белок либо продуцировать внутриклеточный либо секретировать среда рассмотреть несколько работа оценивать влияние локализация выход продукция несколько гетерологичный белок продуцировать l лактис вопрос ограничение размер конформация протеолиз рассматриваться обсуждаться учёт выход белок дать показывать i секреция предпочтительный цитоплазматический продукция ii усиление секреция путём оптимизация сигнальный пептид пропептид приводить увеличение выход продукция iii конформация белок размер мочь ухудшить секреция образ изменить выход продукция iv слияние стабильный белок мочь стабилизировать лабильный белка обсуждаться роль внутриклеточный протеолиз гетерологичный цитоплазматический белок предшественник новый задача являться разработка система пищевой качество также идентификация оптимизация фактор хозяин влиять выработка гетерологичный белок l lactis вид молочнокислый бактерия

секреция белок lactococcus lactis эффективный способ увеличение общий продукция гетерологичный белок

yba7mdtb

Обнаружение и характеристика горизонтальных переносов у прокариот с использованием геномной сигнатуры

Горизонтальный перенос ДНК является важным фактором эволюции и участвует в биологическом разнообразии. К сожалению, местоположение и протяженность горизонтальных переносов (ГП) известны лишь для немногих видов. Было показано, что использование коротких олигонуклеотидов в последовательности (так называемая геномная сигнатура) является видоспецифичным даже для фрагментов ДНК длиной всего 1 кб. Поэтому геномная сигнатура предлагается в качестве инструмента для обнаружения ГТ. Поскольку перенос ДНК происходит от видов, сигнатура которых отличается от сигнатуры вида-реципиента, анализ локальных вариаций сигнатуры вдоль генома реципиента может позволить обнаружить экзогенную ДНК. Стратегия заключается в (i) сканировании генома с помощью скользящего окна и вычислении соответствующей локальной сигнатуры, (ii) оценке ее отклонения от сигнатуры всего генома и (iii) поиске похожих сигнатур в базе данных геномных сигнатур. Всего таким образом проанализировано 22 генома прокариот. Было отмечено, что в среднем нетипичные регионы составляют около 6% каждого генома. Обнаружено большинство заявленных ГТ, а также новых. Происхождение предполагаемых переносов ДНК изучается среди примерно 12 000 видов. Предлагаются и иногда настоятельно рекомендуются виды-доноры, учитывая сходство сигнатур. Среди изученных видов Bacillus subtilis, Haemophilus Influenzae и Escherichia coli изучаются многими авторами и дают возможность провести тщательное сравнение большинства методов биоинформатики, используемых для обнаружения ГТ.

горизонтальный перенос днк являться важный фактор эволюция участвовать биологический разнообразие сожаление местоположение протяжённость горизонтальный перенос гп известный лишь немногий вид показать использование короткий олигонуклеотид последовательность называть геномный сигнатура являться видоспецифичный фрагмент днк длина весь 1 кб поэтому геномный сигнатура предлагаться качество инструмент обнаружение гт поскольку перенос днк происходить вид сигнатура отличаться сигнатура вид реципиент анализ локальный вариация сигнатура вдоль геном реципиент мочь позволить обнаружить экзогенный днк стратегия заключаться i сканирование геном помощь скользящий окно вычисление соответствовать локальный сигнатура ii оценка отклонение сигнатура весь геном iii поиск похожий сигнатура база данные геномный сигнатура весь образ проанализировать 22 геном прокариот отметить среднее нетипичный регион составлять около 6 каждый геном обнаружить большинство заявить гт также новый происхождение предполагать перенос днк изучаться среди примерно 12 000 вид предлагаться настоятельно рекомендоваться вид донор учитывать сходство сигнатура среди изучить вид bacillus subtilis haemophilus influenzae escherichia coli изучаться многий автор давать возможность провести тщательный сравнение большинство метод биоинформатика использовать обнаружение гт

обнаружение характеристика горизонтальный перенос прокариот использование геномный сигнатура

bbvxu8op

Сравнение зондов замены, вставки и удаления для повторного секвенирования и мутационного анализа с использованием олигонуклеотидных микрочипов

Хотя олигонуклеотидные зонды, комплементарные заменам отдельных нуклеотидов, обычно используются в скрининге генетической изменчивости на основе микрочипов, мало что известно о гибридизационных свойствах зондов, комплементарных небольшим вставкам и делециям. Необходимо определить гибридизационные свойства этих последних зондов, чтобы улучшить специфичность и чувствительность мутационного анализа генов, связанных с заболеваниями, на основе олигонуклеотидных микрочипов. В данной работе мы сравниваем и сопоставляем гибридизационные свойства олигонуклеотидных микрочипов, состоящих из 25-мерных зондов, комплементарных всем возможным заменам и вставкам отдельных нуклеотидов, а также делециям одного и двух оснований в кодирующей области гена ATM (мутантный при атаксии-телеангиэктазии) длиной 9168 п.н. К этим микрочипам были применены более 68 различных меченых красителем одноцепочечных нуклеиновых кислот-мишеней, представляющих все кодирующие экзоны ATM. Мы оцениваем специфичность гибридизации, сравнивая относительные сигналы гибридизации от зондов, идеально соответствующих последовательностям ATM, с теми, которые содержат несоответствия. Зонды, комплементарные двухосновным заменам, продемонстрировали самую высокую среднюю специфичность, за ними следуют зонды, комплементарные одноосновным заменам, одноосновным делециям и одноосновным вставкам. Во всех случаях на специфичность гибридизации сильно влияли контекст последовательности и возможная внутри- и межмолекулярная структура зонда и/или мишени. Более того, зонды с заменой одного нуклеотида продемонстрировали наиболее последовательные данные специфичности гибридизации, за которыми следуют зонды с делециями одного основания, зонды с делециями двух оснований и зонды с вставками одного нуклеотида. В целом, эти исследования предоставляют ценные эмпирические данные, которые можно использовать для более точного моделирования свойств гибридизации зондов вставки и делеции, а также для улучшения дизайна и интерпретации ресеквенирования и мутационного анализа на основе микрочипов олигонуклеотидов.

хотя олигонуклеотидный зонд комплементарный замена отдельный нуклеотид обычно использоваться скрининг генетический изменчивость основа микрочип мало известно гибридизационный свойство зонд комплементарный небольшой вставка делеция необходимо определить гибридизационный свойство последний зонд улучшить специфичность чувствительность мутационный анализ ген связанный заболевание основа олигонуклеотидный микрочип дать работа сравнивать сопоставлять гибридизационный свойство олигонуклеотидный микрочип состоять 25 мерный зонд комплементарный весь возможный замена вставка отдельный нуклеотид также делеция основание кодировать область ген atm мутантный атаксия телеангиэктазия длина 9168 п н это микрочип применить 68 различный меченый краситель одноцепочечный нуклеиновый кислота мишень представлять всё кодировать экзон atm оценивать специфичность гибридизация сравнивать относительный сигнал гибридизация зонд идеально соответствующий последовательность atm содержать несоответствие зонд комплементарный двухосновный замена продемонстрировать самый высокий средний специфичность следовать зонд комплементарный одноосновный замена одноосновный делеция одноосновный вставка весь случай специфичность гибридизация сильно влиять контекст последовательность возможный внутри межмолекулярный структура зонд мишень зонд замена нуклеотид продемонстрировать наиболее последовательный дать специфичность гибридизация следовать зонд делеция основание зонд делеция основание зонд вставка нуклеотид целое исследование предоставлять ценный эмпирический дать использовать точный моделирование свойство гибридизация зонд вставка делеция также улучшение дизайн интерпретация ресеквенирование мутационный анализ основа микрочип олигонуклеотид

сравнение зонд замена вставка удаление повторный секвенирование мутационный анализ использование олигонуклеотидный микрочип

e62cfqt7

Ген, кодирующий специфичную для сиаловой кислоты 9-O-ацетилэстеразу, обнаружен в яичках взрослого человека

Используя дифференциальную дисплейную ОТ-ПЦР, мы идентифицировали ген размером 2750 п.н. из яичек взрослого человека, названный H-Lse, который кодирует предполагаемый белок из 523 аминокислот и молекулярной массой 58 кДа со структурными характеристиками, аналогичными характеристиками специфической для сиаловой кислоты лизосом мыши 9-O-ацетилэстеразы. Анализ методом нозерн-блоттинга показал широкое распространение H-Lse в различных тканях человека с высокой экспрессией в яичках, предстательной железе и толстой кишке. Результаты гибридизации in situ показали, что, хотя H-Lse не был обнаружен в эмбриональных яичках, положительные сигналы были обнаружены в сперматоцитах, но не в сперматогониях во взрослых яичках человека. Субклеточная локализация H-Lse была визуализирована с помощью зеленого флуоресцентного белка (GFP), слитого с аминоконцом H-Lse, что показало компартментализацию H-Lse в крупных плотных везикулах, предположительно лизосомах, в цитоплазме. Регулируемая развитием и специфичная для сперматогенной стадии экспрессия H-Lse предполагает его возможное участие в развитии яичек и/или дифференцировке половых клеток.

использовать дифференциальный дисплейный пцр идентифицировать ген размер 2750 п н яичко взрослый человек назвать h lse кодировать предполагать белок 523 аминокислота молекулярный масса 58 кда структурный характеристика аналогичный характеристика специфический сиаловой кислота лизосома мышь 9 o ацетилэстераза анализ метод нозерна блоттинг показать широкий распространение h lse различный ткань человек высокий экспрессия яичко предстательный железа толстой кишка результат гибридизация in situ показать хотя h lse обнаружить эмбриональный яичко положительный сигнал обнаружить сперматоцит сперматогония взрослый яичко человек субклеточный локализация h lse визуализировать помощь зелёный флуоресцентный белок gfp слить аминоконец h lse показать компартментализация h lse крупный плотный везикула предположительно лизосома цитоплазма регулировать развитие специфичный сперматогенный стадия экспрессия h lse предполагать возможный участие развитие яичко дифференцировка половой клетка

ген кодировать специфичный сиаловой кислота 9 o ацетилэстераза обнаружить яичко взрослый человек

4cvy9u28

Роль тучных клеток в патогенезе боли при хроническом панкреатите

ПРЕДЫСТОРИЯ: Биологическая основа боли при хроническом панкреатите изучена недостаточно. Тучные клетки участвуют в патогенезе боли при других заболеваниях. Мы предположили, что тучные клетки играют роль в возникновении боли при хроническом панкреатите. Мы изучили связь боли с тучными клетками в образцах аутопсии пациентов с болезненным хроническим панкреатитом. Мы дополнительно изучили нашу гипотезу, используя экспериментальную модель хронического панкреатита, вызванного тринитробензолсульфоновой кислотой (TNBS), как у мышей дикого типа (WT), так и у мышей с дефицитом тучных клеток (MCDM). МЕТОДЫ: Были идентифицированы архивные ткани с гистологическим диагнозом хронического панкреатита и изучены клинические записи на предмет наличия или отсутствия зарегистрированных болей у людей. Подсчитывали количество тучных клеток. Наличие боли оценивалось с помощью нитей фон Фрея (VFF) для измерения реакции отдергивания брюшной полости у мышей WT и MCDM с хроническим панкреатитом и без него. РЕЗУЛЬТАТЫ: У людей с болезненным хроническим панкреатитом наблюдалось в 3,5 раза больше тучных клеток поджелудочной железы по сравнению с людьми с безболезненным хроническим панкреатитом. Мыши дикого типа с хроническим панкреатитом были значительно более чувствительны, что было оценено с помощью болевого теста живота VFF, по сравнению с мышами MCDM. ВЫВОД: У людей с болезненным хроническим панкреатитом наблюдается повышенное количество тучных клеток поджелудочной железы по сравнению с людьми с безболезненным хроническим панкреатитом. MCDM менее чувствительны к механической стимуляции живота после индукции хронического панкреатита по сравнению с WT. Тучные клетки могут играть важную роль в патогенезе боли при хроническом панкреатите.

предыстория биологический основа боль хронический панкреатит изучить недостаточно тучный клетка участвовать патогенез боль заболевание предположить тучный клетка играть роль возникновение боль хронический панкреатит изучить связь боль тучный клетка образец аутопсия пациент болезненный хронический панкреатит дополнительно изучить наш гипотеза использовать экспериментальный модель хронический панкреатит вызвать тринитробензолсульфонов кислота tnbs мышь дикий тип wt мышь дефицит тучный клетка mcdm метод идентифицировать архивный ткань гистологический диагноз хронический панкреатит изучить клинический запись предмет наличие отсутствие зарегистрировать боль человек подсчитывать количество тучный клетка наличие боль оцениваться помощь нить фон фрей vff измерение реакция отдёргивание брюшной полость мышь wt mcdm хронический панкреатит результат человек болезненный хронический панкреатит наблюдаться 3 5 большой тучный клетка поджелудочный железа сравнение человек безболезненный хронический панкреатит мышь дикий тип хронический панкреатит значительно чувствительный оценить помощь болевой тест живот vff сравнение мышь mcdm вывод человек болезненный хронический панкреатит наблюдаться повышенный количество тучный клетка поджелудочный железа сравнение человек безболезненный хронический панкреатит mcdm менее чувствительный механический стимуляция живот индукция хронический панкреатит сравнение wt тучный клетка мочь играть важный роль патогенез боль хронический панкреатит

роль тучный клетка патогенез боль хронический панкреатит

zowp10ts

Рекомбинация каждый день: обильная рекомбинация в вирусе во время заражения одного многоклеточного хозяина

Вирусная рекомбинация может существенно повлиять на эволюцию и эпидемиологию. У вирусов скорость рекомбинации зависит от частоты генетического обмена между различными вирусными геномами внутри инфицированной клетки-хозяина и от частоты возникновения таких коинфекций. Хотя скорость рекомбинации была недавно оценена в экспериментально коинфицированных клеточных культурах для нескольких вирусов, прямая количественная оценка на наиболее биологически значимом уровне, уровне инфицирования хозяина, все еще отсутствует. Данное исследование восполняет этот пробел, используя в качестве модели вирус мозаики цветной капусты. Мы распределили четыре нейтральных маркера по вирусному геному и совместно инокулировали растения-хозяева вирусами, содержащими маркеры, и вирусами дикого типа. Частоту рекомбинантных геномов оценивали через 21 день после инокуляции. В среднем более 50% вирусных геномов, восстановленных после заражения одного хозяина, были рекомбинантными, что ясно указывает на то, что рекомбинация очень часто встречается у этого вируса. Оценки скорости рекомбинации показывают, что все области генома в равной степени затронуты этим процессом. Предполагая, что в ходе нашего эксперимента произошло десять циклов репликации вируса — на основании данных о времени обнаружения белка оболочки — скорость рекомбинации на основание и цикл репликации составила порядка 2 × 10(−5) — 4 × 10(−5). Это первое определение скорости рекомбинации вируса во время заражения одного многоклеточного хозяина свидетельствует о том, что рекомбинация очень часто встречается в повседневной жизни этого вируса.

вирусный рекомбинация мочь существенно повлиять эволюция эпидемиология вирус скорость рекомбинация зависеть частота генетический обмен различный вирусный геном внутри инфицировать клетка хозяин частота возникновение коинфекция хотя скорость рекомбинация недавно оценить экспериментально коинфицировать клеточный культура несколько вирус прямой количественный оценка наиболее биологически значимый уровень уровень инфицирование хозяин всё ещё отсутствовать данный исследование восполнять пробел использовать качество модель вирус мозаика цветной капуста распределить четыре нейтральный маркер вирусный геном совместно инокулировать растение хозяин вирус содержать маркер вирус дикий тип частота рекомбинантный геном оценивать 21 день инокуляция среднее 50 вирусный геном восстановить заражение хозяин рекомбинантный ясно указывать рекомбинация очень часто встречаться это вирус оценка скорость рекомбинация показывать всё область геном равный степень затронуть это процесс предполагать ход наш эксперимент произойти десять цикл репликация вирус основание данные время обнаружение белок оболочка скорость рекомбинация основание цикл репликация составить порядок 2 10 5 4 10 5 это первый определение скорость рекомбинация вирус время заражение многоклеточный хозяин свидетельствовать рекомбинация очень часто встречаться повседневный жизнь это вирус

рекомбинация каждый день обильный рекомбинация вирус время заражение многоклеточный хозяин

5dk231qs

Торсионное ограничение: новый взгляд на псевдоузлы со сдвигом рамки

Псевдоузлы мРНК выполняют стимулирующую функцию в запрограммированном рибосомальном сдвиге рамки считывания -1 (-1 PRF). Хотя ранее мы представили модель того, как псевдоузлы мРНК могут активировать механизм −1 PRF, в ней не рассматривался вопрос о роли, которую они могут играть в позиционировании мРНК относительно рибосомы в этом процессе [E. П. Плант, К. Л. М. Джейкобс, Дж. В. Харгер, А. Мескаускас, Я. Л. Джейкобс, Дж. Л. Бакстер, А. Н. Петров и Я. Д. Динман (2003) РНК, 9, 168–174]. Отдельная модель «торсионного ограничения» предполагает, что псевдоузлы мРНК увеличивают долю рибосом, направленных на остановку, при этом расположенный выше гептамерный скользящий участок расположен в участках декодирования A и P рибосомы [J. Д. Динман (1995) Дрожжи, 11, 1115–1127]. В данном случае для проверки этой модели были проведены эксперименты с использованием серии «псевдо-псевдоузлов», имеющих различные степени вращательной свободы. Результаты данного исследования подтверждают механистическую гипотезу о том, что сдвиг рамки считывания рибосомы на −1 усиливается за счет сопротивления скручиванию псевдоузла мРНК.

псевдоузел мрнк выполнять стимулировать функция запрограммировать рибосомальный сдвиг рамка считывание 1 1 prf хотя ранее представить модель псевдоузел мрнк мочь активировать механизм 1 prf рассматриваться вопрос роль мочь играть позиционирование мрнк относительно рибосома это процесс e п плант л м джейкобс дж харгера мескаускас л джейкобс дж л бакстер н петров далее динман 2003 рнк 9 168 174 отдельный модель торсионный ограничение предполагать псевдоузел мрнк увеличивать доля рибосома направить остановка это расположить выше гептамерный скользящий участок расположить участок декодирование a p рибосома j далее динман 1995 дрожжи 11 1115 1127 данный случай проверка модель провести эксперимент использование серия псевдо псевдоузел иметь различный степень вращательный свобода результат данный исследование подтверждать механистический гипотеза сдвиг рамка считывание рибосома 1 усиливаться счёт сопротивление скручивание псевдоузел мрнк

торсионный ограничение новый взгляд псевдоузел сдвиг рамка

snqdma0s

Исправление ошибок в синтетической ДНК путем перетасовки консенсуса

Хотя существуют эффективные методы сборки синтетических олигонуклеотидов в гены и геномы, они страдают от наличия 1–3 случайных ошибок на кб ДНК. Здесь мы представляем новый метод, называемый консенсусным перетасовыванием, и демонстрируем его использование для значительного уменьшения случайных ошибок в синтетической ДНК. В этом методе ошибки выявляются как несоответствия путем повторной гибридизации популяции. ДНК фрагментируется, а несовпадающие фрагменты удаляются при связывании с иммобилизованным белком, связывающим несовпадающие основания (MutS). Сборка оставшихся фрагментов методом ПЦР дает новую популяцию полноразмерных последовательностей, обогащенных консенсусной последовательностью входной популяции. Мы показываем, что две итерации консенсусного перетасовывания улучшили популяцию клонов синтетического зеленого флуоресцентного белка (GFPuv) с ∼60 до >90% флуоресценции и снизили ошибки в 3,5–4,3 раза до конечных значений ∼1 ошибка на 3500 п.н. Кроме того, две итерации консенсусного перетасовывания скорректировали популяцию клонов GFPuv, где все члены были нефункциональными, до популяции, где 82% клонов были флуоресцентными. Консенсусное перетасовывание должно способствовать быстрому и точному синтезу длинных последовательностей ДНК.

хотя существовать эффективный метод сборка синтетический олигонуклеотид ген геном страдать наличие 1 3 случайный ошибка кб днк представлять новый метод называть консенсусный перетасовывание демонстрировать использование значительный уменьшение случайный ошибка синтетический днк это метод ошибка выявляться несоответствие путём повторный гибридизация популяция днк фрагментироваться несовпадающий фрагмент удаляться связывание иммобилизовать белок связывать несовпадающий основание muts сборка остаться фрагмент метод пцр давать новый популяция полноразмерный последовательность обогатить консенсусный последовательность входной популяция показывать итерация консенсусный перетасовывание улучшить популяция клон синтетический зелёный флуоресцентный белок gfpuv 60 90 флуоресценция снизить ошибка 3 5 4 3 конечный значение 1 ошибка 3500 п н кроме итерация консенсусный перетасовывание скорректировать популяция клон gfpuv всё член нефункциональный популяция 82 клон флуоресцентный консенсусный перетасовывание должный способствовать быстрый точный синтез длинный последовательность днк

исправление ошибка синтетический днк путём перетасовка консенсус

1pq6dkl5

На пути к стандартизации оценки качества РНК с использованием независимых от пользователя классификаторов следов микрокапиллярного электрофореза

Хотя общепризнано, что интактная РНК является наилучшим отражением устойчивого состояния транскрипции, не существует золотого стандарта для определения качества РНК перед анализом экспрессии генов. В этом отчете мы оценили надежность традиционных методов оценки качества РНК, включая УФ-спектроскопию и соотношение площадей 28S:18S, и продемонстрировали их противоречивость. Затем мы использовали два новых свободно доступных классификатора — системы Degradometer и RIN — для получения независимых от пользователя показателей качества РНК на основе анализа следов микрокапиллярного электрофореза. Обе системы предоставили высокоинформативные и ценные данные, а результаты оказались в высокой степени коррелированными, при этом система RIN предоставила более надежные данные. Значимость показателей качества РНК для оценки различий в экспрессии генов была проверена с помощью количественной ПЦР, которая выявила значительное снижение относительной экспрессии генов в образцах РНК разного качества, в то время как образцы схожей, даже плохой целостности, были признаны весьма сопоставимыми. Мы обсуждаем последствия этих наблюдений для минимизации артефактного обнаружения ложноположительной и отрицательной дифференциальной экспрессии из-за различий в целостности РНК и предлагаем схему разработки стандартной операционной процедуры с дополнительной регистрацией показателей целостности РНК в публичных репозиториях данных об экспрессии генов.

хотя общепризнать интактный рнк являться хороший отражение устойчивый состояние транскрипция существовать золотой стандарт определение качество рнк анализ экспрессия ген это отчёт оценить надёжность традиционный метод оценка качество рнк включая уф спектроскопия соотношение площадь 28s 18s продемонстрировать противоречивость затем использовать новый свободно доступный классификатор система degradometer rin получение независимый пользователь показатель качество рнк основа анализ след микрокапиллярный электрофорез оба система предоставить высокоинформативный ценный дать результат оказаться высокий степень коррелированный это система rin предоставить надёжный дать значимость показатель качество рнк оценка различие экспрессия ген проверить помощь количественный пцр выявить значительный снижение относительный экспрессия ген образец рнк разный качество время образец схожий плохой целостность признать весьма сопоставимый обсуждать последствие наблюдение минимизация артефактный обнаружение ложноположительный отрицательный дифференциальный экспрессия различие целостность рнк предлагать схема разработка стандартный операционный процедура дополнительный регистрация показатель целостность рнк публичный репозиторий данные экспрессия ген

путь стандартизация оценка качество рнк использование независимый пользователь классификатор след микрокапиллярный электрофорез

754nln40

Факторы, влияющие на трансляцию в запрограммированном −1 рибосомном сайте сдвига рамки считывания РНК вируса крапчатости ежи сборной in vivo

Соотношение между белками P27 и репликазой вируса крапчатости ежи сборной (CfMV) регулируется посредством запрограммированного сдвига рамки считывания рибосом на −1 (−1 PRF). Минимальный сигнал сдвига рамки считывания со скользким гептамером U UUA AAC и нижестоящей структурой «стебель-петля» был вставлен в двойной репортерный вектор и направлен на −1 PRF с эффективностью 14,4 ± 1,9% в дрожжах и 2,4 ± 0,7% в бактериях. Последовательность CfMV, кодирующая P27 и фланкирующая минимальный сигнал сдвига рамки, вызывала примерно двукратное увеличение эффективности −1 PRF как у дрожжей, так и у бактерий. Помимо ожидаемых белков слияния, в дрожжевых клетках были обнаружены продукты терминации, предположительно заканчивающиеся в месте сдвига рамки считывания. Мы предполагаем, что количество преждевременной терминации трансляции из контрольных мРНК сыграло роль в определении расчетной эффективности −1PRF. Совместная экспрессия CfMV P27 с двойным репортерным вектором, содержащим минимальный сигнал сдвига рамки считывания, снизила продукцию нижестоящего репортера, тогда как совместная экспрессия репликазы не имела выраженного эффекта. Это открытие позволяет нам предположить, что белок CfMV P27 может влиять на трансляцию в месте сдвига рамки считывания, но механизм еще предстоит выяснить.

соотношение белок p27 репликаза вирус крапчатость ежи сборная cfmv регулироваться посредством запрограммировать сдвиг рамка считывание рибосома 1 1 prf минимальный сигнал сдвиг рамка считывание скользкий гептамер u uua aac нижестоящий структура стебель петлить вставить двойной репортерный вектор направить 1 prf эффективность 14 4 1 9 дрожжи 2 4 0 7 бактерия последовательность cfmv кодировать p27 фланкировать минимальный сигнал сдвиг рамка вызывать примерно двукратный увеличение эффективность 1 prf дрожжи бактерия помимо ожидать белок слияние дрожжев клетка обнаружить продукт терминация предположительно заканчиваться место сдвиг рамка считывание предполагать количество преждевременный терминация трансляция контрольный мрнк сыграть роль определение расчётный эффективность 1prf совместный экспрессия cfmv p27 двойной репортерный вектор содержать минимальный сигнал сдвиг рамка считывание снизить продукция нижестоящий репортёр совместный экспрессия репликаз иметь выраженный эффект это открытие позволять предположить белок cfmv p27 мочь влиять трансляция место сдвиг рамка считывание механизм ещё предстоять выяснить

фактор влиять трансляция запрограммировать 1 рибосомный сайт сдвиг рамка считывание рнк вирус крапчатость ежи сборная in vivo

p34ezktf

Политика здравоохранения Австралии в 2003–2004 гг.

В Австралии, по сравнению с другими развитыми странами, многочисленные и разнообразные программы, составляющие общественное здравоохранение, по-прежнему финансируются недостаточно и несистематически, особенно с учетом объема публично выраженной политической поддержки. В 2003 году основные события в политике общественного здравоохранения в области контроля инфекционных заболеваний были связаны с атипичной пневмонией и финансированием вакцинации, в то время как TGA сосредоточила свое внимание на панфармацевтическом кризисе. Были одобрены программы, направленные на поддержание здоровья и здоровое старение. Сектор высшего образования участвовал в разработке программ обучения кадров общественного здравоохранения и новых профессиональных квалификаций и компетенций. Отчет Абельсона получил поддержку зарубежных экспертов, предоставив потенциальную платформу для призывов к улучшению национального финансирования будущих австралийских профилактических программ. Однако во всех юрисдикциях сохранялись противоречия в подходах к решению национальных приоритетов в области здравоохранения. Несмотря на то, что 2004 год был годом выборов, политика в области общественного здравоохранения не была заметной, поскольку основная часть финансирования общественного здравоохранения, предусмотренного в федеральном бюджете 2004/05 года, была направлена ​​на управление такими новыми рисками, как птичий грипп. В заключение мы предлагаем несколько выводов на будущее.

австралия сравнение развитой страна многочисленный разнообразный программа составлять общественный здравоохранение прежний финансироваться недостаточно несистематически особенно учёт объём публично выраженный политический поддержка 2003 год основной событие политика общественный здравоохранение область контроль инфекционный заболевание связать атипичный пневмония финансирование вакцинация время tga сосредоточить свой внимание панфармацевтический кризис одобрить программа направить поддержание здоровье здоровый старение сектор высокий образование участвовать разработка программа обучение кадр общественный здравоохранение новый профессиональный квалификация компетенция отчёт абельсон получить поддержка зарубежный эксперт предоставить потенциальный платформа призыв улучшение национальный финансирование будущий австралийский профилактический программа однако весь юрисдикция сохраняться противоречие подход решение национальный приоритет область здравоохранение несмотря 2004 год год выборы политика область общественный здравоохранение заметный поскольку основный часть финансирование общественный здравоохранение предусмотренный федеральный бюджет 2004 05 год направить управление новый риск птичий грипп заключение предлагать несколько вывод будущее

политика здравоохранение австралия 2003 2004 год

l3z27806

GIDEON: комплексный веб-ресурс по географической медицине

GIDEON (Глобальная сеть инфекционных заболеваний и эпидемиологии) — это веб-программа, предназначенная для поддержки принятия решений и информатики в области географической медицины. Первый из четырех интерактивных модулей генерирует ранжированную дифференциальную диагностику на основе признаков пациента, симптомов, истории контакта и страны приобретения заболевания. Дополнительные возможности включают возможность наблюдения за синдромными заболеваниями и моделирование сценариев биотерроризма. Второй модуль обеспечивает доступ к подробной и актуальной информации о состоянии 338 отдельных заболеваний в каждой из 220 стран. Более 50 000 изображений болезней, карт и созданных пользователями графиков можно загрузить для использования в обучении и подготовке письменных материалов. Третий модуль представляет собой комплексный источник информации об использовании 328 противоинфекционных препаратов и вакцин, включая список более 9500 международных торговых наименований. Четвертый модуль можно использовать для характеристики или идентификации любой бактерии или дрожжей на основе лабораторного фенотипа. GIDEON — это современный и всеобъемлющий ресурс по географической медицине.

gideon глобальный сеть инфекционный заболевание эпидемиология это веб программа предназначить поддержка принятие решение информатика область географический медицина первый четыре интерактивный модуль генерировать ранжировать дифференциальный диагностик основа признак пациент симптом история контакт страна приобретение заболевание дополнительный возможность включать возможность наблюдение синдромный заболевание моделирование сценарий биотерроризм второй модуль обеспечивать доступ подробный актуальный информация состояние 338 отдельный заболевание каждый 220 страна 50 000 изображение болезнь карта создать пользователь график загрузить использование обучение подготовка письменный материал третий модуль представлять комплексный источник информация использование 328 противоинфекционный препарат вакцина включая список 9500 международный торговый наименование четвёртый модуль использовать характеристика идентификация любой бактерия дрожжи основа лабораторный фенотип gideon это современный всеобъемлющий ресурс географический медицина

gideon комплексный веб ресурс географический медицина

yz2wbpuu

Глобализация и здоровье

В этой дебютной редакционной статье журнала «Глобализация и здоровье» представлен журнал, кратко описаны его цели и задачи, а также обозначен круг его тем. Ожидается, что публикация в формате «открытого доступа» станет все более важным форматом для рецензируемых научных журналов, и то, что «Глобализация и здравоохранение» — это «открытый доступ», вполне уместно. Основание для создания журнала, посвященного глобализации и здоровью, имеет три причины: Во-первых: глобализация меняет социальную географию, в рамках которой мы можем стремиться к укреплению здоровья или профилактике заболеваний. Факторы, определяющие здоровье, — будь то вирус атипичной пневмонии или пристрастие к жирной пище — присоединились к нам в нашей глобальной мобильности. Под влиянием экономической либерализации и меняющихся технологий феномен «доступа», скорее всего, будет все больше доминировать в разворачивающемся опыте болезней и благополучия человека. Во-вторых: понимание глобализации как предмета само по себе требует определенных критериев и барометров ее успехов и неудач. Здоровье — один из таких барометров. Это маркер социальной инфраструктуры и социального благополучия, и как таковой он может использоваться как для подачи сигнала тревоги, так и для торжества, поскольку наша взаимосвязанность одновременно вредит и исцеляет население, которому мы служим. И последнее: в той же степени, в какой глобализация может оказывать влияние на здоровье, верно и то, что здоровье и болезни оказывают влияние на глобализацию, примером чего является существование карантинных законов и разрушительные экономические последствия пандемии СПИДа. Сбалансированный взгляд предполагает, что влияние глобализации на здоровье (и системы здравоохранения) не является ни всецело положительным, ни отрицательным, а скорее зависит от контекста. Если диалог, касающийся глобализации, должен быть направлен или предвзят в каком-либо направлении, то он должен быть следующим: мы должны в первую очередь думать о бедных.

дебютный редакционный статья журнал глобализация здоровье представить журнал кратко описать цель задача также обозначить круг ожидаться публикация формат открытый доступ стать всё важный формат рецензировать научный журнал глобализация здравоохранение это открытый доступ вполне уместно основание создание журнал посвятить глобализация здоровье иметь причина первый глобализация менять социальный география рамка мочь стремиться укрепление здоровье профилактика заболевание фактор определять здоровье вирус атипичный пневмония пристрастие жирный пища присоединиться наш глобальный мобильность влияние экономический либерализация меняться технология феномен доступ скорее весь всё большой доминировать разворачиваться опыт болезнь благополучие человек второй понимание глобализация предмет требовать определённый критерий барометр успех неудача здоровье барометр это маркёр социальный инфраструктура социальный благополучие таковой мочь использоваться подача сигнал тревога торжество поскольку наш взаимосвязанность одновременно вредить исцелять население служить последний степень глобализация мочь оказывать влияние здоровье верно здоровье болезнь оказывать влияние глобализация пример являться существование карантинный закон разрушительный экономический последствие пандемия спид сбалансированный взгляд предполагать влияние глобализация здоровье система здравоохранение являться всецело положительный отрицательный скорее зависеть контекст диалог касаться глобализация должный направить предвзятый либо направление должный следующий должный первый очередь думать бедный

глобализация здоровье

kvhoa2se

«Полисемичный» кодон — кодон с множественным назначением аминокислот, вызванным двойной специфичностью идентичности тРНК.

У некоторых видов Candida универсальный кодон лейцина CUG транслируется как серин. Однако в большинстве случаев сериновые тРНК, ответственные за это неуниверсальное декодирование (тРНК(Ser)CAG), принимают in vitro не только серин, но и, в некоторой степени, лейцин. Эксперименты по замене нуклеотидов показали, что m1G37 имеет решающее значение для активности лейцилирования. Это открытие подтверждается тем фактом, что тРНК(Сер)ЦАГ, обладающие лейцилирующей активностью, всегда имеют m1G37, тогда как у Candida cylindracea, не обладающей лейцилирующей активностью, имеется A37. Количественное определение определенных аминоацетилированных тРНК в клетках показало, что 3% тРНК(Ser)CAG, содержащих m1G37, фактически были заряжены лейцином in vivo. Генетический подход с использованием ауксотрофного мутанта C.maltosa, обладающего этим типом тРНК(Ser)CAG, также предполагает, что ген URA3, инактивированный из-за трансляции CUG как серина, был восстановлен путем небольшого включения лейцина в полипептид, что показало, что тРНК, нагруженная несколькими аминокислотами, может участвовать в трансляции. Эти результаты являются первым доказательством того, что две различные аминокислоты соответствуют одному кодону, что естественным образом происходит в процессе трансляции у некоторых видов Candida. Мы называем этот новый тип кодона «полисемичным кодоном».

некоторый вид candida универсальный кодон лейцин cug транслироваться серин однако большинство случай сериновое трнк ответственный это неуниверсальный декодирование трнк ser cag принимать in vitro серин некоторый степень лейцин эксперимент замена нуклеотид показать m1g37 иметь решающий значение активность лейцилирование это открытие подтверждаться факт трнк сера цаг обладать лейцилировать активность иметь m1g37 candida cylindracea обладать лейцилировать активность иметься a37 количественный определение определённый аминоацетилировать трнк клетка показать 3 трнк ser cag содержать m1g37 фактически зарядить лейцин in vivo генетический подход использование ауксотрофный мутант c maltosa обладать это тип трнк ser cag также предполагать ген ura3 инактивированный трансляция cug серин восстановить путём небольшой включение лейцин полипептид показать трнк нагрузить несколько аминокислота мочь участвовать трансляция результат являться первый доказательство различный аминокислота соответствовать кодон естественный образ происходить процесс трансляция некоторый вид candida называть новый тип кодон полисемичный кодон

полисемичный кодон кодон множественный назначение аминокислота вызвать двойной специфичность идентичность трнк

cgl34ykt

Универсальная система рекомбинации РНК на основе BMV — как искать общие правила в рекомбинации РНК

В настоящее время нет сомнений в том, что рекомбинация РНК является одним из основных факторов, ответственных за возникновение новых РНК-вирусов и ретровирусов. Для исследования этого сложного явления было создано множество экспериментальных систем. В результате у нескольких вирусов были выявлены специфические структурные мотивы РНК, опосредующие рекомбинацию. К сожалению, до сих пор не сформулирована единая модель генетической РНК-рекомбинации, что обусловлено, прежде всего, трудностями прямого сравнения данных, полученных для разных РНК-содержащих вирусов. Для решения этой проблемы мы попытались создать универсальную систему, в которой можно было бы тестировать рекомбинационную активность различных последовательностей РНК. Для этой цели мы использовали вирус мозаики костра, модельный (+)РНК-вирус растений, для которого структурные требования к рекомбинации РНК хорошо определены. Эффективность новой гомомолекулярной системы была доказана в эксперименте с двумя последовательностями РНК, полученными из генома вируса гепатита С. Кроме того, сравнение данных, полученных с помощью гомомолекулярной системы, с данными, полученными ранее с использованием гетеромолекулярной системы, предоставило новые доказательства того, что механизмы гомологичной и негомологичной рекомбинации различны и зависят от способа репликации вируса.

настоящий время сомнение рекомбинация рнк являться основный фактор ответственный возникновение новый рнк вирус ретровирус исследование это сложный явление создать множество экспериментальный система результат несколько вирус выявить специфический структурный мотив рнк опосредовать рекомбинация сожаление сей пора сформулировать единый модель генетический рнк рекомбинация обусловить прежде весь трудность прямой сравнение данные получить разный рнк содержать вирус решение проблема попытаться создать универсальный система тестировать рекомбинационный активность различный последовательность рнк цель использовать вирус мозаика костёр модельный рнк вирус растение структурный требование рекомбинация рнк определить эффективность новый гомомолекулярный система доказать эксперимент последовательность рнк получить геном вирус гепатит кроме сравнение данные получить помощь гомомолекулярный система данные получить ранее использование гетеромолекулярный система предоставить новый доказательство механизм гомологичный негомологичный рекомбинация различный зависеть способ репликация вирус

универсальный система рекомбинация рнк основа bmv искать общий правило рекомбинация рнк

ajlctjeb

Нейтрофильная эластаза, кислотонезависимая сериновая протеаза, облегчает снятие оболочки реовируса и инфицирование промоноцитарных клеток U937

ПРЕДЫСТОРИЯ: Реовирусы млекопитающих естественным образом заражают своих хозяев через кишечный и дыхательный тракты. При кишечных инфекциях протеолиз внешнего капсидного белка реовируса σ3 опосредуется сериновыми протеазами поджелудочной железы. Напротив, протеазы, имеющие решающее значение для репликации реовируса в легких, неизвестны. Нейтрофильная эластаза (НЭ) — кислотонезависимая воспалительная сериновая протеаза, преимущественно экспрессируемая нейтрофилами. Помимо своей обычной роли в микробной защите, аномальная экспрессия NE может быть связана с патологией острого респираторного дистресс-синдрома (ОРДС). Поскольку репликация реовируса в легких грызунов вызывает симптомы, похожие на ОРДС, и вызывает инфильтрацию нейтрофилов, мы исследовали способность NE способствовать раздеванию вириона реовируса. РЕЗУЛЬТАТЫ: Клеточная линия человеческих промоноцитов U937 экспрессирует NE. Обработка клеток U937 ингибитором цистеиновой протеазы широкого спектра действия E64 [транс-эпоксисукцинил-L-лейциламидо-(4-гуанидино)бутан] и агентами, повышающими везикулярный pH, не подавляла репликацию реовируса. Даже при использовании этих ингибиторов в комбинации реовирус реплицировался со значительным выходом, что указывает на то, что кислотонезависимая нецистеиновая протеаза способна опосредовать снятие оболочки реовируса в культурах клеток U937. Для идентификации ответственной протеазы(-ий) клетки U937 обрабатывали форбол-12-миристат-13-ацетатом (ФМА), агентом, который индуцирует клеточную дифференциацию и приводит к снижению экспрессии кислотонезависимых сериновых протеаз, включая NE и катепсин (Cat) G. В присутствии E64 реовирус не размножался эффективно в клетках, обработанных PMA. Для непосредственной оценки роли NE в реовирусной инфекции клеток U937 мы исследовали рост вируса в присутствии хлорметилкетона N-Ala-Ala-Pro-Val, специфического ингибитора NE. Репликация реовируса в присутствии E64 была значительно снижена при обработке клеток ингибитором NE. Инкубация вирионов с очищенным NE привела к образованию инфекционных субвирусных частиц, не требующих дополнительного внутриклеточного протеолиза. ВЫВОД: Наши результаты показывают, что NE может способствовать реовирусной инфекции. Тот факт, что это происходит в присутствии агентов, повышающих везикулярный pH, подтверждает модель, в которой потребность в кислом pH во время инфекции отражает условия, необходимые для оптимальной активности протеазы. Способность реовируса использовать NE может влиять на репликацию вируса в легких и других тканях во время естественных инфекций.

предыстория реовирус млекопитающее естественный образ заражать свой хозяин кишечный дыхательный тракт кишечный инфекция протеолиз внешний капсидный белок реовирус σ3 опосредоваться сериновое протеаз поджелудочный железа напротив протеаза иметь решающий значение репликация реовирус лёгкий неизвестный нейтрофильный эластаз нэ кислотонезависить воспалительный сериновый протеаза преимущественно экспрессировать нейтрофил помимо свой обычный роль микробный защита аномальный экспрессия ne мочь связать патология острый респираторный дистресс синдром ордс поскольку репликация реовирус лёгкий грызун вызывать симптом похожий ордс вызывать инфильтрация нейтрофил исследовать способность ne способствовать раздевание вирион реовирус результат клеточный линия человеческий промоноцит u937 экспрессировать ne обработка клетка u937 ингибитор цистеинов протеаза широкий спектр действие e64 транс эпоксисукцинить l лейциламидо 4 гуанидино бутан агент повышать везикулярный ph подавлять репликация реовирус использование ингибитор комбинация реовирус реплицироваться значительный выход указывать кислотонезависить нецистеиновый протеаза способный опосредовать снятие оболочка реовирус культура клетка u937 идентификация ответственный протеаза ия клетка u937 обрабатывать форбол 12 миристат 13 ацетат фма агент индуцировать клеточный дифференциация приводить снижение экспрессия кислотонезависить сериновое протеаза включая ne катепсиный cat g присутствие e64 реовирус размножаться эффективно клетка обработать pma непосредственный оценка роль ne реовирусный инфекция клетка u937 исследовать рост вирус присутствие хлорметилкетон n ala ala pro val специфический ингибитор ne репликация реовирус присутствие e64 значительно снизить обработка клетка ингибитор ne инкубация вирион очистить ne привести образование инфекционный субвирусный частица требовать дополнительный внутриклеточный протеолиз вывод наш результат показывать ne мочь способствовать реовирусный инфекция факт это происходить присутствие агент повышать везикулярный ph подтверждать модель потребность кислый ph время инфекция отражать условие необходимый оптимальный активность протеаза способность реовирус использовать ne мочь влиять репликация вирус лёгкий ткань время естественный инфекция

нейтрофильный эластаз кислотонезависить сериновый протеаза облегчать снятие оболочка реовирус инфицирование промоноцитарный клетка u937

cl9gpt9w

Влияние заблокированных остатков нуклеиновых кислот на термодинамические свойства 2′-O-метил РНК/РНК гетеродуплексов

Сообщается о влиянии остатков заблокированных нуклеиновых кислот (LNA) на термодинамические свойства 2′-O-метил РНК/РНК-гетеродуплексов. Исследования оптического плавления показывают, что LNA, включенный в 2′-O-метилированный РНК-олигонуклеотид, обычно, но не всегда, повышает стабильность комплементарных дуплексов, образованных с РНК. Очевидны несколько тенденций, в том числе: (i) 3′-концевой U LNA и 5′-концевой LNA обладают меньшей стабилизацией, чем внутренние и другие 3′-концевые LNA; (ii) большая часть повышения стабильности достигается, когда нуклеотиды LNA разделены по крайней мере одним 2′-O-метилнуклеотидом; и (iii) эффекты замен LNA приблизительно аддитивны, когда нуклеотиды LNA разделены по крайней мере одним 2′-O-метилнуклеотидом. Предложено уравнение для приблизительного расчета стабильности комплементарных дуплексов, образованных с РНК, когда по крайней мере один 2′-O-метилнуклеотид разделяет нуклеотиды LNA. Зависимость последовательности 2′-O-метил РНК/РНК дуплексов, по-видимому, аналогична зависимости РНК/РНК дуплексов, и для 2′-O-метил РНК/РНК дуплексов представлены предварительные приращения свободной энергии ближайших соседей при 37°C. Внутренние несоответствия с нуклеотидами LNA существенно дестабилизируют дуплексы с РНК.

сообщаться влияние остаток заблокировать нуклеиновый кислота lna термодинамический свойство 2 o метил рнк рнк гетеродуплекс исследование оптический плавление показывать lna включить 2 o метилировать рнк олигонуклеотид обычно повышать стабильность комплементарный дуплекс образовать рнк очевидный несколько тенденция число i 3 концев u lna 5 концев lna обладать малый стабилизация внутренний 3 концевой lna ii больший часть повышение стабильность достигаться нуклеотид lna разделить крайний мера 2 o метилнуклеотид iii эффект замена lna приблизительно аддитивный нуклеотид lna разделить крайний мера 2 o метилнуклеотид предложить уравнение приблизительный расчёт стабильность комплементарный дуплекс образовать рнк крайний мера 2 o метилнуклеотид разделять нуклеотид lna зависимость последовательность 2 o метил рнк рнк дуплекс видимый аналогичный зависимость рнк рнк дуплекс 2 o метил рнк рнк дуплекс представить предварительный приращение свободный энергия близкий сосед 37 c внутренний несоответствие нуклеотид lna существенно дестабилизировать дуплекс рнк

влияние заблокировать остаток нуклеиновый кислота термодинамический свойство 2 o метил рнк рнк гетеродуплекс

t40ybhgb

Черновые и готовые данные последовательности для разработки диагностических признаков ДНК и белков

Секвенирование геномов патогенов — дорогостоящий процесс, требующий тщательного распределения ограниченных ресурсов для секвенирования. Мы создали конвейер анализа вычислительного секвенирования (SAP) для принятия решений относительно объема геномного секвенирования, необходимого для разработки высококачественных диагностических ДНК и белковых сигнатур. SAP использует моделирование для оценки количества целевых геномов и близких филогенетических родственников (ближайших соседей или NN) для секвенирования. Мы используем SAP для оценки того, достаточно ли предварительных данных или требуется завершенное секвенирование с использованием последовательностей вирусов Марбург и натуральной оспы. Моделирование показывает, что черновик среднего и высокого качества с частотой ошибок 10(−3)–10(−5) (примерно 8-кратное покрытие) целевых организмов подходит для прогнозирования сигнатуры ДНК. Низкокачественный черновик с уровнем ошибок ∼1% (покрытие от 3× до 6×) целевых изолятов неадекватен для прогнозирования сигнатуры ДНК, хотя низкокачественный черновик NN достаточен, если целевые геномы имеют высокое качество. При прогнозировании сигнатуры белка ошибки секвенирования в целевых геномах существенно снижают возможность обнаружения сохранения аминокислотной последовательности, даже если черновик имеет высокое качество. Подводя итог, можно сказать, что высококачественный проект целевой сети и низкокачественный проект нейронных сетей представляются экономически эффективным вложением для прогнозирования сигнатур ДНК, но могут привести к недооценке прогнозируемых сигнатур белков.

секвенирование геном патоген дорогостоящий процесс требовать тщательный распределение ограниченный ресурс секвенирование создать конвейер анализ вычислительный секвенирование sap принятие решение относительно объём геномный секвенирование необходимый разработка высококачественный диагностический днк белков сигнатура sap использовать моделирование оценка количество целевой геном близкий филогенетический родственник близкий сосед nn секвенирование использовать sap оценка достаточно предварительный данные требоваться завершить секвенирование использование последовательность вирус марбург натуральный оспа моделирование показывать черновик среднее высокий качество частота ошибка 10 3 10 5 примерно 8 кратное покрытие целевой организм подходить прогнозирование сигнатура днк низкокачественный черновик уровень ошибка 1 покрытие 3 6 целевой изолят неадекватный прогнозирование сигнатура днк хотя низкокачественный черновик nn достаточный целевой геном иметь высокий качество прогнозирование сигнатура белок ошибка секвенирование целевой геном существенно снижать возможность обнаружение сохранение аминокислотный последовательность черновик иметь высокий качество подводить итог сказать высококачественный проект целевой сеть низкокачественный проект нейронный сеть представляться экономически эффективный вложение прогнозирование сигнатура днк мочь привести недооценка прогнозировать сигнатура белок

черновой готовый дать последовательность разработка диагностический признак днк белок

zwbc7nnn

Онтология иммунных эпитопов: применение для проектирования базы данных широкого спектра иммунных реактивностей

ПРЕДЫСТОРИЯ: Эпитопы можно определить как молекулярные структуры, связанные со специфическими рецепторами, которые распознаются во время иммунных реакций. Проект базы данных и ресурсов анализа иммунных эпитопов (IEDB) будет каталогизировать и организовывать информацию, касающуюся эпитопов антител и Т-клеток инфекционных патогенов, экспериментальных антигенов и аутоантигенов, уделяя приоритетное внимание патогенам категорий A-C по классификации NIAID () и новым/повторно возникающим инфекционным заболеваниям. Будут каталогизированы как внутренние структурные и филогенетические особенности, так и информация, касающаяся взаимодействия эпитопов с иммунной системой хозяина. ОПИСАНИЕ: Для эффективного представления и передачи информации, связанной с иммунными эпитопами, была разработана формальная онтология. Семантика домена эпитопа и связанных с ним понятий была зафиксирована в виде иерархии классов, которые представляют общие и специальные отношения между различными понятиями. Полный список классов и их свойств можно найти по адресу . ЗАКЛЮЧЕНИЕ: Онтология IEDB является первой онтологией, специально разработанной для сбора как внутренней химической, так и биохимической информации, касающейся иммунных эпитопов, с информацией, касающейся взаимодействия этих структур с молекулами, полученными из иммунной системы хозяина. Мы ожидаем, что разработка такого типа онтологии и связанных с ней баз данных будет способствовать строгому описанию данных, связанных с иммунными эпитопами, и в конечном итоге может привести к появлению совершенно новых методов описания и моделирования иммунных реакций.

предыстория эпитоп определить молекулярный структура связанный специфический рецептор распознаваться время иммунный реакция проект база данные ресурс анализ иммунный эпитоп iedb каталогизировать организовывать информация касаться эпитоп антитело клетка инфекционный патоген экспериментальный антиген аутоантиген уделять приоритетный внимание патоген категория a c классификация niaid новый повторно возникать инфекционный заболевание каталогизировать внутренний структурный филогенетический особенность информация касаться взаимодействие эпитоп иммунный система хозяин описание эффективный представление передача информация связанный иммунный эпитоп разработать формальный онтология семантика домен эпитоп связанный понятие зафиксировать вид иерархия класс представлять общий специальный отношение различный понятие полный список класс свойство найти адрес заключение онтология iedb являться первый онтология специально разработать сбор внутренний химический биохимический информация касаться иммунный эпитоп информация касаться взаимодействие структура молекула получить иммунный система хозяин ожидать разработка тип онтология связанный база данные способствовать строгий описание данные связанный иммунный эпитоп конечный итог мочь привести появление совершенно новый метод описание моделирование иммунный реакция

онтология иммунный эпитоп применение проектирование база данные широкий спектр иммунный реактивность

1r65yam5

Оценка потенциальных референтных генов в исследованиях атлантического лосося методом ОТ-ПЦР в реальном времени

ПРЕДЫСТОРИЯ: Лососевые рыбы являются одними из наиболее широко изучаемых модельных видов рыб, однако отчеты о систематической оценке референтных генов в исследованиях с использованием ОТ-ПЦР отсутствуют. РЕЗУЛЬТАТЫ: Стабильность шести потенциальных референтных генов была исследована в восьми тканях атлантического лосося (Salmo salar) с целью определения наиболее подходящих генов для использования в количественном анализе ОТ-ПЦР в реальном времени. Относительные уровни транскрипции генов, кодирующих 18S рРНК, рибосомальный белок S20, β-актин, глицеральдегид-3P-дегидрогеназу (GAPDH) и два паралогичных гена, кодирующих фактор удлинения 1A (EF1A(A) и EF1A(B)), были количественно определены в жабрах, печени, головной почке, селезенке, тимусе, мозге, мышцах и заднем отделе кишечника у шести необработанных взрослых рыб, а также у группы особей, прошедших смолтификацию. На основании расчетов, выполненных с помощью апплета geNorm VBA, который определяет наиболее стабильные гены из набора протестированных генов в заданном образце кДНК, ранжирование исследованных генов у взрослого атлантического лосося было следующим: EF1A(B)>EF1A(A)>β-актин>18S рРНК>S20>GAPDH. Когда те же расчеты были выполнены для 24 особей, находящихся на четырех стадиях процесса смолтификации (пресмолт, смолт, смолтифицированная морская вода и десмолтифицированная пресноводная вода), ранжирование генов было следующим: EF1A(B)>EF1A(A)>S20>β-актин>18S рРНК>GAPDH. ЗАКЛЮЧЕНИЕ: В целом, данная работа предполагает, что гены EF1A(A) и EF1A(B) могут быть полезны в качестве референтных генов при исследовании экспрессии генов у атлантического лосося с помощью ОТ-ПЦР.

предыстория лососёвый рыба являться наиболее широко изучать модельный вид рыба однако отчёт систематический оценка референтный ген исследование использование пцр отсутствовать результат стабильность шесть потенциальный референтный ген исследовать восемь ткань атлантический лосось salmo salar цель определение наиболее подходящий ген использование количественный анализ пцр реальный время относительный уровень транскрипция ген кодировать 18s ррнк рибосомальный белок s20 β актин глицеральдегид 3p дегидрогеназа gapdh паралогичный ген кодировать фактор удлинение 1a ef1a a ef1a b количественно определить жабра печень головной почка селезёнка тимус мозг мышца задний отдел кишечник шесть необработанный взрослый рыба также группа особь прошедшее смолтификация основание расчёт выполнить помощь апплет genorm vba определять наиболее стабильный ген набор протестировать ген задать образец кднк ранжирование исследовать ген взрослый атлантический лосось следующий ef1a b ef1a a β актин 18s ррнк s20 gapdh расчёт выполнить 24 особь находиться четыре стадия процесс смолтификация пресмолт смолт смолтифицировать морской вода десмолтифицировать пресноводный вода ранжирование ген следующий ef1a b ef1a a s20 β актин 18s ррнк gapdh заключение целое дать работа предполагать ген ef1a a ef1a b мочь полезный качество референтный ген исследование экспрессия ген атлантический лосось помощь пцр

оценка потенциальный референтный ген исследование атлантический лосось метод пцр реальный время

oa4lzkru

Свирепые существа

Зоонозы — заболевания, которые передаются от животных к человеку, — становятся растущей проблемой здравоохранения во всем мире. Поэтому понимание их причин и последствий для человека стало важной темой для мирового общественного здравоохранения.

зооноз заболевание передаваться животное человек становиться расти проблема здравоохранение весь мир поэтому понимание причина последствие человек стать важный тема мировой общественный здравоохранение

свирепый существо

qva0jt86

Значение человеческого метапневмовируса при обострениях ХОБЛ

ПРЕДЫСТОРИЯ И МЕТОДЫ: Человеческий метапневмовирус (hMPV) — недавно открытый респираторный вирус, связанный с бронхиолитом, пневмонией, крупом и обострениями астмы. Поскольку респираторные вирусы часто выявляются у пациентов с острыми обострениями ХОБЛ (ОЭ-ХОБЛ), нашей целью было изучить частоту выявления hMPV в проспективной когорте госпитализированных пациентов с ОЭ-ХОБЛ по сравнению с пациентами со стабильной ХОБЛ и курильщиками без нее с помощью количественной ОТ-ПЦР в реальном времени. РЕЗУЛЬТАТЫ: Мы проанализировали промывание носа и индуцированную мокроту 130 пациентов с AE-COPD, 65 пациентов со стабильной COPD и 34 курильщиков без COPD. HMPV был обнаружен у 3/130 (2,3%) пациентов с AE-COPD со средним показателем 6,5 × 10(5) вирусных копий/мл в назальных промывных водах и 1,88 × 10(5) вирусных копий/мл в индуцированной мокроте. Он не был обнаружен у пациентов со стабильной ХОБЛ или курильщиков без ХОБЛ. ВЫВОД: HMPV обнаруживается только у очень небольшого числа пациентов с AE-COPD. Однако его следует рассматривать как еще один возможный вирусный триггер АЭ-ХОБЛ, поскольку бессимптомное носительство маловероятно.

предыстория метод человеческий метапневмовирус hmpv недавно открытый респираторный вирус связанный бронхиолит пневмония круп обострение астма поскольку респираторный вирус часто выявляться пациент острый обострение хобл оэ хобл наш цель изучить частота выявление hmpv проспективный когорта госпитализировать пациент оэ хобл сравнение пациент стабильный хобл курильщик помощь количественный пцр реальный время результат проанализировать промывание нос индуцировать мокрота 130 пациент ae copd 65 пациент стабильный copd 34 курильщик copd hmpv обнаружить 3 130 2 3 пациент ae copd средний показатель 6 5 10 5 вирусный копия мл назальный промывный вода 1 88 10 5 вирусный копия мл индуцировать мокрота обнаружить пациент стабильный хобл курильщик хобл вывод hmpv обнаруживаться очень небольшой число пациент ae copd однако следовать рассматривать ещё возможный вирусный триггер аэ хобл поскольку бессимптомный носительство маловероятный

значение человеческий метапневмовирус обострение хобл

vw8xjo9t

Биоэтические последствия глобализации: международный консорциумный проект Европейской комиссии

Проект BIG рассматривает некоторые этические проблемы, связанные с глобализацией и здравоохранением.

проект big рассматривать некоторый этический проблема связанный глобализация здравоохранение

биоэтический последствие глобализация международный консорциумный проект европейский комиссия

bnnl700a

Осведомленность общественности о факторах риска развития рака среди населения Японии: опрос населения

ПРЕДЫСТОРИЯ: Целью настоящего исследования было предоставление информации об осведомленности об атрибутивной доле причин рака среди населения Японии в целом. МЕТОДЫ: В рамках комплексного исследования репрезентативной общенациональной выборке из 2000 японцев в возрасте 20 лет и старше был задан вопрос об их восприятии и уровне обеспокоенности различными экологическими и генетическими факторами риска в связи с профилактикой рака. Были проведены интервью с 1355 респондентами (609 мужчин и 746 женщин). РЕЗУЛЬТАТЫ: Среди 12 потенциальных факторов риска самой высокой считалась доля вирусных и бактериальных инфекций, вызывающих рак (51%), за ней следовали курение табака (43%), стресс (39%) и химические вещества, нарушающие работу эндокринной системы (37%). С другой стороны, относимые доли рака, связанные с употреблением жареной рыбы и мяса (21%) и употреблением алкоголя (22%), считались низкими по сравнению с другими возможными факторами риска. Для большинства факторов риска ответные реакции атрибутивной фракции были выше у женщин, чем у мужчин. В целом, испытуемые имели тенденцию давать более высокие ответы, чем те, которые предполагались эпидемиологическими данными на Западе. Доля рака, предположительно обусловленного генетически, составила 32%, в то время как 36% случаев рака считались предотвратимыми путем улучшения образа жизни. ВЫВОД: Наши результаты показывают, что осведомленность об атрибутивной доле причин рака среди населения Японии в целом, как правило, определяется канцерогенными инфекциями, профессиональными факторами, загрязнением воздуха и пищевыми добавками, а не основными факторами образа жизни, такими как диета.

предыстория цель настоящий исследование предоставление информация осведомлённость атрибутивный доля причина рак среди население япония целое метод рамка комплексный исследование репрезентативный общенациональный выборка 2000 японец возраст 20 год старший задать вопрос восприятие уровень обеспокоенность различный экологический генетический фактор риск связь профилактика рак провести интервью 1355 респондент 609 мужчина 746 женщина результат среди 12 потенциальный фактор риск высокий считаться доля вирусный бактериальный инфекция вызывающий рак 51 следовать курение табак 43 стресс 39 химический вещество нарушать работа эндокринный система 37 сторона относить доля рак связанный употребление жареный рыба мясо 21 употребление алкоголь 22 считаться низкий сравнение возможный фактор риск большинство фактор риск ответный реакция атрибутивный фракция выше женщина мужчина целое испытуемый иметь тенденция давать высокий ответ предполагаться эпидемиологический данные запад доля рак предположительно обусловить генетически составить 32 время 36 случай рак считаться предотвратимый путём улучшение образ жизнь вывод наш результат показывать осведомлённость атрибутивный доля причина рак среди население япония целое правило определяться канцерогенный инфекция профессиональный фактор загрязнение воздух пищевой добавка основный фактор образ жизнь диета

осведомлённость общественность фактор риск развитие рак среди население япония опрос население

m71xkuo9

Визуальное обнаружение последовательности реакций LAMP путем добавления катионных полимеров

ПРЕДЫСТОРИЯ: Разработка практического устройства для тестирования генов в месте оказания медицинской помощи (устройство g-POCT) требует инновационных методов обнаружения для демонстрации результатов реакции амплификации генов без использования дорогостоящего оборудования. Мы изучили новый метод визуального обнаружения мельчайших количеств нуклеиновых кислот, специфичный для определенной последовательности, с использованием реакции преципитации путем добавления катионных полимеров к ампликонам петлевой изотермической амплификации (LAMP). РЕЗУЛЬТАТЫ: Олиго-ДНК-зонды, меченые различными флуоресцентными красителями, были подготовлены для нескольких шаблонов нуклеиновых кислот, и шаблоны были амплифицированы с помощью реакций LAMP в присутствии зондов. По завершении реакции LAMP добавляли оптимальное количество низкомолекулярного полиэтиленимина (ПЭИ), что приводило к осаждению нерастворимого комплекса ампликон LAMP-ПЭИ. Флуоресцентно меченые олиго-ДНК-зонды, гибридизованные с продуктом LAMP, были включены в осадок, и осадок испустил флуоресценцию, соответствующую амплифицированным шаблонам нуклеиновых кислот. Цвет испускаемой флуоресценции можно легко обнаружить невооруженным глазом с помощью обычного УФ-осветителя. ЗАКЛЮЧЕНИЕ: Наличие или отсутствие незначительного количества шаблонов нуклеиновых кислот можно обнаружить простым способом посредством визуальной оценки цвета осадка комплекса ампликона LAMP-PEI. Мы пришли к выводу, что этот метод обнаружения может способствовать разработке небольшого и простого устройства g-POCT.

предыстория разработка практический устройство тестирование ген место оказание медицинский помощь устройство g poct требовать инновационный метод обнаружение демонстрация результат реакция амплификация ген использование дорогостоящий оборудование изучить новый метод визуальный обнаружение мелкий количество нуклеиновый кислота специфичный определённый последовательность использование реакция преципитация путём добавление катионный полимер ампликона петлевой изотермический амплификация lamp результат олиго днк зонд меченый различный флуоресцентный краситель подготовить несколько шаблон нуклеиновый кислота шаблон амплифицировать помощь реакция lamp присутствие зонд завершение реакция lamp добавлять оптимальный количество низкомолекулярный полиэтиленимин пэи приводить осаждение нерастворимый комплекс ампликона lamp пэи флуоресцентный меченый олиго днк зонд гибридизовать продукт lamp включить осадка осадка испустить флуоресценция соответствовать амплифицировать шаблон нуклеиновый кислота цвет испускать флуоресценция легко обнаружить невооружённый глаз помощь обычный уф осветитель заключение наличие отсутствие незначительный количество шаблон нуклеиновый кислота обнаружить простой способ посредством визуальный оценка цвет осадка комплекс ампликона lamp pei прислать вывод метод обнаружение мочь способствовать разработка небольшой простой устройство g poct

визуальный обнаружение последовательность реакция lamp путём добавление катионный полимер

s64v656n

Употребление инъекционных наркотиков и ВИЧ/СПИД в Китае: обзор текущей ситуации, профилактики и политических последствий

За последние 10–20 лет в Китае резко возросли масштабы незаконного употребления наркотиков и заболеваемости ВИЧ/СПИДом. В данной статье рассматривается злоупотребление наркотиками в Китае, эпидемия ВИЧ/СПИДа и ее связь с употреблением инъекционных наркотиков (ПИН), а также политика Китая в отношении незаконного употребления наркотиков и профилактики ВИЧ/СПИДа на основе опубликованной литературы и неопубликованных официальных данных. Будучи крупной страной-перевалочным пунктом, источником наркотиков которой являются регионы «Золотого треугольника» и «Золотого полумесяца» в Азии, Китай также становится все более важным рынком потребления наркотиков. Около половины из 1,14 миллиона зарегистрированных потребителей наркотиков в Китае употребляют наркотики инъекционно, а многие пользуются общими иглами. На сегодняшний день ПИН стали причиной 42% всех зарегистрированных случаев ВИЧ/СПИДа. Незаконный оборот наркотиков в Китае является незаконным и может повлечь за собой смертную казнь. Департаменты общественной безопасности придерживаются подхода «нулевой терпимости» к употреблению наркотиков, что противоречит политике снижения вреда департаментов общественного здравоохранения. Опыт Китая показывает, что борьба с контрабандой наркотиков и запрет на их употребление сами по себе не могут предотвратить или решить все проблемы, связанные с незаконным оборотом наркотиков в эпоху глобализации. В последние годы центральное правительство разработало ряд прагматичных мер по поощрению программ снижения вреда; в то же время некоторые местные органы власти не в полной мере мобилизовались для серьезного решения проблем наркомании и ВИЧ/СПИДа. Укрепление руководства правительства как на центральном, так и на местном уровне; расширение программ заместительной терапии метадоном и обмена игл; обеспечение доступности и приемлемости добровольного консультирования и тестирования на ВИЧ для городских и сельских потребителей наркотиков; а также более активное использование аутрич-работы и неправительственных организаций предлагаются в качестве дополнительных стратегий, которые помогут справиться с проблемой ВИЧ и наркомании в Китае.

последний 10 20 год китай резко возрасти масштаб незаконный употребление наркотик заболеваемость вич спид дать статья рассматриваться злоупотребление наркотик китай эпидемия вич спид связь употребление инъекционный наркотик пин также политика китай отношение незаконный употребление наркотик профилактика вич спид основа опубликовать литература неопубликованный официальный данные крупный страна перевалочный пункт источник наркотик являться регион золотой треугольник золотой полумесяц азия китай также становиться всё важный рынок потребление наркотик около половина 1 14 миллион зарегистрировать потребитель наркотик китай употреблять наркотик инъекционный многие пользоваться общий игла сегодняшний день пин стать причина 42 весь зарегистрировать случай вич спид незаконный оборот наркотик китай являться незаконный мочь повлечь смертный казнь департамент общественный безопасность придерживаться подход нулевой терпимость употребление наркотик противоречить политика снижение вред департамент общественный здравоохранение опыт китай показывать борьба контрабанда наркотик запрет употребление мочь предотвратить решить всё проблема связанный незаконный оборот наркотик эпоха глобализация последний год центральный правительство разработать ряд прагматичный мера поощрение программа снижение вред время некоторый местный орган власть полный мера мобилизоваться серьёзный решение проблема наркомания вич спид укрепление руководство правительство центральный местный уровень расширение программа заместительный терапия метадон обмен игла обеспечение доступность приемлемость добровольный консультирование тестирование вич городской сельский потребитель наркотик также активный использование аутрич работа неправительственный организация предлагаться качество дополнительный стратегия помочь справиться проблема вич наркомания китай

употребление инъекционный наркотик вич спид китай обзор текущий ситуация профилактика политический последствие

oluq7v0h

Разработка гуманизированного моноклонального антитела с терапевтическим потенциалом против вируса Западного Нила

Нейтрализация вируса Западного Нила (ВЗН) in vivo коррелирует с развитием гуморального ответа против белка вирусной оболочки (Е). Используя случайный мутагенез и дисплей на поверхности дрожжей, мы определили отдельные контактные остатки 14 вновь созданных моноклональных антител против домена III белка E вируса Западного Нила. Моноклональные антитела, которые эффективно нейтрализовали вирус Западного Нила, локализованный на поверхностном участке боковой поверхности домена III. Реконвалесцентные антитела у людей, выздоровевших от инфекции ВЗН, также обнаружили этот эпитоп. Одно моноклональное антитело, E16, нейтрализовало 10 различных штаммов in vitro и продемонстрировало терапевтическую эффективность у мышей, даже при введении однократной дозы через 5 дней после заражения. Была создана гуманизированная версия E16, сохранившая антигенную специфичность, авидность и нейтрализующую активность. В ходе постконтактных терапевтических испытаний на мышах однократная доза гуманизированного E16 защитила мышей от смертности, вызванной ВЗН, и поэтому может быть жизнеспособным вариантом лечения инфекции ВЗН у людей. ДОПОЛНИТЕЛЬНАЯ ИНФОРМАЦИЯ: Онлайн-версия этой статьи (doi:10.1038/nm1240) содержит дополнительный материал, который доступен авторизованным пользователям.

нейтрализация вирус западный нил взн in vivo коррелировать развитие гуморальный ответ против белок вирусный оболочка использовать случайный мутагенез дисплей поверхность дрожжи определить отдельный контактный остаток 14 вновь создать моноклональный антитело против домен iii белок e вирус западный нил моноклональный антитело эффективно нейтрализовать вирус западный нил локализовать поверхностный участок боков поверхность домен iii реконвалесцентный антитело человек выздороветь инфекция взн также обнаружить эпитоп моноклональный антитело e16 нейтрализовать 10 различный штамм in vitro продемонстрировать терапевтический эффективность мышь введение однократный доза 5 день заражение создать гуманизировать версия e16 сохранить антигенный специфичность авидность нейтрализовать активность ход постконтактный терапевтический испытание мышь однократный доза гуманизированный e16 защитить мышь смертность вызвать взн поэтому мочь жизнеспособный вариант лечение инфекция взн человек дополнительный информация онлайн версия статья doi 10 1038 nm1240 содержать дополнительный материал доступный авторизовать пользователь

разработка гуманизированный моноклональный антитело терапевтический потенциал против вирус западный нил

tw6wusxe

Мнение местных работников общественного здравоохранения о мерах реагирования на пандемию гриппа

ПРЕДЫСТОРИЯ: Текущие национальные планы обеспечения готовности требуют, чтобы местные департаменты здравоохранения играли важную роль в реагировании на пандемию гриппа — серьезную угрозу общественному здравоохранению, которую Всемирная организация здравоохранения охарактеризовала как «неизбежную и, возможно, неминуемую». Чтобы понять восприятие местными работниками общественного здравоохранения мер реагирования на пандемию гриппа, мы опросили 308 сотрудников трех департаментов здравоохранения в Мэриленде в период с марта по июль 2005 года с целью выяснить факторы, которые могут повлиять на их способность и готовность приступить к исполнению служебных обязанностей в случае возникновения такой ситуации. РЕЗУЛЬТАТЫ: Данные свидетельствуют о том, что почти половина работников местных департаментов здравоохранения, скорее всего, не выйдут на работу во время пандемии. Установленная вероятность явки на службу была значительно выше для клинического персонала (многомерный ОШ: 2,5; ДИ 1,3–4,7), чем для технического и вспомогательного персонала, а восприятие важности своей роли в общем реагировании агентства было единственным наиболее влиятельным фактором, связанным с готовностью сообщать о нарушениях (многомерный ОШ: 9,5; ДИ 4,6–19,9). ВЫВОД: Было показано, что воспринимаемый риск среди работников общественного здравоохранения связан с несколькими факторами, не имеющими отношения к фактической опасности этого события. Эти модификаторы восприятия риска и выявленные пробелы в знаниях являются препятствиями для реагирования на пандемию гриппа и должны быть специально устранены, чтобы обеспечить эффективное реагирование местного общественного здравоохранения на эту серьезную угрозу.

предыстория текущий национальный план обеспечение готовность требовать местный департамент здравоохранение играть важный роль реагирование пандемия грипп серьёзный угроза общественный здравоохранение всемирный организация здравоохранение охарактеризовать неизбежный возможно неминуемый понять восприятие местный работник общественный здравоохранение мера реагирование пандемия грипп опросить 308 сотрудник департамент здравоохранение мэриленд период март июль 2005 год цель выяснить фактор мочь повлиять способность готовность приступить исполнение служебный обязанность случай возникновение ситуация результат дать свидетельствовать половина работник местный департамент здравоохранение скорее весь выйти работа время пандемия установленный вероятность явка служба значительно выше клинический персонал многомерный ош 2 5 ди 1 3 4 7 технический вспомогательный персонал восприятие важность свой роль общий реагирование агентство единственный наиболее влиятельный фактор связанный готовность сообщать нарушение многомерный ош 9 5 ди 4 6 19 9 вывод показать воспринимать риск среди работник общественный здравоохранение связать несколько фактор иметь отношение фактический опасность это событие модификатор восприятие риск выявить пробел знание являться препятствие реагирование пандемия грипп должный специально устранить обеспечить эффективный реагирование местный общественный здравоохранение серьёзный угроза

мнение местный работник общественный здравоохранение мера реагирование пандемия грипп

58czem0j

О пандемиях и обязанности заботиться: чья обязанность? какая разница?

ПРЕДЫСТОРИЯ: Как отметили многие комментаторы, атипичная пневмония выявила уязвимость наших систем здравоохранения и структур управления. Медицинские работники и больничные системы, которые приняли на себя основную тяжесть вспышки атипичной пневмонии, продолжают бороться с последствиями кризиса. Действительно, врачи — как в клинической практике, так и в сфере общественного здравоохранения — подверглись суровому испытанию из-за атипичной пневмонии. К их навыкам и опыту предъявлялись беспрецедентные требования, а их личная преданность профессии подвергалась суровым испытаниям. Многие подверглись серьезному риску заболеваемости и смертности, о чем свидетельствуют данные Всемирной организации здравоохранения, показывающие, что около 30% зарегистрированных случаев были среди медицинских работников, некоторые из которых умерли от инфекции. Несмотря на эту проблему, профессиональные этические кодексы ничего не говорят о долге по оказанию помощи во время вспышек инфекционных заболеваний, тем самым не давая никаких указаний относительно того, что ожидается от медицинских работников или как им следует подходить к выполнению своего долга по оказанию помощи в условиях риска. ОБСУЖДЕНИЕ: После вспышки атипичной пневмонии и в связи с угрозой пандемии птичьего гриппа крайне важно (пере)смотреть обязательства медицинских работников в отношении пациентов с тяжелыми инфекционными заболеваниями, особенно заболеваниями, представляющими риск для лиц, оказывающих медицинскую помощь. Крайне важно, чтобы организации, представляющие медицинских работников, четко обозначили, какой стандарт медицинской помощи ожидается от их членов в случае пандемии. В данной статье мы рассматриваем вопрос об особых обязанностях медицинских работников во время вспышки инфекционного заболевания. Мы утверждаем, что существует настоятельная необходимость в разъяснении прав и обязанностей медицинских работников в текущем контексте готовности к пандемии гриппа и что эти права и обязанности должны быть закреплены в профессиональных этических кодексах. Наконец, мы представляем краткий исторический обзор трактовки обязанности проявлять заботу в кодексах профессиональной этики здравоохранения. РЕЗЮМЕ: Необходимо провести честный и критический анализ роли медицинских работников во время вспышек инфекционных заболеваний, чтобы разработать руководящие принципы относительно профессиональных прав и обязанностей, а также этических обязанностей и обязательств. С помощью этой статьи мы надеемся открыть социальный диалог и продвинуть общественную дискуссию по этому все более актуальному вопросу.

предыстория отметить многие комментатор атипичный пневмония выявить уязвимость наш система здравоохранение структура управление медицинский работник больничный система принять основный тяжесть вспышка атипичный пневмония продолжать бороться последствие кризис действительно врач клинический практика сфера общественный здравоохранение подвергнуться суровый испытание атипичный пневмония навык опыт предъявляться беспрецедентный требование личный преданность профессия подвергаться суровый испытание многие подвергнуться серьёзный риск заболеваемость смертность свидетельствовать дать всемирный организация здравоохранение показывать около 30 зарегистрировать случай среди медицинский работник некоторый умереть инфекция несмотря проблема профессиональный этический кодекс говорить долг оказание помощь время вспышка инфекционный заболевание самый давать никакой указание относительно ожидаться медицинский работник следовать подходить выполнение свой долг оказание помощь условие риск обсуждение вспышка атипичный пневмония связь угроза пандемия птичий грипп крайне важно перо смотреть обязательство медицинский работник отношение пациент тяжёлый инфекционный заболевание особенно заболевание представлять риск лицо оказывать медицинский помощь крайне важно организация представлять медицинский работник чётко обозначить стандарт медицинский помощь ожидаться член случай пандемия дать статья рассматривать вопрос особый обязанность медицинский работник время вспышка инфекционный заболевание утверждать существовать настоятельный необходимость разъяснение право обязанность медицинский работник текущий контекст готовность пандемия грипп право обязанность должный закрепить профессиональный этический кодекс представлять краткий исторический обзор трактовка обязанность проявлять забота кодекс профессиональный этика здравоохранение резюме необходимо провести честный критический анализ роль медицинский работник время вспышка инфекционный заболевание разработать руководящий принцип относительно профессиональный право обязанность также этический обязанность обязательство помощь статья надеяться открыть социальный диалог продвинуть общественный дискуссия всё актуальный вопрос

пандемия обязанность заботиться чей обязанность разница

x7wg7e9s

Эпикатехины, очищенные из зеленого чая (Camellia sinensis), дифференциально подавляют рост линий клеток рака человека, зависящих от пола

Противораковый потенциал катехинов, полученных из зеленого чая, изучен недостаточно, отчасти потому, что подавление роста и/или апоптоз, вызванные катехином, по-видимому, зависят от типа и стадии злокачественности, а также от типа катехина. В этом исследовании in vitro изучались биологические эффекты эпикатехина (EC), эпигаллокатехина (EGC), EC 3-галлата (ECG) и EGC 3-галлата (EGCG) в клеточных линиях, полученных от человеческих пол-специфических раковых заболеваний. Клеточные линии, полученные из ограниченного органом (HH870) и метастатического (DU145) рака предстательной железы, а также из умеренно (HH450) и слабо дифференцированного (HH639) эпителиального рака яичников, выращивались с использованием EC, EGC, ECG или EGCG или без них. Когда необработанные клетки достигали конфлюэнтности, измеряли жизнеспособность и время удвоения для обработанных и необработанных клеток. В то время как лечение EC снизило пролиферацию клеток HH639 на 50%, EGCG подавил пролиферацию всех клеточных линий на 50%. ECG оказался еще более эффективным: он ингибировал клетки DU145, HH870, HH450 и HH639 в концентрациях 24, 27, 29 и 30 мкМ, тогда как EGCG ингибировал клетки DU145, HH870, HH450 и HH639 в концентрациях 89, 45, 62 и 42 мкМ. По сравнению с ЭГКГ, ЭКГ более эффективно подавляет рост линий клеток рака предстательной железы и эпителиального рака яичников, полученных из опухолей пациентов с разными стадиями заболевания.

противораковый потенциал катехин получить зелёный чай изучить недостаточно отчасти подавление рост апоптоз вызвать катехин видимый зависеть тип стадия злокачественность также тип катехина это исследование in vitro изучаться биологический эффект эпикатехин ec эпигаллокатехин egc ec 3 галлата ecg egc 3 галлата egcg клеточный линия получить человеческий пол специфический раковый заболевание клеточный линия получить ограниченный орган hh870 метастатический du145 рак предстательный железа также умеренно hh450 слабо дифференцированный hh639 эпителиальный рак яичниковый выращиваться использование ec egc ecg egcg необработанный клетка достигать конфлюэнтность измерять жизнеспособность время удвоение обработать необработанный клетка время лечение ec снизить пролиферация клетка hh639 50 egcg подавить пролиферация весь клеточный линия 50 ecg оказаться ещё эффективный ингибировать клетка du145 hh870 hh450 hh639 концентрация 24 27 29 30 мкм egcg ингибировать клетка du145 hh870 hh450 hh639 концентрация 89 45 62 42 мкм сравнение эгкг экг эффективно подавлять рост линия клетка рак предстательный железа эпителиальный рак яичниковый получить опухоль пациент разный стадия заболевание

эпикатехин очистить зелёный чай camellia sinensis дифференциальный подавлять рост линия клетка рак человек зависеть пол

utglk4af

Маркеры тяжести обострения хронической обструктивной болезни легких

ПРЕДЫСТОРИЯ: У пациентов с хронической обструктивной болезнью легких (ХОБЛ) могут возникать «обострения» своего заболевания. Обострение — это событие, определяемое с точки зрения субъективных признаков или симптомов, а именно одышки, кашля и мокроты, которые ухудшаются в достаточной степени, чтобы потребовать изменения тактики лечения. Необходимы надежные маркеры, отражающие патологические механизмы, лежащие в основе тяжести обострения, и которые можно использовать в качестве суррогатного показателя для оценки эффективности лечения в клинических исследованиях. Мало что известно о том, как изменяются существующие переменные исследования и предлагаемые маркеры как в стабильной фазе, так и в фазе обострения ХОБЛ. В попытке найти наилучшие показатели обострений мы изучили литературу, чтобы определить, какие из этих маркеров изменяются пропорционально тяжести обострения. МЕТОДЫ: Мы провели поиск в стандартных базах данных за период с 1966 по июль 2004 года, используя основные ключевые слова и термины. В данное исследование были включены исследования, в которых были предоставлены демографические данные, спирометрия, потенциальные маркеры и четкие критерии отбора. Центральные тенденции и дисперсии для всех переменных и маркеров, сообщенных и собранных нами, были сначала сведены в таблицу в соответствии с размером выборки и критериями тяжести обострения I–III степеней тяжести ATS/ERS 2004. В связи с возможным сходством пациентов на уровнях II и III данные также были перераспределены по категориям обострений, а именно амбулаторные (уровень I) и стационарные (уровни II и III вместе взятые). Для обоих подходов мы провели метаанализ фиксированного эффекта по каждой из представленных переменных. РЕЗУЛЬТАТЫ: Мы включили в общей сложности 268 исследований, опубликованных в период с 1979 года по июль 2004 года. В ходе этих исследований было обследовано 142 407 пациентов с ХОБЛ. Напряжение углекислого газа в артериальной крови и частота дыхания статистически различались между всеми степенями тяжести обострения, а также между амбулаторными и стационарными условиями. Большинство других показателей показали слабую связь с уровнем или обстановкой, или у них было недостаточно данных для проведения метаанализа. ЗАКЛЮЧЕНИЕ: Уровень углекислого газа в артериальной крови и частота дыхания изменялись в зависимости от тяжести обострения и состояния пациента. Многие другие показатели показали слабую корреляцию, которую следует дополнительно изучить в будущих лонгитюдных исследованиях или оценить с использованием предлагаемых методов математического моделирования.

предыстория пациент хронический обструктивный болезнь лёгкий хобл мочь возникать обострение свой заболевание обострение это событие определять точка зрение субъективный признак симптом именно одышка кашель мокрота ухудшаться достаточный степень потребовать изменение тактика лечение необходимый надёжный маркер отражать патологический механизм лежать основа тяжесть обострение использовать качество суррогатный показатель оценка эффективность лечение клинический исследование мало известно изменяться существующий переменный исследование предлагать маркер стабильный фаза фаза обострение хобл попытка найти хороший показатель обострение изучить литература определить маркер изменяться пропорционально тяжесть обострение метод провести поиск стандартный база данные период 1966 июль 2004 год использовать основной ключевой слово термин данный исследование включить исследование предоставить демографический дать спирометрия потенциальный маркер чёткий критерий отбор центральный тенденция дисперсия весь переменный маркер сообщить собранный сначала свести таблица соответствие размер выборка критерий тяжесть обострение i iii степень тяжесть ats ers 2004 связь возможный сходство пациент уровень ii iii дать также перераспределить категория обострение именно амбулаторный уровень i стационарный уровень ii iii вместе взять оба подход провести метаанализ фиксировать эффект каждый представить переменный результат включить общий сложность 268 исследование опубликовать период 1979 год июль 2004 год ход исследование обследовать 142 407 пациент хобл напряжение углекислый газ артериальный кровь частота дыхание статистически различаться весь степень тяжесть обострение также амбулаторный стационарный условие большинство показатель показать слабый связь уровень обстановка недостаточно данные проведение метаанализ заключение уровень углекислый газ артериальный кровь частота дыхание изменяться зависимость тяжесть обострение состояние пациент многие показатель показать слабый корреляция следовать дополнительно изучить будущий лонгитюдный исследование оценить использование предлагать метод математический моделирование

маркер тяжесть обострение хронический обструктивный болезнь лёгкий

i5fcedbo

Научные рефераты

научный реферат

bjjft7ut

Общество общей внутренней медицины: 28-я ежегодная встреча Новый Орлеан, Луизиана, 11–14 мая 2005 г.: Из хаоса: критическая роль врачей-терапевтов, РЕЗЮМЕ МАТЕРИАЛОВ, ПРИНЯТЫХ ДЛЯ ПРЕЗЕНТАЦИИ

общество общий внутренний медицина 28 ежегодный встреча новый орлеан луизиана 11 14 май 2005 г хаос критический роль врач терапевт резюме материал принять презентация

urk7fe34

КЛИНИЧЕСКИЕ КРАТКИЕ ОПИСАНИЯ

клинический краткий описание

u09rn09u

РЕФЕРАТЫ

реферат

kvztcwu2

Клинические описания

клинический описание

9r62ffew

Дифференциальное профилирование транскриптомов низкой экспрессии гепатомы человека с использованием нового подхода SSH/микрочипов

ПРЕДЫСТОРИЯ: Основным ограничением при проведении полногеномного профилирования экспрессии генов является анализ генов с низкой экспрессией. Для функциональных геномных исследований крайне необходимы подходы с высокой производительностью и высокой чувствительностью для анализа транскриптов с низкой экспрессией. Сочетание методов супрессивной субтрактивной гибридизации (SSH) и микрочипов кДНК с использованием вычтенных клонов кДНК в качестве зондов, напечатанных на чипах, значительно повысило эффективность вылавливания дифференциально экспрессируемых клонов и использовалось ранее. Однако этот метод секвенирования по-прежнему остается утомительным и неэффективным, учитывая большое количество избыточности в вычитаемых ампликонах, а также сводит на нет первоначальные преимущества высокой чувствительности SSH при профилировании транскриптомов с низкой экспрессией. РЕЗУЛЬТАТЫ: Мы модифицировали предыдущую комбинацию методов SSH и микрочипов, напрямую используя вычтенные ампликоны в качестве мишеней для гибридизации предварительно созданных микрочипов кДНК (названных «SSH/микрочип»). мРНК, полученная из трех пар тканей печени, гепатомных и негепатомных, была подвергнута анализам SSH/микрочипов, а также непосредственно обычным анализам кДНК-микрочипов для сравнения. По сравнению с исходными комбинированными анализами SSH и микрочипов модифицированные анализы SSH/микрочипов позволили значительно упростить проверку эффективности вычитания и идентификацию генов в вычтенных ампликонах без утомительной и неэффективной работы по секвенированию. С другой стороны, 5015 из 9376 генов, изначально отфильтрованных обычными анализами на основе микрочипов кДНК из-за низкой экспрессии, стали поддаваться анализу с помощью анализов SSH/микрочипов. Более того, анализы SSH/микрочипов выявили примерно в десять раз больше (701 против 701). 69) Гены HCC по-разному экспрессируются (по крайней мере, двукратное различие и P < 0,01), особенно для тех, у кого есть редкие транскрипты, чем обычные анализы с использованием микрочипов кДНК. Дифференциальная экспрессия была подтверждена в 9 случайно выбранных генах в 18 парах тканей печени с гепатомой/негепатомой с использованием количественной ОТ-ПЦР. Подходы SSH/микрочипов позволили идентифицировать множество дифференциально экспрессируемых генов, участвующих в регуляции клеточного цикла, гибели клеток, передаче сигналов и морфогенезе клеток, что свидетельствует об участии мультибиологических процессов в гепатоканцерогенезе. ЗАКЛЮЧЕНИЕ: Модифицированный подход SSH/микрочип представляет собой простой, но высокочувствительный и высокоэффективный инструмент для дифференциального профилирования транскриптомов с низкой экспрессией. Он наиболее подходит для применения в функциональных геномных исследованиях.

предыстория основный ограничение проведение полногеномный профилирование экспрессия ген являться анализ ген низкий экспрессия функциональный геномный исследование крайне необходимый подход высокий производительность высокий чувствительность анализ транскрипт низкий экспрессия сочетание метод супрессивный субтрактивный гибридизация ssh микрочип кднк использование вычесть клон кднк качество зонд напечатать чип значительно повысить эффективность вылавливание дифференциальный экспрессировать клон использоваться ранее однако метод секвенирование прежний оставаться утомительный неэффективный учитывать большой количество избыточность вычитаемое ампликона также сводить первоначальный преимущество высокий чувствительность ssh профилирование транскриптомов низкий экспрессия результат модифицировать предыдущий комбинация метод ssh микрочип напрямую использовать вычесть ампликона качество мишень гибридизация предварительно создать микрочип кднк назвать ssh микрочип мрнк получить пара ткань печень гепатомный негепатомный подвергнуть анализ ssh микрочип также непосредственно обычный анализ кднк микрочип сравнение сравнение исходный комбинированный анализ ssh микрочип модифицированный анализ ssh микрочип позволить значительно упростить проверка эффективность вычитание идентификация ген вычесть ампликона утомительный неэффективный работа секвенирование сторона 5015 9376 ген изначально отфильтровать обычный анализ основа микрочип кднк низкий экспрессия стать поддаваться анализ помощь анализ ssh микрочип анализ ssh микрочип выявить примерно десять большой 701 против 701 69 ген hcc разный экспрессироваться крайний мера двукратный различие p 0 01 особенно редкий транскрипта обычный анализ использование микрочип кднк дифференциальный экспрессия подтвердить 9 случайно выбрать ген 18 пара ткань печень гепатома негепатома использование количественный пцр подход ssh микрочип позволить идентифицировать множество дифференциальный экспрессировать ген участвовать регуляция клеточный цикл гибель клетка передача сигнал морфогенез клетка свидетельствовать участие мультибиологический процесс гепатоканцерогенез заключение модифицированный подход ssh микрочип представлять простой высокочувствительный высокоэффективный инструмент дифференциальный профилирование транскриптомов низкий экспрессия наиболее подходить применение функциональный геномный исследование

дифференциальный профилирование транскриптомов низкий экспрессия гепатом человек использование новый подход ssh микрочип

d3cko4j2

От функциональной геномики к функциональной иммуномике: новые вызовы, старые проблемы, большие награды

Развитие технологии ДНК-микрочипов десять лет назад привело к становлению функциональной геномики как одной из самых активных и успешных научных дисциплин современности. С развитием технологии иммуномикрочипов — пространственно адресуемой крупномасштабной технологии измерения специфического иммунологического ответа — возникает новая задача функциональной иммуномики, которая имеет сходство с функциональной геномикой, но также существенно отличается от нее. Иммунологический анализ успешно применяется для выявления биологических маркеров, участвующих в аутоиммунных заболеваниях, аллергиях, вирусных инфекциях, таких как вирус иммунодефицита человека (ВИЧ), гриппе, диабете и реакциях на противораковые вакцины. Целью данного обзора является предоставление целостного видения этой зарождающейся научной области и выдвижение предположений о будущих направлениях исследований. Мы подробно обсуждаем такие вопросы, как прогнозирование эпитопов, технологию иммуномикрочипов и ее применение, а также вычислительные и статистические задачи, связанные с функциональной иммуномикой. Основываясь на недавнем открытии механизмов регуляции Т-клеточных реакций, мы предполагаем использование иммуномических микрочипов в качестве инструмента для достижения прогресса в системной биологии клеточных иммунных реакций с помощью моделей иммуномических регуляторных сетей.

развитие технология днк микрочип десять год назад привести становление функциональный геномик самый активный успешный научный дисциплина современность развитие технология иммуномикрочип пространственно адресовать крупномасштабный технология измерение специфический иммунологический ответ возникать новый задача функциональный иммуномик иметь сходство функциональный геномика также существенно отличаться иммунологический анализ успешно применяться выявление биологический маркер участвовать аутоиммунный заболевание аллергия вирусный инфекция вирус иммунодефицит человек вич грипп диабет реакция противораковый вакцина цель данный обзор являться предоставление целостный видение зарождаться научный область выдвижение предположение будущий направление исследование подробно обсуждать вопрос прогнозирование эпитоп технология иммуномикрочип применение также вычислительный статистический задача связанный функциональный иммуномика основываться недавний открытие механизм регуляция клеточный реакция предполагать использование иммуномический микрочип качество инструмент достижение прогресс системный биология клеточный иммунный реакция помощь модель иммуномический регуляторный сеть

функциональный геномик функциональный иммуномик новый вызов старый проблема больший награда

hwlvk68z

Модели передачи оспы: систематический обзор естественных вспышек в Европе и Северной Америке после Второй мировой войны

ПРЕДЫСТОРИЯ: Поскольку натуральная оспа (variola major) может использоваться в качестве биологического оружия, мы проанализировали вспышки заболевания в Европе и Северной Америке после Второй мировой войны, чтобы понять закономерности передачи оспы. МЕТОДЫ: Для выявления статей из Национальной медицинской библиотеки, Embase, Biosis, Cochrane Library, Defense Technical Information Center, WorldCat и списков литературы включенных публикаций использовался систематический обзор. Два автора проанализировали избранные статьи о вспышках оспы. РЕЗУЛЬТАТЫ: Из 1389 публикаций была выявлена ​​51 соответствующая вспышка. Медиана эффективного показателя воспроизводства первого поколения (начальный R) составила 2 (диапазон 0–38). Большинство вспышек были небольшими (менее 5 случаев) и ограничивались одним поколением. Вспышки с небольшим количеством госпитализированных пациентов имели низкие начальные значения R (медиана 1) и были продолжительнее, если изначально не были распознаны (медиана 3 поколения); вспышки с большинством госпитализированных пациентов имели более высокие начальные значения R (медиана 12) и были короче (медиана 3 поколения). Индексные случаи с атипичным проявлением оспы с меньшей вероятностью диагностировались как оспа; вспышки, в которых индексный случай не был правильно диагностирован, были крупнее (медиана 27,5 случаев) и продолжительнее (медиана 3 поколения) по сравнению со вспышками, в которых индексный случай был правильно диагностирован (медиана 3 случая и 1 поколение). ВЫВОД: Модели распространения во время вспышек оспы различаются в зависимости от обстоятельств, но раннее выявление и реализация мер контроля оказывают важнейшее влияние на масштабы вспышек. Большинство вспышек заболеваний, изученных в Европе и Северной Америке, удалось взять под контроль в течение нескольких поколений, если их обнаружить на ранней стадии.

предыстория поскольку натуральный оспа variola major мочь использоваться качество биологический оружие проанализировать вспышка заболевание европа северный америка второй мировой война понять закономерность передача оспа метод выявление стать национальный медицинский библиотека embase biosis cochrane library defense technical information center worldcat список литература включить публикация использоваться систематический обзор автор проанализировать избранный статья вспышка оспа результат 1389 публикация выявить 51 соответствовать вспышка медиана эффективный показатель воспроизводство первый поколение начальный r составить 2 диапазон 0 38 большинство вспышка небольшой менее 5 случай ограничиваться поколение вспышка небольшой количество госпитализировать пациент иметь низкий начальный значение r медиана 1 продолжительный изначально распознать медиана 3 поколение вспышка большинство госпитализировать пациент иметь высокий начальный значение r медиана 12 короче медиана 3 поколение индексный случай атипичный проявление оспа малый вероятность диагностироваться оспа вспышка индексный случай правильно диагностировать крупный медиана 27 5 случай продолжительный медиана 3 поколение сравнение вспышка индексный случай правильно диагностировать медиана 3 случай 1 поколение вывод модель распространение время вспышка оспа различаться зависимость обстоятельство ранний выявление реализация мера контроль оказывать важный влияние масштаб вспышка большинство вспышка заболевание изучить европа северный америка удаться взять контроль течение несколько поколение обнаружить ранний стадия

модель передача оспа систематический обзор естественный вспышка европа северный америка второй мировой война

w5fxen70

Надежность определений случаев для надзора за общественным здравоохранением, оцененная с помощью метода кругового тестирования

ПРЕДЫСТОРИЯ: Определения случаев заболеваний признаны важными элементами систем надзора за общественным здравоохранением. Они призваны обеспечивать сопоставимость и согласованность данных наблюдения и оказывают решающее влияние на чувствительность и положительную прогностическую ценность системы наблюдения. Надежность определений случаев редко подвергалась систематическому исследованию. МЕТОДЫ: Мы провели круговой тест, попросив все 425 местных департаментов здравоохранения (LHD) и 16 государственных департаментов здравоохранения (SHD) в Германии классифицировать выборку из 68 примеров случаев, используя определения случаев. С помощью многомерного анализа мы изучили факторы, связанные с классификационным соответствием золотому стандарту, который был определен группой экспертов. РЕЗУЛЬТАТЫ: Всего было выполнено 7870 классификаций 396 специалистами по управлению транспортными средствами (93%) и всеми специалистами по управлению транспортными средствами. Чувствительность отчета составила 90,0%, положительная прогностическая ценность — 76,6%. Самая низкая точность отчетности наблюдалась в случаях полиомиелита, самая высокая – в случаях сальмонеллеза (OR = 0,008; CI: 0,005–0,013). Определения случаев с форматом контрольного перечня клинических критериев привели к более высокой точности отчетности, чем определения случаев с повествовательным описанием (OR = 3,08; CI: 2,47–3,83). Точность отчетности была выше среди SHD по сравнению с LHD (OR = 1,52; CI: 1,14–2,02). ЗАКЛЮЧЕНИЕ: Наши выводы привели к систематическому пересмотру немецких определений случаев и заложили основу для общих рекомендаций по созданию определений случаев. К ним относятся, среди прочего, то, что проверяемые критерии «да/нет» в формате контрольного списка, вероятно, повысят надежность, а программное обеспечение, используемое для передачи данных, должно разрабатываться в строгом соответствии с определениями случаев. Результаты данного исследования в значительной степени применимы к определениям случаев во многих других странах или международных сетях, поскольку они имеют те же структурные и редакционные характеристики, что и определения случаев, оцененные в данном исследовании до их пересмотра.

предыстория определение случай заболевание признать важный элемент система надзор общественный здравоохранение призвать обеспечивать сопоставимость согласованность данные наблюдение оказывать решающий влияние чувствительность положительный прогностический ценность система наблюдение надёжность определение случай редко подвергаться систематический исследование метод провести круговой тест попросить всё 425 местный департамент здравоохранение lhd 16 государственный департамент здравоохранение shd германия классифицировать выборка 68 пример случай использовать определение случай помощь многомерный анализ изучить фактор связанный классификационный соответствие золотой стандарт определить группа эксперт результат весь выполнить 7870 классификация 396 специалист управление транспортный средство 93 весь специалист управление транспортный средство чувствительность отчёт составить 90 0 положительный прогностический ценность 76 6 самый низкий точность отчётность наблюдаться случай полиомиелит самый высокий случай сальмонеллёз or 0 008 ci 0 005 0 013 определение случай формат контрольный перечень клинический критерий привести высокий точность отчётность определение случай повествовательный описание or 3 08 ci 2 47 3 83 точность отчётность выше среди shd сравнение lhd or 1 52 ci 1 14 2 02 заключение наш вывод привести систематический пересмотр немецкий определение случай заложить основа общий рекомендация создание определение случай относиться среди прочее проверять критерий формат контрольный список вероятно повысить надёжность программный обеспечение использовать передача данные должный разрабатываться строгий соответствие определение случай результат данный исследование значительный степень применимый определение случай многий страна международный сеть поскольку иметь структурный редакционный характеристика определение случай оценить данный исследование пересмотр

надёжность определение случай надзор общественный здравоохранение оценить помощь метод круговой тестирование

mq6bterc

Пневмония, связанная с искусственной вентиляцией легких, и инфекционный контроль

Вентилятор-ассоциированная пневмония (ВАП) является основной причиной заболеваемости и смертности в отделениях интенсивной терапии. По данным различных исследований, заболеваемость ВАП колеблется от 7% до 70%, а показатели смертности составляют 20–75% в зависимости от исследуемой популяции. Основным путем развития ВАП является аспирация колонизированных патогенных микроорганизмов из ротоглотки и желудочно-кишечного тракта. С другой стороны, основным фактором риска ВАП является интубация и продолжительность искусственной вентиляции легких. Диагностика остается сложной задачей, и исследования показали важность раннего начала применения соответствующих антибиотиков для прогноза. ВАП приводит к увеличению продолжительности пребывания в больнице и отделениях интенсивной терапии, а также увеличивает расходы на лечение. Следовательно, политика инфекционного контроля становится более рациональной и позволяет сэкономить деньги.

вентилятор ассоциированный пневмония вап являться основной причина заболеваемость смертность отделение интенсивный терапия данные различный исследование заболеваемость вап колебаться 7 70 показатель смертность составлять 20 75 зависимость исследовать популяция основный путём развитие вап являться аспирация колонизировать патогенный микроорганизм ротоглотка желудочный кишечный тракт сторона основный фактор риск вап являться интубация продолжительность искусственный вентиляция лёгкий диагностика оставаться сложный задача исследование показать важность ранний начало применение соответствующий антибиотик прогноз вап приводить увеличение продолжительность пребывание больница отделение интенсивный терапия также увеличивать расход лечение следовательно политика инфекционный контроль становиться рациональный позволять сэкономить деньга

пневмония связать искусственный вентиляция лёгкий инфекционный контроль

yxhk1qm3

Дозорный эпиднадзор за человеческим энтеровирусом 71 в Сараваке, Малайзия: уроки первых 7 лет

ПРЕДЫСТОРИЯ: Крупная вспышка везикулярной болезни полости рта и конечностей, вызванной человеческим энтеровирусом 71, в Сараваке в 1997 году ознаменовала начало серии вспышек в Азиатско-Тихоокеанском регионе. Некоторые из этих вспышек сопровождались необычно высоким числом смертей, что вызвало большой страх и беспокойство в регионе. МЕТОДЫ: В марте 1998 года мы организовали программу дозорного эпиднадзора за везикулярной болезнью полости рта и конечностей в Сараваке, Малайзия. Ниже описаны наблюдения за первые 7 лет. Выделение вируса, серотипирование и генотипирование проводились на мазках из зева, прямой кишки, везикул и других участков. РЕЗУЛЬТАТЫ: За этот период в Сараваке было зафиксировано две вспышки человеческого энтеровируса 71 — в 2000 и 2003 годах. Преобладающие штаммы, циркулировавшие во время вспышек 1997, 2000 и 2003 годов, относились к геногруппе B, однако штаммы, выделенные во время каждой вспышки, генетически отличались друг от друга. Вспышки человеческого энтеровируса 71 происходили циклично каждые три года, а вирус Коксаки А16 циркулировал совместно с человеческим энтеровирусом 71. Хотя везикулы с наибольшей вероятностью позволяли выделить изолят, в большинстве случаев этот образец был недоступен, поэтому было установлено, что наиболее эффективным способом получения вирусологической информации является взятие мазков из горла. ВЫВОД: Знание эпидемиологии передачи энтеровируса человека 71 позволит работникам общественного здравоохранения прогнозировать возможные вспышки и эффективно планировать мероприятия с целью снижения бремени заболевания.

предыстория крупный вспышка везикулярный болезнь полость рот конечность вызвать человеческий энтеровирус 71 саравак 1997 год ознаменовать начало серия вспышка азиатско тихоокеанский регион некоторый вспышка сопровождаться необычно высокий число смерть вызвать большой страх беспокойство регион метод март 1998 год организовать программа дозорный эпиднадзор везикулярный болезнь полость рот конечность саравак малайзия ниже описать наблюдение первый 7 год выделение вирус серотипирование генотипирование проводиться мазка зев прямой кишка везикула участок результат период саравак зафиксировать вспышка человеческий энтеровирус 71 2000 2003 год преобладать штамм циркулировать время вспышка 1997 2000 2003 год относиться геногруппа b однако штамм выделить время каждый вспышка генетически отличаться друг друг вспышка человеческий энтеровирус 71 происходить циклично каждый год вирус коксак а16 циркулировать совместно человеческий энтеровирус 71 хотя везикула больший вероятность позволять выделить изолят большинство случай образец недоступный поэтому установить наиболее эффективный способ получение вирусологический информация являться взятие мазок горло вывод знание эпидемиология передача энтеровирус человек 71 позволить работник общественный здравоохранение прогнозировать возможный вспышка эффективно планировать мероприятие цель снижение бремя заболевание

дозорный эпиднадзор человеческий энтеровирус 71 саравак малайзия урок первый 7 год

bpnfupzv

26-й Международный симпозиум по интенсивной терапии и неотложной медицине, 21–24 марта 2006 г., Брюссель, Бельгия

26 й международный симпозиум интенсивный терапия неотложный медицина 21 24 март 2006 г брюссель бельгия

j3p1u80n

Разработка вирусов с ослабленным ростом на основе моделирования

Живые вирусные вакцины активируют как гуморальный, так и клеточный иммунитет, требуют только однократной ревакцинации и, как правило, обеспечивают более длительную иммунную защиту, чем убитые или субъединичные вакцины. Однако рост вакцин на основе живых вирусов необходимо ослабить, чтобы свести к минимуму их потенциальное патогенное воздействие, а механизмы ослабления путем традиционной последовательной передачи вирусной адаптации изучены недостаточно. Новые методы ослабления, основанные на рациональной инженерии вирусных геномов, могут обеспечить потенциально более высокий уровень контроля, если удастся связать определенные генетические модификации с изменениями в росте вируса. Чтобы приступить к установлению таких связей между генотипом и фенотипом роста, мы разработали компьютерную модель внутриклеточного роста вируса везикулярного стоматита (ВВС), хорошо изученного, несегментированного, отрицательно-цепочечного РНК-вируса. Наша модель включает в себя установленные регуляторные механизмы VSV, а также ключевые этапы заражения диким типом: захват ресурсов хозяина, транскрипцию, трансляцию и репликацию с последующей сборкой и высвобождением потомственных частиц VSV. Обобщение модели дикого типа для учета перестроек генома соответствовало экспериментально наблюдаемому рейтингу ослабления для рекомбинантных штаммов VSV, которые изменили положение гена нуклеокапсида в геноме. Наконец, наши моделирования отразили ранее опубликованные экспериментальные результаты, показывающие, как изменение положения других генов VSV может ослабить рост VSV, одновременно вызывая повышенную экспрессию иммуногенного поверхностного гликопротеина VSV. Такие модели облегчат разработку новых живых вирусных вакцин, связывая геномные манипуляции с контролируемыми изменениями в экспрессии генов вируса и его росте.

живой вирусный вакцина активировать гуморальный клеточный иммунитет требовать однократный ревакцинация правило обеспечивать длительный иммунный защита убитый субъединичный вакцина однако рост вакцина основа живой вирус необходимо ослабить свести минимум потенциальный патогенный воздействие механизм ослабление путём традиционный последовательный передача вирусный адаптация изучить недостаточно новый метод ослабление основать рациональный инженерия вирусный геном мочь обеспечить потенциально высокий уровень контроль удаться связать определённый генетический модификация изменение рост вирус приступить установление связь генотип фенотип рост разработать компьютерный модель внутриклеточный рост вирус везикулярный стоматит ввс изучить несегментировать отрицательно цепочечный рнк вирус наш модель включать установленный регуляторный механизм vsv также ключевой этап заражение дикий тип захват ресурс хозяин транскрипция трансляция репликация последующий сборка высвобождение потомственный частица vsv обобщение модель дикий тип учёт перестройка геном соответствовать экспериментально наблюдать рейтинг ослабление рекомбинантный штамм vsv изменить положение ген нуклеокапсида геном наш моделирование отразить ранее опубликовать экспериментальный результат показывать изменение положение ген vsv мочь ослабить рост vsv одновременно вызывать повышенный экспрессия иммуногенный поверхностный гликопротеин vsv модель облегчить разработка новый живой вирусный вакцина связывать геномный манипуляция контролировать изменение экспрессия ген вирус рост

разработка вирус ослабить рост основа моделирование

5eqdrd52

Системы доставки для прямого применения siRNA для индукции РНК-интерференции (RNAi) in vivo

РНК-интерференция (РНКi) — это мощный метод подавления активности определенных генов, который также может привести к появлению новых многообещающих терапевтических стратегий. Он опосредован малыми интерферирующими РНК (siRNA), которые специфически запускают расщепление и последующую деградацию целевой мРНК. Одним из важнейших факторов является возможность доставки интактных siRNA в целевые клетки/органы in vivo. В этом обзоре освещается механизм РНК-интерференции и рекомендации по разработке оптимальных siRNA. В нем представлен обзор исследований, основанных на системном или локальном применении голых siRNA или использовании различных невирусных систем доставки siRNA. Одним из перспективных направлений является комплексообразование siRNA с полиэтиленимином (PEI), которое эффективно стабилизирует siRNA и при системном введении приводит к доставке интактных siRNA в различные органы. Описаны противоопухолевые эффекты опосредованного PEI/siRNA генного нацеливания in vivo на белки, имеющие отношение к опухолям, как в моделях ксенотрансплантатов опухолей у мышей.

рнк интерференция рнкi это мощный метод подавление активность определённый ген также мочь привести появление новый многообещающий терапевтический стратегия опосредовать малый интерферировать рнк sirna специфически запускать расщепление последующий деградация целевой мрнк важный фактор являться возможность доставка интактный sirna целевой клетка орган in vivo это обзор освещаться механизм рнк интерференция рекомендация разработка оптимальный sirna немой представить обзор исследование основать системный локальный применение голый sirna использование различный невирусный система доставка sirna перспективный направление являться комплексообразование sirna полиэтиленимин pei эффективно стабилизировать sirna системный введение приводить доставка интактный sirna различный орган описать противоопухолевый эффект опосредовать pei sirna генный нацеливание in vivo белка иметь отношение опухоль модель ксенотрансплантат опухоль мышь

система доставка прямой применение sirna индукция рнк интерференция rnai in vivo

p5jtwb3l

Электрохимический молекулярный анализ без амплификации нуклеиновых кислот

Электрохимические биосенсоры произвели революцию в мониторинге глюкозы, но пока не оправдали своих надежд на недорогую и прямую замену тестам на генетические амплификации, таким как ПЦР [K. Керман, М. Кобаяши, Э. Тамия, Последние тенденции в технологии электрохимических ДНК-биосенсоров, Meas. Научн. Технол. 15 (2004) R1-R11; А. Чауби, Б.Д. Малхотра, Опосредованные биосенсоры. Биосенс. Биоэлектрон. 17 (6-7) (2002) 441-456]. Ожидалось, что интеграция наномасштабных химических структур, таких как самоорганизующиеся монослои, с электрохимическими биосенсорами увеличит чувствительность за счет снижения собственного шума системы. Мы разработали новый подход к биосенсорике, включающий такую ​​интеграцию, и добились быстрой сверхнизкой чувствительности к концентрации без усиления мишени. Необработанные образцы смешиваются с лизирующим буфером, что позволяет провести гибридизацию целевых нуклеиновых кислот с якорными и сигнальными зондами перед иммобилизацией сигнального фермента вблизи поверхности биосенсора. Затем прикладывают потенциал смещения и измеряют вторичный побочный продукт циклической пероксидазной реакции. Дальнейшие исследования продемонстрировали возможность применения нашего подхода в белковых, клинической химии и ионных анализах.

электрохимический биосенсор произвести революция мониторинг глюкоза пока оправдать свой надежда недорогой прямой замена тест генетический амплификация пцр k керман м кобаяша э тамия последний тенденция технология электрохимический днк биосенсор meas научн технол 15 2004 r1 r11 чаубить б далее малхотр опосредовать биосенсор биосенс биоэлектрон 17 6 7 2002 441 456 ожидаться интеграция наномасштабный химический структура самоорганизоваться монослой электрохимический биосенсор увеличить чувствительность счёт снижение собственный шум система разработать новый подход биосенсорика включать интеграция добиться быстрый сверхнизкий чувствительность концентрация усиление мишень необработанный образец смешиваться лизировать буфер позволять провести гибридизация целевой нуклеиновый кислота якорный сигнальный зонд иммобилизация сигнальный фермент вблизи поверхность биосенсор затем прикладывать потенциал смещение измерять вторичный побочный продукт циклический пероксидазный реакция дальнейший исследование продемонстрировать возможность применение наш подход белков клинический химия ионный анализ

электрохимический молекулярный анализ амплификация нуклеиновый кислота

c5hrdrtu

Выявление новых участников процессов созревания и овуляции ооцитов радужной форели (Oncorhynchus mykiss) с использованием микрочипов кДНК

ПРЕДЫСТОРИЯ: Гормональный контроль созревания ооцитов и овуляции, а также молекулярные механизмы созревания ядра были тщательно изучены у рыб. Напротив, другим молекулярным событиям, происходящим в яичнике во время поствителлогенеза, уделяется гораздо меньше внимания. МЕТОДЫ: Нейлоновые микрочипы, отображающие 9152 кДНК радужной форели, были гибридизованы с использованием образцов РНК, полученных из ткани яичников, собранных во время позднего вителлогенеза, поствителлогенеза и созревания ооцитов. Гены с дифференциальной экспрессией были идентифицированы с помощью статистического анализа. Контролируемый кластерный анализ проводился с использованием только дифференциально экспрессируемых генов с целью выявления кластеров генов, демонстрирующих схожие профили экспрессии. Кроме того, были отобраны определенные гены и проанализирована их преовуляторная экспрессия в яичниках с помощью ПЦР в реальном времени. РЕЗУЛЬТАТЫ: В результате статистического анализа было выявлено 310 дифференциально экспрессируемых генов. Среди этих генов 90 были активированы во время созревания ооцитов, тогда как 220 демонстрировали противоположную картину. После кластерного анализа 90 клонов, принадлежащих к 3 кластерам генов, демонстрирующим наиболее примечательные паттерны экспрессии, были сохранены для дальнейшего анализа. Используя анализ ПЦР в реальном времени, мы наблюдали сильную регуляцию генов транспорта ионов и воды, таких как аквапорин 4 (aqp4) и пендрин (slc26). Кроме того, наблюдалось резкое повышение экспрессии гена вазотоцина (avt). Кроме того, гены ангиотензинпревращающего фермента 2 (ace2), фактора свертывания крови V (cf5), adam 22 и хемокина cxcl14 продемонстрировали резкую положительную регуляцию во время созревания ооцитов. Наконец, овариальная ароматаза (cyp19a1) продемонстрировала резкое снижение уровня экспрессии в поствителлогенный период, в то время как снижение уровня экспрессии цитидинмонофосфат-гидроксилазы N-ацетилнейраминовой кислоты (cmah) наблюдалось во время созревания ооцитов. ЗАКЛЮЧЕНИЕ: Мы выявили повышенную или пониженную экспрессию более 300 генов, большинство из которых ранее не изучались или были неизвестны в преовуляторном яичнике рыб. Наши данные подтвердили снижение экспрессии генов синтеза эстрогена в преовуляторный период. Кроме того, сильная активация генов aqp4 и slc26 перед овуляцией предполагает их участие в процессе гидратации ооцита, происходящем в это время. Кроме того, среди наиболее активно экспрессируемых клонов несколько генов, таких как cxcl14, ace2, adam22, cf5, обладают провоспалительными, сосудорасширяющими, протеолитическими и коагуляционными функциями. Идентичность и паттерны экспрессии этих генов подтверждают теорию, сравнивающую овуляцию с реакцией, похожей на воспалительную.

предыстория гормональный контроль созревание ооцит овуляция также молекулярный механизм созревание ядро тщательно изучить рыба напротив молекулярный событие происходить яичник время поствителлогенез уделяться гораздо маленький внимание метод нейлоновый микрочип отображать 9152 кднк радужный форель гибридизовать использование образец рнк получить ткань яичниковый собранный время поздний вителлогенез поствителлогенез созревание ооцит ген дифференциальный экспрессия идентифицировать помощь статистический анализ контролировать кластерный анализ проводиться использование дифференциальный экспрессировать ген цель выявление кластер ген демонстрировать схожий профиль экспрессия кроме отобрать определённый ген проанализировать преовуляторный экспрессия яичник помощь пцр реальный время результат результат статистический анализ выявить 310 дифференциальный экспрессировать ген среди ген 90 активировать время созревание ооцит 220 демонстрировать противоположный картина кластерный анализ 90 клон принадлежащий 3 кластер ген демонстрировать наиболее примечательный паттерн экспрессия сохранить дальнейший анализ использовать анализ пцр реальный время наблюдать сильный регуляция ген транспорт ион вода аквапорина 4 aqp4 пендрина slc26 кроме наблюдаться резкий повышение экспрессия ген вазотоцин avt кроме ген ангиотензинпревращать фермент 2 ace2 фактор свёртывание кровь v cf5 adam 22 хемокина cxcl14 продемонстрировать резкий положительный регуляция время созревание ооцит овариальный ароматаз cyp19a1 продемонстрировать резкий снижение уровень экспрессия поствителлогенный период время снижение уровень экспрессия цитидинмонофосфат гидроксилаза n ацетилнейраминов кислота cmah наблюдаться время созревание ооцит заключение выявить повышенный понизить экспрессия 300 ген большинство ранее изучаться неизвестный преовуляторный яичник рыба наш дать подтвердить снижение экспрессия ген синтез эстроген преовуляторный период кроме сильный активация ген aqp4 slc26 овуляция предполагать участие процесс гидратация ооцит происходить это время кроме среди наиболее активно экспрессировать клон несколько ген cxcl14 ace2 adam22 cf5 обладать провоспалительный сосудорасширяющий протеолитический коагуляционный функция идентичность паттерн экспрессия ген подтверждать теория сравнивать овуляция реакция похожий воспалительный

выявление новый участник процесс созревание овуляция ооцит радужный форель oncorhynchus mykiss использование микрочип кднк

pk7pnmlo

Объектная имитационная модель для моделирования гипотетических эпидемий заболеваний – EpiFlex

ПРЕДЫСТОРИЯ: EpiFlex — это гибкая и простая в использовании компьютерная модель для одного компьютера, предназначенная для управления одним пользователем, которому не обязательно быть экспертом. Целью проекта является изучение in silico эпидемического поведения широкого спектра заболеваний, как известных, так и теоретических, путем моделирования их распространения на уровне заражения отдельных людей и заражения ими других. Чтобы полностью понять систему, данную статью следует читать одновременно с изучением программного обеспечения и его результатов. EpiFlex оценивается с использованием результатов моделирования эпидемий гриппа А и сравнения их с различными источниками полевых данных и другими типами моделирования. EpiFlex — это объектно-ориентированная система Монте-Карло, распределяющая сущности в соответствии с индивидуумами, переносчиками болезней, заболеваниями и местами, где могут обитать носители. EpiFlex определяет восемь различных типов контактов, доступных для заболевания. Контакты происходят внутри локаций модели. Популяции состоят из демографических групп, каждая из которых имеет цикл перемещения между локациями. В пределах локаций суперраспространение определяется перекосом распределения контактов. РЕЗУЛЬТАТЫ: EpiFlex указывает на три явления, представляющих интерес для общественного здравоохранения: (1) R(0) является переменным, и чем меньше численность населения, тем больше будет инфицированная фракция в этой популяции; (2) значительное сжатие/синхронизация между городами примерно в 2 раза происходит между ранней инкубационной фазой эпидемии в нескольких городах и фазой основных проявлений; (3) если бы были доступны более точные данные о заболеваемости, было бы обнаружено больше бессимптомных носителей, распространяющих болезнь, чем мы в настоящее время считаем в случае гриппа. Эти результаты свидетельствуют о том, что полевые исследования для изучения таких явлений, хотя и требуют больших затрат, должны быть оправданными. ВЫВОД: Поскольку EpiFlex показывает все стадии развития заболевания, возможно получение детального представления о ходе эпидемий. EpiFlex демонстрирует характерную мультимодальность и, по-видимому, случайную изменчивость, характерную для данных реального мира, но делает это как возникающее свойство тщательно построенной модели динамики заболевания и не является просто стохастической системой. EpiFlex может обеспечить лучшее понимание инфекционных заболеваний и стратегий реагирования.

предыстория epiflex это гибкий простой использование компьютерный модель компьютер предназначить управление пользователь обязательно эксперт цель проект являться изучение in silico эпидемический поведение широкий спектр заболевание известный теоретический путём моделирование распространение уровень заражение отдельный человек заражение полностью понять система данный статья следовать читать одновременно изучение программный обеспечение результат epiflex оцениваться использование результат моделирование эпидемия грипп сравнение различный источник полевой данные тип моделирование epiflex это объектный ориентировать система монт карло распределять сущность соответствие индивидуум переносчик болезнь заболевание место мочь обитать носитель epiflex определять восемь различный тип контакт доступный заболевание контакт происходить внутри локация модель популяция состоять демографический группа каждый иметь цикл перемещение локация предел локация суперраспространение определяться перекос распределение контакт результат epiflex указывать явление представлять интерес общественный здравоохранение 1 r 0 являться переменный маленький численность население большой инфицировать фракция популяция 2 значительный сжатие синхронизация город примерно 2 происходить ранний инкубационный фаза эпидемия несколько город фаза основный проявление 3 доступный точный дать заболеваемость обнаружить большой бессимптомный носитель распространять болезнь настоящий время считать случай грипп результат свидетельствовать полевой исследование изучение явление хотя требовать больший затрата должный оправданный вывод поскольку epiflex показывать всё стадия развитие заболевание возможно получение детальный представление ход эпидемия epiflex демонстрировать характерный мультимодальность видимый случайный изменчивость характерный данные реальный мир делать это возникать свойство тщательно построить модель динамика заболевание являться просто стохастический система epiflex мочь обеспечить хороший понимание инфекционный заболевание стратегия реагирование

объектный имитационный модель моделирование гипотетический эпидемия заболевание epiflex

nhb4o6ty

Мультиплексный генетический анализ с использованием расширенного генетического алфавита

ПРЕДЫСТОРИЯ: Во всех штатах требуется проведение определенного вида тестирования для новорожденных, но эта политика далека от стандартизации. В некоторых штатах скрининг новорожденных может включать генетические тесты по широкому кругу признаков, однако стоимость и сложность новых генетических тестов сдерживают расширение скрининга новорожденных. Мы описываем разработку и техническую оценку мультиплексной платформы, которая может способствовать расширению генетического скрининга новорожденных. МЕТОДЫ: MultiCode(®) PLx включает три основных этапа: ПЦР, целевое расширение и жидкостное декодирование чипа. Каждый этап выполняется в одном и том же реакционном сосуде, и испытание завершается примерно за 3 часа. Для сайт-специфической маркировки и декодирования при комнатной температуре мы используем дополнительную пару оснований, сконструированную из изогуанозина и изоцитидина. Мы использовали этот метод для проверки мутаций в гене регулятора трансмембранной проводимости при муковисцидозе (CFTR). Разработанный тест проводился вручную и с помощью автоматизированной обработки жидкостей. Первоначально с помощью этого метода было проведено ретроспективное тестирование 225 образцов с различными генотипами. В проспективном исследовании были использованы образцы более чем от 400 новорожденных. РЕЗУЛЬТАТЫ: В ретроспективном исследовании 99,1% образцов были правильно генотипированы, не было сделано ни одного неправильного вывода. В перспективном исследовании 95% образцов были правильно генотипированы для всех целей, и не было ни одного неправильного ответа. ВЫВОДЫ: Уникальная генетическая мультиплексная платформа успешно протестировала 31 цель в гене CFTR и обеспечивает точное определение генотипа в клинических условиях.

предыстория весь штат требоваться проведение определённый вид тестирование новорождённый политика далёкий стандартизация некоторый штат скрининг новорождённый мочь включать генетический тест широкий круг признак однако стоимость сложность новый генетический тест сдерживать расширение скрининг новорождённый описывать разработка технический оценка мультиплексный платформа мочь способствовать расширение генетический скрининг новорождённый метод multicode plx включать основный этап пцр целевой расширение жидкостный декодирование чип каждый этап выполняться реакционный сосуд испытание завершаться примерно 3 час сайт специфический маркировка декодирование комнатный температура использовать дополнительный пара основание сконструировать изогуанозин изоцитидин использовать метод проверка мутация ген регулятор трансмембранный проводимость муковисцидоз cftr разработать тест проводиться вручную помощь автоматизированный обработка жидкость первоначально помощь это метод провести ретроспективный тестирование 225 образец различный генотип проспективный исследование использовать образец 400 новорождённый результат ретроспективный исследование 99 1 образец правильно генотипировать сделать неправильный вывод перспективный исследование 95 образец правильно генотипировать весь цель неправильный ответ вывод уникальный генетический мультиплексный платформа успешно протестировать 31 цель ген cftr обеспечивать точный определение генотип клинический условие

мультиплексный генетический анализ использование расширить генетический алфавит

xgwbl8em

Антисмысловой сдвиг рамки считывания рибосом

Программируемый рибосомный сдвиг рамки считывания обеспечивает механизм декодирования информации, расположенной в двух перекрывающихся рамках считывания, путем переключения части транслирующих рибосом во вторую открытую рамку считывания (ORF). В результате образуются два белка: продукт стандартной трансляции ORF1 и белок слияния ORF1–ORF2. Такой запрограммированный сдвиг рамки считывания обычно используется как механизм экспрессии генов в вирусах, которые заражают эукариотические клетки, а также в подмножестве клеточных генов. Вторичные структуры РНК, состоящие из псевдоузлов или стебель-петлей, расположенные ниже по течению от места сдвига, часто действуют как цис-стимуляторы сдвига рамки считывания. В данной работе мы впервые демонстрируем, что антисмысловые олигонуклеотиды могут функционально имитировать эти структуры РНК, вызывая сдвиг рамки считывания рибосомы +1 при отжиге ниже сайта сдвига рамки считывания, UCC UGA. Сдвиг рибосомы в рамку считывания +1, вызванный антисмысловой последовательностью, весьма эффективен как в реакциях трансляции лизата ретикулоцитов кролика, так и в культивируемых клетках млекопитающих. Эффективность сдвига рамки считывания, вызванного антисмысловыми антителами, в этом сайте зависит от контекста последовательности 5' сайта сдвига и от уровней полиаминов.

программировать рибосомный сдвиг рамка считывание обеспечивать механизм декодирование информация расположить перекрываться рамка считывание путём переключение часть транслировать рибосома второй открытый рамка считывание orf результат образоваться белок продукт стандартный трансляция orf1 белок слияние orf1 orf2 запрограммировать сдвиг рамка считывание обычно использоваться механизм экспрессия ген вирус заражать эукариотический клетка также подмножество клеточный ген вторичный структура рнк состоять псевдоузел стебель петля расположить ниже течение место сдвиг часто действовать цис стимулятор сдвиг рамка считывание дать работа впервые демонстрировать антисмысловой олигонуклеотид мочь функционально имитировать структура рнк вызывать сдвиг рамка считывание рибосома 1 отжиг ниже сайт сдвиг рамка считывание ucc uga сдвиг рибосома рамка считывание 1 вызвать антисмысловой последовательность весьма эффективный реакция трансляция лизат ретикулоцит кролик культивировать клетка млекопитающее эффективность сдвиг рамка считывание вызвать антисмысловой антитело это сайт зависеть контекст последовательность 5 сайт сдвиг уровень полиамин

антисмысловой сдвиг рамка считывание рибосома

69gftii4

Ген архейной α-L-фукозидазы экспрессируется путем трансляционного сдвига рамки считывания

Стандартные правила генетического трансляционного декодирования изменяются в конкретных генах под воздействием различных событий, которые в общем называются перекодированием. У архей перекодирование до сих пор однозначно определено только для событий считывания терминирующих кодонов. В данной работе мы изучаем механизм экспрессии гена, кодирующего α-L-фукозидазу из археи Sulfolobus solfataricus (fucA1), который разделен на две открытые рамки считывания, разделенные сдвигом рамки на -1. Экспрессия в Escherichia coli расщепленного гена дикого типа привела к получению методом сдвига рамки считывания полноразмерных полипептидов с эффективностью 5%. Мутации в регуляторном участке, где происходит сдвиг, показывают, что экспрессия in vivo происходит запрограммированным образом. Далее мы идентифицируем полноразмерный продукт fucA1 в экстрактах S.solfataricus, которые транслируют этот ген in vitro, следуя запрограммированному сдвигу рамки считывания на −1. Это первая экспериментальная демонстрация того, что такой тип перекодирования присутствует у архей.

стандартный правило генетический трансляционный декодирование изменяться конкретный ген воздействие различный событие общий называться перекодирование архей перекодирование сей пора однозначно определить событие считывание терминировать кодон дать работа изучать механизм экспрессия ген кодировать α l фукозидаза архей sulfolobus solfataricus fuca1 раздельный открытый рамка считывание разделить сдвиг рамка 1 экспрессия escherichia coli расщепить ген дикий тип привести получение метод сдвиг рамка считывание полноразмерный полипептид эффективность 5 мутация регуляторный участок происходить сдвиг показывать экспрессия in vivo происходить запрограммировать образ далее идентифицировать полноразмерный продукт fuca1 экстракт s solfataricus транслировать ген in vitro следовать запрограммировать сдвиг рамка считывание 1 это первый экспериментальный демонстрация тип перекодирование присутствовать архей

ген архейной α l фукозидаза экспрессироваться путём трансляционный сдвиг рамка считывание

vefs1h6o

Роль РНК-хеликаз в репликации ВИЧ-1

Вирусы представляют собой геномы, способные к репликации, но относительно бедные генами. Даже самые крупные вирусы (т.е. Герпесвирусы) кодируют лишь немного (>200 открытых рамок считывания (ОРС)). Однако, поскольку вирусы обязательно размножаются внутри клеток, и учитывая, что эволюция может быть обусловлена ​​принципом экономии масштаба, разумно предположить, что многие вирусы развили способность использовать кодируемые клетками белки для обеспечения необходимых суррогатных функций. Исследование in silico баз данных вирусных последовательностей показывает, что большинство вирусов с положительной и двухцепочечной РНК имеют ОРС для РНК-хеликаз. С другой стороны, геномы ретровирусов лишены вирусно-кодируемой хеликазы. Здесь мы кратко рассмотрим идею о том, что вирус иммунодефицита человека (ВИЧ-1) приобрел способность использовать одну или несколько клеточных РНК-хеликаз для своего репликативного жизненного цикла.

вирус представлять геном способный репликация относительно бедный ген самый крупный вирус герпесвирус кодировать лишь немного 200 открытый рамка считывание орс однако поскольку вирус обязательно размножаться внутри клетка учитывать эволюция мочь обусловить принцип экономия масштаб разумно предположить многие вирус развить способность использовать кодировать клетка белка обеспечение необходимый суррогатный функция исследование in silico база данные вирусный последовательность показывать большинство вирус положительный двухцепочечный рнк иметь орс рнк хеликаз сторона геном ретровирус лишить вирусный кодировать хеликаз кратко рассмотреть идея вирус иммунодефицит человек вич 1 приобрести способность использовать несколько клеточный рнк хеликаз свой репликативный жизненный цикл

роль рнк хеликаз репликация вич 1

1ypgij14

MIMOX: веб-инструмент для картирования эпитопов на основе фагового дисплея

ПРЕДЫСТОРИЯ: Фаговый дисплей широко используется в фундаментальных исследованиях, таких как изучение участков и сетей белок-белкового взаимодействия, а также в прикладных исследованиях, таких как разработка новых лекарств, вакцин и диагностических средств. Он также стал многообещающим методом картирования эпитопов. Исследования новых алгоритмов, которые облегчают и автоматизируют картирование эпитопов на основе фагового дисплея, привлекли внимание многих групп. Однако большинство существующих инструментов до сих пор не были реализованы в виде онлайн-сервисов, что затрудняет для сообщества доступ к ним, их использование и оценку. РЕЗУЛЬТАТЫ: Мы представляем MIMOX — бесплатный веб-инструмент, который помогает картировать нативный эпитоп антитела на основе одного или нескольких предоставленных пользователем мимотопов и структуры антигена. MIMOX был написан на Perl с использованием модулей из проекта Bioperl. Он состоит из двух частей. В первом разделе MIMOX предоставляет простой интерфейс для ClustalW для выравнивания набора мимотопов. Он также предоставляет простой статистический метод для получения консенсусной последовательности и встраивает JalView в качестве Java-апплета для просмотра и управления выравниванием. Во втором разделе MIMOX может картировать отдельный мимотоп или консенсусную последовательность набора мимотопов на соответствующей структуре антигена и искать все кластеры остатков, которые могут представлять нативный эпитоп. NACCESS используется для оценки доступности поверхности кластеров-кандидатов, а Jmol встроен для их интерактивного просмотра в трехмерном контексте. Первоначальные исследования показывают, что MIMOX может воспроизводить сопоставления из существующих инструментов, таких как FINDMAP и 3DEX, а также предоставлять новые, рациональные результаты. ЗАКЛЮЧЕНИЕ: Разработан веб-инструмент под названием MIMOX для картирования эпитопов на основе фагового дисплея. Поскольку это общедоступный онлайн-сервис в этой области, сообществу удобно получать к нему доступ, использовать и оценивать его, дополняя другие существующие программы. MIMOX доступен бесплатно по адресу .

предыстория фаговыя дисплей широко использоваться фундаментальный исследование изучение участок сеть белок белковый взаимодействие также прикладной исследование разработка новый лекарство вакцина диагностический средство также стать многообещающий метод картирование эпитоп исследование новый алгоритм облегчать автоматизировать картирование эпитоп основа фаговый дисплей привлечь внимание многий группа однако большинство существующий инструмент сей пора реализовать вид онлайн сервис затруднять сообщество доступ использование оценка результат представлять mimox бесплатный веб инструмент помогать картировать нативный эпитоп антитело основа несколько предоставить пользователь мимотоп структура антиген mimox написать perl использование модуль проект bioperl состоять часть первый раздел mimox предоставлять простой интерфейс clustalw выравнивание набор мимотоп также предоставлять простой статистический метод получение консенсусный последовательность встраивать jalview качество java апплет просмотр управление выравнивание второй раздел mimox мочь картировать отдельный мимотоп консенсусный последовательность набор мимотоп соответствовать структура антиген искать всё кластер остаток мочь представлять нативный эпитоп naccess использоваться оценка доступность поверхность кластер кандидат jmol встроить интерактивный просмотр трёхмерный контекст первоначальный исследование показывать mimox мочь воспроизводить сопоставление существующий инструмент findmap 3dex также предоставлять новый рациональный результат заключение разработать веб инструмент название mimox картирование эпитоп основа фаговый дисплей поскольку это общедоступный онлайн сервис область сообщество удобно получать доступ использовать оценивать дополнять существующий программа mimox доступный бесплатно адрес

mimox веб инструмент картирование эпитоп основа фаговый дисплей

1axxmq84

Эндогенное клеточное восстановление хронической демиелинизации

При рассеянном склерозе ремиелинизация обычно не происходит из-за повторных или хронических эпизодов демиелинизации, что приводит к неврологической инвалидности. Модели острой демиелинизации у грызунов обычно демонстрируют активную спонтанную ремиелинизацию, что не позволяет адекватно оценить стратегии улучшения состояний недостаточной ремиелинизации. В текущем исследовании мы использовали мышиную модель хронической демиелинизации, вызванной непрерывным приемом 0,2% купризона в течение 12 недель. Этот хронический процесс истощает популяцию предшественников олигодендроцитов и нарушает регенерацию олигодендроцитов. Ремиелинизация оставалась ограниченной после исключения купризона из рациона. Экспрессия фактора роста фибробластов 2 (FGF2) была устойчиво повышена в мозолистом теле хронически демиелинизированных мышей по сравнению с мышами без поражений. Мы использовали мышей FGF2(−/−), чтобы определить, способствует ли удаление эндогенного FGF2 ремиелинизации хронически демиелинизированных областей. У мышей дикого типа и мышей FGF2(−/−) наблюдалась схожая демиелинизация во время хронического лечения купризоном. Важно отметить, что в отличие от мышей дикого типа, у мышей FGF2(−/−) спонтанно произошла полная ремиелинизация в период восстановления после хронической демиелинизации. Повышенная ремиелинизация у мышей FGF2(−/−) коррелировала с усиленной регенерацией олигодендроглии. Генотип FGF2 не изменял плотность клеток-предшественников олигодендроцитов или пролиферирующих клеток после хронической демиелинизации. Эти результаты свидетельствуют о том, что ослабление FGF2 создало достаточно благоприятную среду поражения для эндогенных клеток, чтобы эффективно ремиелинизировать жизнеспособные аксоны даже после хронической демиелинизации.

рассеянный склероз ремиелинизация обычно происходить повторный хронический эпизод демиелинизация приводить неврологический инвалидность модель острый демиелинизация грызун обычно демонстрировать активный спонтанный ремиелинизация позволять адекватно оценить стратегия улучшение состояние недостаточный ремиелинизация текущий исследование использовать мышиный модель хронический демиелинизация вызвать непрерывный приём 0 2 купризона течение 12 неделя хронический процесс истощать популяция предшественник олигодендроцит нарушать регенерация олигодендроцит ремиелинизация оставаться ограниченный исключение купризона рацион экспрессия фактор рост фибробласт 2 fgf2 устойчивый повысить мозолистый тело хронически демиелинизированный мышь сравнение мышь поражение использовать мышь fgf2 определить способствовать удаление эндогенный fgf2 ремиелинизация хронически демиелинизированный область мышь дикий тип мышь fgf2 наблюдаться схожий демиелинизация время хронический лечение купризон важно отметить отличие мышь дикий тип мышь fgf2 спонтанно произойти полный ремиелинизация период восстановление хронический демиелинизация повышенный ремиелинизация мышь fgf2 коррелировать усиленный регенерация олигодендроглия генотип fgf2 изменять плотность клетка предшественник олигодендроцит пролиферировать клетка хронический демиелинизация результат свидетельствовать ослабление fgf2 создать достаточно благоприятный среда поражение эндогенный клетка эффективно ремиелинизировать жизнеспособный аксон хронический демиелинизация

эндогенный клеточный восстановление хронический демиелинизация

cxzlmfst

Автоматическая идентификация множества микроорганизмов с помощью ресеквенирования ДНК-микрочипов

Все большее признание получает тот факт, что подробная информация о последовательности нуклеиновых кислот будет полезна и даже необходима для диагностики, лечения и наблюдения за многими значимыми патогенами. Поскольку получение подробной информации о патогенах приводит к значительному увеличению объемов данных, необходимо разработать автоматизированные методы анализа, чтобы сократить время анализа и стандартизировать критерии идентификации. Это особенно важно для анализов на множественные патогены, призванных сократить время и затраты на анализ. В данной статье мы представляем успешный алгоритм обнаружения патогенов и предоставления максимально возможного уровня детализации с использованием микрочипов повторного секвенирования нескольких патогенов. Алгоритм фильтрует последовательность вызовов оснований из микрочипа и находит записи в генетических базах данных, которые наиболее точно соответствуют. Затем для соотнесения этих записей друг с другом используются таксономические базы данных, что позволяет идентифицировать микроорганизм. Несмотря на то, что данный подход был разработан с использованием микрочипа для ресеквенирования, он применим к любому методу анализа, который позволяет получить информацию о последовательности нуклеотидов. Успех и постоянное развитие этого подхода означают, что теперь даже неспециалист может самостоятельно анализировать результаты, полученные с помощью данных частичной последовательности.

всё больший признание получать факт подробный информация последовательность нуклеиновый кислота полезный необходимый диагностика лечение наблюдение многий значимый патоген поскольку получение подробный информация патоген приводить значительный увеличение объём данные необходимо разработать автоматизированный метод анализ сократить время анализ стандартизировать критерий идентификация это особенно важно анализ множественный патоген призвать сократить время затрата анализ дать статья представлять успешный алгоритм обнаружение патоген предоставление максимально возможный уровень детализация использование микрочип повторный секвенирование несколько патоген алгоритм фильтровать последовательность вызов основание микрочип находить запись генетический база данные наиболее точно соответствовать затем соотнесение запись друг друг использоваться таксономический база данные позволять идентифицировать микроорганизм несмотря данный подход разработать использование микрочип ресеквенирование применимый любой метод анализ позволять получить информация последовательность нуклеотид успех постоянный развитие это подход означать неспециалист мочь самостоятельно анализировать результат получить помощь данные частичный последовательность

автоматический идентификация множество микроорганизм помощь ресеквенирование днк микрочип

br2p09pg

Молекулярно-динамическое моделирование человека [Формула: см. текст]: роль модифицированных оснований в распознавании мРНК

Точность трансляции генетического кода в белки зависит от правильного распознавания тРНК–мРНК в контексте рибосомы. У человека [Формула: см. текст] в антикодоновой петле-стебле присутствуют три модифицированных основания — 2-метилтио-N6-треонилкарбамоиладенозин в позиции 37 (ms(2)t(6)A37), 5-метоксикарбонилметил-2-тиоуридин в позиции 34 (mcm(5)s(2)U34) и псевдоуридин (ψ) в позиции 39 — два из которых, ms(2)t(6)A37 и mcm(5)s(2)U34, необходимы для достижения активности связывания дикого типа у человека дикого типа [Формула: см. текст] [C. Яриан, М. Маршалек, Э. Сохацкая, А. Малькевич, Р. Гюнтер, А. Мискевич и П. Ф. Агрис (2000) Биохимия, 39, 13390–13395]. Было проведено моделирование молекулярной динамики девяти антикодоновых стеблей-петель тРНК с различными комбинациями нестандартных оснований. Моделирование дикого типа показало каноническую ступенчатую конформацию антикодона. Модификация ms(2)t(6) в позиции 37 необходима для поддержания этой структуры и снижает доступность U36 для растворителя. Ms(2)t(6)A37 обычно образует водородные связи по всей петле и может препятствовать переходу U36 в раствор. Молекула воды координируется с ψ39 большую часть времени моделирования, но слабо, поскольку большинство времен пребывания составляют <40 пс.

точность трансляция генетический код белка зависеть правильный распознавание трнк мрнк контекст рибосома человек формула смотреть текст антикодоновый петля стебло присутствовать модифицированный основание 2 метилтио n6 треонилкарбамоиладенозин позиция 37 ms 2 t 6 a37 5 метоксикарбонилметить 2 тиоуридина позиция 34 mcm 5 s 2 u34 псевдоуридина ψ позиция 39 ms 2 t 6 a37 mcm 5 s 2 u34 необходимый достижение активность связывание дикий тип человек дикий тип формула смотреть текст c яриана м маршалька э сохацкай малькевич р гюнтер мискевич п ф агрис 2000 биохимия 39 13390 13395 провести моделирование молекулярный динамика девять антикодоновое стебель петля трнк различный комбинация нестандартный основание моделирование дикий тип показать канонический ступенчатый конформация антикодон модификация ms 2 t 6 позиция 37 необходимый поддержание структура снижать доступность u36 растворитель ms 2 t 6 a37 обычно образовать водородный связь весь петля мочь препятствовать переход u36 раствор молекула вода координироваться ψ39 больший часть время моделирование слабо поскольку большинство время пребывание составлять 40 пс

молекулярный динамический моделирование человек формула смотреть текст роль модифицированный основание распознавание мрнк

kt9pmfdr

Новая система пост-ПЦР-генотипирования эндонуклеазы IV

Здесь мы описываем новый анализ на основе эндонуклеазы IV (Endo IV), в котором используется субстрат, имитирующий абазические повреждения, которые обычно возникают в двухцепочечной ДНК. Трехкомпонентный субстрат характеризуется одноцепочечной ДНК-мишенью, олигонуклеотидным зондом, отделенным от вспомогательного олигонуклеотида промежутком в одно основание. Олигонуклеотидный зонд содержит нефлуоресцентный гаситель на 5'-конце и флуорофор, прикрепленный к 3'-концу через специальный жесткий линкер. Флуоресценция олигонуклеотидного зонда эффективно гасится взаимодействием терминального красителя и гасителя, если он не гибридизован. При гибридизации олигонуклеотидного зонда и вспомогательного зонда с их комплементарной мишенью фосфодиэфирная связь между жестким линкером и 3'-концом зонда эффективно расщепляется, генерируя флуоресцентный сигнал. В данном исследовании демонстрируется использование анализа Endo IV в качестве системы обнаружения после ПЦР-амплификации. Высокая чувствительность и специфичность иллюстрируются с помощью обнаружения полиморфизма отдельных нуклеотидов.

описывать новый анализ основа эндонуклеаза iv endo iv использоваться субстрат имитировать абазический повреждение обычно возникать двухцепочечный днк трехкомпонентный субстрат характеризоваться одноцепочечный днк мишень олигонуклеотидный зонд отделённый вспомогательный олигонуклеотид промежуток основание олигонуклеотидный зонд содержать нефлуоресцентный гаситель 5 конец флуорофор прикрепить 3 конец специальный жёсткий линкер флуоресценция олигонуклеотидный зонд эффективно гаситься взаимодействие терминальный краситель гаситель гибридизовать гибридизация олигонуклеотидный зонд вспомогательный зонд комплементарный мишень фосфодиэфирный связь жёсткий линкер 3 конец зонд эффективно расщепляться генерировать флуоресцентный сигнал данный исследование демонстрироваться использование анализ endo iv качество система обнаружение пцр амплификация высокий чувствительность специфичность иллюстрироваться помощь обнаружение полиморфизм отдельный нуклеотид

новый система пост пцр генотипирование эндонуклеаза iv

5fl0rk90

Готовность к пандемическому гриппу: этические принципы принятия решений

ПРЕДЫСТОРИЯ: В больницах по всему миру ведется планирование на случай следующей вспышки пандемического гриппа. Глобальный опыт борьбы с атипичной пневмонией научил нас, что этические основы принятия решений могут помочь сократить сопутствующий ущерб и повысить доверие и солидарность внутри организаций здравоохранения и между ними. Хорошее планирование на случай пандемии требует размышлений о ценностях, поскольку сама по себе наука не может подсказать нам, как подготовиться к кризису в области общественного здравоохранения. ОБСУЖДЕНИЕ: В этой статье мы представляем этические основы планирования мер по борьбе с пандемией гриппа. Этическая основа была разработана с использованием опыта клинической, организационной и этической стороны общественного здравоохранения и проверена в ходе процесса взаимодействия с заинтересованными сторонами. Этическая основа включает как содержательные, так и процедурные элементы этического планирования борьбы с пандемией гриппа. Внедрению этических принципов в планирование мер по борьбе с пандемией может способствовать поддержка их использования старшими администраторами больниц, привлечение заинтересованных сторон к проверке структуры и разработка или определение процессов анализа решений. Мы обсуждаем достоинства и ограничения прикладной этической основы принятия решений в больнице, а также надежность этой основы. РЕЗЮМЕ: Необходимость в размышлениях над этическими вопросами, поднятыми призраком вспышки пандемического гриппа, огромна. Наши усилия по решению нормативных аспектов планирования мероприятий на случай пандемии в больницах вызвали интерес со стороны других больниц и государственного сектора. Структура потребует переоценки и доработки, и мы надеемся, что этот документ вызовет обратную связь о том, как сделать ее еще более надежной.

предыстория больница весь мир вестись планирование случай следующий вспышка пандемический грипп глобальный опыт борьба атипичный пневмония научить этический основа принятие решение мочь помочь сократить сопутствовать ущерб повысить доверие солидарность внутри организация здравоохранение хороший планирование случай пандемия требовать размышление ценность поскольку наука мочь подсказать подготовиться кризис область общественный здравоохранение обсуждение статья представлять этический основа планирование мера борьба пандемия грипп этический основа разработать использование опыт клинический организационный этический сторона общественный здравоохранение проверить ход процесс взаимодействие заинтересованный сторона этический основа включать содержательный процедурный элемент этический планирование борьба пандемия грипп внедрение этический принцип планирование мера борьба пандемия мочь способствовать поддержка использование старший администратор больница привлечение заинтересованный сторона проверка структура разработка определение процесс анализ решение обсуждать достоинство ограничение прикладной этический основа принятие решение больница также надёжность основа резюме необходимость размышление этический вопрос поднять призрак вспышка пандемический грипп огромный наш усилие решение нормативный аспект планирование мероприятие случай пандемия больница вызвать интерес сторона больница государственный сектор структура потребовать переоценка доработка надеяться документ вызвать обратный связь сделать ещё надёжный

готовность пандемический грипп этический принцип принятие решение

kuf3ssdb

Открытая биопсия легкого на ранней стадии острого респираторного дистресс-синдрома

ВВЕДЕНИЕ: Острый респираторный дистресс-синдром (ОРДС) имеет гетерогенную этиологию, быстрое прогрессирующее течение и высокий уровень смертности. Для улучшения результатов лечения ОРДС необходима точная диагностика и эффективное раннее лечение. В настоящем исследовании изучались клинические эффекты и безопасность открытой биопсии легкого (ОБЛ) у пациентов с ОРДС на ранней стадии предположительно неинфекционного происхождения. МЕТОДЫ: Мы провели ретроспективное исследование 41 пациента с ранней стадией ОРДС (определяемой как одна неделя или менее после интубации), которые перенесли ОЛБ в двух отделениях интенсивной терапии больницы третичного уровня медицинской помощи с 1999 по 2005 год. Анализируемые данные включали исходные характеристики, частоту осложнений, патологические диагнозы, изменения в лечении и выживаемость в больнице. РЕЗУЛЬТАТЫ: Возраст пациентов составил 55 ± 17 лет (среднее значение ± SD). Среднее отношение парциального давления кислорода в артериальной крови (PaO(2)) к фракции вдыхаемого кислорода (FiO(2)) составило 116 ± 43 мм рт. ст. (среднее значение ± SD) при биопсии. У семнадцати пациентов (41%) наблюдался иммунодефицит. Послеоперационные осложнения возникли у 20% пациентов (8/41). Все биопсии дали патологический диагноз с диагностической ценностью 100%. Конкретные патологические диагнозы были поставлены 44% пациентов (18/41). Результаты биопсии привели к изменению тактики лечения у 73% пациентов (30/41). Частота изменения лечения была выше у пациентов с неспецифическими диагнозами, чем у пациентов с специфическими диагнозами (p = 0,0024). Общая смертность составила 50% (21/41) и не зависела от возраста, пола, оксигенации до ОЛБ, частоты осложнений, патологических результатов и изменения лечения. Смертности, связанной с хирургическим вмешательством, не было. В этом исследовании уровень выживаемости пациентов с ослабленным иммунитетом был выше, чем у иммунокомпетентных пациентов (71% против 33%; p = 0,0187). ЗАКЛЮЧЕНИЕ: Наше ретроспективное исследование показывает, что ОЛБ была полезной и приемлемо безопасной диагностической процедурой у некоторых пациентов с ранней стадией ОРДС.

введение острый респираторный дистресс синдром ордс иметь гетерогенный этиология быстрый прогрессировать течение высокий уровень смертность улучшение результат лечение ордс необходимый точный диагностика эффективный ранний лечение настоящий исследование изучаться клинический эффект безопасность открытый биопсия лёгкий обл пациент ордс ранний стадия предположительно неинфекционный происхождение метод провести ретроспективный исследование 41 пациент ранний стадия ордс определять неделя менее интубация перенести олб отделение интенсивный терапия больница третичный уровень медицинский помощь 1999 2005 год анализировать дать включать исходный характеристика частота осложнение патологический диагноз изменение лечение выживаемость больница результат возраст пациент составить 55 17 год средний значение sd средний отношение парциальный давление кислород артериальный кровь pao 2 фракция вдыхать кислород fio 2 составить 116 43 мм рт ст средний значение sd биопсия семнадцать пациент 41 наблюдаться иммунодефицит послеоперационный осложнение возникнуть 20 пациент 8 41 всё биопсия дать патологический диагноз диагностический ценность 100 конкретный патологический диагноз поставить 44 пациент 18 41 результат биопсия привести изменение тактика лечение 73 пациент 30 41 частота изменение лечение выше пациент неспецифический диагноз пациент специфический диагноз p 0 0024 общий смертность составить 50 21 41 зависеть возраст пол оксигенация олб частота осложнение патологический результат изменение лечение смертность связанный хирургический вмешательство это исследование уровень выживаемость пациент ослабить иммунитет выше иммунокомпетентный пациент 71 против 33 p 0 0187 заключение наш ретроспективный исследование показывать олб полезный приемлемый безопасный диагностический процедура некоторый пациент ранний стадия ордс

открытый биопсия лёгкий ранний стадия острый респираторный дистресс синдром

rr2wwvue

Ассоциация и селективность хозяина у патогенов с множественными хозяевами

Распространение патогенов, имеющих несколько хозяев, по всему кругу их хозяев обуславливает динамику и структуру их популяции. Кроме того, коинфекция хозяина различными патогенами может иметь важные последствия для эволюции хозяев и патогенов, а также коэволюции хозяина и патогена. Поэтому интересно узнать, является ли распределение патогенов по кругу их хозяев случайным или существуют ли связи между хозяевами и патогенами или между патогенами, имеющими общего хозяина. Для анализа этих вопросов мы предлагаем индексы для наблюдаемых закономерностей инфицирования хозяина патогенами и для наблюдаемых закономерностей коинфекции, а также тесты для анализа того, соответствуют ли эти закономерности случайности или отражают ассоциации. Применение этих тестов к распространенности пяти вирусов растений на 21 виде диких растений выявило наличие ассоциаций хозяин-вирус: большинство хозяев и вирусов были селективны по отношению к вирусам и хозяевам соответственно. Интересно, что более распространенными были вирусы, избирательно относящиеся к хозяину, что позволяет предположить, что специализация хозяина является успешной стратегией для патогенов, имеющих несколько хозяев. Анализы также показали, что вирусы, как правило, положительно ассоциируются с коинфицированными хозяевами. Разработанные индексы и тесты предоставляют инструменты для анализа того, насколько сильны и распространены эти ассоциации среди различных групп патогенов, что поможет понять и смоделировать популяционную биологию патогенов с множественными хозяевами.

распространение патоген иметь несколько хозяин весь круг хозяин обуславливать динамика структура популяция кроме коинфекция хозяин различный патоген мочь иметь важный последствие эволюция хозяин патоген также коэволюция хозяин патоген поэтому интересно узнать являться распределение патоген круг хозяин случайный существовать связь хозяин патоген патоген иметь общий хозяин анализ вопрос предлагать индекс наблюдать закономерность инфицирование хозяин патоген наблюдать закономерность коинфекция также тест анализ соответствовать закономерность случайность отражать ассоциация применение тест распространённость пять вирус растение 21 вид дикий растение выявить наличие ассоциация хозяин вирус большинство хозяин вирус селективный отношение вирус хозяин соответственно интересно распространить вирус избирательно относиться хозяин позволять предположить специализация хозяин являться успешный стратегия патоген иметь несколько хозяин анализ также показать вирус правило положительно ассоциироваться коинфицировать хозяин разработать индекс тест предоставлять инструмент анализ насколько сильный распространить ассоциация среди различный группа патоген помочь понять смоделировать популяционный биология патоген множественный хозяин

ассоциация селективность хозяин патоген множественный хозяин

1n0rg5vd

Эффективность отслеживания контактов при новых эпидемиях

ПРЕДЫСТОРИЯ: Отслеживание контактов играет важную роль в борьбе с новыми инфекционными заболеваниями, но пока мало что известно о его эффективности. Здесь мы выводим из общей математической модели, как эффективность отслеживания соотносится с различными аспектами времени, такими как течение индивидуальной инфекционности, (изменчивость) времени между заражением и выявлением на основе симптомов, а также задержки в процессе отслеживания. Кроме того, рассматривается возможность итеративного отслеживания еще бессимптомных инфицированных. С помощью этих идей мы объясняем, почему отслеживание контактов было и будет эффективным для контроля оспы и атипичной пневмонии, но лишь частично эффективным для борьбы с ящуром и, скорее всего, неэффективным для борьбы с гриппом. МЕТОДЫ И РЕЗУЛЬТАТЫ: Мы изучаем отслеживание контактов в модели возникающей эпидемии, которая достаточно гибка для использования в отношении большинства инфекций. Мы рассматриваем изоляцию симптоматически инфицированных как базовый сценарий и выражаем эффективность как долю контактов, которые необходимо отслеживать для коэффициента воспроизводства меньше 1. Мы получаем общие результаты для частных случаев, которые интерпретируются с учетом вероятной успешности отслеживания эпидемий гриппа, оспы, атипичной пневмонии и ящура. ВЫВОДЫ: Мы приходим к выводу, что (1) не существует общей прогностической формулы для доли, подлежащей отслеживанию, как это существует для доли, подлежащей вакцинации; (2) изменчивость времени обнаружения благоприятствует эффективному отслеживанию; (3) эффективность отслеживания не обязательно должна быть чувствительна к продолжительности латентного периода и задержкам отслеживания; (4) итеративное отслеживание в первую очередь повышает эффективность, когда одношаговое отслеживание находится на грани эффективности.

предыстория отслеживание контакт играть важный роль борьба новый инфекционный заболевание пока мало известно эффективность выводить общий математический модель эффективность отслеживание соотноситься различный аспект время течение индивидуальный инфекционность изменчивость время заражение выявление основа симптом также задержка процесс отслеживание кроме рассматриваться возможность итеративный отслеживание ещё бессимптомный инфицировать помощь идея объяснять почему отслеживание контакт эффективный контроль оспа атипичный пневмония лишь частично эффективный борьба ящур скорее весь неэффективный борьба грипп метод результат изучать отслеживание контакт модель возникать эпидемия достаточно гибкий использование отношение большинство инфекция рассматривать изоляция симптоматически инфицировать базовый сценарий выражать эффективность доля контакт необходимо отслеживать коэффициент воспроизводство маленький 1 получать общий результат частный случай интерпретироваться учёт вероятный успешность отслеживание эпидемия грипп оспа атипичный пневмония ящур вывод приходить вывод 1 существовать общий прогностический формула доля подлежать отслеживание это существовать доля подлежать вакцинация 2 изменчивость время обнаружение благоприятствовать эффективный отслеживание 3 эффективность отслеживание обязательно должный чувствительный продолжительность латентный период задержка отслеживание 4 итеративный отслеживание первый очередь повышать эффективность одношаговый отслеживание находиться грань эффективность

эффективность отслеживание контакт новый эпидемия

nzh87aux

Время ожидания распространения пандемического гриппа между странами

ПРЕДЫСТОРИЯ: Временная задержка между началом пандемии гриппа и ее последующим распространением в других странах имеет большое значение для планирования готовности. Мы количественно оцениваем распределение этого случайного времени с точки зрения отдельных компонентов этой задержки и оцениваем, насколько задержка может быть увеличена за счет нефармацевтических вмешательств. МЕТОДЫ И ВЫВОДЫ: Модель, построенная для этой временной задержки, учитывает: (i) рост эпидемии в регионе-источнике, (ii) задержку до тех пор, пока инфицированный человек из региона-источника не попытается отправиться в страну, подверженную риску, (iii) вероятность того, что инфицированные путешественники будут обнаружены путем скрининга на границах въезда и выезда, (iv) возможность передачи инфекции во время полета, (v) вероятность того, что прибытие инфицированного человека может не спровоцировать эпидемию, и (vi) задержку до того, как инфекция в стране, подверженной риску, наберет обороты. Меры по снижению числа случаев воспроизводства заболевания в регионе-источнике до уровня ниже двух и жесткие ограничения на поездки наиболее эффективны для задержки локальной эпидемии и при благоприятных обстоятельствах могут добавить к задержке несколько месяцев. С другой стороны, модель прогнозирует, что пограничный скрининг на предмет симптоматической инфекции, ношение защитной маски во время поездки, содействие раннему выявлению случаев заболевания среди прибывающих пассажиров и умеренное сокращение объемов поездок увеличивают задержку всего на несколько дней или недель. Повышенная передача в полете сокращает задержку лишь в минимальной степени. ВЫВОДЫ: Задержка до завоза эпидемии пандемического штамма гриппа в страну, подверженную риску, во многом определяется ходом эпидемии в регионе-источнике и числом путешественников, пытающихся въехать в страну, подверженную риску, и мало зависит от нефармацевтических вмешательств, нацеленных на этих путешественников. За исключением полного предотвращения международных поездок, единственным надежным методом предотвращения распространения пандемического штамма гриппа из страны в страну, по-видимому, является ликвидация зарождающейся пандемии в регионе ее происхождения.

предыстория временной задержка начало пандемия грипп последующий распространение страна иметь большой значение планирование готовность количественно оценивать распределение это случайный время точка зрение отдельный компонент задержка оценивать насколько задержка мочь увеличить счёт нефармацевтический вмешательство метод вывод модель построить временной задержка учитывать i рост эпидемия регион источник ii задержка пора пока инфицировать человек регион источник попытаться отправиться страна подверженный риск iii вероятность инфицировать путешественник обнаружить путём скрининг граница въезд выезд iv возможность передача инфекция время полёт v вероятность прибытие инфицировать человек мочь спровоцировать эпидемия vi задержка инфекция страна подверженный риск набрать оборот мера снижение число случай воспроизводство заболевание регион источник уровень ниже жёсткий ограничение поездка наиболее эффективный задержка локальный эпидемия благоприятный обстоятельство мочь добавить задержка несколько месяц сторона модель прогнозировать пограничный скрининг предмет симптоматический инфекция ношение защитный маска время поездка содействие ранний выявление случай заболевание среди прибывать пассажир умеренный сокращение объём поездка увеличивать задержка весь несколько день неделя повышенный передача полёт сокращать задержка лишь минимальный степень вывод задержка завоз эпидемия пандемический штамм грипп страна подверженный риск многое определяться ход эпидемия регион источник число путешественник пытаться въехать страна подверженный риск мало зависеть нефармацевтический вмешательство нацелить путешественник исключение полный предотвращение международный поездка единственный надёжный метод предотвращение распространение пандемический штамм грипп страна страна видимый являться ликвидация зарождаться пандемия регион происхождение

время ожидание распространение пандемический грипп страна

1y5nej0m

Нейтрализующие антитела не влияют на течение инфекции вируса Эбола у обезьян

Профилактика высокими дозами нейтрализующих антител обычно обеспечивает защиту от заражения вирусами, вызывающими острые инфекции. В данном исследовании мы изучили способность нейтрализующего человеческого моноклонального антитела KZ52 защищать от вируса Эбола у макак-резус. Ранее было показано, что это антитело полностью защищает морских свинок от инфекции. Четырем макакам-резусам внутривенно вводили 50 мг/кг нейтрализующего человеческого моноклонального антитела KZ52 за 1 день до заражения 1000 бляшкообразующими единицами вируса Эбола, а затем вторую дозу 50 мг/кг антитела через 4 дня после заражения. Контрольное животное подвергалось воздействию вируса без лечения антителами. Пассивный перенос нейтрализующего человеческого моноклонального антитела не только не защитил макак от заражения вирусом Эбола, но и оказал минимальное влияние на взрывную репликацию вируса после заражения. Мы показываем, что неспособность антитела воздействовать на инфекцию не была следствием ускользания от нейтрализации. По-видимому, вирус Эбола обладает механизмом распространения инфекции in vivo у макак, который уникально нечувствителен даже к высоким концентрациям нейтрализующих антител.

профилактика высокий доза нейтрализовать антитело обычно обеспечивать защита заражение вирус вызывающий острый инфекция данный исследование изучить способность нейтрализовать человеческий моноклональный антитело kz52 защищать вирус эбола макака резус ранее показать это антитело полностью защищать морской свинка инфекция четыре макака резус внутривенно вводить 50 мг кг нейтрализовать человеческий моноклональный антитело kz52 1 день заражение 1000 бляшкообразуть единица вирус эбола затем второй доза 50 мг кг антитело 4 день заражение контрольный животное подвергаться воздействие вирус лечение антитело пассивный перенос нейтрализовать человеческий моноклональный антитело защитить макака заражение вирус эбола оказать минимальный влияние взрывной репликация вирус заражение показывать неспособность антитело воздействовать инфекция следствие ускользание нейтрализация видимый вирус эбола обладать механизм распространение инфекция in vivo макака уникально нечувствительный высокий концентрация нейтрализовать антитело

нейтрализовать антитело влиять течение инфекция вирус эбола обезьяна

fvfjz7al

Готовность общественного здравоохранения в Альберте: системное исследование

ПРЕДЫСТОРИЯ: Недавние международные и национальные события привлекли пристальное внимание к канадской системе общественного здравоохранения и к тому, насколько она готова реагировать на различные типы современных угроз общественному здоровью. В статье описывается дизайн исследования и методы, используемые для проведения системного анализа готовности общественного здравоохранения в провинции Альберта, Канада. Проект финансируется Фондом медицинских исследований, Фондом медицинских исследований Альберты. МЕТОДЫ/ДИЗАЙН: Мы используем встроенный дизайн многофакторного исследования, объединяющий качественные и количественные методы для эмпирического измерения степени межорганизационной координации, существующей среди учреждений общественного здравоохранения в Альберте, Канада. Мы помещаем наши измерения межорганизационных сетевых связей в структуру системного уровня, чтобы оценить относительное влияние межорганизационных связей, индивидуальных организационных характеристик и институциональных характеристик среды на готовность общественного здравоохранения. Относительный вклад каждого компонента изучается на примере двух потенциальных угроз общественному здравоохранению: пандемического гриппа и вируса Западного Нила. ОБСУЖДЕНИЕ: Организационные аспекты готовности общественного здравоохранения зависят от сложного сочетания индивидуальных организационных характеристик, межведомственных отношений и факторов институциональной среды. Наше исследование призвано провести различие между этими различными компонентами системы и оценить независимое влияние каждого из них на другой, а также общий уровень готовности общественного здравоохранения в Альберте. Хотя все согласны с тем, что компетентные организации и функционирующие сети являются важными компонентами готовности общественного здравоохранения, это исследование является одним из первых, в котором формальный сетевой анализ используется для изучения роли межведомственных сетей в развитии подготовленных систем общественного здравоохранения.

предыстория недавний международный национальный событие привлечь пристальный внимание канадский система общественный здравоохранение насколько готовый реагировать различный тип современный угроза общественный здоровье статья описываться дизайн исследование метод использовать проведение системный анализ готовность общественный здравоохранение провинция альберт канада проект финансироваться фонд медицинский исследование фонд медицинский исследование альберт метод дизайн использовать встроить дизайн многофакторный исследование объединять качественный количественный метод эмпирический измерение степень межорганизационный координация существующий среди учреждение общественный здравоохранение альберт канада помещать наш измерение межорганизационный сетевой связь структура системный уровень оценить относительный влияние межорганизационный связь индивидуальный организационный характеристика институциональный характеристика среда готовность общественный здравоохранение относительный вклад каждый компонент изучаться пример потенциальный угроза общественный здравоохранение пандемический грипп вирус западный нил обсуждение организационный аспект готовность общественный здравоохранение зависеть сложный сочетание индивидуальный организационный характеристика межведомственный отношение фактор институциональный среда наш исследование призвать провести различие различный компонент система оценить независимый влияние каждый также общий уровень готовность общественный здравоохранение альберт хотя всё согласный компетентный организация функционировать сеть являться важный компонент готовность общественный здравоохранение это исследование являться первый формальный сетевой анализ использоваться изучение роль межведомственный сеть развитие подготовить система общественный здравоохранение

готовность общественный здравоохранение альберт системный исследование

lntn11a9

Иммунорегуляторные и аллерген-ассоциированные цитокины в этиологии экссудативного среднего отита.

Воспаление слизистой оболочки среднего уха, которое может быть спровоцировано различными первичными факторами, такими как бактериальная и вирусная инфекция, местные аллергические реакции и рефлюкс, является решающим событием в патогенезе экссудативного среднего отита (ЭСО). Неразрешенные острые воспалительные реакции или дефектная иммунорегуляция среднего воспаления могут способствовать хроническим воспалительным процессам и стимулировать хроническое состояние среднего воспалительного эпителия. Цитокины являются центральными молекулярными регуляторами воспаления среднего уха и могут переводить острую фазу воспаления в хроническую стадию, а также вызывать молекулярно-патологические процессы, приводящие к гистопатологическим изменениям, сопровождающим средний отит. В этом обзоре мы представляем цитокины, выявленные при среднем отите, иммунорегуляторные [интерлейкин (ИЛ)-2, ИЛ-10, трансформирующий фактор роста бета]) и связанные с аллергией (ИЛ-4, ИЛ-5, гранулоцитарно-макрофагальный колониестимулирующий фактор), как важнейшие молекулярные регуляторы, ответственные за хроническое воспаление в среднем ухе и хроническое состояние среднего уха.

воспаление слизистый оболочка среднее ухо мочь спровоцировать различный первичный фактор бактериальный вирусный инфекция местный аллергический реакция рефлюкс являться решающий событие патогенез экссудативный среднее отит эсо неразрешённый острый воспалительный реакция дефектный иммунорегуляция среднее воспаление мочь способствовать хронический воспалительный процесс стимулировать хронический состояние среднее воспалительный эпителий цитокина являться центральный молекулярный регулятор воспаление среднее ухо мочь переводить острый фаза воспаление хронический стадия также вызывать молекулярный патологический процесс приводить гистопатологический изменение сопровождать средний отит это обзор представлять цитокина выявить среднее отит иммунорегуляторный интерлейкина ил 2 ил 10 трансформировать фактор рост бета связанный аллергия ил 4 ил 5 гранулоцитарный макрофагальный колониестимулировать фактор важный молекулярный регулятор ответственный хронический воспаление среднее уха хронический состояние среднее ухо

иммунорегуляторный аллерген ассоциированный цитокина этиология экссудативный среднее отит

nzk8m912

Обзор «от лаборатории до постели больного»: когнитивная дисфункция, связанная с критическими заболеваниями – механизмы, маркеры и новые методы лечения

Когнитивная дисфункция часто встречается у пациентов, находящихся в критическом состоянии, причем не только во время острой фазы заболевания, но и в течение длительного времени после его выздоровления. Считается, что в основе когнитивной дисфункции, связанной с критическими заболеваниями, лежит большое количество патофизиологических механизмов, включая нарушения нейротрансмиттеров и скрытое диффузное поражение головного мозга. Маркеры, которые можно использовать для оценки влияния конкретных механизмов у отдельных пациентов, включают сывороточную антихолинергическую активность, некоторые мозговые белки и определение концентрации натрия в тканях с помощью трехмерной магнитно-резонансной томографии высокого разрешения. Хотя последние терапевтические достижения в этой области впечатляют, они все еще слишком незрелы, чтобы повлиять на лечение пациентов. Необходимы дополнительные исследования, если мы хотим лучше понять относительный вклад конкретных механизмов в развитие когнитивной дисфункции, связанной с критическими заболеваниями, и определить, поддаются ли эти механизмы лечению или профилактике.

когнитивный дисфункция часто встречаться пациент находиться критический состояние причём время острый фаза заболевание течение длительный время выздоровление считаться основа когнитивный дисфункция связанный критический заболевание лежать большой количество патофизиологический механизм включая нарушение нейротрансмиттер скрытый диффузный поражение головной мозг маркер использовать оценка влияние конкретный механизм отдельный пациент включать сывороточный антихолинергический активность некоторый мозговой белка определение концентрация натрий ткань помощь трёхмерный магнитный резонансный томография высокий разрешение хотя последний терапевтический достижение область впечатлять всё ещё слишком незрелый повлиять лечение пациент необходимый дополнительный исследование хотеть хороший понять относительный вклад конкретный механизм развитие когнитивный дисфункция связанный критический заболевание определить поддаваться механизм лечение профилактика

обзор лаборатория постель больной когнитивный дисфункция связать критический заболевание механизм маркер новый метод лечение

ps3mnpzq

ProCAT: подход к анализу данных для белковых микрочипов

Белковые микрочипы представляют собой универсальный метод анализа многих видов биохимической активности белков. Существующие методы анализа ДНК-микрочипов не применимы к белковым микрочипам из-за различий в технологиях. В данной статье мы описываем новый подход ProCAT, который корректирует фоновые смещения и пространственные артефакты, выявляет значимые сигналы, фильтрует неспецифические пятна и нормализует полученный сигнал по содержанию белка. ProCAT обеспечивает новый мощный и гибкий подход к анализу многих типов белковых микрочипов.

белковый микрочип представлять универсальный метод анализ многий вид биохимический активность белок существующий метод анализ днк микрочип применимый белков микрочип различие технология дать статья описывать новый подход procat корректировать фоновый смещение пространственный артефакт выявлять значимый сигнал фильтровать неспецифический пятно нормализовать получить сигнал содержание белок procat обеспечивать новый мощный гибкий подход анализ многий тип белков микрочип

procat подход анализ данные белков микрочип

m56agj4z

Позиционная кластеризация улучшает вычислительное обнаружение участков связывания и идентифицирует новые цис-регуляторные участки в генах субъединиц рецептора ГАМК(А) млекопитающих

Понимание опосредованного факторами транскрипции (ТФ) контроля экспрессии генов остается серьезной проблемой на стыке вычислительной и экспериментальной биологии. Вычислительные методы прогнозирования специфичности сайта связывания ТФ часто ненадежны. С другой стороны, комплексная экспериментальная проверка сложна и требует много времени. Мы представляем простую стратегию, которая значительно повышает надежность и точность вычислительного прогнозирования сайтов связывания. Во-первых, мы оцениваем частоту повторения вычислительных прогнозов TFBS с помощью общепринятых процедур выборки. Мы обнаружили, что подавляющее большинство результатов биологически бессмысленны. Однако кластеризация результатов на основе положения нуклеотидов повышает предсказательную силу. Кроме того, мы обнаружили, что позиционная кластеризация повышает устойчивость к длинным или несовершенно выбранным входным последовательностям. Позиционную кластеризацию также можно использовать в качестве механизма интеграции результатов нескольких подходов к выборке для повышения точности по сравнению с каждым из них в отдельности. Наконец, мы прогнозируем и подтверждаем регуляторные последовательности, частично ответственные за транскрипционный контроль генов субъединицы рецептора γ-аминомасляной кислоты типа А млекопитающих (GABA(A)R). Позиционная кластеризация полезна для улучшения вычислительных прогнозов сайтов связывания и может применяться для улучшения нашего понимания экспрессии генов млекопитающих. В частности, предсказанные регуляторные механизмы в семействе генов субъединицы ГАМК(А)Р млекопитающих могут открыть новые направления исследований для понимания этой фармакологически важной системы рецепторов нейротрансмиттеров.

понимание опосредовать фактор транскрипция тф контроль экспрессия ген оставаться серьёзный проблема стык вычислительный экспериментальный биология вычислительный метод прогнозирование специфичность сайт связывание тф часто ненадёжный сторона комплексный экспериментальный проверка сложный требовать время представлять простой стратегия значительно повышать надёжность точность вычислительный прогнозирование сайт связывание первый оценивать частота повторение вычислительный прогноз tfbs помощь общепринятый процедура выборка обнаружить подавлять большинство результат биологически бессмысленный однако кластеризация результат основа положение нуклеотид повышать предсказательный сила кроме обнаружить позиционный кластеризация повышать устойчивость длинный несовершенно выбрать входной последовательность позиционный кластеризация также использовать качество механизм интеграция результат несколько подход выборка повышение точность сравнение каждый отдельность прогнозировать подтверждать регуляторный последовательность частично ответственный транскрипционный контроль ген субъединица рецептор γ аминомасляный кислота тип млекопитающее gaba a r позиционный кластеризация полезный улучшение вычислительный прогноз сайт связывание мочь применяться улучшение наш понимание экспрессия ген млекопитающее частность предсказать регуляторный механизм семейство ген субъединица гамк р млекопитающее мочь открыть новый направление исследование понимание фармакологически важный система рецептор нейротрансмиттер

позиционный кластеризация улучшать вычислительный обнаружение участок связывание идентифицировать новый цис регуляторный участок ген субъединица рецептор гамк млекопитающее

x2zq0lnt

Трансмиссивность высокопатогенного птичьего гриппа среди коммерческой птицы в промышленно развитых странах

ПРЕДЫСТОРИЯ: В связи с участившимися случаями вспышек гриппа H5N1 во всем мире существует обеспокоенность тем, что вирус может проникнуть на коммерческие птицеводческие фермы, что приведет к серьезным экономическим последствиям. МЕТОДОЛОГИЯ/ОСНОВНЫЕ ВЫВОДЫ: Мы анализируем данные по четырем недавним вспышкам высокопатогенного птичьего гриппа (ВПГП) среди коммерческой птицы, чтобы оценить репродуктивное число ВПГП от фермы к ферме. Репродуктивное число является ключевым показателем трансмиссивности вируса птичьего гриппа на уровне фермы, поскольку его можно использовать для оценки эффективности мер контроля. В ходе этих вспышек среднее репродуктивное число от фермы к ферме до контрольных случаев варьировалось от 1,1 до 2,4, а максимальное репродуктивное число на ферме находилось в диапазоне от 2,2 до 3,2. Усиление биологической безопасности, ограничения передвижения и своевременная изоляция зараженных ферм во всех четырех очагах существенно снизили репродуктивное число, но оно оставалось близким к пороговому значению 1, необходимому для обеспечения ликвидации заболевания. ВЫВОДЫ/ЗНАЧЕНИЕ: Наши результаты показывают, что в зависимости от конкретной ситуации, в которой происходит вспышка птичьего гриппа, текущих мер контроля может быть недостаточно для искоренения заболевания, и поэтому требуется тщательный мониторинг вспышки. Метод, который мы использовали для оценки репродуктивного числа, прост в реализации и может использоваться в режиме реального времени. Поэтому он может стать полезным инструментом для принятия обоснованных политических решений.

предыстория связь участиться случай вспышка грипп h5n1 весь мир существовать обеспокоенность вирус мочь проникнуть коммерческий птицеводческий ферма привести серьёзный экономический последствие методология основной вывод анализировать дать четыре недавний вспышка высокопатогенный птичий грипп впгп среди коммерческий птица оценить репродуктивный число впгп ферма ферма репродуктивный число являться ключевой показатель трансмиссивность вирус птичий грипп уровень ферма поскольку использовать оценка эффективность мера контроль ход вспышка средний репродуктивный число ферма ферма контрольный случай варьироваться 1 1 2 4 максимальный репродуктивный число ферма находиться диапазон 2 2 3 2 усиление биологический безопасность ограничение передвижение своевременный изоляция заразить ферма весь четыре очаг существенно снизить репродуктивный число оно оставаться близкие пороговый значение 1 необходимый обеспечение ликвидация заболевание вывод значение наш результат показывать зависимость конкретный ситуация происходить вспышка птичий грипп текущий мера контроль мочь недостаточно искоренение заболевание поэтому требоваться тщательный мониторинг вспышка метод использовать оценка репродуктивный число простой реализация мочь использоваться режим реальный время поэтому мочь стать полезный инструмент принятие обоснованный политический решение

трансмиссивность высокопатогенный птичий грипп среди коммерческий птица промышленно развитой страна

hf3nytb2

Инструмент планирования готовности к пандемии гриппа InfluSim

ПРЕДЫСТОРИЯ: Планирование мер общественного здравоохранения по борьбе с пандемией гриппа основывается на прогностических моделях, с помощью которых можно оценить воздействие различных стратегий вмешательства. До настоящего времени исследования были сосредоточены скорее на составлении прогнозов для определенных местностей или в определенных условиях, чем на разработке общедоступного инструмента планирования, который могли бы применять органы общественного здравоохранения. Здесь мы предлагаем такой инструмент, который воспроизводится посредством четко сформулированной структуры и предназначен для работы с оптимальным сочетанием конкурирующих требований точности, реалистичности и общности. РЕЗУЛЬТАТЫ: InfluSim — это детерминированная компартментная модель, основанная на системе из более чем 1000 дифференциальных уравнений, которые расширяют классическую модель SEIR клиническими и демографическими параметрами, имеющими значение для планирования готовности к пандемии. Он позволяет рассчитывать временные зависимости и кумулятивное число случаев гриппа, амбулаторных посещений, примененных доз противовирусного лечения, госпитализаций, смертей и рабочих дней, потерянных из-за болезни, — все это может быть связано с экономическими аспектами. Программное обеспечение написано на языке Java, работает независимо от платформы и может запускаться на обычных настольных компьютерах. ВЫВОД: InfluSim — это доступное онлайн-программное обеспечение, которое эффективно помогает специалистам по планированию общественного здравоохранения разрабатывать оптимальные меры по борьбе с пандемией гриппа. Он может воспроизводить динамику заражения пандемическим гриппом подобно сложным компьютерным симуляциям, обеспечивая при этом воспроизводимость, более высокую вычислительную производительность и лучшую работоспособность.

предыстория планирование мера общественный здравоохранение борьба пандемия грипп основываться прогностический модель помощь оценить воздействие различный стратегия вмешательство настоящий время исследование сосредоточить скорее составление прогноз определённый местность определённый условие разработка общедоступный инструмент планирование мочь применять орган общественный здравоохранение предлагать инструмент воспроизводиться посредством чётко сформулировать структура предназначить работа оптимальный сочетание конкурировать требование точность реалистичность общность результат influsim это детерминированный компартментный модель основать система 1000 дифференциальный уравнение расширять классический модель seir клинический демографический параметр иметь значение планирование готовность пандемия позволять рассчитывать временной зависимость кумулятивный число случай грипп амбулаторный посещение применить доза противовирусный лечение госпитализация смерть рабочий день потерянный болезнь всё это мочь связать экономический аспект программный обеспечение написать язык java работать независимо платформа мочь запускаться обычный настольный компьютер вывод influsim это доступный онлайн программный обеспечение эффективно помогать специалист планирование общественный здравоохранение разрабатывать оптимальный мера борьба пандемия грипп мочь воспроизводить динамика заражение пандемический грипп подобно сложный компьютерный симуляция обеспечивать это воспроизводимость высокий вычислительный производительность хороший работоспособность

инструмент планирование готовность пандемия грипп influsim

byp2eqhd

Иммунные пути и защитные механизмы у медоносных пчел Apis mellifera

Социальные насекомые способны выстраивать как групповую, так и индивидуальную защиту от патогенов. Здесь мы сосредоточимся на индивидуальных защитных механизмах, представив полногеномный анализ иммунитета у общественного насекомого — медоносной пчелы Apis mellifera. Мы представляем модели медоносных пчел для каждого из четырех сигнальных путей, связанных с иммунитетом, и выявляем вероятные ортологи почти для всех предсказанных членов пути. По сравнению с секвенированными геномами Drosophila и Anopheles, медоносные пчелы обладают примерно на треть меньшим количеством генов в 17 семействах генов, участвующих в иммунитете к насекомым. Мы предполагаем, что подразумеваемое снижение иммунной гибкости у пчел отражает либо силу социальных барьеров на пути к болезням, либо тенденцию пчел подвергаться нападению ограниченного набора высоко эволюционировавших патогенов.

социальный насекомое способный выстраивать групповой индивидуальный защита патоген сосредоточиться индивидуальный защитный механизм представить полногеномный анализ иммунитет общественный насекомое медоносный пчела apis mellifera представлять модель медоносный пчела каждый четыре сигнальный путь связанный иммунитет выявлять вероятный ортолог весь предсказать член путь сравнение секвенированный геном drosophila anopheles медоносный пчела обладать примерно треть малый количество ген 17 семейство ген участвовать иммунитет насекомое предполагать подразумевать снижение иммунный гибкость пчела отражать либо сила социальный барьер путь болезнь либо тенденция пчела подвергаться нападение ограниченный набор высоко эволюционировать патоген

иммунный путь защитный механизм медоносный пчела apis mellifera

s4y6uxsb

ElaD — деубиквитинирующая протеаза, экспрессируемая E. кишечная палочка

ПРЕДЫСТОРИЯ: Убиквитин и убиквитин-подобные белки (Ubl) предназначены для модификации полипептидов у эукариот. Ковалентное связывание убиквитина или Ubl с субстратными белками может быть отменено специфическими гидролазами. Один конкретный набор цистеиновых протеаз, клан CE, который нацелен на убиквитин и Ubl, имеет гомологов у эукариот, прокариот и вирусов. РЕЗУЛЬТАТЫ: Мы клонировали и проанализировали E. белок кишечной палочки elaD, который отдаленно связан с эукариотическими членами клана CE семейства протеаз ULP/SENP, специфичными для SUMO и Nedd8. Ранее ошибочно аннотированный как предполагаемая сульфатаза/фосфатаза, elaD является эффективным и специфичным деубиквитинирующим ферментом in vitro. Интересно, что elaD присутствует у всех кишечных патогенных E. штаммов кишечной палочки, но заметно отсутствуют среди внекишечных патогенных штаммов (ExPECs). Дальнейшие гомологи этой протеазы можно найти в Acanthamoeba Polyphaga Mimivirus, а также в альфа-, бета- и гаммапротеобактериях. ВЫВОД: Таким образом, экспрессия гидролаз, связанных с ULP/SENP, в бактериях распространяется на фитопатогены и имеющие медицинское значение штаммы Escherichia coli, Legionella pneumophila, Rickettsiae, Chlamydiae и Salmonellae, у которых ортолог elaD sseL недавно был идентифицирован как фактор вирулентности с деубиквитинирующей активностью. В качестве контраргумента наше филогенетическое и функциональное исследование показывает, что древние эукариотические протеазы ULP/SENP также обладают потенциалом убиквитин-специфического гидролиза, что предполагает раннее общее происхождение этого клана пептидаз.

предыстория убиквитин убиквитин подобный белка ubl предназначить модификация полипептид эукариот ковалентный связывание убиквитин ubl субстратный белок мочь отменить специфический гидролаза конкретный набор цистеинов протеаза клан ce нацелить убиквитин ubl иметь гомолог эукариот прокариот вирус результат клонировать проанализировать e белок кишечный палочка elad отдалённо связать эукариотический член клан ce семейство протеаза ulp senp специфичный sumo nedd8 ранее ошибочно аннотировать предполагать сульфатаз фосфатаз elad являться эффективный специфичный деубиквитинировать фермент in vitro интересно elad присутствовать весь кишечный патогенный e штамм кишечный палочка заметно отсутствовать среди внекишечный патогенный штамм expecs дальнейший гомолог протеаза найти acanthamoeba polyphaga mimivirus также альфа бета гаммапротеобактерия вывод образ экспрессия гидролаза связанный ulp senp бактерия распространяться фитопатоген иметь медицинский значение штамм escherichia coli legionella pneumophila rickettsiae chlamydiae salmonellae ортолог elad ssel недавно идентифицировать фактор вирулентность деубиквитинировать активность качество контраргумент наш филогенетический функциональный исследование показывать древний эукариотический протеаза ulp senp также обладать потенциал убиквитин специфический гидролиз предполагать ранний общий происхождение это клан пептидаза

elad деубиквитинировать протеаза экспрессировать e кишечный палочка

9zmyojbu

Мутационный анализ человеческого CEACAM1: потенциал полиморфизма рецептора в повышении восприимчивости хозяина к бактериальной инфекции

Общий перекрывающийся участок на N-концевом домене, подобном IgV, молекул клеточной адгезии, связанных с человеческим карциноэмбриональным антигеном (CEACAMs), является мишенью для нескольких важных респираторных патогенов человека. К ним относятся Neisseria meningitidis (Nm) и Haemophilus influenzae (Hi), которые могут вызывать диссеминированные или персистирующие локализованные инфекции. Чтобы определить точные структурные особенности, определяющие связывание различных патогенов с CEACAM, мы провели молекулярное моделирование и мутацию молекул рецепторов в ранее выявленных ключевых целевых остатках, необходимых для связывания бактерий. К ним относятся Ser-32, Tyr-34, Val-39, Gln-44 и Gln-89, а также Ile-91, основное место стыковки патогенов. Большинство, но не все, из этих остатков располагались рядом друг с другом в предыдущей модели N-домена человеческого CEACAM1, которая была основана на REI, CD2 и CD4. В текущих исследованиях мы усовершенствовали эту модель на основе кристаллической структуры мышиного CEACAM1 и обнаружили, что все вышеперечисленные остатки образуют открытую непрерывную область связывания на N-домене. Изучение модели также показало, что замена двух из этих остатков 34 и 89 может повлиять на доступность Ile-91 для связывания лиганда. Введя выбранные мутации в положениях 91, 34 и 89, мы подтвердили первостепенную важность Ile-91 во всех бактериальных связываниях с CEACAM1, несмотря на межвидовые и внутривидовые структурные различия между бактериальными лигандами, связывающими CEACAM. Исследования также показали, что эффективность связывания была значительно повышена для определенных штаммов за счет таких мутаций, как Y34F и Q89N, которые также изменили иерархию связывания штаммов Nm и Hi. Эти исследования предполагают, что различные полиморфизмы в эпителиальных CEACAM человека могут снижать или повышать риск заражения патогенами, воздействующими на рецепторы.

общий перекрываться участок n концевой домен подобный igv молекула клеточный адгезия связанный человеческий карциноэмбриональный антиген ceacams являться мишень несколько важный респираторный патоген человек относиться neisseria meningitidis nm haemophilus influenzae hi мочь вызывать диссеминировать персистировать локализовать инфекция определить точный структурный особенность определять связывание различный патоген ceacam провести молекулярный моделирование мутация молекула рецептор ранее выявить ключевой целевой остаток необходимый связывание бактерия относиться ser 32 tyr 34 val 39 gln 44 gln 89 также ile 91 основный место стыковка патоген большинство всё остаток располагаться рядом друг друг предыдущий модель n домен человеческий ceacam1 основать rei cd2 cd4 текущий исследование усовершенствовать модель основа кристаллический структура мышиный ceacam1 обнаружить всё вышеперечисленный остаток образовать открытый непрерывный область связывание n домен изучение модель также показать замена остаток 34 89 мочь повлиять доступность ile 91 связывание лиганд ввести выбрать мутация положение 91 34 89 подтвердить первостепенный важность ile 91 весь бактериальный связывание ceacam1 несмотря межвидовой внутривидовой структурный различие бактериальный лиганд связывать ceacam исследование также показать эффективность связывание значительно повысить определённый штамм счёт мутация y34f q89n также изменить иерархия связывание штамм nm hi исследование предполагать различный полиморфизм эпителиальный ceacam человек мочь снижать повышать риск заражение патоген воздействовать рецептор

мутационный анализ человеческий ceacam1 потенциал полиморфизм рецептор повышение восприимчивость хозяин бактериальный инфекция

4y8ghcpq

Воспалительный синдром восстановления иммунитета (ВСВИ): обзор распространенных инфекционных проявлений и вариантов лечения

Воспалительный синдром восстановления иммунитета (ВСВИ) у ВИЧ-инфицированных пациентов, начинающих антиретровирусную терапию (АРТ), возникает в результате восстановления иммунитета к определенным инфекционным или неинфекционным антигенам. Для синдрома характерно парадоксальное клиническое ухудшение известного состояния или появление нового состояния после начала терапии. Возможные механизмы развития синдрома включают частичное восстановление иммунной системы или бурные иммунологические реакции хозяина на антигенные стимулы. Общая заболеваемость ВСВИ неизвестна, но зависит от изучаемой популяции и сопутствующей ей оппортунистической инфекционной нагрузки. Инфекционными возбудителями, наиболее часто вызывающими синдром, являются микобактерии, вирус ветряной оспы, герпесвирусы и цитомегаловирус (ЦМВ). Единого варианта лечения не существует, он зависит от основного инфекционного возбудителя и его клинической картины. В настоящее время проводятся проспективные когортные исследования, посвященные оптимальному скринингу и лечению оппортунистических инфекций у пациентов, имеющих право на АРТ. Эти исследования предоставят доказательства для разработки рекомендаций по лечению с целью снижения бремени ВСВИ. Мы рассматриваем имеющуюся литературу по патогенезу и эпидемиологии ВСВИ и представляем варианты лечения наиболее распространенных инфекционных проявлений этого разнообразного синдрома, а также проявлений, связанных с высокой заболеваемостью.

воспалительный синдром восстановление иммунитет всвить вич инфицировать пациент начинающий антиретровирусный терапия арт возникать результат восстановление иммунитет определённый инфекционный неинфекционный антиген синдром характерный парадоксальный клинический ухудшение известный состояние появление новый состояние начало терапия возможный механизм развитие синдром включать частичный восстановление иммунный система бурный иммунологический реакция хозяин антигенный стимул общий заболеваемость всвить неизвестный зависеть изучать популяция сопутствовать оппортунистический инфекционный нагрузка инфекционный возбудитель наиболее часто вызывающий синдром являться микобактерия вирус ветряный оспа герпесвирус цитомегаловирус цмв единый вариант лечение существовать зависеть основный инфекционный возбудитель клинический картина настоящий время проводиться проспективный когортный исследование посвятить оптимальный скрининг лечение оппортунистический инфекция пациент иметь право арт исследование предоставить доказательство разработка рекомендация лечение цель снижение бремя всвить рассматривать иметься литература патогенез эпидемиология всвить представлять вариант лечение наиболее распространить инфекционный проявление это разнообразный синдром также проявление связанный высокий заболеваемость

воспалительный синдром восстановление иммунитет всвить обзор распространить инфекционный проявление вариант лечение

63bos83o

Глобальный надзор за новыми генотипами вируса гриппа с помощью масс-спектрометрии

ПРЕДЫСТОРИЯ: Эффективный надзор за гриппом требует новых методов, позволяющих проводить быстрый и недорогой геномный анализ эволюционирующих видов вируса для обеспечения готовности к пандемии, понимания эволюции циркулирующих видов вируса и выбора штамма вакцины. Мы разработали один из таких подходов, основанный на ранее описанной технологии широкополосной обратной транскрипции ПЦР/масс-спектрометрии с ионизацией электрораспылением (ОТ-ПЦР/ЭСИ-МС). МЕТОДЫ И ОСНОВНЫЕ ВЫВОДЫ: Анализ базовых составов ампликонов ОТ-ПЦР из основных сегментов гена гриппа (PB1, PB2, PA, M, NS, NP) используется для идентификации подвидов и определения подтипов вируса гриппа H и N. Используя этот подход, мы обнаружили и правильно идентифицировали 92 изолята вируса гриппа млекопитающих и птиц, представляющих 30 различных типов H и N, включая 29 изолятов птичьего гриппа H5N1. Кроме того, прямой анализ 656 клинических образцов респираторного материала человека, собранных за семилетний период (1999–2006 гг.), показал правильную идентификацию видов и подтипов вируса с чувствительностью и специфичностью >97%. Кластеры, полученные на основе базового состава, полученные в результате этого анализа, показали 100% соответствие ранее установленным кладам. Продолжающееся наблюдение за образцами, полученными в ходе последних сезонов вируса гриппа (2005–2006 гг.), продемонстрировало наличие и распространение новых генотипов циркулирующих по всему миру штаммов вируса H3N2. Примерно в 1% недавних образцов были обнаружены смешанные вирусные квазивиды, что дает представление об эволюции вирусов. ВЫВОД/ЗНАЧЕНИЕ: Таким образом, быстрый анализ ОТ-ПЦР/ЭСИ-МС может быть использован для одновременной идентификации всех видов вирусов гриппа с разрешением на уровне клад, выявления смешанных вирусных популяций и мониторинга глобального распространения и появления новых вирусных генотипов. Этот высокопроизводительный метод обещает стать неотъемлемым компонентом надзора за гриппом.

предыстория эффективный надзор грипп требовать новый метод позволять проводить быстрый недорогой геномный анализ эволюционировать вид вирус обеспечение готовность пандемия понимание эволюция циркулировать вид вирус выбор штамм вакцина разработать подход основать ранее описать технология широкополосный обратный транскрипция пцр масса спектрометрия ионизация электрораспыление пцр эси мс метод основной вывод анализ базовый состав ампликоновый пцр основный сегмент ген грипп pb1 pb2 pa m ns np использоваться идентификация подвид определение подтип вирус грипп h n использовать подход обнаружить правильно идентифицировать 92 изолят вирус грипп млекопитающее птица представлять 30 различный тип h n включая 29 изолят птичий грипп h5n1 кроме прямой анализ 656 клинический образец респираторный материал человек собранный семилетний период 1999 2006 год показать правильный идентификация вид подтип вирус чувствительность специфичность 97 кластер получить основа базовый состав получить результат это анализ показать 100 соответствие ранее установленный клад продолжаться наблюдение образец получить ход последний сезон вирус грипп 2005 2006 год продемонстрировать наличие распространение новый генотип циркулировать весь мир штамм вирус h3n2 примерно 1 недавний образец обнаружить смешанный вирусный квазивид давать представление эволюция вирус вывод значение образ быстрый анализ пцр эси мс мочь использовать одновременный идентификация весь вид вирус грипп разрешение уровень клад выявление смешанный вирусный популяция мониторинг глобальный распространение появление новый вирусный генотип высокопроизводительный метод обещать стать неотъемлемый компонент надзор грипп

глобальный надзор новый генотип вирус грипп помощь масса спектрометрия

hqc7u9w3

Параметры передачи эпидемии ящура 2001 г. в Великобритании

Несмотря на интенсивные продолжающиеся исследования, ключевые аспекты пространственно-временной эволюции эпидемии ящура 2001 года в Великобритании (GB) остаются невыясненными. Здесь мы разрабатываем метод Монте-Карло с цепями Маркова (MCMC) для оценки эпидемиологических параметров вспышки 2001 года для ряда простых моделей передачи. Мы делаем упрощающее предположение, что в 2001 году заражённые фермы были полностью обследованы, что эквивалентно предположению, что фермы, которые были заблаговременно забиты, но не диагностированы на ящур, не были заражёнными, даже если некоторые из них были инфицированы. Мы оцениваем, как параметры передачи менялись с течением времени, подчеркивая влияние мер контроля на развитие эпидемии. Мы демонстрируем статистически значимые доказательства ассортативных моделей контактов между животными одного вида. Для подобранных моделей представлены карты прогнозного риска потенциальной передачи в различных географических районах Великобритании.

несмотря интенсивный продолжаться исследование ключевой аспект пространственно временной эволюция эпидемия ящур 2001 год великобритания gb оставаться невыясненный разрабатывать метод монт карло цепь марков mcmc оценка эпидемиологический параметр вспышка 2001 год ряд простой модель передача делать упрощать предположение 2001 год заразить ферма полностью обследовать эквивалентный предположение ферма заблаговременно забитый диагностировать ящур заразить некоторый инфицировать оценивать параметр передача меняться течение время подчёркивать влияние мера контроль развитие эпидемия демонстрировать статистически значимый доказательство ассортативный модель контакт животное вид подобрать модель представить карта прогнозный риск потенциальный передача различный географический район великобритания

параметр передача эпидемия ящур 2001 г великобритания

87zt7lew

Эффективная репликация вируса пневмонии мышей (PVM) в линии клеток макрофагов мышей

Вирус пневмонии мышей (ВПМ; семейство Paramyxoviridae, подсемейство Pneumovirinae) является естественным респираторным патогеном грызунов и важной новой моделью для изучения тяжелого вирусного бронхиолита и пневмонии. Однако, несмотря на высокие титры вируса, обычно обнаруживаемые в инфицированной легочной ткани мышей in vivo, клеточные линии, обычно используемые для размножения вируса in vitro, не обладают высокой восприимчивостью к инфекции PVM. Мы оценили несколько линий клеток грызунов и приматов на восприимчивость к инфекции PVM и выявили самые высокие титры вируса при заражении линии клеток мышиных моноцитов-макрофагов RAW 264.7. Кроме того, репликация вируса в клетках RAW 264.7 индуцирует синтез и секрецию провоспалительных цитокинов, имеющих отношение к респираторным вирусным заболеваниям, включая фактор некроза опухоли-α (TNF-α), интерферон-β (IFN-β), макрофагальные воспалительные белки 1α и 1β (MIP-1α и MIP-1β) и функциональный гомолог человеческого IL-8, мышиный макрофагальный воспалительный пептид-2 (MIP-2). Идентификация и характеристика линии клеток грызунов, которая поддерживает репликацию PVM и индуцирует синтез провоспалительных медиаторов, связанных с заболеванием, будет способствовать изучению молекулярных механизмов вирусного патогенеза, которые дополнят и расширят результаты, полученные на модельных системах мышей.

вирус пневмония мышь впм семейство paramyxoviridae подсемейство pneumovirinae являться естественный респираторный патоген грызун важный новый модель изучение тяжёлый вирусный бронхиолит пневмония однако несмотря высокий титр вирус обычно обнаруживать инфицировать лёгочный ткань мышь in vivo клеточный линия обычно использовать размножение вирус in vitro обладать высокий восприимчивость инфекция pvm оценить несколько линия клетка грызун примат восприимчивость инфекция pvm выявить самый высокий титр вирус заражение линия клетка мышиный моноцит макрофаг raw 264 7 кроме репликация вирус клетка raw 264 7 индуцировать синтез секреция провоспалительный цитокин иметь отношение респираторный вирусный заболевание включая фактор некроз опухоль α tnf α интерферон β ifn β макрофагальный воспалительный белка 1α 1β mip 1α mip 1β функциональный гомолог человеческий il 8 мышиный макрофагальный воспалительный пептид 2 mip 2 идентификация характеристика линия клетка грызун поддерживать репликация pvm индуцировать синтез провоспалительный медиатор связанный заболевание способствовать изучение молекулярный механизм вирусный патогенез дополнить расширить результат получить модельный система мышь

эффективный репликация вирус пневмония мышь pvm линия клетка макрофаг мышь

wgxt36jv

Разработка и проведение штабных учений по оценке готовности общественного здравоохранения к биологическим угрозам антропогенного и естественного происхождения

ПРЕДЫСТОРИЯ: С 2001 года государственные и местные департаменты здравоохранения в Соединенных Штатах Америки (США) активизировали усилия по подготовке к чрезвычайным ситуациям в области общественного здравоохранения, которые могут иметь серьезные последствия. Одним из компонентов этой деятельности стала разработка и проведение программ учений для оценки возможностей, обучения персонала и налаживания взаимоотношений. В данной статье обобщены уроки, извлеченные из командно-штабных учений по готовности к чрезвычайным ситуациям в области общественного здравоохранения, а также по процессу их разработки, проведения и оценки. МЕТОДЫ: Мы разработали, провели и оценили 31 кабинетное учение в сотрудничестве с государственными и местными департаментами здравоохранения по всей территории США с 2003 по 2006 год. Самооценки участников, отчеты о проделанной работе и формы оценки кабинетных учений использовались для выявления аспектов самих учений, а также мер реагирования на чрезвычайные ситуации в области общественного здравоохранения, которые участники посчитали более или менее сложными, а также для выделения извлеченных уроков относительно разработки кабинетных учений. РЕЗУЛЬТАТЫ: Разработка учений включала тесное сотрудничество с представителями участвующих департаментов здравоохранения, чтобы гарантировать, что сценарии были достоверными, учитывали местные потребности и приоритеты в плане готовности и были логистически осуществимыми. В ходе проведения учений почти все департаменты здравоохранения столкнулись с общим набором проблем, связанных с надзором за заболеваниями, эпидемиологическими расследованиями, коммуникацией, командованием и контролем, а также возможностями экстренной медицинской помощи. Напротив, сильные стороны эффективности в разных участвующих учреждениях различались в большей степени, отражая особые характеристики отдельных департаментов здравоохранения или сообществ, опыт реагирования на реальные чрезвычайные ситуации в области общественного здравоохранения или акцент на предыдущих усилиях по обеспечению готовности. ЗАКЛЮЧЕНИЕ: Разработка, проведение и оценка кабинетных учений, описанных в настоящем отчете, стали возможными благодаря совместному планированию с участием заинтересованных сторон из участвующих департаментов здравоохранения, а также разработчиков и организаторов учений из других учреждений. Хотя эти учения выявили как сильные, так и слабые стороны готовности к чрезвычайным ситуациям, необходима дополнительная работа по разработке надежных показателей для оценки эффективности учений, информирования о последующих действиях и разработки проектов повторной оценки учений, которые позволят оценить влияние вмешательств после учений.

предыстория 2001 год государственный местный департамент здравоохранение соединить штат америка сша активизировать усилие подготовка чрезвычайный ситуация область общественный здравоохранение мочь иметь серьёзный последствие компонент деятельность стать разработка проведение программа учение оценка возможность обучение персонал налаживание взаимоотношение дать статья обобщить урок извлечь командный штабной учение готовность чрезвычайный ситуация область общественный здравоохранение также процесс разработка проведение оценка метод разработать провести оценить 31 кабинетный учение сотрудничество государственный местный департамент здравоохранение весь территория сша 2003 2006 год самооценка участник отчёт проделать работа форма оценка кабинетный учение использоваться выявление аспект учение также мера реагирование чрезвычайный ситуация область общественный здравоохранение участник посчитать менее сложный также выделение извлечь урок относительно разработка кабинетный учение результат разработка учение включать тесный сотрудничество представитель участвовать департамент здравоохранение гарантировать сценарий достоверный учитывать местный потребность приоритет план готовность логистически осуществимый ход проведение учение всё департамент здравоохранение столкнуться общий набор проблема связанный надзор заболевание эпидемиологический расследование коммуникация командование контроль также возможность экстренный медицинский помощь напротив сильный сторона эффективность разный участвовать учреждение различаться больший степень отражать особый характеристика отдельный департамент здравоохранение сообщество опыт реагирование реальный чрезвычайный ситуация область общественный здравоохранение акцент предыдущий усилие обеспечение готовность заключение разработка проведение оценка кабинетный учение описать настоящий отчёт стать возможный благодаря совместный планирование участие заинтересованный сторона участвовать департамент здравоохранение также разработчик организатор учение учреждение хотя учение выявить сильный слабый сторона готовность чрезвычайный ситуация необходимый дополнительный работа разработка надёжный показатель оценка эффективность учение информирование последующий действие разработка проект повторный оценка учение позволить оценить влияние вмешательство учение

разработка проведение штабной учение оценка готовность общественный здравоохранение биологический угроза антропогенный естественный происхождение

qbldmef1

Аннотации на уровне транскрипта наборов зондов Affymetrix улучшают интерпретацию данных экспрессии генов

ПРЕДЫСТОРИЯ: Широкое использование микрочипов Affymetrix в различных областях биологических исследований сделало аннотацию набора зондов важной проблемой. Стандартная аннотация набора зондов Affymetrix осуществляется на уровне генов, т. е. набор зондов точно связан с геном, а интенсивность набора зондов интерпретируется как экспрессия гена. Расширение знаний о том, что один ген может иметь несколько вариантов транскриптов, явно указывает на необходимость обновления этой аннотации на уровне гена до уточненного уровня транскрипта. РЕЗУЛЬТАТЫ: Выполняя тщательное выравнивание последовательностей зондов Affymetrix с полным пулом доступных в настоящее время последовательностей транскриптов и дополнительно связывая наборы зондов с Международным индексом белков, мы создали таблицы аннотаций на уровне транскриптов или белков для двух популярных массивов экспрессии Affymetrix: массива Mouse Genome 430A 2.0 и массива Human Genome U133A. Применение наших новых аннотаций при повторном изучении существующих наборов данных по экспрессии показывает возросшую согласованность экспрессии среди синонимичных наборов зондов и усиленную корреляцию экспрессии между взаимодействующими белками. ЗАКЛЮЧЕНИЕ: Усовершенствуя стандартную аннотацию Affymetrix наборов зондов микрочипов от уровня генов до уровня транскриптов и уровня белков, можно добиться более надежной интерпретации их экспериментальных данных, что может привести к открытию более глубоких регуляторных механизмов.

предыстория широкий использование микрочип affymetrix различный область биологический исследование сделать аннотация набор зонд важный проблема стандартный аннотация набор зонд affymetrix осуществляться уровень ген набор зонд точно связать геном интенсивность набор зонд интерпретироваться экспрессия ген расширение знание ген мочь иметь несколько вариант транскрипт явно указывать необходимость обновление аннотация уровень ген уточнить уровень транскрипта результат выполнять тщательный выравнивание последовательность зонд affymetrix полный пул доступный настоящий время последовательность транскрипт дополнительно связывать набор зонд международный индекс белок создать таблица аннотация уровень транскрипт белок популярный массив экспрессия affymetrix массив mouse genome 430a 2 0 массив human genome u133a применение наш новый аннотация повторный изучение существующий набор данные экспрессия показывать возрасти согласованность экспрессия среди синонимичный набор зонд усиленный корреляция экспрессия взаимодействовать белок заключение усовершенствовать стандартный аннотация affymetrix набор зонд микрочип уровень ген уровень транскрипт уровень белок добиться надёжный интерпретация экспериментальный данные мочь привести открытие глубокий регуляторный механизм

аннотация уровень транскрипта набор зонд affymetrix улучшать интерпретация данные экспрессия ген