_id
stringlengths 8
8
| title
stringlengths 0
1.19k
| text
stringlengths 0
125k
| metadata
dict | processed_text
stringlengths 0
113k
| processed_title
stringlengths 0
1.11k
|
---|---|---|---|---|---|
nn09hh29 | Использование динамического стохастического моделирования для оценки популяционных факторов риска инфекционных заболеваний: пример FIV в 15 популяциях кошек | ПРЕДЫСТОРИЯ: В естественных популяциях кошек вирус иммунодефицита кошек (ВИК) передается через укусы между особями. Такие факторы, как плотность кошек в популяции или соотношение полов, могут иметь потенциально сильное влияние на частоту драк между особями и, следовательно, являются важными популяционными факторами риска заражения ВИК. МЕТОДОЛОГИЯ/ОСНОВНЫЕ ВЫВОДЫ: Для изучения таких популяционных факторов риска мы представляем данные о распространенности ВИК в 15 популяциях кошек на северо-востоке Франции. Мы исследуем пять ключевых социальных факторов популяций кошек: плотность кошек, соотношение полов, количество самцов и средний возраст самцов и самок в популяции. Мы преодолеваем проблему зависимости в данных об инфекционном статусе, используя структурированные по полу динамические стохастические модели. На частоту передачи вируса от мужчины к женщине влиял только возраст мужчин и женщин (p = 0,043 и p = 0,02 соответственно). Благодаря многочисленным тестам вполне вероятно, что эти эффекты на самом деле незначительны. Наконец, мы показываем, что в нашей области исследования данные можно объяснить с помощью очень простой модели, которая не учитывает никаких факторов риска. ЗАКЛЮЧЕНИЕ: Наш вывод заключается в том, что в системах хозяин-паразит в целом колебания, обусловленные стохастичностью процесса передачи, по своей природе очень велики и могут сами по себе объяснить большую часть изменчивости наблюдаемой распространенности заболеваний между популяциями, чем предполагалось ранее. Наконец, мы определили доверительные интервалы для простых параметров модели, которые можно использовать для дальнейшей помощи в лечении заболевания. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2770169/",
"pubmed_id": "19888418"
} | предыстория естественный популяция кошка вирус иммунодефицит кошка вика передаваться укус особь фактор плотность кошка популяция соотношение пол мочь иметь потенциально сильный влияние частота драка особь следовательно являться важный популяционный фактор риск заражение вика методология основной вывод изучение популяционный фактор риск представлять дать распространённость вика 15 популяция кошка северо восток франция исследовать пять ключевой социальный фактор популяция кошка плотность кошка соотношение пол количество самец средний возраст самец самка популяция преодолевать проблема зависимость данные инфекционный статус использовать структурировать пол динамический стохастический модель частота передача вирус мужчина женщина влиять возраст мужчина женщина p 0 043 p 0 02 соответственно благодаря многочисленный тест вполне вероятно эффект дело незначительный показывать наш область исследование дать объяснить помощь очень простой модель учитывать никакой фактор риск заключение наш вывод заключаться система хозяин паразит целое колебание обусловить стохастичность процесс передача свой природа очень большой мочь объяснить больший часть изменчивость наблюдать распространённость заболевание популяция предполагаться ранее определить доверительный интервал простой параметр модель использовать дальнейший помощь лечение заболевание | использование динамический стохастический моделирование оценка популяционный фактор риск инфекционный заболевание пример fiv 15 популяция кошка |
7658dmvk | Программное обеспечение для прогнозирования мультиплексных праймеров для расходящихся целей | Мы описываем алгоритм прогнозирования мультиплексных праймеров (MPP) для создания мультиплексных совместимых наборов праймеров для амплификации всех членов больших, разнообразных и невыровненных наборов целевых последовательностей. Алгоритм MPP масштабируется до более крупных целевых наборов, чем другое доступное программное обеспечение, и не требует многократного выравнивания последовательностей. Мы применили его к вопросам обнаружения вирусов и продемонстрировали, что среди вирусов не существует универсально консервативных последовательностей праймеров и что для генерации ампликонов из всех секвенированных вирусов может потребоваться неоправданно большое количество праймеров (∼3700 18-меров или ∼2000 10-меров). Затем мы разработали наборы праймеров отдельно для каждого семейства вирусов, а также для нескольких различных видов, таких как вирус ящура (FMDV), сегменты гемагглютинина (HA) и нейраминидазы (NA) вируса гриппа А, вируса Норволка и ВИЧ-1. Мы эмпирически продемонстрировали применение программного обеспечения с мультиплексным набором из 16 коротких (10 нуклеотидов) праймеров, предназначенных для амплификации семейства Poxviridae с целью получения специфического ампликона из вируса вакцинии. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2770652/",
"pubmed_id": "19759213"
} | описывать алгоритм прогнозирование мультиплексный праймер mpp создание мультиплексный совместимый набор праймер амплификация весь член больший разнообразный невыровненный набор целевой последовательность алгоритм mpp масштабироваться крупный целевой набор доступный программный обеспечение требовать многократный выравнивание последовательность применить вопрос обнаружение вирус продемонстрировать среди вирус существовать универсально консервативный последовательность праймер генерация ампликоновый весь секвенировать вирус мочь потребоваться неоправданно большой количество праймер 3700 18 мер 2000 10 мер затем разработать набор праймер отдельно каждый семейство вирус также несколько различный вид вирус ящур fmdv сегмент гемагглютинин ha нейраминидаза na вирус грипп вирус норволк вич 1 эмпирически продемонстрировать применение программный обеспечение мультиплексный набор 16 короткий 10 нуклеотид праймер предназначить амплификация семейство poxviridae цель получение специфический ампликона вирус вакцинии | программный обеспечение прогнозирование мультиплексный праймер расходиться цель |
uvf5qzfd | Короткие шпилечные РНК, доставляемые лентивирусным вектором, запускают активацию IFN, опосредованную RIG-I | Активация пути интерферона I типа (ИФН) с помощью малой интерферирующей РНК (siRNA) является основным фактором, способствующим нецелевым эффектам РНК-интерференции в клетках млекопитающих. Хотя индукция IFN усложняет исследования функций генов, иммуностимуляция с помощью siRNA может быть полезной в определенных терапевтических ситуациях. Сообщалось, что различные формы siRNA, отвечающие различным композиционным и структурным требованиям, вызывают активацию IFN. Общее мнение заключается в том, что внутриклеточно экспрессируемые короткие шпилечные РНК (shRNA) менее склонны к активации IFN, поскольку они не обнаруживаются рецепторами на поверхности клеток. В частности, сообщалось, что трансдукция shRNA, опосредованная лентивирусным вектором, позволяет избежать реакции IFN. В данной работе мы идентифицируем shRNA, которая эффективно активирует путь IFN в клетках человека в зависимости от последовательности и 5′-трифосфата. Помимо подавления целевой мРНК, экспрессия shRNA приводит к димеризации регуляторного фактора интерферона-3, активации промоторов IFN и секреции биологически активных IFN во внеклеточную среду. Доставка с помощью лентивирусной векторной трансдукции не позволила избежать активации IFN этой и другой, неродственной shRNA. Мы также продемонстрировали, что ген I, индуцируемый ретиноевой кислотой, а не ген 5, ассоциированный с дифференцировкой меланомы, или толл-подобный рецептор 3, является цитоплазматическим сенсором для внутриклеточно экспрессируемых shRNA, которые запускают активацию IFN. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2770676/",
"pubmed_id": "19729514"
} | активация путь интерферон i тип ифн помощь малый интерферировать рнк sirna являться основный фактор способствовать нецелевой эффект рнк интерференция клетка млекопитающее хотя индукция ifn усложнять исследование функция ген иммуностимуляция помощь sirna мочь полезный определённый терапевтический ситуация сообщаться различный форма sirna отвечать различный композиционный структурный требование вызывать активация ifn общий мнение заключаться внутриклеточный экспрессировать короткий шпилечный рнк shrna менее склонный активация ifn поскольку обнаруживаться рецептор поверхность клетка частность сообщаться трансдукция shrna опосредовать лентивирусный вектор позволять избежать реакция ifn дать работа идентифицировать shrna эффективно активировать путь ifn клетка человек зависимость последовательность 5 трифосфат помимо подавление целевой мрнк экспрессия shrna приводить димеризация регуляторный фактор интерферон 3 активация промотор ifn секреция биологически активный ifn внеклеточный среда доставка помощь лентивирусный векторный трансдукция позволить избежать активация ifn неродственный shrna также продемонстрировать ген i индуцировать ретиноев кислота ген 5 ассоциированный дифференцировка меланома толл подобный рецептор 3 являться цитоплазматический сенсор внутриклеточный экспрессировать shrna запускать активация ifn | короткий шпилечный рнк доставлять лентивирусный вектор запускать активация ifn опосредовать rig i |
cai6tqxq | Ранняя диверсификация гриппа A/H1N1pdm | Предыстория С момента своего первого обнаружения в апреле 2009 года вирус гриппа A/H1N1pdm быстро распространился среди людей, унеся с собой более 5700 человеческих жизней. Однако мало что известно об эволюционной динамике H1N1pdm и его географической и временной диверсификации. Методы Филогенетический анализ проводился на основе конкатенированных кодирующих областей последовательностей всего генома 290 изолятов вируса H1N1pdm, отобранных по всему миру в период с 1 апреля по 9 июля 2009 года, включая относительно большие образцы из американских штатов Висконсин и Нью-Йорк. Результаты По меньшей мере 7 филогенетически различных вирусных кладов распространились по всему миру и совместно циркулировали в местностях, где наблюдалось многократное занесение H1N1pdm. В эпидемиях в Нью-Йорке и Висконсине доминировали две разные клады, обе филогенетически отличающиеся от вирусов, впервые выявленных в Калифорнии и Мексике, что указывает на важную роль эффектов основателя в определении локальных структур вирусной популяции. Выводы Определение глобального разнообразия H1N1pdm имеет решающее значение для понимания эволюции и пространственного распространения текущей пандемии, а также для прогнозирования ее будущего воздействия на популяции людей. Наши результаты показывают, что H1N1pdm уже разделился на отдельные вирусные линии с определенными пространственными закономерностями. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2773564/",
"pubmed_id": "20029664"
} | предыстория момент свой первый обнаружение апрель 2009 год вирус грипп a h1n1pdm быстро распространиться среди человек унести 5700 человеческий жизнь однако мало известно эволюционный динамика h1n1pdm географический временной диверсификация метод филогенетический анализ проводиться основа конкатенировать кодировать область последовательность весь геном 290 изолят вирус h1n1pdm отобрать весь мир период 1 апрель 9 июль 2009 год включая относительно больший образец американский штат висконсин нью йорк результат малый мера 7 филогенетически различный вирусный клад распространиться весь мир совместно циркулировать местность наблюдаться многократный занесение h1n1pdm эпидемия нью йорк висконсин доминировать разный клад оба филогенетически отличаться вирус впервые выявить калифорния мексика указывать важный роль эффект основатель определение локальный структура вирусный популяция вывод определение глобальный разнообразие h1n1pdm иметь решающий значение понимание эволюция пространственный распространение текущий пандемия также прогнозирование будущее воздействие популяция человек наш результат показывать h1n1pdm разделиться отдельный вирусный линия определённый пространственный закономерность | ранний диверсификация грипп a h1n1pdm |
tkxpjlyn | Рецепторы вирусов суперсемейства иммуноглобулинов и эволюция адаптивного иммунитета | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2777377/",
"pubmed_id": "19956667"
} | рецептор вирус суперсемейство иммуноглобулин эволюция адаптивный иммунитет |
||
t74b5j2j | Опосредованная пептидами клеточная доставка терапевтических средств на основе олигонуклеотидов in vitro: количественная оценка общей эффективности с использованием простых в использовании репортерных систем | Клеточное поглощение терапевтических олигонуклеотидов и последующая внутриклеточная транспортировка к целевым участкам представляют собой основное техническое препятствие для биологической эффективности этих потенциальных препаратов. Соответственно, лаборатории по всему миру сосредоточены на разработке подходящих систем доставки. Среди различных доступных невирусных систем, таких как катионные полимеры, катионные липосомы и полимерные наночастицы, пептиды, проникающие в клетки (КПК), представляют собой привлекательную концепцию, позволяющую обойти проблему плохой проницаемости мембран этих заряженных макромолекул. Хотя поглощение само по себе в большинстве случаев не является основным препятствием для доставки нуклеиновых кислот in vitro, становится все более очевидным, что узким местом является внутриклеточный транспорт. Вследствие этого для оптимизации данной системы доставки требуется параллельный анализ интернализованной нуклеиновой кислоты и соответствующего биологического эффекта для определения общей эффективности. В этом обзоре мы сосредоточимся на пептидно-опосредованной доставке siRNA и стерических блоковых олигонуклеотидов, а также обсудим различные методы количественной оценки количества поглощенного груза и способы соотнесения этих цифр с биологическими эффектами с помощью простых в использовании репортерных систем. Чтобы проиллюстрировать текущие ограничения невирусных систем доставки нуклеиновых кислот, мы приводим собственные данные в качестве примера и обсуждаем варианты улучшения транспортировки молекул, заключенных в клеточных компартментах. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2778081/",
"pubmed_id": "19075740"
} | клеточный поглощение терапевтический олигонуклеотид последующий внутриклеточный транспортировка целевой участок представлять основный технический препятствие биологический эффективность потенциальный препарат соответственно лаборатория весь мир сосредоточить разработка подходящий система доставка среди различный доступный невирусный система катионный полимер катионный липосома полимерный наночастица пептид проникать клетка кпк представлять привлекательный концепция позволять обойти проблема плохой проницаемость мембрана зарядить макромолекула хотя поглощение большинство случай являться основный препятствие доставка нуклеиновый кислота in vitro становиться всё очевидный узкий место являться внутриклеточный транспорт вследствие это оптимизация дать система доставка требоваться параллельный анализ интернализовать нуклеиновый кислота соответствующий биологический эффект определение общий эффективность это обзор сосредоточиться пептидный опосредовать доставка sirna стерический блоковый олигонуклеотид также обсудить различный метод количественный оценка количество поглотить груз способ соотнесение цифра биологический эффект помощь простой использование репортерный система проиллюстрировать текущий ограничение невирусный система доставка нуклеиновый кислота приводить собственный дать качество пример обсуждать вариант улучшение транспортировка молекула заключить клеточный компартмент | опосредовать пептид клеточный доставка терапевтический средство основа олигонуклеотид in vitro количественный оценка общий эффективность использование простой использование репортерный система |
p4exyu56 | Специфические для малярии В-клетки человека, ассоциированные с беременностью, нацелены на полиморфные, конформационные эпитопы в VAR2CSA | Малярия, связанная с беременностью (МАБ), вызывается эритроцитами (ЭИ), инфицированными Plasmodium falciparum, которые связываются с хондроитинсульфатом А (ХСА) в плаценте с помощью клонально-вариантных поверхностных антигенов (ВСА), связанных с МАБ. Специфические для беременности VSA (VSA(PAM)), включающие вариант PfEMP1 VAR2CSA, являются мишенями защитного иммунитета к PAM, опосредованного IgG. В данной работе мы представляем исследование специфичности естественно приобретенного иммунитета к PAM с использованием восьми человеческих моноклональных антител IgG1, которые реагируют исключительно с интактными IE, связывающимися с CSA и экспрессирующими VSA(PAM). Четыре из них реагировали в вестерн-блоттинге с белками с высокой молекулярной массой (> 200 кДа), а семь реагировали либо с доменами DBL3-X, либо с DBL5-ε VAR2CSA, экспрессируемыми либо в виде конструкций бакуловируса, либо на поверхности трансфицированных клеток Jurkat. Мы использовали панель рекомбинантных антигенов, представляющих домены DBL3-X из P. полевых изолятов falciparum для оценки разнообразия эпитопов В-клеток среди изолятов паразитов и идентифицировали сайт связывания одного моноклонального антитела с использованием химерной конструкции DBL3-X. Наши результаты показывают, что существует высокочастотная реакция памяти на VSA(PAM), что указывает на то, что VAR2CSA является основной мишенью естественно приобретенного защитного иммунитета, специфичного к PAM, и демонстрируют ценность человеческих моноклональных антител и конформационно неповрежденных рекомбинантных антигенов в характеристике VSA. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2779471/",
"pubmed_id": "17176260"
} | малярия связать беременность маб вызываться эритроцит эи инфицировать plasmodium falciparum связываться хондроитинсульфат хса плацента помощь клонально вариантный поверхностный антиген вса связанный маб специфический беременность vsa vsa pam включать вариант pfemp1 var2csa являться мишень защитный иммунитет pam опосредовать igg дать работа представлять исследование специфичность естественно приобрести иммунитет pam использование восемь человеческий моноклональный антитело igg1 реагировать исключительно интактный ie связываться csa экспрессируть vsa pam четыре реагировать вестерн блоттинг белок высокий молекулярный масса 200 кда семь реагировать либо домен dbl3 x либо dbl5 ε var2csa экспрессируть либо вид конструкция бакуловирус либо поверхность трансфицировать клетка jurkat использовать панель рекомбинантный антиген представлять домен dbl3 x p полевой изолят falciparum оценка разнообразие эпитоп клетка среди изолят паразит идентифицировать сайт связывание моноклональный антитело использование химерный конструкция dbl3 x наш результат показывать существовать высокочастотный реакция память vsa pam указывать var2csa являться основной мишень естественно приобрести защитный иммунитет специфичный pam демонстрировать ценность человеческий моноклональный антитело конформационный неповреждённый рекомбинантный антиген характеристика vsa | специфический малярия клетка человек ассоциированный беременность нацелить полиморфный конформационный эпитоп var2csa |
dqqcajjd | Проект OptAIDS: на пути к глобальной остановке ВИЧ/СПИДа | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2779497/",
"pubmed_id": "19922679"
} | проект optaids путь глобальный остановка вич спид |
||
ugbwvy6j | Ранняя оценка тревожности и поведенческой реакции на новый вирус гриппа свиного происхождения A(H1N1) | ПРЕДЫСТОРИЯ: С конца апреля 2009 года новый вирус гриппа A (H1N1), обычно называемый «свиным гриппом», распространился по всему миру и заразил сотни тысяч людей. В течение первых нескольких дней после первоначальной вспышки в Мексике широкое освещение в СМИ в сочетании с высокой степенью неопределенности относительно заразности и уровня смертности, связанных с вирусом, вызвали широкую обеспокоенность среди населения. На распространение инфекционного заболевания могут оказывать сильное влияние изменения поведения (например, социальное дистанцирование) на ранней стадии эпидемии, однако данные о восприятии риска и поведенческой реакции на новый вирус обычно собираются со значительной задержкой или после того, как эпидемия уже прошла. МЕТОДОЛОГИЯ/ОСНОВНЫЕ ВЫВОДЫ: Здесь мы сообщаем о результатах онлайн-опроса, в ходе которого были собраны данные (n = 6249) о восприятии риска вспышки гриппа A(H1N1) в течение первых нескольких дней широкого освещения в СМИ (28 апреля - 5 мая 2009 г.). Мы обнаружили, что после первоначально высокого уровня беспокойства уровень тревожности снизился вместе с восприятием вируса как непосредственной угрозы. В целом наши данные свидетельствуют о том, что эмоциональный статус опосредует поведенческую реакцию. Интересно, что анализ главных компонентов выявил сильную кластеризацию тревожности по поводу свиного гриппа, птичьего гриппа и терроризма. Все три угрозы привлекают большое внимание средств массовой информации, и их фундаментальная неопределенность, вероятно, породит чрезмерный страх перед их реальной угрозой. ВЫВОДЫ/ЗНАЧЕНИЕ: Наши результаты показывают, что поведение респондентов меняется предсказуемым образом. Особый интерес представляет тот факт, что мы обнаружили, что аффективные переменные, такие как самооценка тревожности по поводу эпидемии, опосредуют вероятность того, что респонденты будут придерживаться защитного поведения. Понимание того, как меняется защитное поведение, такое как социальное дистанцирование, и конкретных факторов, которые его опосредуют, может помочь в разработке стратегий борьбы с эпидемией. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2779851/",
"pubmed_id": "19997505"
} | предыстория конец апрель 2009 год новый вирус грипп a h1n1 обычно называть свиной грипп распространиться весь мир заразить сотня тысяча человек течение первый несколько день первоначальный вспышка мексика широкий освещение сми сочетание высокий степень неопределённость относительно заразность уровень смертность связанный вирус вызвать широкий обеспокоенность среди население распространение инфекционный заболевание мочь оказывать сильный влияние изменение поведение например социальный дистанцирование ранний стадия эпидемия однако дать восприятие риск поведенческий реакция новый вирус обычно собираться значительный задержка эпидемия пройти методология основной вывод сообщать результат онлайн опрос ход собрать дать n 6249 восприятие риск вспышка грипп a h1n1 течение первый несколько день широкий освещение сми 28 апрель 5 май 2009 г обнаружить первоначально высокий уровень беспокойство уровень тревожность снизиться вместе восприятие вирус непосредственный угроза целое наш дать свидетельствовать эмоциональный статус опосредовать поведенческий реакция интересно анализ главный компонент выявить сильный кластеризация тревожность повод свиной грипп птичий грипп терроризм всё угроза привлекать большой внимание средство массовый информация фундаментальный неопределённость вероятно породить чрезмерный страх реальный угроза вывод значение наш результат показывать поведение респондент меняться предсказуемый образ особый интерес представлять факт обнаружить аффективный переменный самооценка тревожность повод эпидемия опосредовать вероятность респондент придерживаться защитный поведение понимание меняться защитный поведение социальный дистанцирование конкретный фактор опосредовать мочь помочь разработка стратегия борьба эпидемия | ранний оценка тревожность поведенческий реакция новый вирус грипп свиной происхождение a h1n1 |
0pe8691t | Точная проекция шума для моделей с уменьшенной стохастичностью эпидемий | Мы рассматриваем стохастическую эпидемиологическую модель «восприимчивый-контактировавший-инфицированный-выздоровевший» (SEIR). Используя преобразование координат в нормальной форме, мы можем аналитически вывести стохастическое центральное многообразие вместе с соответствующим сокращенным набором уравнений стохастической эволюции. Преобразование правильно проецирует как динамику, так и шум на центральный коллектор. Таким образом, решение этой редуцированной стохастической динамической системы дает превосходное согласие как по амплитуде, так и по фазе с решением исходной стохастической системы для временного масштаба, который на порядки больше типичного времени релаксации. Этот новый метод позволяет улучшить прогнозирование временных рядов числа случаев заражения при моделировании распространения заболевания в популяции. Численные решения флуктуаций модели SEIR рассматриваются в пределе бесконечной популяции с использованием подхода уравнения Ланжевена, а также в конечной популяции, моделируемой как марковский процесс. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2780467/",
"pubmed_id": "20059206"
} | рассматривать стохастический эпидемиологический модель восприимчивый контактировать инфицировать выздороветь seir использовать преобразование координата нормальный форма мочь аналитически вывести стохастический центральный многообразие вместе соответствовать сократить набор уравнение стохастический эволюция преобразование правильно проецировать динамика шум центральный коллектор образ решение редуцировать стохастический динамический система давать превосходный согласие амплитуда фаза решение исходный стохастический система временной масштаб порядок большой типичный время релаксация новый метод позволять улучшить прогнозирование временной ряд число случай заражение моделирование распространение заболевание популяция численный решение флуктуация модель seir рассматриваться предел бесконечный популяция использование подход уравнение ланжевена также конечный популяция моделировать марковский процесс | точный проекция шум модель уменьшить стохастичность эпидемия |
eabho73n | Сравнение показателей расстояния в пространственном аналитическом моделировании для планирования услуг здравоохранения | ПРЕДЫСТОРИЯ: Для оценки расстояния в исследованиях здравоохранения использовалось несколько методологических подходов. В этом исследовании, посвященном услугам катетеризации сердца, для оценки расстояний от места жительства пациента до больницы используются евклидовы, манхэттенские и менее известные метрики расстояний Минковского. Метрики расстояния обычно дают менее точные оценки, чем фактические измерения, но каждая метрика предоставляет единую модель перемещения по заданной сети. Таким образом, метрики расстояния, в отличие от реальных измерений, могут быть напрямую использованы в пространственном аналитическом моделировании. Чаще всего используется евклидово расстояние, но вряд ли это самая подходящая метрика. Расстояние Минковского — более перспективный метод. Расстояния, рассчитанные с использованием каждой метрики, сопоставляются с измерениями расстояния по дороге и времени в пути, а оптимизированное расстояние Минковского применяется в пространственном аналитическом моделировании. МЕТОДЫ: Расстояние и время в пути рассчитываются на основе почтового индекса места жительства каждого пациента, проходящего катетеризацию сердца, до соответствующей больницы. Метрика Минковского оптимизирована для приблизительного определения времени в пути и расстояния по дороге соответственно. Затем оценки расстояний и измерения расстояний сравниваются с использованием методов описательной статистики и визуального картирования. Оптимизированная метрика Минковского реализована посредством матрицы пространственных весов в пространственной регрессионной модели, выявляющей социально-экономические факторы, в значительной степени связанные с катетеризацией сердца. РЕЗУЛЬТАТЫ: Коэффициент Минковского, который наилучшим образом аппроксимирует расстояние по дороге, составляет 1,54; 1,31 наилучшим образом аппроксимирует время в пути. Последний показатель также является хорошим показателем расстояния по дороге, что позволяет получить наилучшую единую модель путешествия от места жительства пациента до больницы. В регрессионной модели поочередно реализованы евклидова метрика и оптимальная метрика Минковского, а результаты сравниваются. Метод Минковского дает более надежные результаты, чем традиционная евклидова метрика. ВЫВОД: Измерения расстояния и времени в пути по дороге являются наиболее точными оценками, но их невозможно напрямую реализовать в пространственном аналитическом моделировании. Евклидово расстояние имеет тенденцию недооценивать расстояние по дороге и время в пути; манхэттенское расстояние имеет тенденцию переоценивать и то, и другое. Оптимизированное расстояние Минковского частично преодолевает их недостатки; оно обеспечивает единую модель перемещения по сети. Метод является гибким, подходит для аналитического моделирования и точнее традиционных метрик; его использование в конечном итоге повышает надежность пространственных аналитических моделей. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2781002/",
"pubmed_id": "19895692"
} | предыстория оценка расстояние исследование здравоохранение использоваться несколько методологический подход это исследование посвятить услуга катетеризация сердце оценка расстояние место жительство пациент больница использоваться евклидов манхэттенский менее известный метрика расстояние минковский метрика расстояние обычно давать менее точный оценка фактический измерение каждый метрика предоставлять единый модель перемещение задать сеть образ метрика расстояние отличие реальный измерение мочь напрямую использовать пространственный аналитический моделирование частый весь использоваться евклидов расстояние вряд это самый подходящий метрика расстояние минковский перспективный метод расстояние рассчитать использование каждый метрика сопоставляться измерение расстояние дорога время путь оптимизировать расстояние минковский применяться пространственный аналитический моделирование метод расстояние время путь рассчитываться основа почтовый индекс место жительство каждый пациент проходить катетеризация сердце соответствовать больница метрика минковский оптимизировать приблизительный определение время путь расстояние дорога соответственно затем оценка расстояние измерение расстояние сравниваться использование метод описательный статистика визуальный картирование оптимизировать метрика минковский реализовать посредством матрица пространственный вес пространственный регрессионный модель выявлять социально экономический фактор значительный степень связанный катетеризация сердце результат коэффициент минковский хороший образ аппроксимировать расстояние дорога составлять 1 54 1 31 хороший образ аппроксимировать время путь последний показатель также являться хороший показатель расстояние дорога позволять получить хороший единый модель путешествие место жительство пациент больница регрессионный модель поочерёдно реализовать евклидов метрика оптимальный метрика минковский результат сравниваться метод минковский давать надёжный результат традиционный евклидов метрика вывод измерение расстояние время путь дорога являться наиболее точный оценка невозможно напрямую реализовать пространственный аналитический моделирование евклидов расстояние иметь тенденция недооценивать расстояние дорога время путь манхэттенский расстояние иметь тенденция переоценивать оптимизировать расстояние минковский частично преодолевать недостаток оно обеспечивать единый модель перемещение сеть метод являться гибкий подходить аналитический моделирование точнее традиционный метрика использование конечный итог повышать надёжность пространственный аналитический модель | сравнение показатель расстояние пространственный аналитический моделирование планирование услуга здравоохранение |
e523mnz1 | Оценка пяти методов дезактивации фильтрующих респираторов | Высказываются опасения относительно доступности фильтрующих респираторов N95, сертифицированных Национальным институтом охраны труда и промышленной гигиены (NIOSH), во время пандемии гриппа. Одной из возможных стратегий решения проблемы нехватки респираторов является повторное использование респираторов после процесса биологической дезактивации, в ходе которого инфекционный материал на респираторе становится неактивным. Однако данных о влиянии методов дезактивации на целостность и эффективность респираторов мало. В этом исследовании оценивались пять методов дезактивации [ультрафиолетовое бактерицидное облучение (UVGI), оксид этилена, испарившаяся перекись водорода (VHP), облучение в микроволновой печи и отбеливатель] с использованием девяти моделей респираторов, сертифицированных NIOSH (по три модели респираторов N95, хирургических респираторов N95 и респираторов P100), чтобы определить, какие методы следует рассмотреть для будущих исследований. После обработки каждым методом дезактивации респираторы оценивались на предмет изменений внешнего вида, запаха и лабораторных показателей (проникновение аэрозоля в фильтр и сопротивление фильтра воздушному потоку). Впоследствии были проведены дополнительные эксперименты (воздействие сухого тепла в лабораторной печи, выделение газа и гидрофобность респираторов) для лучшего понимания свойств материалов и возможных рисков для здоровья пользователя респиратора после дезактивации. Однако в данном исследовании не оценивалась эффективность методов дезактивации для инактивации жизнеспособных микроорганизмов. Облучение в микроволновой печи расплавило образцы двух моделей FFR. Остальные образцы FFR, которые были дезактивированы, имели ожидаемые уровни проникновения аэрозоля через фильтр и сопротивления воздушного потока фильтра. Запах отбеливателя оставался заметным после ночной сушки, а при регидратации деионизированной водой из FFR, дезактивированных отбеливателем, выделялось небольшое количество газообразного хлора. Было установлено, что наиболее перспективными методами дезактивации являются ультрафиолетовое излучение, оксид этилена (EtO) и VHP; однако сохраняются опасения относительно пропускной способности EtO и VHP. Прежде чем рекомендовать какие-либо конкретные методы дезактивации, необходимы дополнительные исследования. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2781738/",
"pubmed_id": "19805391"
} | высказываться опасение относительно доступность фильтровать респиратор n95 сертифицированный национальный институт охрана труд промышленный гигиена niosh время пандемия грипп возможный стратегия решение проблема нехватка респиратор являться повторный использование респиратор процесс биологический дезактивация ход инфекционный материал респиратор становиться неактивный однако данные влияние метод дезактивация целостность эффективность респиратор мало это исследование оцениваться пять метод дезактивация ультрафиолетовый бактерицидный облучение uvgi оксид этилен испариться перекись водород vhp облучение микроволновой печь отбеливатель использование девять модель респиратор сертифицированный niosh модель респиратор n95 хирургический респиратор n95 респиратор p100 определить метод следовать рассмотреть будущий исследование обработка каждый метод дезактивация респиратор оцениваться предмет изменение внешний вид запах лабораторный показатель проникновение аэрозоль фильтр сопротивление фильтр воздушный поток впоследствии провести дополнительный эксперимент воздействие сухой тепло лабораторный печь выделение газ гидрофобность респиратор хороший понимание свойство материал возможный риск здоровье пользователь респиратор дезактивация однако данный исследование оцениваться эффективность метод дезактивация инактивация жизнеспособный микроорганизм облучение микроволновой печь расплавить образец модель ffr остальной образец ffr дезактивировать иметь ожидать уровень проникновение аэрозоль фильтр сопротивление воздушный поток фильтр запах отбеливатель оставаться заметный ночной сушка регидратация деионизированный вода ffr дезактивировать отбеливатель выделяться небольшой количество газообразный хлор установить наиболее перспективный метод дезактивация являться ультрафиолетовый излучение оксид этилен eto vhp однако сохраняться опасение относительно пропускной способность eto vhp прежде рекомендовать либо конкретный метод дезактивация необходимый дополнительный исследование | оценка пять метод дезактивация фильтровать респиратор |
m2k8lf7v | Противовирусная активность некоторых растений, используемых в непальской традиционной медицине | Метанольные экстракты 41 вида растений, принадлежащих к 27 семействам, используемые в традиционной медицине Непала, были исследованы на противовирусную активность in vitro против вируса простого герпеса типа 1 (HSV-1) и вируса гриппа А с помощью анализа поглощения красителя в системах HSV-1/клетки Vero и вирус гриппа А/клетки MDCK. Экстракты Astilbe rivularis, Bergenia ciliata, Cassiope fastigiata и Thymus linearis проявили мощную противогерпесвирусную активность. Экстракты Allium oreoprasum, Androsace strigilosa, Asparagus filicinus, Astilbe rivularis, Bergenia ciliata и Verbascum thapsus проявили сильную противогриппозную вирусную активность. Только выдержки из А. ривуляр и Б. инфузории продемонстрировали замечательную активность против обоих вирусов. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2781767/",
"pubmed_id": "18955262"
} | метанольный экстракт 41 вид растение принадлежащий 27 семейство использовать традиционный медицина непал исследовать противовирусный активность in vitro против вирус простой герпес тип 1 hsv 1 вирус грипп помощь анализ поглощение краситель система hsv 1 клетка vero вирус грипп клетка mdck экстракт astilbe rivularis bergenia ciliata cassiope fastigiata thymus linearis проявить мощный противогерпесвирусный активность экстракт allium oreoprasum androsace strigilosa asparagus filicinus astilbe rivularis bergenia ciliata verbascum thapsus проявить сильный противогриппозный вирусный активность выдержка ривуляр б инфузория продемонстрировать замечательный активность против оба вирус | противовирусный активность некоторый растение использовать непальский традиционный медицина |
ujquw0g8 | Прогнозирование намерения лечить ВИЧ-инфицированных пациентов среди студентов-медиков и стоматологов из Танзании и Судана с использованием теории запланированного поведения — поперечное исследование | ПРЕДЫСТОРИЯ: Эпидемия ВИЧ создает серьезные проблемы для стран с низким уровнем дохода в Африке к югу от Сахары (АЮС), влияя на уровень текучести кадров среди работников здравоохранения, уровень их мотивации и прогулы на работе. Мало что известно о том, как бороться с ухудшением кадровых ресурсов в системах здравоохранения. Целью данного исследования было спрогнозировать намерение предоставить хирургическое лечение ВИЧ-инфицированным пациентам среди студентов-медиков и стоматологов в Танзании и Судане с использованием расширенной версии теории запланированного поведения (ТПБ). МЕТОДЫ: Четыреста семьдесят пять студентов-медиков и студентов-стоматологов Университета Дар-эс-Салама (средний возраст 25 лет) и 642 студента-стоматолога, посещающих 6 государственных и частных стоматологических факультетов в Хартуме (средний возраст 21,7 года), самостоятельно заполнили анкеты TPB в 2005 и 2007 годах соответственно. РЕЗУЛЬТАТЫ: Студенты из Танзании и Судана продемонстрировали твердое намерение оказывать помощь людям с ВИЧ и СПИДом. Пошаговая линейная регрессия показала, что на долю TPB приходилось 51% (43% в Танзании и Судане) дисперсии намерений в разных местах исследования. После учета страны и прошлого поведения, TPB с точки зрения установок, субъективных норм и воспринимаемого поведенческого контроля составил 34%, а моральные нормы — еще 2,3% объяснимой дисперсии намерений. В обоих местах проведения исследования отношение оказалось наиболее сильным предиктором намерений, за ним в порядке убывания следовали субъективные нормы, моральные нормы и воспринимаемый контроль поведения. ВЫВОД: План действий по оказанию медицинской помощи применим к намерениям студентов в отношении ВИЧ и СПИДа в двух исследованных странах Африки, африканских и южноафриканских. Предполагается, что установки, субъективные нормы, моральные нормы и воспринимаемый поведенческий контроль являются ключевыми факторами готовности студентов лечить пациентов, больных СПИДом и ВИЧ, и должны стать объектами вмешательств, направленных на улучшение качества оказания медицинской помощи в этом контексте. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2784770/",
"pubmed_id": "19930555"
} | предыстория эпидемия вич создавать серьёзный проблема страна низкий уровень доход африка юг сахара аюс влиять уровень текучесть кадр среди работник здравоохранение уровень мотивация прогул работа мало известно бороться ухудшение кадровый ресурс система здравоохранение цель данный исследование спрогнозировать намерение предоставить хирургический лечение вич инфицировать пациент среди студент медик стоматолог танзания судан использование расширить версия теория запланировать поведение тпб метод четыреста семьдесят пять студент медик студент стоматолог университет дар эс салам средний возраст 25 год 642 студент стоматолог посещать 6 государственный частный стоматологический факультет хартум средний возраст 21 7 год самостоятельно заполнить анкета tpb 2005 2007 год соответственно результат студент танзания судан продемонстрировать твёрдый намерение оказывать помощь человек вич спид пошаговый линейный регрессия показать доля tpb приходиться 51 43 танзания судан дисперсия намерение разный место исследование учёт страна прошлое поведение tpb точка зрение установка субъективный норма воспринимать поведенческий контроль составить 34 моральный норма ещё 2 3 объяснимый дисперсия намерение оба место проведение исследование отношение оказаться наиболее сильный предиктор намерение порядок убывание следовать субъективный норма моральный норма воспринимать контроль поведение вывод план действие оказание медицинский помощь применимый намерение студент отношение вич спид исследовать страна африка африканский южноафриканский предполагаться установка субъективный норма моральный норма воспринимать поведенческий контроль являться ключевой фактор готовность студент лечить пациент больной спид вич должный стать объект вмешательство направить улучшение качество оказание медицинский помощь это контекст | прогнозирование намерение лечить вич инфицировать пациент среди студент медик стоматолог танзания судан использование теория запланировать поведение поперечный исследование |
idffrnac | Механизмы острого повреждения легких, зависящие от рецепторов распознавания образов | Острое повреждение легких (ОПЛ), клинически проявляющееся как острый респираторный дистресс-синдром, вызывается неконтролируемой системной воспалительной реакцией, возникающей в результате клинических событий, включая сепсис, обширное хирургическое вмешательство и травму. Активация врожденного иммунитета играет центральную роль в развитии ОПЛ. Врожденный иммунитет активируется посредством семейств родственных рецепторов распознавания образов (PRR), которые распознают консервативные микробные мотивы или молекулярные паттерны, ассоциированные с патогенами (PAMP). Толл-подобные рецепторы были первым крупным семейством PRR, обнаруженным у млекопитающих. Недавно к этому списку были добавлены рецепторы NACHT с богатыми лейцином повторами (LRR) и рецепторы, подобные генам, индуцируемым ретиноевой кислотой. В настоящее время известно, что помимо распознавания инфекционных стимулов, как Toll-подобные рецепторы, так и рецепторы NACHT-LRR могут также реагировать на эндогенные молекулы, высвобождаемые в ответ на стресс, травму и повреждение клеток. Эти молекулы были названы молекулярными паттернами, связанными с повреждением (DAMP). В течение длительного времени клинически наблюдалось, что инфекционные и неинфекционные поражения вызывают воспаление, поэтому подтверждение перекрывающихся рецепторно-сигнальных путей активации между PAMP и DAMP не стало неожиданностью. В обзоре представлен обзор механизмов острого респираторного синдрома, зависящих от PRR, и их клиническое значение. Модификация путей PRR, вероятно, станет логичной терапевтической целью при ОПЛ/остром респираторном дистресс-синдроме. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2785474/",
"pubmed_id": "19949486"
} | острый повреждение лёгкий опл клинически проявляться острый респираторный дистресс синдром вызываться неконтролируемый системный воспалительный реакция возникать результат клинический событие включая сепсис обширный хирургический вмешательство травма активация врождённый иммунитет играть центральный роль развитие опл врождённый иммунитет активироваться посредством семейство родственный рецептор распознавание образ prr распознавать консервативный микробный мотив молекулярный паттерн ассоциированный патоген pamp толл подобный рецептор первый крупный семейство prr обнаружить млекопитающее недавно список добавить рецептор nacht богатый лейцин повтор lrr рецептор подобный ген индуцировать ретиноев кислота настоящий время известно помимо распознавание инфекционный стимул toll подобный рецептор рецептор nacht lrr мочь также реагировать эндогенный молекула высвобождать ответ стресс травма повреждение клетка молекула назвать молекулярный паттерн связанный повреждение damp течение длительный время клинически наблюдаться инфекционный неинфекционный поражение вызывать воспаление поэтому подтверждение перекрываться рецепторный сигнальный путь активация pamp damp стать неожиданность обзор представить обзор механизм острый респираторный синдром зависеть prr клинический значение модификация путь prr вероятно стать логичный терапевтический цель опл острый респираторный дистресс синдром | механизм острый повреждение лёгкий зависеть рецептор распознавание образ |
a3tammig | Воздействие низких доз вируса лейкоза кошек: сероконверсия как единственный параметр инфекции | У кошачьих заражение вирусом лейкемии кошек (FeLV) приводит к различным последствиям: от абортивного исхода (вирус легко устраняется и никогда не обнаруживается) до прогрессирующей инфекции (персистирующая виремия и выделение вируса). Недавно был постулирован новый результат при низких дозах заражения FeLV. У кошек, не имевших заболевания, которые контактировали с фекалиями постоянно инфицированных кошек, наблюдалась сероконверсия, что указывало на наличие инфекции, но при этом в крови оставались отрицательные результаты на провирус и антиген p27. Провирус FeLV был обнаружен в некоторых тканях, но не в костном мозге, инфицирование которого обычно считается необходимой стадией для прогрессирования заболевания. Для изучения влияния низких доз вируса лейкоза у молодых кошек и проверки гипотезы о том, что воздействие низких доз может привести к неизвестному патогенезу инфекции без вовлечения костного мозга, 21 кошку заразили ороназально различными дозами вируса. Уровень p27 в крови, провирусная и вирусная нагрузки отслеживались до 20-й недели после инфицирования. Также определялась провирусная нагрузка тканей. Иммунный ответ контролировался путем измерения общего вируса FeLV и антител p45, а также анализа антигена клеточной мембраны, ассоциированного с онкорнавирусом кошек (FOCMA). У одной кошки наблюдалась регрессивная инфекция (транзиторная антигенемия, постоянная позитивность к провирусу и сероконверсия), при этом провирус был обнаружен только в некоторых органах при умерщвлении. У 7 из 20 оставшихся кошек положительный результат анализа FOCMA был единственным признаком инфекции, тогда как все остальные тесты были отрицательными. В целом результаты показывают, что воздействие низких доз FeLV может привести к сероконверсии во время предполагаемой абортивной инфекции. Таким образом, общепринятые методы обнаружения не позволяют обнаружить всех животных, инфицированных FeLV, что может привести к недооценке распространенности инфекции. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2789331/",
"pubmed_id": "19861115"
} | кошачий заражение вирус лейкемия кошка felv приводить различный последствие абортивный исход вирус легко устраняться обнаруживаться прогрессировать инфекция персистировать виремия выделение вирус недавно постулировать новый результат низкий доза заражение felv кошка иметь заболевание контактировать фекалия постоянно инфицировать кошка наблюдаться сероконверсия указывать наличие инфекция это кровь оставаться отрицательный результат провирус антиген p27 провирус felv обнаружить некоторый ткань костный мозг инфицирование обычно считаться необходимый стадия прогрессирование заболевание изучение влияние низкий доза вирус лейкоз молодой кошка проверка гипотеза воздействие низкий доза мочь привести неизвестный патогенез инфекция вовлечение костный мозг 21 кошка заразить ороназальный различный доза вирус уровень p27 кровь провирусный вирусный нагрузка отслеживаться 20 й неделя инфицирование также определяться провирусный нагрузка ткань иммунный ответ контролироваться путём измерение общий вирус felv антитело p45 также анализ антиген клеточный мембрана ассоциированный онкорнавирус кошка focma кошка наблюдаться регрессивный инфекция транзиторный антигенемия постоянный позитивность провирус сероконверсия это провирус обнаружить некоторый орган умерщвление 7 20 остаться кошка положительный результат анализ focma единственный признак инфекция всё остальной тест отрицательный целое результат показывать воздействие низкий доза felv мочь привести сероконверсия время предполагать абортивный инфекция образ общепринятый метод обнаружение позволять обнаружить весь животное инфицировать felv мочь привести недооценка распространённость инфекция | воздействие низкий доза вирус лейкоз кошка сероконверсия единственный параметр инфекция |
0rq0wdpq | Большая и точная коллекция расщеплений пептидаз в базе данных MEROPS | Пептидазы — ферменты, гидролизующие пептидные связи в белках и пептидах. Пептидазы играют важную роль в патологических состояниях, таких как болезнь Альцгеймера, опухоли и паразитарные инвазии, а также в переработке вирусных полипротеинов. База данных MEROPS — интернет-ресурс, содержащий информацию о пептидазах, их субстратах и ингибиторах. Теперь база данных содержит сведения о позициях расщепления в субстратах, как физиологических, так и нефизиологических, природных и синтетических. В коллекции имеется 39 118 расщеплений, в том числе 34 606 из 10 513 различных белков и 2677 расщеплений в синтетических субстратах. Число дроблений, обозначенных как «физиологические», составляет 13 307. Данные получены из 6095 публикаций. Для 45% из 2415 различных пептидаз, обнаруженных в базе данных MEROPS, известно по крайней мере одно расщепление субстрата. Теперь на сайте есть три новых дисплея: два из них демонстрируют специфичность пептидазы в виде логотипа и матрицы частот, а третий демонстрирует динамически генерируемое выравнивание между каждым белковым субстратом и его наиболее близкими гомологами. Многие из белков, описанных в литературе как субстраты пептидазы, изучались только in vitro. Исходя из предположения, что физиологически значимый участок расщепления будет сохраняться между видами, была изучена консервативность каждого участка с точки зрения предпочтения пептидазы и выявлено несколько участков, которые не сохраняются. Существует ряд веских причин, по которым объект не может быть сохранен. Каждый плохо сохранившийся участок был обследован, и была установлена причина. Выявлены некоторые участки, которые сохранились очень плохо, и в которых расщепление, скорее всего, является случайным, а не имеющим физиологического значения. Этот набор данных находится в свободном доступе через Интернет и является полезным обучающим набором для алгоритмов прогнозирования субстратов для пептидаз и позиций расщепления в этих субстратах. Эти данные также могут быть полезны для разработки ингибиторов и создания новых специфических пептидаз. URL базы данных: http://merops.sanger.ac.uk | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2790309/",
"pubmed_id": "20157488"
} | пептидаза фермент гидролизовать пептидный связь белок пептид пептидаза играть важный роль патологический состояние болезнь альцгеймер опухоль паразитарный инвазия также переработка вирусный полипротеин база данные merops интернет ресурс содержать информация пептидаза субстрат ингибитор база данные содержать сведение позиция расщепление субстрат физиологический нефизиологический природный синтетический коллекция иметься 39 118 расщепление число 34 606 10 513 различный белок 2677 расщепление синтетический субстрат число дробление обозначить физиологический составлять 13 307 дать получить 6095 публикация 45 2415 различный пептидаза обнаружить база данные merops известно крайний мера расщепление субстрат сайт новый дисплей демонстрировать специфичность пептидаза вид логотип матрица частота третий демонстрировать динамически генерировать выравнивание каждый белков субстрат наиболее близкий гомолог многие белок описать литература субстрат пептидаза изучаться in vitro исходить предположение физиологически значимый участок расщепление сохраняться вид изучить консервативность каждый участок точка зрение предпочтение пептидаза выявить несколько участок сохраняться существовать ряд веский причина объект мочь сохранный каждый плохо сохраниться участок обследовать установить причина выявить некоторый участок сохраниться очень плохо расщепление скорее весь являться случайный иметь физиологический значение набор данные находиться свободный доступ интернет являться полезный обучать набор алгоритм прогнозирование субстрат пептидаза позиция расщепление субстрат дать также мочь полезный разработка ингибитор создание новый специфический пептидаза url база данные http merops sanger ac uk | больший точный коллекция расщепление пептидаза база данные merops |
5kapn32k | Эффективная сборка и секреция рекомбинантных субвирусных частиц четырех серотипов лихорадки Денге с использованием нативных белков prM и E | ПРЕДЫСТОРИЯ: Клетки, инфицированные флавивирусом, продуцируют инфекционные вирионы и субвирусные частицы, которые образуются путем сборки белков оболочки prM и E и, как полагают, подвергаются одному и тому же процессу созревания. Рекомбинантные субвирусные частицы лихорадки Денге были получены в клеточных культурах с использованием модифицированных или химерных белков, но без использования нативных форм prM и E. МЕТОДОЛОГИЯ/ОСНОВНЫЕ ВЫВОДЫ: Мы использовали стратегию оптимизации кодонов для получения эффективной экспрессии собственных вирусных белков и получения рекомбинантных субвирусных частиц (RSP) для всех четырех серотипов вируса денге (DV). Была создана стабильная линия клеток HeLa, экспрессирующая DV1 prME (HeLa-prME), и RSP были проанализированы с помощью иммунофлуоресценции и трансмиссионной электронной микроскопии. Мы обнаружили, что белок E в основном присутствует в эндоплазматическом ретикулуме (ЭР), где можно наблюдать сборку RSP. Биохимическая характеристика секреции RSP DV1 выявила как расщепление белка prM, так и гомодимеризацию белков E перед их высвобождением в супернатант, что указывает на то, что RSP подвергаются такому же процессу созревания, как и вирус денге. Эксперимент с отслеживанием импульсов показал, что для секреции RSP DV1 требуется 8 часов. Мы использовали HeLa-prME для разработки полуколичественного анализа и провели скрининг библиотеки человеческих siRNA, нацеленной на гены, участвующие в мембранном транспорте. Нокдаун 23 генов привел к значительному снижению секреции DV RSP, тогда как для 22 других мы наблюдали увеличение уровня RSP в супернатанте клеток. ВЫВОДЫ/ЗНАЧЕНИЕ: Наши данные описывают эффективное производство RSP, содержащих нативные белки оболочки prM и E для всех серотипов лихорадки денге. RSP вируса денге и соответствующие им клеточные линии-продуценты являются безопасными и новыми инструментами, которые можно использовать при изучении путей распространения вируса, а также при разработке вакцин и препаратов против вируса денге. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2790604/",
"pubmed_id": "20016834"
} | предыстория клетка инфицировать флавивирус продуцировать инфекционный вирион субвирусный частица образоваться путём сборка белок оболочка prm e полагать подвергаться процесс созревание рекомбинантный субвирусный частица лихорадка денге получить клеточный культура использование модифицированный химерный белок использование нативный форма prm e методология основной вывод использовать стратегия оптимизация кодон получение эффективный экспрессия собственный вирусный белок получение рекомбинантный субвирусный частица rsp весь четыре серотип вирус денге dv создать стабильный линия клетка hela экспрессировать dv1 prme hela prme rsp проанализировать помощь иммунофлуоресценция трансмиссионный электронный микроскопия обнаружить белок e основное присутствовать эндоплазматический ретикулум эра наблюдать сборка rsp биохимический характеристика секреция rsp dv1 выявить расщепление белок prm гомодимеризация белок e высвобождение супернатант указывать rsp подвергаться процесс созревание вирус денге эксперимент отслеживание импульс показать секреция rsp dv1 требоваться 8 час использовать hela prme разработка полуколичественный анализ провести скрининг библиотека человеческий sirna нацелить ген участвовать мембранный транспорт нокдаун 23 ген привести значительный снижение секреция dv rsp 22 наблюдать увеличение уровень rsp супернатанта клетка вывод значение наш дать описывать эффективный производство rsp содержать нативный белка оболочка prm e весь серотип лихорадка денге rsp вирус денге соответствующий клеточный линия продуцент являться безопасный новый инструмент использовать изучение путь распространение вирус также разработка вакцина препарат против вирус денге | эффективный сборка секреция рекомбинантный субвирусный частица четыре серотип лихорадка денге использование нативный белок prm e |
yxtdqjay | Рассеивая волны: моделирование потенциального воздействия мер общественного здравоохранения на отсрочку пика эпидемии нового гриппа A/H1N1 | ПРЕДЫСТОРИЯ: 11 июня 2009 года Всемирная организация здравоохранения объявила о шестой фазе пандемии нового гриппа A/H1N1. Хотя к концу сентября 2009 года новый вирус был зарегистрирован на всех континентах, его воздействие на большинство стран северного полушария было ограниченным. Возвращение вируса во второй волне затронет группы населения, которые еще не имеют иммунитета и не вакцинированы. Мы смоделировали эффект стратегий контроля для сокращения распространения с целью отсрочить волну эпидемии в стране, где она обнаружена на очень ранней стадии. МЕТОДОЛОГИЯ/ОСНОВНЫЕ ВЫВОДЫ: Мы построили детерминированную модель SEIR, используя возрастное распределение и численность населения Германии на основе наблюдаемого числа завезенных случаев и ранних результатов эпидемиологических характеристик, описанных Фрейзером (Science, 2009). Мы предлагаем двухэтапную стратегию контроля, включающую первоначальные усилия по отслеживанию, помещению на карантин и выборочному проведению профилактического лечения лицам, контактировавшим с первыми 100–500 случаями. На втором этапе те же меры будут направлены на домохозяйства следующих 5000–10 000 случаев. В результате пик эпидемии может быть отсрочен до 7,6 недель при выявлении до 30% случаев. Однако совокупные показатели атак не изменятся. Необходимые дозы противовирусных препаратов будут меньше количества курсов лечения для 0,1% населения. При анализе чувствительности как частота выявления случаев, так и вариация R0 оказывают существенное влияние на итоговую задержку. ВЫВОДЫ/ЗНАЧЕНИЕ: Стратегии контроля, которые сдерживают распространение заболевания на ранней стадии волны пандемии, могут привести к существенной задержке эпидемии. Поскольку профилактическое лечение предлагается только лицам, контактировавшим с первыми 10 000 заболевших, количество необходимых противовирусных препаратов по-прежнему весьма ограничено. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2791869/",
"pubmed_id": "20027293"
} | предыстория 11 июнь 2009 год всемирный организация здравоохранение объявить шестой фаза пандемия новый грипп a h1n1 хотя конец сентябрь 2009 год новый вирус зарегистрировать весь континент воздействие большинство страна северный полушарие ограниченный возвращение вирус второй волна затронуть группа население ещё иметь иммунитет вакцинировать смоделировать эффект стратегия контроль сокращение распространение цель отсрочить волна эпидемия страна обнаружить очень ранний стадия методология основной вывод построить детерминированный модель seir использовать возрастной распределение численность население германия основа наблюдать число завезти случай ранний результат эпидемиологический характеристика описать фрейзер science 2009 предлагать двухэтапный стратегия контроль включать первоначальный усилие отслеживание помещение карантин выборочный проведение профилактический лечение лицо контактировать первый 100 500 случай второй этап мера направить домохозяйство следующий 5000 10 000 случай результат пик эпидемия мочь отсрочить 7 6 неделя выявление 30 случай однако совокупный показатель атака измениться необходимый доза противовирусный препарат маленький количество курс лечение 0 1 население анализ чувствительность частота выявление случай вариация r0 оказывать существенный влияние итоговый задержка вывод значение стратегия контроль сдерживать распространение заболевание ранний стадия волна пандемия мочь привести существенный задержка эпидемия поскольку профилактический лечение предлагаться лицо контактировать первый 10 000 заболеть количество необходимый противовирусный препарат прежний весьма ограничить | рассеивать волна моделирование потенциальный воздействие мера общественный здравоохранение отсрочка пик эпидемия новый грипп a h1n1 |
oi9j5o0n | Европейские ежи как хозяева Borrelia spp., Германия | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2792852/",
"pubmed_id": "17582907"
} | европейский ежи хозяин borrelia spp германия |
||
2xvd5ogf | Экспрессия белка VP2 мышиного норовируса с помощью стратегии терминации-реинициации трансляции | ПРЕДЫСТОРИЯ: Считается, что экспрессия минорного вириона структурного белка VP2 мышиного норовируса калицивируса (MNV) происходит посредством необычного механизма повторной инициации трансляции, зависящей от терминирующего кодона. В этом процессе после трансляции расположенной выше открытой рамки считывания (ORF) и терминации на стоп-кодоне часть субъединиц 40S остается связанной с мРНК и повторно инициируется в AUG расположенной ниже открытой рамки считывания (ORF), которая обычно находится в непосредственной близости. В соответствии с этим, стартовый кодон VP2 (AUG) MNV перекрывает стоп-кодон расположенной выше ORF VP1 (UAA) в пентануклеотиде UAA UG. ОСНОВНЫЕ ВЫВОДЫ: Здесь мы подтверждаем, что экспрессия MNV VP2 регулируется терминацией-реинициацией, и определяем требования к последовательности мРНК. Эффективная реинициация зависит от 43 нуклеотидов РНК, расположенных непосредственно перед сайтом UAA UG. Химическое и ферментативное зондирование показало, что РНК в этом регионе не имеет высокой структуры и включает существенный участок оснований, комплементарный спирали 26 18S рРНК (мотив 1). Относительное положение Мотива 1 по отношению к участку UAA UG влияет на эффективность процесса. Было также обнаружено, что терминация-реинициация в MNV относительно нечувствительна к ингибитору инициации эдеину. ВЫВОДЫ: Сигнал терминации-реинициации MNV наиболее близок к сигналу гриппа BM2. Подобно другим вирусам, использующим эту стратегию, спаривание оснований между мРНК и рРНК, вероятно, играет роль в присоединении субъединицы 40S к мРНК после терминации на стоп-кодоне VP1. Наши данные также указывают на то, что точное распознавание ORF VP2 AUG не является обязательным условием для эффективного возобновления трансляции в этой системе. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2793014/",
"pubmed_id": "20027307"
} | предыстория считаться экспрессия минорный вирион структурный белок vp2 мышиный норовирус калицивирус mnv происходить посредством необычный механизм повторный инициация трансляция зависеть терминировать кодон это процесс трансляция расположить выше открытый рамка считывание orf терминация стоп кодон часть субъединица 40s оставаться связанный мрнк повторно инициироваться aug расположить ниже открытый рамка считывание orf обычно находиться непосредственный близость соответствие это стартовый кодон vp2 aug mnv перекрывать стоп кодон расположить выше orf vp1 uaa пентануклеотид uaa ug основной вывод подтверждать экспрессия mnv vp2 регулироваться терминация реинициация определять требование последовательность мрнк эффективный реинициация зависеть 43 нуклеотид рнк расположить непосредственно сайт uaa ug химический ферментативный зондирование показать рнк это регион иметь высокий структура включать существенный участок основание комплементарный спираль 26 18s ррнк мотив 1 относительный положение мотив 1 отношение участок uaa ug влиять эффективность процесс также обнаружить терминация реинициация mnv относительно нечувствительный ингибитор инициация эдеина вывод сигнал терминация реинициация mnv наиболее близкий сигнал грипп bm2 подобно вирус использовать стратегия спаривание основание мрнк ррнк вероятно играть роль присоединение субъединица 40s мрнк терминация стоп кодон vp1 наш дать также указывать точный распознавание orf vp2 aug являться обязательный условие эффективный возобновление трансляция система | экспрессия белок vp2 мышиный норовирус помощь стратегия терминация реинициация трансляция |
ftxq9g7h | Взаимодействие сигнала сдвига рамки ВИЧ-1 с рибосомой | Рибосомный сдвиг рамки считывания вирусных РНК основан на механических свойствах структурных элементов, часто псевдоузлов и реже стебельчатых петель, которые разворачиваются рибосомой во время трансляции. В вирусе иммунодефицита человека (ВИЧ)-1 типа B длинная шпилька, содержащая выступ из трех нуклеотидов, отвечает за эффективный сдвиг рамки считывания. Этот выступ из трех нуклеотидов разделяет шпильку на два домена: нестабильный нижний стебель, за которым следует богатый GC верхний стебель. Анализы тоупринтинга и химического зондирования показывают, что структура, похожая на шпильку, сохраняется, когда рибосомы, изначально связанные со скользкой последовательностью, подвергаются многократным циклам транслокации, катализируемым EF-G. Однако, в то время как верхний стержень остается нетронутым, нижний стержень легко плавится. После первого и единственного шага транслокации деацилированной тРНК в сайт 30 S P движение стебель-петли мРНК в направлении 5' останавливается, что согласуется с представлением о том, что расположенная ниже вторичная структура сопротивляется развертыванию. Механическое растяжение шпильки с помощью оптического пинцета позволяет четко определить разгибание верхнего стебля только при усилии 12,8 ± 1,0 пН. Это говорит о том, что нижний стебель нестабилен и действительно может легко разворачиваться в присутствии перемещающейся рибосомы. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2794165/",
"pubmed_id": "19812214"
} | рибосомный сдвиг рамка считывание вирусный рнк основать механический свойство структурный элемент часто псевдоузел редкий стебельчатый петля разворачиваться рибосома время трансляция вирус иммунодефицит человек вич 1 тип b длинный шпилька содержать выступ нуклеотид отвечать эффективный сдвиг рамка считывание выступ нуклеотид разделять шпилька домен нестабильный нижний стебель следовать богатый gc верхний стебель анализ тоупринтинг химический зондирование показывать структура похожий шпилька сохраняться рибосома изначально связанный скользкий последовательность подвергаться многократный цикл транслокация катализировать ef g однако время верхний стержень оставаться нетронутый нижний стержень легко плавиться первый единственный шаг транслокация деацилировать трнк сайт 30 s p движение стебель петля мрнк направление 5 останавливаться согласоваться представление расположить ниже вторичный структура сопротивляться развёртывание механический растяжение шпилька помощь оптический пинцет позволять чётко определить разгибание верхний стебель усилие 12 8 1 0 пн это говорить нижний стебель нестабильный действительно мочь легко разворачиваться присутствие перемещаться рибосома | взаимодействие сигнал сдвиг рамка вич 1 рибосома |
1rzcrkmt | Внешняя среда и патогены человека в воздухе | Представляют ли патогены в атмосферном воздухе проблему для здоровья в настоящее время или они станут проблемой в будущем? В 2007 году в Университетском колледже Лондона (Великобритания) была создана рабочая группа под названием AirPath — Внешняя среда и патогены человека в воздухе. Целью этой группы было инициировать новую дискуссию и создать исследовательскую сеть для изучения науки и воздействия внешних патогенов. Целью данной статьи является рассмотрение и обсуждение следующих вопросов: Что является источником патогенов для человека в наружном воздухе? Какие текущие, развивающиеся и будущие технологии нам нужны? Можем ли мы определить группы риска по их видам деятельности и среде обитания? Как нам подготовиться к ожидаемым проблемам, связанным с изменением окружающей среды и новыми и возникающими заболеваниями? И как мы можем контролировать и предотвращать появление патогенов на открытом воздухе? Мы считаем, что данная работа может принести пользу широкому научному сообществу и лицам, формирующим политику, предоставив краткий обзор различных аспектов исследования и соображений, которые могут быть важны для их работы. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2796493/",
"pubmed_id": "20102582"
} | представлять патоген атмосферный воздух проблема здоровье настоящий время стать проблема будущее 2007 год университетский колледж лондон великобритания создать рабочий группа название airpath внешний среда патоген человек воздух цель группа инициировать новый дискуссия создать исследовательский сеть изучение наука воздействие внешний патоген цель дать статья являться рассмотрение обсуждение следующий вопрос являться источник патоген человек наружное воздух текущий развивающийся будущий технология нужный мочь определить группа риск вид деятельность среда обитание подготовиться ожидать проблема связанный изменение окружающий среда новый возникать заболевание мочь контролировать предотвращать появление патоген открытый воздух считать дать работа мочь принести польза широкий научный сообщество лицо формировать политика предоставить краткий обзор различный аспект исследование соображение мочь важный работа | внешний среда патоген человек воздух |
ilhnluqc | Комбинированные стратегии реагирования на пандемию гриппа — систематический обзор исследований математического моделирования | ПРЕДЫСТОРИЯ: Отдельные стратегии в планах готовности к пандемии могут не снизить воздействие пандемии гриппа. МЕТОДЫ: Мы провели поиск публикаций по моделированию через PubMed и связанных с ними ссылок с 1990 года по 30 сентября 2009 года. Критериями включения были модельные документы, количественно оценивающие эффективность комбинированных стратегий, как фармацевтических, так и нефармацевтических. РЕЗУЛЬТАТЫ: Было отобрано девятнадцать работ по моделированию комбинированных стратегий. Четыре исследования изучали комбинированные стратегии в глобальном масштабе, 14 — в отдельных странах и одно — в небольшом сообществе. Стохастическое индивидуальное моделирование использовалось в девяти исследованиях, стохастическое метапопуляционное моделирование — в пяти, а детерминированное компартментальное моделирование — еще в пяти. В рамках комбинированных стратегий вакцинация изучалась в восьми исследованиях, противовирусная профилактика и/или лечение — в 16, карантин местности или домохозяйства — в восьми, изоляция случаев — в шести, меры социального дистанцирования — в 10 и ограничение авиаперелетов — в шести исследованиях. Два исследования показали высокую вероятность успешного сдерживания эпицентра гриппа с помощью комбинированных стратегий при благоприятных условиях. Во время пандемии комбинированные стратегии задерживали распространение, сокращали общее число случаев заболевания, а также задерживали и снижали пиковую заболеваемость в большей степени, чем отдельные стратегии. Комбинированные стратегии оставались эффективными при высоких показателях репродуктивности по сравнению с одиночной стратегией. Глобальные совместные стратегии, включая перераспределение противовирусных препаратов, оказались эффективными в снижении глобального воздействия и показателей заболеваемости пандемическим гриппом. ВЫВОД: Комбинированные стратегии повышают эффективность отдельных стратегий. Они включают фармацевтические (противовирусные препараты, антибиотики и вакцины) и нефармацевтические вмешательства (изоляция случаев, карантин, меры личной гигиены, социальное дистанцирование и ограничение поездок). Для подтверждения эффективности и осуществимости необходимы местные эпидемиологические и модельные исследования. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2797001/",
"pubmed_id": "20003249"
} | предыстория отдельный стратегия план готовность пандемия мочь снизить воздействие пандемия грипп метод провести поиск публикация моделирование pubmed связанный ссылка 1990 год 30 сентябрь 2009 год критерий включение модельный документ количественно оценивать эффективность комбинированный стратегия фармацевтический нефармацевтический результат отобрать девятнадцать работа моделирование комбинированный стратегия четыре исследование изучать комбинированный стратегия глобальный масштаб 14 отдельный страна небольшой сообщество стохастический индивидуальный моделирование использоваться девять исследование стохастический метапопуляционный моделирование пять детерминированный компартментальный моделирование ещё пять рамка комбинированный стратегия вакцинация изучаться восемь исследование противовирусный профилактика лечение 16 карантин местность домохозяйство восемь изоляция случай шесть мера социальный дистанцирование 10 ограничение авиаперелёт шесть исследование исследование показать высокий вероятность успешный сдерживание эпицентр грипп помощь комбинированный стратегия благоприятный условие время пандемия комбинированный стратегия задерживать распространение сокращать общий число случай заболевание также задерживать снижать пиковый заболеваемость больший степень отдельный стратегия комбинированный стратегия оставаться эффективный высокий показатель репродуктивность сравнение одиночный стратегия глобальный совместный стратегия включая перераспределение противовирусный препарат оказаться эффективный снижение глобальный воздействие показатель заболеваемость пандемический грипп вывод комбинированный стратегия повышать эффективность отдельный стратегия включать фармацевтический противовирусный препарат антибиотик вакцина нефармацевтический вмешательство изоляция случай карантин мера личный гигиена социальный дистанцирование ограничение поездка подтверждение эффективность осуществимость необходимый местный эпидемиологический модельный исследование | комбинированный стратегия реагирование пандемия грипп систематический обзор исследование математический моделирование |
gbdaad4l | Пусть солнце светит: влияние ультрафиолетового излучения на риск инвазивной пневмококковой инфекции в Филадельфии, Пенсильвания | ПРЕДЫСТОРИЯ: Streptococcus pneumoniae является частой причиной внебольничной пневмонии и бактериемии. Повышенная зимняя смертность, связанная с пневмонией, отмечается уже более столетия, однако сезонность инвазивной пневмококковой инфекции (ИПИ) была описана сравнительно недавно и плохо изучена. Улучшение понимания влияния окружающей среды на сезонность заболеваний приобрело особую актуальность в связи с глобальным изменением климата. МЕТОДЫ: Мы оценили 602 случая ИПИ, зарегистрированных в округе Филадельфия, штат Пенсильвания, с 2002 по 2007 год. Для выявления связей между недельными погодными условиями и количеством случаев заболевания использовались модели регрессии Пуассона, включающие сезонные сглаживатели. Связи между острыми (ежедневными) колебаниями окружающей среды и возникновением ИПЗ оценивались с использованием перекрестного подхода. Была изучена модификация эффекта в зависимости от возраста и пола, и были созданы модели метарегрессии с использованием оценок эффекта, специфичных для страт. РЕЗУЛЬТАТЫ: Наибольшая заболеваемость ИПИ наблюдалась в зимнее время, а спектральное разложение выявило пик на 51,0 неделе, что соответствует годовой периодичности. После внесения поправок на сезонность, ежегодный рост числа сообщений и температуру было обнаружено, что еженедельная заболеваемость связана с УФ-индексом при ясном небе (IRR на единицу увеличения индекса: 0,70 [95% ДИ 0,54–0,91]). Влияние УФ-индекса было наиболее выражено среди молодых людей и уменьшалось с возрастом. В более коротких временных масштабах только связь с повышением концентрации оксидов серы в окружающей среде была связана с риском заболевания (OR для наивысшего терциля воздействия 0,75, 95% ДИ от 0,60 до 0,93). ЗАКЛЮЧЕНИЕ: Мы подтвердили преобладание ИПИ в зимнее время в крупном городском центре. Основным предиктором ИПД в Филадельфии являются продолжительные периоды низкого уровня УФ-излучения, что может объяснять наблюдаемую зимнюю сезонность. Механизм действия уменьшенного воздействия света на возникновение заболеваний может быть обусловлен прямым воздействием на выживаемость патогенов или иммунную функцию хозяина через измененный метаболизм 1,25-(ОН)(2)-витамина D. Эти результаты могут указывать на меньшее снижение будущего риска ИПИ в связи с изменением климата, чем можно было бы ожидать, если бы зимняя сезонность определялась температурой. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2797517/",
"pubmed_id": "19961583"
} | предыстория streptococcus pneumoniae являться частый причина внебольничный пневмония бактериемия повышенный зимний смертность связать пневмония отмечаться столетие однако сезонность инвазивный пневмококковый инфекция ипи описать сравнительно недавно плохо изучить улучшение понимание влияние окружающий среда сезонность заболевание приобрести особый актуальность связь глобальный изменение климат метод оценить 602 случай ипи зарегистрировать округ филадельфия штат пенсильвания 2002 2007 год выявление связь недельный погодный условие количество случай заболевание использоваться модель регрессия пуассон включать сезонный сглаживатель связь острый ежедневный колебание окружающий среда возникновение ипз оцениваться использование перекрёстный подход изучить модификация эффект зависимость возраст пол создать модель метарегрессия использование оценка эффект специфичный страта результат больший заболеваемость ипи наблюдаться зимний время спектральный разложение выявить пик 51 0 неделя соответствовать годовой периодичность внесение поправка сезонность ежегодный рост число сообщение температура обнаружить еженедельный заболеваемость связать уф индекс ясный небо irr единица увеличение индекс 0 70 95 ди 0 54 0 91 влияние уф индекс наиболее выразить среди молодой человек уменьшаться возраст короткий временной масштаб связь повышение концентрация оксид сера окружающий среда связать риск заболевание or высокий терциля воздействие 0 75 95 ди 0 60 0 93 заключение подтвердить преобладание ипи зимний время крупный городской центр основный предиктор ипд филадельфия являться продолжительный период низкий уровень уф излучение мочь объяснять наблюдать зимний сезонность механизм действие уменьшить воздействие свет возникновение заболевание мочь обусловить прямой воздействие выживаемость патоген иммунный функция хозяин изменить метаболизм 1 25 2 витамин d результат мочь указывать малый снижение будущее риск ипи связь изменение климат ожидать зимний сезонность определяться температура | пусть солнце светить влияние ультрафиолетовый излучение риск инвазивный пневмококковый инфекция филадельфия пенсильвания |
mszzo4o4 | Листериолизин О необходим и достаточен для индукции аутофагии при инфекции Listeria monocytogenes | ПРЕДЫСТОРИЯ: Недавние исследования показали, что аутофагия используется клетками в качестве защитного механизма против инфекции Listeria monocytogenes. МЕТОДОЛОГИЯ/ОСНОВНЫЕ ВЫВОДЫ: Однако мы обнаружили, что аутофагия не играет заметной роли в вакуолярном побеге и внутриклеточном росте в первичных культивируемых макрофагах, полученных из костного мозга (BMDM), дефицитных по аутофагии (atg5(−/−)). Тем не менее, мы приводим доказательства того, что порообразующая активность холестеринзависимого цитолизина листериолизина О (LLO) может вызывать аутофагию после заражения L. моноцитогенес. Заражение БМДМ L. monocytogenes индуцировал липидизацию легкой цепи 3 белка, ассоциированного с микротрубочками (LC3), что согласуется с активацией аутофагии, тогда как мутант, лишенный LLO, этого не делал. Инфицирование BMDM, экспрессирующих LC3-GFP, показало, что дикий тип L. monocytogenes был инкапсулирован LC3-GFP, что согласуется с активацией аутофагии, тогда как мутант, лишенный LLO, не был. Bacillus subtilis, экспрессирующая либо LLO, либо родственный цитолизин, перфринголизин O (PFO), индуцировала колокализацию LC3 и липидизацию LC3. Кроме того, липосомы, содержащие LLO, также привлекали LC3-GFP, что указывает на то, что LLO было достаточно для индукции направленной аутофагии при отсутствии инфекции. Роль аутофагии имела различные эффекты в зависимости от типа анализируемых клеток. В эмбриональных фибробластах мыши atg5(−/−) L. monocytogenes имел первичный дефект выхода из вакуоли. Однако бактерии вырвались наружу и нормально размножались в BMDM atg5(−/−). ВЫВОДЫ/ЗНАЧЕНИЕ: Мы предполагаем, что повреждение мембраны, например, вызванное LLO, запускает направленную на бактерии аутофагию, хотя аутофагия не влияет на судьбу дикого типа внутриклеточных L. monocytogenes в первичных БМДМ. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2797616/",
"pubmed_id": "20062534"
} | предыстория недавний исследование показать аутофагия использоваться клетка качество защитный механизм против инфекция listeria monocytogenes методология основной вывод однако обнаружить аутофагия играть заметный роль вакуолярный побег внутриклеточный рост первичный культивировать макрофаг получить костный мозг bmdm дефицитный аутофагия atg5 менее приводить доказательство порообразовать активность холестеринзависимый цитолизин листериолизин llo мочь вызывать аутофагия заражение l моноцитогенеса заражение бмдм l monocytogenes индуцировать липидизация лёгкий цепь 3 белок ассоциированный микротрубочка lc3 согласоваться активация аутофагия мутант лишённый llo это делать инфицирование bmdm экспрессировать lc3 gfp показать дикий тип l monocytogenes инкапсулировать lc3 gfp согласоваться активация аутофагия мутант лишённый llo bacillus subtilis экспрессировать либо llo либо родственный цитолизин перфринголизин o pfo индуцировать колокализация lc3 липидизация lc3 кроме липосома содержать llo также привлекать lc3 gfp указывать llo достаточно индукция направить аутофагия отсутствие инфекция роль аутофагия иметь различный эффект зависимость тип анализировать клетка эмбриональный фибробласт мышь atg5 l monocytogenes иметь первичный дефект выход вакуоль однако бактерия вырваться наружу нормально размножаться bmdm atg5 вывод значение предполагать повреждение мембрана например вызвать llo запускать направить бактерия аутофагия хотя аутофагия влиять судьба дикий тип внутриклеточный l monocytogenes первичный бмдм | листериолизин необходимый достаточный индукция аутофагия инфекция listeria monocytogenes |
dp8971im | Определение гаплотипов Mafa-A и -B у породистых макак cynomolgus (Macaca fasccularis) | Генный/аллельный репертуар главного комплекса гистосовместимости (MHC) класса I B был исследован в породистой популяции яванских макак смешанного индонезийско-малайзийского происхождения. Аллели Mafa-B, обнаруженные в этой когорте, в основном специфичны для данной географической области, и только небольшое количество аллелей, по-видимому, являются общими с другими популяциями. Это говорит о быстрой эволюции аллелей Mafa-B вследствие адаптации к новым условиям. В отличие от людей, локус B у обезьян Старого Света демонстрирует значительную вариацию числа копий. Комбинации генов Mafa-B и ранее определенных -A разделяются в семьях, что позволяет определить расширенные гаплотипы. Во многих случаях удавалось также отнести определенный аллель Mafa-I к одному из этих гаплотипов Mafa-A/B. Наличие большого количества стабильных гаплотипов в этой когорте животных, которая разводилась на протяжении восьми поколений, выглядит многообещающим для разработки дискриминантных инструментов типирования MHC, которые были бы менее громоздкими. Более того, открытие 53 ранее не зарегистрированных последовательностей Mafa-B значительно расширяет словарь аллелей и может помочь в понимании сложной организации региона B макаки. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2802488/",
"pubmed_id": "19937015"
} | генный аллельный репертуар главное комплекс гистосовместимость mhc класс i b исследовать породистый популяция яванский макака смешанный индонезийско малайзийский происхождение аллель mafa b обнаружить когорта основное специфичный дать географический область небольшой количество аллель видимый являться общий популяция это говорить быстрый эволюция аллель mafa b вследствие адаптация новый условие отличие человек локус b обезьяна старое свет демонстрировать значительный вариация число копия комбинация ген mafa b ранее определённый a разделяться семья позволять определить расширить гаплотип многий случай удаваться также отнести определённый аллель mafa i гаплотип mafa a b наличие большой количество стабильный гаплотип когорта животное разводиться протяжение восемь поколение выглядеть многообещающий разработка дискриминантный инструмент типирование mhc менее громоздкий открытие 53 ранее зарегистрировать последовательность mafa b значительно расширять словарь аллель мочь помочь понимание сложный организация регион b макака | определение гаплотип mafa a b породистый макака cynomolgus macaca fasccularis |
imxe4jeo | Тестирование жизнеспособности и цитотоксичности in vitro и многопараметрические комбинации в одной и той же лунке для высокопроизводительного скрининга | Тестирование цитотоксичности in vitro стало неотъемлемой частью разработки лекарственных препаратов, поскольку оно представляет собой удобный, экономически эффективный и прогнозируемый способ характеристики токсического потенциала новых химических соединений. Раннее и повсеместное внедрение этого тестирования свидетельствует о его прогностической значимости для человека. Несмотря на то, что для 96-луночных форматов существует множество химических реагентов и методов анализа, лишь немногие из них являются практичными и достаточно чувствительными для применения в высокопроизводительном скрининге (HTS). Здесь мы кратко описываем несколько наиболее надежных и проверенных на данный момент анализов HTS для точной и эффективной оценки цитотоксического риска. Мы также даем рекомендации по успешному внедрению HTS и обсуждаем уникальные преимущества и недостатки, присущие каждому методу. Наконец, мы обсудим преимущества объединения определенных HTS-совместимых анализов в многопараметрические форматы с использованием одной и той же лунки. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2802765/",
"pubmed_id": "20161834"
} | тестирование цитотоксичность in vitro стать неотъемлемый часть разработка лекарственный препарат поскольку оно представлять удобный экономически эффективный прогнозировать способ характеристика токсический потенциал новый химический соединение ранний повсеместный внедрение это тестирование свидетельствовать прогностический значимость человек несмотря 96 луночный формат существовать множество химический реагент метод анализ лишь немногие являться практичный достаточно чувствительный применение высокопроизводительный скрининг hts кратко описывать несколько наиболее надёжный проверить данный момент анализ hts точный эффективный оценка цитотоксический риск также давать рекомендация успешный внедрение hts обсуждать уникальный преимущество недостаток присущий каждый метод обсудить преимущество объединение определённый hts совместимый анализ многопараметрический формат использование лунка | тестирование жизнеспособность цитотоксичность in vitro многопараметрический комбинация лунка высокопроизводительный скрининг |
c8snsa4z | Рецидивирующий синдром активации макрофагов у 15-летней девочки с болезнью Стилла: описание случая | ВВЕДЕНИЕ: Синдром активации макрофагов — тяжелое, потенциально опасное для жизни состояние, которое может сопровождать болезнь Стилла. Заболевание характеризуется лихорадкой, гепатоспленомегалией, лимфаденопатией, тяжелой цитопенией, серьезным нарушением функции печени, коагулопатией и неврологическими нарушениями. Основное лечение пациентов с этим синдромом включает этопозид 150 мг/2 М два раза в неделю в течение двух недель, дексаметазон 10 мг/2 М в течение двух недель и циклоспорин 3–5 мг/кг в течение более длительного периода. Случаи рецидива синдрома активации макрофагов относительно редки. ОПИСАНИЕ СЛУЧАЯ: Мы описываем случай 15-летней иракской девочки с болезнью Стилла, у которой развился синдром активации макрофагов с острым респираторным дистресс-синдромом, потребовавший реанимации и искусственной вентиляции легких. После интенсивного лечения, включавшего высокие дозы стероидов и циклоспорина, состояние пациента значительно улучшилось. Однако через две недели после отмены циклоспорина она была повторно госпитализирована с острым рецидивом синдрома активации макрофагов, проявившимся в виде резкой лихорадки, артралгий, макулопапулезной сыпи и лейкоцитоза. На этот раз пациент выздоровел после возобновления лечения циклоспорином и добавления микофенолата мофетила (Селлсепт). ЗАКЛЮЧЕНИЕ: Мы считаем, что циклоспорин является краеугольным камнем в лечении болезни Стилла. Мы рекомендуем продолжать прием этого препарата в течение нескольких недель после клинического выздоровления пациента, чтобы предотвратить рецидивы синдрома активации макрофагов. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2803809/",
"pubmed_id": "20062775"
} | введение синдром активация макрофаг тяжёлый потенциально опасный жизнь состояние мочь сопровождать болезнь стилл заболевание характеризоваться лихорадка гепатоспленомегалия лимфаденопатия тяжёлый цитопения серьёзный нарушение функция печень коагулопатия неврологический нарушение основный лечение пациент это синдром включать этопозид 150 мг 2 м неделя течение неделя дексаметазон 10 мг 2 м течение неделя циклоспорин 3 5 мг кг течение длительный период случай рецидив синдром активация макрофаг относительно редкий описание случай описывать случай 15 летний иракский девочка болезнь стилл развиться синдром активация макрофаг острый респираторный дистресс синдром потребовать реанимация искусственный вентиляция лёгкий интенсивный лечение включать высокий доза стероид циклоспорин состояние пациент значительно улучшиться однако неделя отмена циклоспорин повторно госпитализировать острый рецидив синдром активация макрофаг проявиться вид резкий лихорадка артралгия макулопапулезный сыпь лейкоцитоз пациент выздороветь возобновление лечение циклоспорин добавление микофенолат мофетил селлсепт заключение считать циклоспорин являться краеугольный камень лечение болезнь стилл рекомендовать продолжать приём это препарат течение несколько неделя клинический выздоровление пациент предотвратить рецидив синдром активация макрофаг | рецидивировать синдром активация макрофаг 15 летний девочка болезнь стилл описание случай |
b1h8hweh | Множественные абсцессы легких, вызванные ацинетобактерной инфекцией: описание случая | Виды Acinetobacter являются хорошо известными возбудителями внутрибольничных инфекций. В последнее время все больше данных подчеркивают роль этих патогенов в возникновении инфекций, приобретенных в обществе. Мы описываем случай 16-летней девушки с лихорадкой, болью в горле, продуктивным кашлем, недомоганием и наличием уплотнения в легких с множественными абсцессами при рентгенологическом исследовании. У пациента не было существенной истории болезни. После детального диагностического обследования был поставлен диагноз: внебольничная пневмония, вызванная Acinetobacter, с множественными абсцессами легких. Штамм Acinetobacter оказался восприимчивым к различным антимикробным препаратам, и состояние пациента быстро улучшилось. Новая компьютерная томография грудной клетки, проведенная три месяца спустя, подтвердила полное выздоровление. Наличие абсцессов легких вследствие инфекции Acinetobacter является крайне редким проявлением заболевания. Этот случай подчеркивает важную роль, которую эти бактерии, часто обладающие множественной лекарственной устойчивостью, могут играть в будущем, возможно, также и в инфекционных заболеваниях среди населения. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2804000/",
"pubmed_id": "20062600"
} | вид acinetobacter являться известный возбудитель внутрибольничный инфекция последний время всё большой данные подчёркивать роль патоген возникновение инфекция приобрести общество описывать случай 16 летний девушка лихорадка боль горло продуктивный кашель недомогание наличие уплотнение лёгкий множественный абсцесс рентгенологический исследование пациент существенный история болезнь детальный диагностический обследование поставить диагноз внебольничный пневмония вызвать acinetobacter множественный абсцесс лёгкий штамм acinetobacter оказаться восприимчивый различный антимикробный препарат состояние пациент быстро улучшиться новый компьютерный томография грудной клетка провести месяц спустя подтвердить полный выздоровление наличие абсцесс лёгкий вследствие инфекция acinetobacter являться крайне редкий проявление заболевание случай подчёркивать важный роль бактерия часто обладать множественный лекарственный устойчивость мочь играть будущее возможно также инфекционный заболевание среди население | множественный абсцесс лёгкий вызвать ацинетобактерный инфекция описание случай |
134qz0aw | Новая антимикобактериальная функция митоген-активируемой протеинкиназы фосфатазы-1 | ПРЕДЫСТОРИЯ: Микобактерия туберкулеза (МБТ) является одной из основных причин заболеваемости и смертности в мире. Для борьбы с этим патогеном иммунные клетки выделяют цитокины, включая фактор некроза опухоли-α (ФНО-α), который играет решающую роль в развитии защитных гранулем. Наши предыдущие результаты показали, что бацилла Кальметта-Герена (БЦЖ), микобактерия, используемая в качестве модели для исследования иммунного ответа против МБТ, стимулирует индукцию ФНО-α через митоген-активируемую протеинкиназу (МАРК) в моноцитах крови человека. Поскольку известно, что фосфатаза MAPK-1 (MKP-1) регулирует активность MAPK, мы изучили, играет ли MKP-1 роль в активации MAPK, вызванной БЦЖ, и экспрессии цитокинов. РЕЗУЛЬТАТЫ: Первичные моноциты крови человека были обработаны БЦЖ и проанализированы на экспрессию MKP-1. Наши результаты показали, что после воздействия БЦЖ наблюдалось увеличение экспрессии MKP-1. Кроме того, индукция MKP-1 регулировалась p38 MAPK и киназами 1 и 2, регулируемыми внеклеточным сигналом (ERK1/2). Удивительно, но когда экспрессия MKP-1 блокировалась его специфической siRNA, наблюдалось значительное снижение уровней фосфо-MAPK (p38 MAPK и ERK1/2) и TNF-α, индуцируемых БЦЖ. ВЫВОДЫ: Поскольку TNF-α играет ключевую роль в формировании гранулемы, результаты показали неожиданную положительную функцию MKP-1 против микобактериальной инфекции в отличие от его обычной фосфатазной активности. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2804704/",
"pubmed_id": "20017901"
} | предыстория микобактерия туберкулёз мбт являться основный причина заболеваемость смертность мир борьба это патоген иммунный клетка выделять цитокина включая фактор некроз опухоль α фно α играть решающий роль развитие защитный гранулёма наш предыдущий результат показать бацилла кальметта герена бцж микобактерия использовать качество модель исследование иммунный ответ против мбт стимулировать индукция фно α митоген активировать протеинкиназа марк моноцит кровь человек поскольку известно фосфатаз mapk 1 mkp 1 регулировать активность mapk изучить играть mkp 1 роль активация mapk вызвать бцж экспрессия цитокин результат первичный моноцит кровь человек обработать бцж проанализировать экспрессия mkp 1 наш результат показать воздействие бцж наблюдаться увеличение экспрессия mkp 1 кроме индукция mkp 1 регулироваться p38 mapk киназ 1 2 регулировать внеклеточный сигнал erk1 2 удивительно экспрессия mkp 1 блокироваться специфический sirna наблюдаться значительный снижение уровень фосфо mapk p38 mapk erk1 2 tnf α индуцировать бцж вывод поскольку tnf α играть ключевой роль формирование гранулёма результат показать неожиданный положительный функция mkp 1 против микобактериальный инфекция отличие обычный фосфатазный активность | новый антимикобактериальный функция митоген активировать протеинкиназа фосфатаз 1 |
piusm60c | Локализация мембранных белков низкой плотности, устойчивых к детергентам, в интактной и прореагировавшей на акросому сперме мышей | Сперматозоиды млекопитающих становятся фертильными после завершения капацитации — процесса, связанного с потерей холестерина и изменением биофизических свойств мембран сперматозоидов, который подготавливает сперматозоиды к прохождению акросомной реакции. Различные лаборатории выдвинули гипотезу, что отток холестерина может влиять на размер и/или перемещение микродоменов липидного рафта. В предыдущем исследовании наша лаборатория изучала идентификацию белков спермы, предположительно связанных с рафтами. После экстракции с помощью Triton X-100 и ультрацентрифугирования в градиентах сахарозы белки, распределяющиеся по фракциям легкой плавучей плотности, были извлечены из полиакриламидных гелей и микросеквенированы. В этом исследовании была выбрана подгруппа этих белков (TEX101, базигин, гексокиназа 1, облегченный транспортер глюкозы 3, IZUMO и SPAM1) и других молекул, которые, как известно, обогащены мембранными плотами (кавеолин 2, флотиллин 1, флотиллин 2 и ганглиозид GM3), для изучения их локализации в сперме и их поведения во время капацитации и акросомной реакции. Эти молекулы локализуются в нескольких доменах сперматозоидов, включая акросомальный колпачок (IZUMO, кавеолин 2 и флотиллин 2), экваториальный сегмент (GM3), цитоплазматическую каплю (TEX101), среднюю часть (базигин, облегченный транспортер глюкозы 3 и флотиллин 2) и основную часть (облегченный транспортер глюкозы 3). Некоторые из этих маркеров изменили свой паттерн иммунофлуоресценции после инкубации спермы в условиях повышения емкости, и эти изменения коррелировали с возникновением акросомной реакции. В то время как GM3 и кавеолин 2 не были обнаружены после акросомной реакции, флотиллин 2 был обнаружен в экваториальном сегменте сперматозоида, прореагировавшего на акросому, а IZUMO распределился вдоль головки сперматозоида, достигнув пост- и параакросомальных областей. Принимая во внимание необходимость акросомной реакции для того, чтобы сперматозоид стал способным к слиянию, эти результаты позволяют предположить, что динамика мембранного плота может играть определенную роль во взаимодействии мембраны сперматозоида и яйцеклетки. | {
"url": "https://academic.oup.com/biolreprod/article-pdf/80/5/897/10571849/biolreprod0897.pdf",
"pubmed_id": "19144954"
} | сперматозоид млекопитающее становиться фертильный завершение капацитация процесс связанный потеря холестерин изменение биофизический свойство мембрана сперматозоид подготавливать сперматозоид прохождение акросомный реакция различный лаборатория выдвинуть гипотеза отток холестерин мочь влиять размер перемещение микродомен липидный рафт предыдущий исследование наш лаборатория изучать идентификация белок сперма предположительно связанный рафтами экстракция помощь triton x 100 ультрацентрифугирование градиент сахароза белка распределяться фракция лёгкий плавучий плотность извлечь полиакриламидный гель микросеквенировать это исследование выбрать подгруппа белок tex101 базигин гексокиназа 1 облегчить транспортёр глюкоза 3 izumo spam1 молекула известно обогатить мембранный плот кавеолин 2 флотиллина 1 флотиллина 2 ганглиозид gm3 изучение локализация сперма поведение время капацитация акросомный реакция молекула локализоваться несколько домен сперматозоид включая акросомальный колпачок izumo кавеолин 2 флотиллина 2 экваториальный сегмент gm3 цитоплазматический капля tex101 средний часть базигин облегчить транспортёр глюкоза 3 флотиллина 2 основный часть облегчить транспортёр глюкоза 3 некоторый маркер изменить свой паттерн иммунофлуоресценция инкубация сперма условие повышение ёмкость изменение коррелировать возникновение акросомный реакция время gm3 кавеолин 2 обнаружить акросомный реакция флотиллина 2 обнаружить экваториальный сегмент сперматозоид прореагировать акросом izumo распределиться вдоль головка сперматозоид достигнуть пост параакросомальный область принимать внимание необходимость акросомный реакция сперматозоид стать способный слияние результат позволять предположить динамика мембранный плот мочь играть определённый роль взаимодействие мембрана сперматозоид яйцеклетка | локализация мембранный белок низкий плотность устойчивый детергент интактный прореагировать акросом сперма мышь |
a7oqm956 | Глобальное профилирование экспрессии при эпилептогенезе: добавляет ли оно путаницы? | С момента создания глобальных платформ профилирования экспрессии генов в середине 1990-х годов наблюдался значительный рост числа публикаций о дифференциально экспрессируемых генах в процессе эпилептогенеза. В частности, при мезиальной височной эпилепсии наличие латентного периода между первым проявлением приступов и хронической эпилепсией дает возможность для терапевтических вмешательств на уровне молекулярной биологии. Используя методы глобального профилирования экспрессии, было опубликовано около 2000 генов, демонстрирующих дифференциальную экспрессию при мезиальной височной эпилепсии. Однако большинство этих изменений специфичны для лабораторных или экспериментальных условий, и только 53 гена продемонстрировали изменения более чем в двух публикациях. С этой целью мы рассматриваем современное состояние профилирования экспрессии генов при эпилептогенезе и предлагаем стандартные рекомендации, которым следует следовать для большей точности и воспроизводимости результатов. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2805866/",
"pubmed_id": "19243383"
} | момент создание глобальный платформа профилирование экспрессия ген середина 1990 х год наблюдаться значительный рост число публикация дифференциальный экспрессировать ген процесс эпилептогенез частность мезиальна височный эпилепсия наличие латентный период первый проявление приступ хронический эпилепсия давать возможность терапевтический вмешательство уровень молекулярный биология использовать метод глобальный профилирование экспрессия опубликовать около 2000 ген демонстрировать дифференциальный экспрессия мезиальна височный эпилепсия однако большинство изменение специфичный лабораторный экспериментальный условие 53 ген продемонстрировать изменение публикация цель рассматривать современный состояние профилирование экспрессия ген эпилептогенез предлагать стандартный рекомендация следовать следовать больший точность воспроизводимость результат | глобальный профилирование экспрессия эпилептогенез добавлять оно путаница |
zwgnkegf | Флуоресцентный конкурентный анализ. Измерение изменений свободной энергии для псевдоузлов РНК. | [Изображение: см. текст] Псевдоузлы РНК выполняют важные функции, а термодинамическая стабильность является ключом к прогнозированию псевдоузлов в последовательностях РНК и пониманию их функций. Традиционные методы измерения термодинамики РНК, такие как УФ-плавление и дифференциальная сканирующая калориметрия, ограничены диапазонами температур вблизи температуры плавления псевдоузла. В данной работе мы сообщаем об изменениях свободной энергии псевдоузлов РНК при 37 °C, измеренных с помощью флуоресцентных конкурентных анализов. Исследования, зависящие от последовательности, для области петли 1-стебля 2 показывают, что (1) модель водородных связей между ближайшими соседями (INN-HB) дает разумную оценку изменения свободной энергии при изменении пары оснований Уотсона-Крика в стебле 2, (2) энтропию петли можно оценить с помощью статистической полимерной модели, хотя для определенных последовательностей петель необходим некоторый штраф, и (3) третичные взаимодействия могут значительно стабилизировать псевдоузлы, а увеличение длины стебля 2 может изменить третичные взаимодействия, так что модель INN-HB не предсказывает чистый эффект добавления пары оснований. Результаты могут быть использованы при написании алгоритмов для прогнозирования и/или проектирования вторичных структур РНК. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2808147/",
"pubmed_id": "19921809"
} | изображение смотреть текст псевдоузел рнк выполнять важный функция термодинамический стабильность являться ключ прогнозирование псевдоузел последовательность рнк понимание функция традиционный метод измерение термодинамика рнк уф плавление дифференциальный сканировать калориметрия ограничить диапазон температура вблизи температура плавление псевдоузел дать работа сообщать изменение свободный энергия псевдоузел рнк 37 c измерить помощь флуоресцентный конкурентный анализ исследование зависеть последовательность область петля 1 стебель 2 показывать 1 модель водородный связь близкий сосед inn hb давать разумный оценка изменение свободный энергия изменение пара основание уотсон крик стебло 2 2 энтропия петля оценить помощь статистический полимерный модель хотя определённый последовательность петля необходимый некоторый штраф 3 третичный взаимодействие мочь значительно стабилизировать псевдоузел увеличение длина стебель 2 мочь изменить третичный взаимодействие модель inn hb предсказывать чистый эффект добавление пара основание результат мочь использовать написание алгоритм прогнозирование проектирование вторичный структура рнк | флуоресцентный конкурентный анализ измерение изменение свободный энергия псевдоузел рнк |
jgxbpy4j | Протеомный анализ ядрышка в клетках, инфицированных аденовирусом | Аденовирусы размножаются в основном в ядре клетки-хозяина, и хорошо известно, что аденовирусная инфекция влияет на структуру и функцию ядрышек клетки-хозяина, а также кодирует ряд вирусных белков, нацеленных на ядрышки. В данной работе мы использовали беспристрастные методы протеомики, включая высокопроизводительную масс-спектрометрию в сочетании с маркировкой стабильными изотопами аминокислот в культуре клеток (SILAC) и традиционный двумерный гель-электрофорез, для выявления количественных изменений в составе белков ядрышка при аденовирусной инфекции. Двумерный анализ геля выявил изменения в шести белках. Напротив, подходы на основе SILAC позволили идентифицировать 351 белок, причем 24 белка продемонстрировали как минимум двукратное изменение после заражения. Ранее сообщалось, что четыре из них имеют аномальную локализацию и/или функциональную значимость во время аденовирусной инфекции. Всего с помощью конфокальной микроскопии в инфицированных клетках было исследовано 15 белков, количество которых, как было выявлено методами протеомики, изменилось. Одиннадцать из этих белков показали измененные паттерны локализации в клетках, инфицированных аденовирусом. Сравнение наших данных с эффектами актиномицина D на ядрышковый протеом показало, что аденовирусная инфекция, по-видимому, специфически воздействует на относительно небольшую подгруппу ядрышковых антигенов в исследуемый момент времени. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2808258/",
"pubmed_id": "19812395"
} | аденовирус размножаться основное ядро клетка хозяин известно аденовирусный инфекция влиять структура функция ядрышко клетка хозяин также кодировать ряд вирусный белок нацелить ядрышко дать работа использовать беспристрастный метод протеомик включая высокопроизводительный масса спектрометрия сочетание маркировка стабильный изотоп аминокислота культура клетка silac традиционный двумерный гель электрофорез выявление количественный изменение состав белок ядрышко аденовирусный инфекция двумерный анализ гель выявить изменение шесть белок напротив подход основа silac позволить идентифицировать 351 белок причём 24 белок продемонстрировать минимум двукратный изменение заражение ранее сообщаться четыре иметь аномальный локализация функциональный значимость время аденовирусный инфекция весь помощь конфокальный микроскопия инфицировать клетка исследовать 15 белок количество выявить метод протеомик измениться одиннадцать белок показать изменить паттерн локализация клетка инфицировать аденовирус сравнение наш данные эффект актиномицин d ядрышковый проте показать аденовирусный инфекция видимый специфически воздействовать относительно небольшой подгруппа ядрышковый антиген исследовать момент время | протеомный анализ ядрышко клетка инфицировать аденовирус |
d08buwtu | Анализ реакций В-клеток памяти и выделение новых моноклональных антител с нейтрализующим спектром от лиц, инфицированных ВИЧ-1 | ПРЕДЫСТОРИЯ: Выделение человеческих моноклональных антител (мАТ), нейтрализующих широкий спектр первичных изолятов ВИЧ-1, и характеристика реакции нейтрализующих антител В-клеток человека на инфекцию ВИЧ-1 являются важными целями, имеющими центральное значение для разработки эффективной вакцины на основе антител. МЕТОДЫ И РЕЗУЛЬТАТЫ: Мы иммортализованы IgG(+) В-клетки памяти от людей, инфицированных различными кладами ВИЧ-1 и отобранных на основе профилей нейтрализации плазмы, которые были перекрестными и относительно эффективными. Культуральные супернатанты были исследованы с использованием различных рекомбинантных форм оболочечных гликопротеинов (Env) в нескольких параллельных анализах. Мы выделили 58 моноклональных антител, которые были сопоставлены с различными поверхностями Env, большинство из которых проявили нейтрализующую активность. В частности, одно моноклональное антитело (HJ16), специфичное к новому эпитопу, проксимальному участку связывания CD4 на gp120, селективно нейтрализовало многокладную панель псевдовирусов ВИЧ-1 второго уровня и продемонстрировало реактивность, сопоставимую по широте, но отличную по специфичности нейтрализации от реактивности другого моноклонального антитела b12, специфичного к участку связывания CD4. Второе моноклональное антитело (HGN194) связывало консервативный эпитоп в короне V3 и нейтрализовало все протестированные псевдовирусы уровня 1 и часть псевдовирусов уровня 2, независимо от клады. Третье моноклональное антитело (HK20) с широкой нейтрализующей активностью, особенно в виде Fab-фрагмента, распознало высококонсервативный эпитоп в области HR-1 gp41, но продемонстрировало поразительную селективность в зависимости от анализа. ВЫВОДЫ: Это исследование показывает, что при использовании соответствующих методов скрининга можно выделить большую часть В-клеток памяти, которые продуцируют моноклональные антитела с активностью, нейтрализующей ВИЧ-1. Три из этих моноклональных антител демонстрируют необычайно широкий спектр нейтрализации и, следовательно, дополняют существующую панель нейтрализующих антител ВИЧ-1 с потенциалом для пассивной защиты и разработки вакцин на основе шаблонов. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2808385/",
"pubmed_id": "20098712"
} | предыстория выделение человеческий моноклональный антитело мат нейтрализовать широкий спектр первичный изолят вич 1 характеристика реакция нейтрализовать антитело клетка человек инфекция вич 1 являться важный цель иметь центральный значение разработка эффективный вакцина основа антитело метод результат иммортализовать igg клетка память человек инфицировать различный клад вич 1 отобрать основа профиль нейтрализация плазма перекрёстный относительно эффективный культуральный супернатанта исследовать использование различный рекомбинантный форма оболочечный гликопротеин env несколько параллельный анализ выделить 58 моноклональный антитело сопоставить различный поверхность env большинство проявить нейтрализовать активность частность моноклональный антитело hj16 специфичный новый эпитоп проксимальный участок связывание cd4 gp120 селективный нейтрализовать многокладный панель псевдовирус вич 1 второй уровень продемонстрировать реактивность сопоставимый широта отличный специфичность нейтрализация реактивность моноклональный антитело b12 специфичный участок связывание cd4 второе моноклональный антитело hgn194 связывать консервативный эпитоп корона v3 нейтрализовать всё протестировать псевдовирус уровень 1 часть псевдовирус уровень 2 независимо клад третий моноклональный антитело hk20 широкий нейтрализовать активность особенно вид fab фрагмент распознать высококонсервативный эпитоп область hr 1 gp41 продемонстрировать поразительный селективность зависимость анализ вывод это исследование показывать использование соответствующий метод скрининг выделить больший часть клетка память продуцировать моноклональный антитело активность нейтрализовать вич 1 моноклональный антитело демонстрировать необычайно широкий спектр нейтрализация следовательно дополнять существующий панель нейтрализовать антитело вич 1 потенциал пассивный защита разработка вакцина основа шаблон | анализ реакция клетка память выделение новый моноклональный антитело нейтрализовать спектр лицо инфицировать вич 1 |
8y8ho2x5 | Recode-2: новый дизайн, новые инструменты поиска и много других генов | «Перекодирование» — термин, используемый для описания нестандартного считывания генетического кода и охватывающий такие явления, как запрограммированный сдвиг рамки считывания рибосом, считывание стоп-кодона, вставка селеноцистеина и обход трансляции. Хотя только небольшая часть генов использует перекодирование при синтезе белка, точная аннотация «перекодированных» генов значительно отстает от аннотации «стандартных» генов. Для решения этой проблемы, предоставления услуг исследователям в этой области и предоставления обучающих данных разработчикам программного обеспечения для аннотации генов мы собрали известные случаи перекодирования в базе данных Recode. Recode-2 — улучшенная и обновленная версия базы данных. Он обеспечивает доступ к подробной информации о генах, использующих трансляционное перекодирование, и позволяет выполнять сложные поисковые запросы, просматривать данные перекодирования и улучшать визуализацию аннотированных элементов последовательности. В настоящее время база данных Recode-2 хранит информацию примерно о 1500 генах, которые, как известно, используют перекодирование в своей экспрессии, что примерно в три раза больше, чем в предыдущей версии базы данных. Recode-2 доступен по адресу http://recode.ucc.ie | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2808893/",
"pubmed_id": "19783826"
} | перекодирование термин использовать описание нестандартный считывание генетический код охватывать явление запрограммировать сдвиг рамка считывание рибосома считывание стоп кодон вставка селеноцистеин обход трансляция хотя небольшой часть ген использовать перекодирование синтез белок точный аннотация перекодировать ген значительно отставать аннотация стандартный ген решение проблема предоставление услуга исследователь область предоставление обучать данные разработчик программный обеспечение аннотация ген собрать известный случай перекодирование база данные recode recode 2 улучшить обновить версия база данные обеспечивать доступ подробный информация ген использовать трансляционный перекодирование позволять выполнять сложный поисковый запрос просматривать дать перекодирование улучшать визуализация аннотировать элемент последовательность настоящий время база данные recode 2 хранить информация примерно 1500 ген известно использовать перекодирование свой экспрессия примерно большой предыдущий версия база данные recode 2 доступный адрес http recode ucc ie | recode 2 новый дизайн новый инструмент поиск ген |
sbnnh2mm | ViralORFeome: интегрированная база данных для создания универсальной коллекции вирусных ORF | Большие коллекции открытых рамок считывания (ОРС), кодирующих белки, созданные в универсальной системе клонирования на основе рекомбинации, сыграли важную роль в изучении функций белков в высокопроизводительных анализах. Подобные ресурсы «ORFeome» были разработаны для нескольких организмов, но в вирусологии по-прежнему необходимы коллекции плазмид, охватывающие значительную часть виросферы. В этой связи мы представляем ViralORFeome 1.0 (http://www.viralorfeome.com) — базу данных и систему управления с открытым доступом, которая предоставляет интегрированный набор биоинформационных инструментов для клонирования вирусных ОРС в системе Gateway®. ViralORFeome предоставляет удобный интерфейс для навигации по последовательностям генома вируса, для разработки клонирующих праймеров, специфичных для ОРС, для проверки последовательности созданных конструкций и для просмотра существующих коллекций ОРС вирусов. Что наиболее важно, ViralORFeome был разработан для управления всеми возможными вариантами или мутантами заданной ORF, чтобы процедуру клонирования можно было применить к любому новому штамму вируса. Подмножество плазмидных конструкций, созданных с помощью платформы ViralORFeome, было успешно протестировано на предмет экспрессии гетерологичных белков в различных системах экспрессии в масштабе протеома. ViralORFeome должен предоставить нашему сообществу основу для создания большой коллекции клонов вирусных ORF, инструментального ресурса для определения функций, активности и партнеров по связыванию вирусных белков. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2808970/",
"pubmed_id": "20007148"
} | больший коллекция открытый рамка считывание орс кодировать белка создать универсальный система клонирование основа рекомбинация сыграть важный роль изучение функция белок высокопроизводительный анализ подобный ресурс orfeome разработать несколько организм вирусология прежний необходимый коллекция плазмида охватывать значительный часть виросфера связь представлять viralorfeome 1 0 http www viralorfeome com база данные система управление открытый доступ предоставлять интегрировать набор биоинформационный инструмент клонирование вирусный орс система gateway viralorfeome предоставлять удобный интерфейс навигация последовательность геном вирус разработка клонировать праймер специфичный орс проверка последовательность создать конструкция просмотр существующий коллекция орс вирус наиболее важно viralorfeome разработать управление весь возможный вариант мутант задать orf процедура клонирование применить любой новый штамм вирус подмножество плазмидный конструкция создать помощь платформа viralorfeome успешно протестировать предмет экспрессия гетерологичный белок различный система экспрессия масштаб протеома viralorfeome должный предоставить наш сообщество основа создание большой коллекция клон вирусный orf инструментальный ресурс определение функция активность партнёр связывание вирусный белок | viralorfeome интегрировать база данные создание универсальный коллекция вирусный orf |
hxjxczyr | Клинический обзор: Первичная гриппозная вирусная пневмония | Первичная гриппозная пневмония имеет высокий уровень смертности во время пандемий не только среди лиц с ослабленным иммунитетом и пациентов с сопутствующими заболеваниями, но и среди молодых здоровых взрослых. Врачам следует сохранять высокую степень настороженности в отношении этого диагноза у пациентов с симптомами гриппа, которые быстро (от 2 до 5 дней) прогрессируют до респираторного дистресса и обширного поражения легких. Чувствительность методов быстрой диагностики при выявлении инфекций, вызванных пандемическим штаммом гриппа H1N1v 2009, в настоящее время недостаточна. Наиболее надежное молекулярное тестирование с использованием обратной транскриптазы и полимеразной цепной реакции в реальном времени доступно в ограниченном количестве клинических условий. Несмотря на 6 месяцев пандемической циркуляции, большинство новых пандемических штаммов вируса H1N1v остаются восприимчивыми к осельтамивиру. В лечении крайне важно обеспечить надлежащую стратегию оксигенации и вентиляции, а также своевременное начало противовирусной терапии. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2811908/",
"pubmed_id": "20085663"
} | первичный гриппозный пневмония иметь высокий уровень смертность время пандемия среди лицо ослабить иммунитет пациент сопутствовать заболевание среди молодой здоровый взрослый врач следовать сохранять высокий степень настороженность отношение это диагноз пациент симптом грипп быстро 2 5 день прогрессировать респираторный дистресс обширный поражение лёгкий чувствительность метод быстрый диагностика выявление инфекция вызвать пандемический штамм грипп h1n1v 2009 настоящий время недостаточный наиболее надёжный молекулярный тестирование использование обратный транскриптаза полимеразный цепной реакция реальный время доступно ограниченный количество клинический условие несмотря 6 месяц пандемический циркуляция большинство новый пандемический штамм вирус h1n1v оставаться восприимчивый осельтамивир лечение крайне важно обеспечить надлежащий стратегия оксигенация вентиляция также своевременный начало противовирусный терапия | клинический обзор первичный гриппозный вирусный пневмония |
zqcu10rp | Расчет вероятности передачи гриппа A (H1N1) во время полета | ПРЕДЫСТОРИЯ: Очевидно, что авиаперелеты, осуществляемые путем перевозки инфицированных людей из одного географического местоположения в другое, существенно влияют на скорость распространения гриппа A (H1N1). Однако возможность передачи вируса H1N1 во время полета не оценивалась, хотя известно, что оспа, корь, туберкулез, атипичная пневмония и сезонный грипп могут передаваться во время коммерческих рейсов. Здесь мы представляем первую количественную оценку риска для определения возможности передачи вируса H1N1 во время полета. МЕТОДЫ: Мы моделируем воздушную передачу инфекционных вирусных частиц H1N1 в самолете Boeing 747, используя методологию из области количественной оценки микробного риска. РЕЗУЛЬТАТЫ: Риск заражения вирусом H1N1 в основном будет ограничен пассажирами, путешествующими в том же салоне, что и источник заболевания. Неудивительно, что мы обнаружили, что чем длиннее перелет, тем большее число случаев заражения можно ожидать. Мы подсчитали, что H1N1, даже во время длительных перелетов, представляет низкий или умеренный риск передачи во время полета, если источник заболевания путешествует первым классом. В частности, за 5-часовой перелет может быть зафиксировано 0-1 случай заражения, за 11-часовой — 1-3 случая заражения, а за 17-часовой — 2-5 случаев заражения. Однако передача вируса во время полета может быть значительной, особенно во время длительных перелетов, если источник заболевания путешествует в эконом-классе. В частности, за 5-часовой перелет может произойти от двух до пяти случаев заражения, за 11-часовой — от 5 до 10 случаев, а за 17-часовой — от 7 до 17 случаев. Если самолет загружен лишь частично, при определенных условиях в первом классе может быть больше случаев заражения, чем в эконом-классе. В течение 17-часового полета в первом классе будет зафиксировано больше случаев заражения, чем в эконом-классе, если салон первого класса полностью заполнен, а эконом-класс заполнен менее чем на 30%. ВЫВОДЫ: Наши результаты дают представление о потенциальной пользе ограничений на авиаперелеты для контроля пандемий гриппа зимой 2009/2010 года. Они показывают, что перемещение одного инфицированного человека может привести не к одной вспышке H1N1, а к нескольким одновременным вспышкам. Полученные результаты свидетельствуют о том, что во время пандемии карантин пассажиров, путешествующих эконом-классом на дальних рейсах, может потенциально стать важной стратегией контроля. Примечательно, что наши результаты показывают, что карантин пассажиров, путешествующих первым классом, вряд ли станет эффективной стратегией контроля. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2813231/",
"pubmed_id": "20034378"
} | предыстория очевидный авиаперелёт осуществлять путём перевозка инфицировать человек географический местоположение существенно влиять скорость распространение грипп a h1n1 однако возможность передача вирус h1n1 время полёт оцениваться хотя известно оспа корь туберкулёз атипичный пневмония сезонный грипп мочь передаваться время коммерческий рейс представлять первый количественный оценка риск определение возможность передача вирус h1n1 время полёт метод моделировать воздушный передача инфекционный вирусный частица h1n1 самолёт boeing 747 использовать методология область количественный оценка микробный риск результат риск заражение вирус h1n1 основное ограничить пассажир путешествовать салон источник заболевание неудивительный обнаружить длинный перелёт больший число случай заражение ожидать подсчитать h1n1 время длительный перелёт представлять низкий умеренный риск передача время полёт источник заболевание путешествовать первый класс частность 5 часовой перелёт мочь зафиксировать 0 1 случай заражение 11 часовой 1 3 случай заражение 17 часовой 2 5 случай заражение однако передача вирус время полёт мочь значительный особенно время длительный перелёт источник заболевание путешествовать эконом класс частность 5 часовой перелёт мочь произойти пять случай заражение 11 часовой 5 10 случай 17 часовой 7 17 случай самолёт загрузить лишь частично определённый условие первый класс мочь большой случай заражение эконом класс течение 17 часовой полёт первый класс зафиксировать большой случай заражение эконом класс салон первый класс полностью заполнить эконом класс заполнить менее 30 вывод наш результат давать представление потенциальный польза ограничение авиаперелёт контроль пандемия грипп зимой 2009 2010 год показывать перемещение инфицировать человек мочь привести вспышка h1n1 несколько одновременный вспышка получить результат свидетельствовать время пандемия карантин пассажир путешествовать эконом класс дальний рейс мочь потенциально стать важный стратегия контроль примечательно наш результат показывать карантин пассажир путешествовать первый класс вряд стать эффективный стратегия контроль | расчёт вероятность передача грипп a h1n1 время полёт |
hwjkbpqp | Тезисы докладов 11-го Международного конгресса поведенческой медицины | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2816237/",
"pubmed_id": "19856109"
} | тезис доклад 11 го международный конгресс поведенческий медицина |
||
094d0rn6 | IPS-1 необходим для контроля инфекции вируса Западного Нила и иммунитета | Врожденный иммунный ответ необходим для контроля инфекции, вызванной вирусом Западного Нила (ВЗН), но то, как этот ответ распространяется и регулирует адаптивный иммунитет in vivo, не определено. В данной работе мы показываем, что IPS-1, центральный адаптерный белок для передачи сигналов RIG-I-подобного рецептора (RLR), необходим для запуска врожденного иммунитета и для эффективного развития и регуляции адаптивного иммунитета против патогенного вируса Западного Нила. Мыши IPS-1(−/−) продемонстрировали повышенную восприимчивость к инфекции ВЗН, что было отмечено усилением репликации и распространения вируса с ранним проникновением вируса в ЦНС. Инфицирование культивируемых дендритных клеток (ДК), макрофагов (МАК) и первичных корковых нейронов, полученных из костного мозга, показало, что сигнальная система RLR, зависящая от IPS-1, необходима для запуска защитных реакций IFN и контроля репликации вируса в этих ключевых клетках-мишенях инфекции. Интересно, что инфицированные мыши IPS-1(−/−) продемонстрировали неконтролируемое воспаление, которое включало повышенный системный IFN типа I, провоспалительные цитокиновые и хемокиновые реакции, увеличенное количество воспалительных ДК, усиленные гуморальные реакции, отмеченные полной потерей активности нейтрализации вируса, а также увеличенное количество вирусспецифических CD8+ Т-клеток и неспецифическую пролиферацию иммунных клеток на периферии и в ЦНС. Эта неконтролируемая воспалительная реакция была связана с отсутствием расширения регуляторных Т-клеток, которое обычно происходит во время острой инфекции ВЗН. Таким образом, усиление воспалительной реакции при отсутствии IPS-1 сочеталось с неспособностью защитить от инфекции ВЗН. Наши данные определяют врожденный/адаптивный иммунный интерфейс, опосредованный сигнализацией RLR, зависящей от IPS-1, которая регулирует количество, качество и баланс иммунного ответа на инфекцию ВНЗ. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2816698/",
"pubmed_id": "20140199"
} | врождённый иммунный ответ необходимый контроль инфекция вызвать вирус западный нил взн ответ распространяться регулировать адаптивный иммунитет in vivo определить дать работа показывать ips 1 центральный адаптерный белок передача сигнал rig i подобный рецептор rlr необходимый запуск врождённый иммунитет эффективный развитие регуляция адаптивный иммунитет против патогенный вирус западный нил мышь ips 1 продемонстрировать повышенный восприимчивость инфекция взн отметить усиление репликация распространение вирус ранний проникновение вирус цнс инфицирование культивировать дендритный клетка дк макрофаг мак первичный корковый нейрон получить костный мозг показать сигнальный система rlr зависеть ips 1 необходимый запуск защитный реакция ifn контроль репликация вирус ключевой клетка мишень инфекция интересно инфицировать мышь ips 1 продемонстрировать неконтролируемый воспаление включать повышенный системный ifn тип i провоспалительный цитокиновый хемокиновый реакция увеличить количество воспалительный дк усиленный гуморальный реакция отметить полный потеря активность нейтрализация вирус также увеличить количество вирусспецифический cd8 клетка неспецифический пролиферация иммунный клетка периферия цнс неконтролируемый воспалительный реакция связать отсутствие расширение регуляторный клетка обычно происходить время острый инфекция взн образ усиление воспалительный реакция отсутствие ips 1 сочетаться неспособность защитить инфекция взн наш дать определять врождённый адаптивный иммунный интерфейс опосредовать сигнализация rlr зависеть ips 1 регулировать количество качество баланс иммунный ответ инфекция внз | ips 1 необходимый контроль инфекция вирус западный нил иммунитет |
stgri6y6 | Тяжелая малярия — случай смертельной инфекции Plasmodium knowlesi с результатами вскрытия: отчет о случае | ПРЕДЫСТОРИЯ: Зоонозная малярия, вызываемая Plasmodium knowlesi, является важным, но недавно обнаруженным патогеном человека. Впервые публикуются результаты вскрытия смертельного случая малярии knowlesi. ОПИСАНИЕ СЛУЧАЯ: У ранее здорового 40-летнего мужчины симптомы проявились через 10 дней после того, как он провел время в джунглях Северного Борнео. Четыре дня спустя он поступил в больницу в состоянии коллапса и умер в течение двух часов. У него была гипонатриемия и повышенные показатели мочевины, калия, лактатдегидрогеназы и аминотрансферазы в крови; также у него была тромбоцитопения и эозинофилия. Было заподозрено геморрагическое поражение, вызванное лихорадкой Денге, и проведено вскрытие. Результаты анализов на вирус денге отрицательные. Анализ крови на малярийные паразиты показал гиперпаразитемию и наличие одного вида P. Инфекция knowlesi была подтверждена методом вложенной ПЦР. Макроскопическая патология мозга и эндокарда выявила множественные петехиальные кровоизлияния, печень и селезенка были увеличены, а легкие имели признаки, соответствующие ОРДС. Микроскопическое исследование показало секвестрацию пигментированных паразитированных эритроцитов в сосудах головного мозга, мозжечка, сердца и почек без признаков хронической воспалительной реакции в мозге или каком-либо другом исследованном органе. Срезы мозга оказались отрицательными на наличие внутриклеточной молекулы адгезии-1. В селезенке и печени было обнаружено обильное количество пигмента, содержащего макрофаги и паразитированные эритроциты. В почке наблюдались признаки острого канальцевого некроза, а в отделах сердца преобладали эндотелиальные клетки. ВЫВОДЫ: Общая картина в данном случае представляла собой системную малярийную инфекцию, соответствующую классификации ВОЗ для тяжелой малярии. Результаты вскрытия в этом случае неожиданно оказались схожи с данными, определяющими смертельную тропическую малярию, включая церебральную патологию. Имелись важные различия, включая отсутствие комы, несмотря на петехиальные кровоизлияния и секвестрацию паразитов в мозге. Полученные результаты свидетельствуют о том, что дальнейшее изучение малярии knowlesi поможет интерпретировать зачастую противоречивую информацию о патофизиологии малярии у людей. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2818646/",
"pubmed_id": "20064229"
} | предыстория зоонознать малярия вызывать plasmodium knowlesi являться важный недавно обнаружить патоген человек впервые публиковаться результат вскрытие смертельный случай малярия knowlesi описание случай ранее здоровый 40 летний мужчина симптом проявиться 10 день провести время джунгли северный борнео четыре день спустя поступить больница состояние коллапс умереть течение час гипонатриемия повышенный показатель мочевина калий лактатдегидрогеназа аминотрансфераза кровь также тромбоцитопения эозинофилия заподозрить геморрагический поражение вызвать лихорадка денге провести вскрытие результат анализ вирус денге отрицательный анализ кровь малярийный паразит показать гиперпаразитемия наличие вид p инфекция knowlesi подтвердить метод вложить пцр макроскопический патология мозг эндокард выявить множественный петехиальный кровоизлияние печень селезёнка увеличить лёгкий иметь признак соответствующий ордс микроскопический исследование показать секвестрация пигментировать паразитировать эритроцит сосуд головной мозг мозжечок сердце почка признак хронический воспалительный реакция мозг либо друг исследовать орган срез мозг оказаться отрицательный наличие внутриклеточный молекула адгезия 1 селезёнка печень обнаружить обильный количество пигмент содержать макрофаг паразитировать эритроцит почка наблюдаться признак острый канальцевой некроз отдел сердце преобладать эндотелиальный клетка вывод общий картина данный случай представлять системный малярийный инфекция соответствовать классификация воз тяжёлый малярия результат вскрытие это случай неожиданно оказаться схожий данные определять смертельный тропический малярия включая церебральный патология иметься важный различие включая отсутствие кома несмотря петехиальный кровоизлияние секвестрация паразит мозг получить результат свидетельствовать дальнейший изучение малярия knowlesi помочь интерпретировать зачастую противоречивый информация патофизиология малярия человек | тяжёлый малярия случай смертельный инфекция plasmodium knowlesi результат вскрытие отчёт случай |
36bfeoqv | Математическое моделирование эффективности масок для лица в снижении распространения нового гриппа A (H1N1) | 11 июня 2009 года Всемирная организация здравоохранения объявила вспышку нового гриппа A (H1N1) пандемией. В условиях ограниченных запасов противовирусных препаратов и вакцин страны и отдельные лица ищут другие способы сокращения распространения пандемического гриппа (H1N1) 2009, в частности, варианты, которые являются экономически эффективными и относительно простыми в реализации. Недавний опыт эпидемий атипичной пневмонии 2003 года и гриппа H1N1 2009 года показал, что люди готовы носить маски для защиты от инфекции; однако было проведено мало исследований для количественной оценки влияния использования масок на снижение распространения заболевания. Мы строим и анализируем математическую модель для популяции, в которой некоторые люди носят маски во время пандемии, и количественно оцениваем влияние этих масок на распространение гриппа. Для оценки значений параметров, используемых для оценки эффективности лицевых масок, мы использовали имеющиеся данные исследований респираторов N95 и хирургических лицевых масок. Результаты показывают, что если респираторы N95 эффективны всего на 20% в снижении восприимчивости и заразности, то для снижения числа случаев гриппа A (H1N1) на 20% их придется носить всего 10% населения. На основании нашей модели можно сделать вывод, что при правильном ношении маски представляют собой эффективную стратегию вмешательства для снижения распространения пандемического гриппа (H1N1) 2009. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2818714/",
"pubmed_id": "20161764"
} | 11 июнь 2009 год всемирный организация здравоохранение объявить вспышка новый грипп a h1n1 пандемия условие ограниченный запас противовирусный препарат вакцина страна отдельный лицо искать способ сокращение распространение пандемический грипп h1n1 2009 частность вариант являться экономически эффективный относительно простой реализация недавний опыт эпидемия атипичный пневмония 2003 год грипп h1n1 2009 год показать человек готовый носить маска защита инфекция однако провести мало исследование количественный оценка влияние использование маска снижение распространение заболевание строить анализировать математический модель популяция некоторый человек носить маска время пандемия количественно оценивать влияние маска распространение грипп оценка значение параметр использовать оценка эффективность лицевой маска использовать иметься дать исследование респиратор n95 хирургический лицевой маска результат показывать респиратор n95 эффективный весь 20 снижение восприимчивость заразность снижение число случай грипп a h1n1 20 прийтись носить весь 10 население основание наш модель сделать вывод правильный ношение маска представлять эффективный стратегия вмешательство снижение распространение пандемический грипп h1n1 2009 | математический моделирование эффективность маска лицо снижение распространение новый грипп a h1n1 |
sk9lud0o | Корректировка фактического числа воспроизводства: простой метод оценки R(0) на основе ранних данных о росте эпидемии | Базовое репродуктивное число R(0), суммарная мера потенциала передачи инфекционного заболевания, оценивается на основе ранних темпов роста эпидемии, но метод оценки, основанный на вероятности, еще не разработан. Настоящее исследование корректирует концепцию фактического числа воспроизводства, предлагая простую структуру для оценки R(0) без предположения экспоненциального роста случаев. Предложенный метод применяется к эпидемии ВИЧ в европейских странах, давая значения R(0) в диапазоне от 3,60 до 3,74, что соответствует значениям, основанным на уравнении Эйлера-Лотка. Метод также позволяет рассчитать ожидаемое значение R(0) с помощью электронной таблицы. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2819789/",
"pubmed_id": "20195446"
} | базовый репродуктивный число r 0 суммарный мера потенциал передача инфекционный заболевание оцениваться основа ранний темп рост эпидемия метод оценка основать вероятность ещё разработать настоящий исследование корректировать концепция фактический число воспроизводство предлагать простой структура оценка r 0 предположение экспоненциальный рост случай предложить метод применяться эпидемия вич европейский страна давать значение r 0 диапазон 3 60 3 74 соответствовать значение основать уравнение эйлер лоток метод также позволять рассчитать ожидать значение r 0 помощь электронный таблица | корректировка фактический число воспроизводство простой метод оценка r 0 основа ранний данные рост эпидемия |
h3yxymh3 | Использование спутниковых снимков изменений окружающей среды для прогнозирования вспышек инфекционных заболеваний | Недавние события наглядно демонстрируют сохраняющуюся уязвимость больших групп населения к инфекционным заболеваниям, что связано с изменением нашей среды обитания, созданной человеком и природой. В 2007 году один человек, больной туберкулезом с множественной лекарственной устойчивостью, стал тревожным сигналом для инфраструктуры общественного здравоохранения США и всего мира, поскольку специалисты в области здравоохранения и общественность осознали, что сегодняшняя простота авиаперелетов может потенциально подвергнуть сотни людей неизлечимому заболеванию, связанному с инфекционным агентом. Легкость передвижения, рост численности населения, перемещение населения, загрязнение окружающей среды, сельскохозяйственная деятельность, изменение социально-экономических структур и международные конфликты по всему миру — все это способствовало возникновению инфекционных заболеваний. Однако сегодня нет ничего более масштабного, обладающего большим потенциалом долгосрочных последствий и более неопределенного, чем влияние изменения климата на вспышки инфекционных заболеваний, эпидемии и пандемии. Мы обсуждаем достижения в области прогнозирования этих событий и, в частности, решающую роль, которую спутниковая съемка может сыграть в организации эффективного реагирования. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2819876/",
"pubmed_id": "19788799"
} | недавний событие наглядно демонстрировать сохраняться уязвимость больший группа население инфекционный заболевание связать изменение наш среда обитание создать человек природа 2007 год человек больной туберкулёз множественный лекарственный устойчивость стать тревожный сигнал инфраструктура общественный здравоохранение сша весь мир поскольку специалист область здравоохранение общественность осознать сегодняшний простота авиаперелёт мочь потенциально подвергнуть сотня человек неизлечимый заболевание связанный инфекционный агент лёгкость передвижение рост численность население перемещение население загрязнение окружающий среда сельскохозяйственный деятельность изменение социально экономический структура международный конфликт весь мир всё это способствовать возникновение инфекционный заболевание однако сегодня масштабный обладать больший потенциал долгосрочный последствие неопределённый влияние изменение климат вспышка инфекционный заболевание эпидемия пандемия обсуждать достижение область прогнозирование событие частность решающий роль спутниковый съёмка мочь сыграть организация эффективный реагирование | использование спутниковый снимок изменение окружающий среда прогнозирование вспышка инфекционный заболевание |
fmgnavfq | Клиническая оценка и улучшение диагностики хрипов, вызванных бокавирусом, у детей, Финляндия | Бокавирус человека (HBoV) — широко распространённый респираторный вирус. Для совершенствования методов диагностики нами проведено иммуноферментное определение иммуноглобулинов (Ig) G и IgM с использованием в качестве антигена рекомбинантных вирусоподобных частиц HBoV. Были исследованы образцы сыворотки острой фазы и контрольные образцы у 258 детей с хрипами, а также отдельные образцы сыворотки у 115 здоровых взрослых в Финляндии. Чувствительность наших анализов составила 97%, а специфичность — 99,5%. У 96% взрослых людей был иммунитет, ни у кого не было острой инфекции. Из 48 детей с серологически диагностированным острым HBoV-заболеванием у 45 была обнаружена виремия, а у 35 — вирус был обнаружен в носоглоточных аспиратах (НПА). Из 39 детей с положительным результатом ПЦР на HBoV NPA, коинфицированных другим вирусом, у 64% была серологически подтверждена инфекция HBoV. HBoV вызывает заболевание, которое длится дольше, чем риновирус, и по тяжести сопоставимо с респираторно-синцитиальным вирусом. Среди детей с бронхиолитом более 25% имели острую инфекцию HBoV. Для точной диагностики HBoV требуется серологический анализ или ПЦР сыворотки; ПЦР только для НПА недостаточно. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2819894/",
"pubmed_id": "19788810"
} | бокавирус человек hbov широко распространить респираторный вирус совершенствование метод диагностика провести иммуноферментный определение иммуноглобулин ig g igm использование качество антиген рекомбинантный вирусоподобный частица hbov исследовать образец сыворотка острый фаза контрольный образец 258 ребёнок хрип также отдельный образец сыворотка 115 здоровый взрослый финляндия чувствительность наш анализ составить 97 специфичность 99 5 96 взрослый человек иммунитет острый инфекция 48 ребёнок серологически диагностировать острый hbov заболевание 45 обнаружить виремия 35 вирус обнаружить носоглоточный аспирата нпа 39 ребёнок положительный результат пцр hbov npa коинфицировать вирус 64 серологически подтвердить инфекция hbov hbov вызывать заболевание длиться долгий риновирус тяжесть сопоставимый респираторный синцитиальный вирус среди ребёнок бронхиолит 25 иметь острый инфекция hbov точный диагностика hbov требоваться серологический анализ пцр сыворотка пцр нпа недостаточно | клинический оценка улучшение диагностика хрип вызвать бокавирус ребёнок финляндия |
k58gx6sf | Доказательства того, что Gag облегчает ассоциацию оболочки ВИЧ-1 как в обогащенной GPI плазматической мембране, так и в мембранах, устойчивых к детергентам, а также облегчает включение оболочки в вирионы в первичных CD4(+)T-клетках | Сборка частиц ВИЧ-1, опосредованная вирусным белком Gag, происходит преимущественно на плазматической мембране. Хотя в Т-клетках была показана колокализация оболочки ВИЧ-1 с богатым липидами микроокружением, значение вирусных белков, модулирующих ассоциацию оболочки в таких микродоменах в плазматической мембране, обогащенной белками, закрепленными на гликозилфосфатидилинозитоле, в первичных Т-клетках CD4(+), которые являются естественными мишенями ВИЧ-1, изучено недостаточно. В данной работе мы показываем, что в первичных Т-клетках CD4(+), которые являются естественными мишенями ВИЧ-1 in vivo, Gag модулирует ассоциацию оболочки ВИЧ-1 с клеточными компартментами, богатыми ганглиозидом GM1 и CD59, а также с мембранами, устойчивыми к детергентам. Наши данные подтверждают доказательства того, что взаимодействие Gag-Env играет важную роль в ассоциации оболочки с липидными плотами, содержащими GPI-заякоренные белки, для эффективной сборки на зрелых вирионах, что приводит к продуктивному инфицированию первичных CD4(+)T-клеток. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2820015/",
"pubmed_id": "20064199"
} | сборка частица вич 1 опосредовать вирусный белок gag происходить преимущественно плазматический мембрана хотя клетка показать колокализация оболочка вич 1 богатый липид микроокружение значение вирусный белок модулировать ассоциация оболочка микродомен плазматический мембрана обогатить белок закрепить гликозилфосфатидилинозитола первичный клетка cd4 являться естественный мишень вич 1 изучить недостаточно дать работа показывать первичный клетка cd4 являться естественный мишень вич 1 in vivo gag модулировать ассоциация оболочка вич 1 клеточный компартмент богатый ганглиозид gm1 cd59 также мембрана устойчивый детергент наш дать подтверждать доказательство взаимодействие gag env играть важный роль ассоциация оболочка липидный плот содержать gpi заякорить белка эффективный сборка зрелый вирион приводить продуктивный инфицирование первичный cd4 t клетка | доказательство gag облегчать ассоциация оболочка вич 1 обогатить gpi плазматический мембрана мембрана устойчивый детергент также облегчать включение оболочка вирион первичный cd4 t клетка |
5l48fvx2 | Два новых эпитопа Т-клеток HLA-A*0201 в нуклеопротеине птичьего вируса H5N1 вызвали специфические иммунные реакции у мышей HHD | Нуклеопротеин гриппа А (NP) является привлекательной целью для разработки вакцины против птичьего гриппа из-за его высокой степени интеграции в эволюционную цепочку вируса. Здесь мы идентифицировали два новых ограниченных эпитопа NP HLA-A*0201, названных H5N1 NP373-381 AMDSNTLEL (NP373) и NP458-466 FQGRGVFEL (NP458), с помощью вычислительного биоинформатического анализа. Пептиды NP продемонстрировали высокую связывающую способность с HLA-A*0201 на клетках T2 и смогли вызвать активацию цитотоксических Т-клеток в мононуклеарных клетках периферической крови человека. Мы изучили потенциал использования пептидных последовательностей NP373 и NP458, дополненных одноцепочечным тримером, в качестве потенциальных кандидатов на ДНК-вакцины в модели трансгенных мышей HHD. Для введения вакцин-кандидатов животным использовалась система доставки «генной пушки». Результаты анализов цитотоксичности и ELISPOT показали, что Т-клетки вакцинированных мышей секретировали значительное количество IFN-γ, и Т-клетки были способны устранять соответствующие нагруженные пептидом клетки Т2. Открытие этих новых иммуногенных пептидов NP дает ценную информацию для разработки и создания вакцины против птичьего гриппа. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2820229/",
"pubmed_id": "19941812"
} | нуклеопротеин грипп np являться привлекательный цель разработка вакцина против птичий грипп высокий степень интеграция эволюционный цепочка вирус идентифицировать новый ограниченный эпитоп np hla a 0201 назвать h5n1 np373 381 amdsntlel np373 np458 466 fqgrgvfel np458 помощь вычислительный биоинформатический анализ пептид np продемонстрировать высокий связывать способность hla a 0201 клетка t2 смочь вызвать активация цитотоксический клетка мононуклеарный клетка периферический кровь человек изучить потенциал использование пептидный последовательность np373 np458 дополнить одноцепочечный тример качество потенциальный кандидат днк вакцина модель трансгенный мышь hhd введение вакцина кандидат животное использоваться система доставка генный пушка результат анализ цитотоксичность elispot показать клетка вакцинировать мышь секретировать значительный количество ifn γ клетка способный устранять соответствующий нагрузить пептид клетка т2 открытие новый иммуногенный пептид np давать ценный информация разработка создание вакцина против птичий грипп | новый эпитоп клетка hla a 0201 нуклеопротеин птичий вирус h5n1 вызвать специфический иммунный реакция мышь hhd |
um0ds7dh | Антропогенные факторы и риск высокопатогенного птичьего гриппа H5N1: перспективы пространственной модели | Начиная с 2003 года высокопатогенный вирус птичьего гриппа (ВПГП) H5N1 распространился по всей Юго-Восточной Азии, вызвав беспрецедентные эпидемии. Массовое заражение произошло в Таиланде в 2004 и 2005 годах, и сегодня там продолжают происходить спорадические вспышки заболевания. Хотя результаты исследований свидетельствуют о том, что на распространение вируса HPAI H5N1 в первую очередь влияют торговые модели, выявление антропогенных факторов риска остается сложной задачей. В данном исследовании мы изучили, какие антропогенные факторы сыграли роль в риске возникновения вируса птичьего гриппа в Таиланде, используя данные о вспышках «второй волны» эпидемии (с 3 июля 2004 года по 5 мая 2005 года) в стране. Сначала мы провели пространственный анализ относительного риска HPAI H5N1 на уровне подокругов на основе иерархической байесовской модели. Мы наблюдали сильную пространственную неоднородность относительного риска. Затем мы протестировали набор потенциальных факторов риска в многомерной линейной модели. Результаты подтвердили роль свободного выпаса уток и интенсивности выращивания риса, но выявили слабую связь с плотностью бойцовых петухов. Результаты также выявили ряд антропогенных факторов, существенно связанных с риском заражения вирусом птичьего гриппа. Высокий риск был тесно связан с густонаселенными районами, короткими расстояниями до развязок автомагистралей и короткими расстояниями до крупных городов. Эти результаты подчеркивают новую объяснительную модель риска HPAI и указывают на то, что, помимо агроэкологических факторов, антропогенные факторы играют важную роль в распространении H5N1. Чтобы ограничить распространение будущих вспышек, необходимо продолжать усилия по контролю за перемещением продуктов птицеводства. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2821766/",
"pubmed_id": "20003910"
} | начинать 2003 год высокопатогенный вирус птичий грипп впгп h5n1 распространиться весь юго восточный азия вызвать беспрецедентный эпидемия массовый заражение произойти таиланд 2004 2005 год сегодня продолжать происходить спорадический вспышка заболевание хотя результат исследование свидетельствовать распространение вирус hpai h5n1 первый очередь влиять торговый модель выявление антропогенный фактор риск оставаться сложный задача данный исследование изучить антропогенный фактор сыграть роль риска возникновение вирус птичий грипп таиланд использовать дать вспышка второй волна эпидемия 3 июль 2004 год 5 май 2005 год страна сначала провести пространственный анализ относительный риск hpai h5n1 уровень подокруг основа иерархический байесовский модель наблюдать сильный пространственный неоднородность относительный риск затем протестировать набор потенциальный фактор риск многомерный линейный модель результат подтвердить роль свободный выпас утка интенсивность выращивание рис выявить слабый связь плотность бойцовый петух результат также выявить ряд антропогенный фактор существенно связанный риск заражение вирус птичий грипп высокий риск тесно связать густонаселённый район короткий расстояние развязка автомагистраль короткий расстояние крупный город результат подчёркивать новый объяснительный модель риск hpai указывать помимо агроэкологический фактор антропогенный фактор играть важный роль распространение h5n1 ограничить распространение будущий вспышка необходимо продолжать усилие контроль перемещение продукт птицеводство | антропогенный фактор риск высокопатогенный птичий грипп h5n1 перспектива пространственный модель |
mxjtj5c0 | Систематический анализ, сравнение и интеграция данных о генетических ассоциациях человека на основе заболеваний и генетической фенотипической информации мышей | ПРЕДЫСТОРИЯ: Генетический вклад в общие заболевания человека и генетические модели заболеваний у мышей сложны и часто пересекаются. При распространенных заболеваниях человека, в отличие от классических менделевских расстройств, генетические факторы, как правило, имеют небольшую величину эффекта, являются многофакторными и высоко плейотропными. Аналогичным образом, генетические модели заболеваний на мышах часто имеют плейотропные и перекрывающиеся фенотипы. Более того, фенотипические описания в литературе как для человека, так и для мышей часто плохо охарактеризованы и их трудно сравнивать напрямую. МЕТОДЫ: В этом отчете обобщены результаты исследований генетических ассоциаций человека, полученные из литературы, с учетом репликации, фенотипа заболевания и результатов, специфичных для генов; они организованы в контексте систематической онтологии заболеваний. Аналогичным образом обобщенные модели генетических заболеваний мышей организованы в онтологии фенотипа млекопитающих. Определены наборы генов, основанные на болезнях и фенотипах человека и мышей. Затем эти наборы генов заболеваний сравниваются по отдельности и в больших группах с помощью анализа дендрограммы и иерархического кластерного анализа. РЕЗУЛЬТАТЫ: Показано, что наборы генов человеческих болезней и фенотипа мышей группируются в группы, соответствующие болезням и фенотипу, как на грубом, так и на тонком уровне на основе обмена генами. ЗАКЛЮЧЕНИЕ: Данный анализ дает систематическую и глобальную перспективу генетики распространенных заболеваний человека в сравнении с ними самими и в контексте генетических моделей заболеваний на мышах. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2822734/",
"pubmed_id": "20092628"
} | предыстория генетический вклад общий заболевание человек генетический модель заболевание мышь сложный часто пересекаться распространить заболевание человек отличие классический менделевский расстройство генетический фактор правило иметь небольшой величина эффект являться многофакторный высоко плейотропный аналогичный образ генетический модель заболевание мышь часто иметь плейотропный перекрываться фенотип фенотипический описание литература человек мышь часто плохо охарактеризовать трудно сравнивать напрямую метод это отчёт обобщить результат исследование генетический ассоциация человек получить литература учёт репликация фенотип заболевание результат специфичный ген организовать контекст систематический онтология заболевание аналогичный образ обобщённый модель генетический заболевание мышь организовать онтология фенотип млекопитающее определить набор ген основать болезнь фенотип человек мышь затем набор ген заболевание сравниваться отдельность больший группа помощь анализ дендрограмм иерархический кластерный анализ результат показать набор ген человеческий болезнь фенотип мышь группироваться группа соответствующий болезнь фенотип грубый тонкий уровень основа обмен ген заключение данный анализ давать систематический глобальный перспектива генетика распространить заболевание человек сравнение контекст генетический модель заболевание мышь | систематический анализ сравнение интеграция данные генетический ассоциация человек основа заболевание генетический фенотипический информация мышь |
mgj9zfft | Пневмонит как следствие комбинированной терапии (ПЕГ)интерфероном-рибавирином при гепатите С: обзор литературы | Сочетание пегинтерферона и рибавирина является современной терапией хронического гепатита С (ВГС). Интерстициальный пневмонит является редким побочным эффектом терапии вирусного гепатита С и является важной причиной снижения дозы или прекращения лечения, что снижает эффективность противовирусной терапии. Мы провели обзор литературы с целью представления методов диагностики и возможных методов лечения пневмонита, а также предоставления рекомендаций. Мы искали случаи, в которых пневмонит был зарегистрирован как побочный эффект лечения вирусного гепатита С. Сначала мы провели поиск литературы через интерфейсы PubMed и Web of Science, а затем провели поиск в трех базах данных по токсичности лекарственных препаратов. Мы систематически проанализировали все отчеты о случаях заболевания с точки зрения клинических проявлений, типа лечения и результатов. Поиск литературы выявил 19 статей, содержащих описания 25 случаев, при этом мы отследили 33 случая из баз данных по токсичности лекарственных препаратов. Пневмонит проявляется любой комбинацией лихорадки, одышки и кашля и может возникнуть при применении любого типа интерферона (обычного или пегилированного). Смертность вследствие пневмонита наблюдалась в 7% случаев, исключительно при применении пегинтерферона α-2b. В большинстве случаев терапию прекращали и начинали прием стероидов. Пневмонит, вызванный интерфероном во время лечения вирусного гепатита С, является серьезным осложнением и должен быть распознан, чтобы предотвратить дальнейшее повреждение легких и/или смерть. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2822957/",
"pubmed_id": "19399621"
} | сочетание пегинтерферон рибавирина являться современный терапия хронический гепатит вгс интерстициальный пневмонит являться редкий побочный эффект терапия вирусный гепатит являться важный причина снижение доза прекращение лечение снижать эффективность противовирусный терапия провести обзор литература цель представление метод диагностика возможный метод лечение пневмонит также предоставление рекомендация искать случай пневмонит зарегистрировать побочный эффект лечение вирусный гепатит сначала провести поиск литература интерфейс pubmed web of science затем провести поиск база данные токсичность лекарственный препарат систематически проанализировать всё отчёт случай заболевание точка зрение клинический проявление тип лечение результат поиск литература выявить 19 стать содержать описание 25 случай это отследить 33 случай база данные токсичность лекарственный препарат пневмонит проявляться любой комбинация лихорадка одышка кашель мочь возникнуть применение любой тип интерферон обычный пегилированный смертность вследствие пневмонит наблюдаться 7 случай исключительно применение пегинтерферон α 2b большинство случай терапия прекращать начинать приём стероид пневмонит вызвать интерферон время лечение вирусный гепатит являться серьёзный осложнение должный распознать предотвратить дальнейший повреждение лёгкий смерть | пневмонит следствие комбинированный терапия пегий интерферон рибавирин гепатит обзор литература |
u3yvpcnr | Ограничения на въезд, проживание и пребывание в Европейском регионе ВОЗ, связанные с ВИЧ: исследование | ПРЕДЫСТОРИЯ: Еще в 1987 году Всемирная организация здравоохранения (ВОЗ) пришла к выводу, что проверка международных путешественников является неэффективным способом предотвращения распространения ВИЧ. Однако некоторые страны по-прежнему ограничивают въезд и/или проживание иностранцев с ВИЧ-инфекцией. Ограничения на поездки, связанные с ВИЧ, имеют серьезные последствия для здоровья отдельных лиц и общества и нарушают признанные на международном уровне права человека. В данном исследовании мы проанализировали текущую ситуацию с ограничениями на поездки, связанными с ВИЧ, в 53 странах Европейского региона ВОЗ. МЕТОДЫ: Мы получили информацию по конкретной стране в основном из Глобальной базы данных по ограничениям на поездки, связанным с ВИЧ, на сайте hivtravel.org. Мы упростили и стандартизировали информацию в базе данных, чтобы иметь возможность создать обзор и сравнить страны. В тех случаях, когда данные были устаревшими, неясными или противоречивыми, мы обращались к координаторам ВОЗ по ВИЧ в странах или в соответствующие неправительственные организации. Для подтверждения и дополнения этих данных также использовался сайт Бюро консульских дел США. РЕЗУЛЬТАТЫ: Наш обзор показал, что в 51 стране Европейского региона ВОЗ нет ограничений на въезд для людей, живущих с ВИЧ. В 11 странах иностранцам, живущим с ВИЧ, подающим заявление на долгосрочное пребывание, не будет выдана виза. Этими странами являются: Андорра, Армения, Кипр (запрещен доступ для граждан стран, не входящих в Европейский Союз), Венгрия, Казахстан, Молдова, Российская Федерация, Таджикистан, Туркменистан, Украина и Узбекистан. В Узбекистане ВИЧ-инфицированный иностранец даже не может въехать в страну, а в Грузии мы не смогли определить, существуют ли какие-либо ограничения на поездки, связанные с ВИЧ, из-за отсутствия информации. ВЫВОДЫ: В 32% стран Европейского региона либо существуют какие-либо ограничения на поездки, связанные с ВИЧ, либо нам не удалось определить, действуют ли такие ограничения. Большинство этих стран отстаивают ограничения, считая их оправданными с точки зрения общественного здравоохранения. Однако нет никаких доказательств того, что отказ во въезде в страну ВИЧ-инфицированным иностранцам является эффективным средством защиты общественного здоровья. Правительствам следует пересмотреть законодательство об ограничениях на поездки, связанных с ВИЧ. В то же время необходимы совместные усилия, чтобы привлечь внимание к продолжающейся дискриминации и стигматизации людей, живущих с ВИЧ, которые имеют место в тех странах Европейского региона, где такие законы и политика все еще действуют. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2823611/",
"pubmed_id": "20205784"
} | предыстория ещё 1987 год всемирный организация здравоохранение воз прийти вывод проверка международный путешественник являться неэффективный способ предотвращение распространение вич однако некоторый страна прежний ограничивать въезд проживание иностранец вич инфекция ограничение поездка связанный вич иметь серьёзный последствие здоровье отдельный лицо общество нарушать признанный международный уровень право человек данный исследование проанализировать текущий ситуация ограничение поездка связанный вич 53 страна европейский регион воз метод получить информация конкретный страна основное глобальный база данные ограничение поездка связанный вич сайт hivtravel org упростить стандартизировать информация база данные иметь возможность создать обзор сравнить страна случай дать устаревший неясный противоречивый обращаться координатор воз вич страна соответствующий неправительственный организация подтверждение дополнение данные также использоваться сайт бюро консульский дело сша результат наш обзор показать 51 страна европейский регион воз ограничение въезд человек жить вич 11 страна иностранец жить вич подавать заявление долгосрочный пребывание выдать виза страна являться андорра армения кипр запретить доступ гражданин страна входящий европейский союз венгрия казахстан молдова российский федерация таджикистан туркменистан украина узбекистан узбекистан вич инфицировать иностранец мочь въехать страна грузия смочь определить существовать либо ограничение поездка связанный вич отсутствие информация вывод 32 страна европейский регион либо существовать либо ограничение поездка связанный вич либо удаться определить действовать ограничение большинство страна отстаивать ограничение считать оправданный точка зрение общественный здравоохранение однако никакой доказательство отказ въезд страна вич инфицировать иностранец являться эффективный средство защита общественный здоровье правительство следовать пересмотреть законодательство ограничение поездка связанный вич время необходимый совместный усилие привлечь внимание продолжаться дискриминация стигматизация человек жить вич иметь место страна европейский регион закон политика всё ещё действовать | ограничение въезд проживание пребывание европейский регион воз связанный вич исследование |
z76vjkxg | Тройная комбинация амантадина, рибавирина и осельтамивира обладает высокой активностью и синергизмом в отношении штаммов вируса гриппа, устойчивых к лекарственным препаратам, in vitro | Быстрое появление и последующее распространение нового вируса гриппа A/H1N1 2009 года (2009 H1N1) побудило Всемирную организацию здравоохранения объявить первую пандемию XXI века, подчеркнув угрозу гриппа для общественного здравоохранения и систем здравоохранения. Широко распространенная устойчивость к обоим классам противовирусных препаратов против гриппа (адамантанам и ингибиторам нейраминидазы) наблюдается как у пандемических, так и у сезонных вирусов, что делает эти препараты малоэффективными в качестве метода лечения. Во всем мире практически все штаммы H1N1 2009 года и сезонного H3N2 устойчивы к адамантанам (римантадину и амантадину), а большинство сезонных штаммов H1N1 устойчивы к осельтамивиру, наиболее широко назначаемому ингибитору нейраминидазы (ИНА). Для решения проблемы более эффективной терапии мы оценили in vitro активность тройной комбинированной схемы противовирусных препаратов (TCAD), состоящей из препаратов с различными механизмами действия против лекарственно-устойчивых вирусов сезонного гриппа и гриппа H1N1 2009 года. Амантадин, рибавирин и осельтамивир, по отдельности и в комбинации, были протестированы против вирусов гриппа А, устойчивых к амантадину и осельтамивиру, с использованием модели инфекции in vitro в клетках MDCK. Наши данные показывают, что тройная комбинация оказалась высокосинергетической против вирусов, устойчивых к лекарственным препаратам, а синергизм тройной комбинации был значительно выше, чем синергизм любой протестированной двойной комбинации (P<0,05), включая комбинацию двух ИНА. Удивительно, но амантадин и осельтамивир способствовали противовирусной активности режима TCAD против вирусов, устойчивых к амантадину и осельтамивиру, соответственно, в концентрациях, при которых они не проявляли активности в качестве отдельных агентов, и в концентрациях, которые были клинически достижимы. Наши данные показывают, что схема TCAD, состоящая из амантадина, рибавирина и осельтамивира, обладает высоким синергизмом против резистентных вирусов, включая H1N1 2009. Режим TCAD преодолевает базовую лекарственную устойчивость к обоим классам одобренных противовирусных препаратов против гриппа и, таким образом, может представлять собой высокоактивную противовирусную терапию для сезонного и пандемического гриппа. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2825274/",
"pubmed_id": "20179772"
} | быстрый появление последующий распространение новый вирус грипп a h1n1 2009 год 2009 h1n1 побудить всемирный организация здравоохранение объявить первый пандемия xxi век подчеркнуть угроза грипп общественный здравоохранение система здравоохранение широко распространить устойчивость оба класс противовирусный препарат против грипп адамантан ингибитор нейраминидаза наблюдаться пандемический сезонный вирус делать препарат малоэффективный качество метод лечение весь мир практически всё штамм h1n1 2009 год сезонный h3n2 устойчивый адамантан римантадин амантадин большинство сезонный штамм h1n1 устойчивый осельтамивир наиболее широко назначать ингибитор нейраминидаза ина решение проблема эффективный терапия оценить in vitro активность тройной комбинированный схема противовирусный препарат tcad состоять препарат различный механизм действие против лекарственный устойчивый вирус сезонный грипп грипп h1n1 2009 год амантадин рибавирина осельтамивир отдельность комбинация протестировать против вирус грипп устойчивый амантадин осельтамивир использование модель инфекция in vitro клетка mdck наш дать показывать тройной комбинация оказаться высокосинергетический против вирус устойчивый лекарственный препарат синергизм тройной комбинация значительно выше синергизм любой протестировать двойной комбинация p 0 05 включая комбинация ина удивительно амантадин осельтамивир способствовать противовирусный активность режим tcad против вирус устойчивый амантадин осельтамивир соответственно концентрация проявлять активность качество отдельный агент концентрация клинически достижимый наш дать показывать схема tcad состоять амантадин рибавирина осельтамивир обладать высокий синергизм против резистентный вирус включая h1n1 2009 режим tcad преодолевать базовый лекарственный устойчивость оба класс одобрить противовирусный препарат против грипп образ мочь представлять высокоактивный противовирусный терапия сезонный пандемический грипп | тройной комбинация амантадин рибавирина осельтамивир обладать высокий активность синергизм отношение штамм вирус грипп устойчивый лекарственный препарат in vitro |
54f3q2o5 | Успешное лечение мультицентрической болезни Кастлмана, связанной с ВИЧ, и полиорганной недостаточности с помощью ритуксимаба и поддерживающей терапии: отчет о клиническом случае | ВВЕДЕНИЕ: Мультицентрическая болезнь Кастлемана (МБК) — лимфопролиферативное заболевание, связанное с инфекцией вируса герпеса человека типа 8 (ВГЧ-8), — встречается все чаще среди пациентов с ВИЧ. Это состояние связано с лимфаденопатией, поликлональной гаммапатией, гепато-спленомегалией и системными симптомами. Ряд небольших исследований продемонстрировали эффективность моноклонального антитела анти-CD20, ритуксимаба, при лечении этого заболевания. ОПИСАНИЕ СЛУЧАЯ: Мы сообщаем о случае 46-летней женщины из Замбии, у которой наблюдались лихорадка, диарея и рвота, спутанность сознания, лимфаденопатия и почечная недостаточность. После начала лечения МКБ ритуксимабом у нее быстро развилась полиорганная недостаточность. После поступления в отделение интенсивной терапии (ОИТ) ей была оказана своевременная многоорганная поддержка. После 21 дня пребывания в отделении интенсивной терапии она вернулась в гематологическое отделение и была выписана в состоянии ремиссии после 149 дней пребывания в больнице. ЗАКЛЮЧЕНИЕ: Ритуксимаб, эффективность которого до сих пор изучалась преимущественно у пациентов за пределами отделения интенсивной терапии, в сочетании с обширной поддержкой органов оказался эффективным средством лечения МКБ с сопутствующей полиорганной недостаточностью. Насколько нам известно, имеется только один опубликованный отчет о его успешном применении в отделении интенсивной терапии, где он применялся в сочетании с циклофосфамидом, адриамицином и преднизолоном. Отчеты, подобные нашему, подтверждают идею о том, что тяжелобольным пациентам с ВИЧ и гематологическими заболеваниями может быть полезна интенсивная терапия. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2825517/",
"pubmed_id": "20205844"
} | введение мультицентрический болезнь кастлеман мбк лимфопролиферативный заболевание связанный инфекция вирус герпес человек тип 8 вгч 8 встречаться всё частый среди пациент вич это состояние связать лимфаденопатия поликлональный гаммапатия гепато спленомегалия системный симптом ряд небольшой исследование продемонстрировать эффективность моноклональный антитело анти cd20 ритуксимаб лечение это заболевание описание случай сообщать случай 46 летний женщина замбия наблюдаться лихорадка диарея рвота спутанность сознание лимфаденопатия почечный недостаточность начало лечение мкб ритуксимаб быстро развиться полиорганный недостаточность поступление отделение интенсивный терапия оит оказать своевременный многоорганный поддержка 21 день пребывание отделение интенсивный терапия вернуться гематологический отделение выписать состояние ремиссия 149 день пребывание больница заключение ритуксимаб эффективность сей пора изучаться преимущественно пациент предел отделение интенсивный терапия сочетание обширный поддержка орган оказаться эффективный средство лечение мкб сопутствовать полиорганный недостаточность насколько известно иметься опубликовать отчёт успешный применение отделение интенсивный терапия применяться сочетание циклофосфамид адриамицин преднизолон отчёт подобный наш подтверждать идея тяжелобольной пациент вич гематологический заболевание мочь полезный интенсивный терапия | успешный лечение мультицентрический болезнь кастлмана связанный вич полиорганный недостаточность помощь ритуксимаб поддерживать терапия отчёт клинический случай |
96xoj10p | Ослабленная РНК-интерференция, опосредованная Salmonella choleraesuis, нацеленная на консервативные регионы против вируса ящура у морских свинок и свиней | В данном исследовании были определены специфические последовательности в трех генах (3D, VP4 и 2B) генома вируса ящура (FMDV), которые являются эффективными мишенями для РНК-интерференции. Анализ последовательности показал, что эти последовательности высококонсервативны среди вирусов разных серотипов. Были сконструированы плазмиды, экспрессирующие малые интерферирующие РНК (siRNA) (p3D-NT19, p3D-NT56, pVP4-NT19, pVP4-NT65 и p2B-NT25), для экспрессии siRNA, нацеленных на 3D, VP4 и 2B соответственно. Противовирусный потенциал этих siRNA в отношении различных изолятов вируса ящура был исследован на клетках почек детенышей хомяков (BHK-21) и мышах-сосунках. Результаты показывают, что эти siRNA ингибировали выход вируса в 10–300 раз для различных изолятов вируса ящура серотипа O и серотипа Asia I через 48 часов после заражения в клетках BHK-21 по сравнению с контрольными клетками. У мышей-сосунков p3D-NT56 и p2B-NT25 задерживали смерть мышей. От 20% до 40% животных, получивших однократную дозу siRNA, выжили через 5 дней после заражения серотипом O или серотипом Asia I. Мы использовали аттенуированный штамм вакцины Salmonella choleraesuis (C500) для переноса плазмиды, которая экспрессирует siRNA, направленную против гена полимеразы 3D (p3D-NT56) вируса ящура. Для оценки ингибирующего действия рекомбинантного S. мы использовали морских свинок. чо (p3D-NT56/S. чо) по поводу заражения вирусом ящура. Результаты показывают, что 80% морских свинок были инокулированы 10(9) КОЕ p3D-NT56/S. cho и через 36 ч заражением 50 ID(50) гомологичного вируса ящура были защищены. Мы также измерили противовирусную активность p3D-NT56/S. чо в свинине. Результаты показывают, что 100% животных, получавших лечение 5 × 10(9) КОЕ p3D-NT56/S. чо были защищены в течение 9 дней. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2826090/",
"pubmed_id": "20167192"
} | данный исследование определить специфический последовательность ген 3d vp4 2b геном вирус ящур fmdv являться эффективный мишень рнк интерференция анализ последовательность показать последовательность высококонсервативный среди вирус разный серотип сконструировать плазмида экспрессировать малый интерферировать рнк sirna p3d nt19 p3d nt56 pvp4 nt19 pvp4 nt65 p2b nt25 экспрессия sirna нацелить 3d vp4 2b соответственно противовирусный потенциал sirna отношение различный изолят вирус ящур исследовать клетка почка детёныш хомяк bhk 21 мышь сосунок результат показывать sirna ингибировать выход вирус 10 300 различный изолят вирус ящур серотип o серотип asia i 48 час заражение клетка bhk 21 сравнение контрольный клетка мышь сосунок p3d nt56 p2b nt25 задерживать смерть мышь 20 40 животное получить однократный доза sirna выжить 5 день заражение серотип o серотип asia i использовать аттенуировать штамм вакцина salmonella choleraesuis c500 перенос плазмида экспрессировать sirna направить против ген полимераза 3d p3d nt56 вирус ящур оценка ингибируть действие рекомбинантный s использовать морской свинка p3d nt56 s повод заражение вирус ящур результат показывать 80 морской свинка инокулировать 10 9 кой p3d nt56 s cho 36 ч заражение 50 id 50 гомологичный вирус ящур защитить также измерить противовирусный активность p3d nt56 s свинин результат показывать 100 животное получать лечение 5 10 9 кой p3d nt56 s защитить течение 9 день | ослабить рнк интерференция опосредовать salmonella choleraesuis нацелить консервативный регион против вирус ящур морской свинка свинья |
67oorg1b | Внебольничная пневмония, вызванная метициллин-резистентным золотистым стафилококком, приводящая к рабдомиолизу: описание случая | Метициллин-резистентный золотистый стафилококк (CA-MRSA), приобретенный в обществе, считается недостаточно изученным заболеванием в Индии. В данном отчете о клиническом случае авторы описывают тридцатипятилетнего иммунокомпетентного мужчину с тяжелым респираторным дистрессом, требующим интубации. При дальнейшем обследовании КТ грудной клетки выявила признаки некротической пневмонии. Морфология и картина чувствительности микроорганизма, обнаруженного в бронхоальвеолярном лаваже и посеве крови, соответствовали MRSA. Пребывание пациента в стационаре осложнилось острой почечной недостаточностью вследствие рабдомиолиза с уровнем КФК 9995 ЕД/л. Пациенту был назначен диализ, после чего состояние улучшилось. Этот случай проливает свет на то, что CA-MRSA становится проблемой в развивающихся странах, где антибиотики часто применяются эмпирически без особого лабораторного контроля. Также редко сообщается о рабдомиолизе, вызванном CA-MRSA. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2831021/",
"pubmed_id": "20205915"
} | метициллина резистентный золотистый стафилококк ca mrsa приобрести общество считаться недостаточно изучить заболевание индия данный отчёт клинический случай автор описывать тридцатипятилетний иммунокомпетентный мужчина тяжёлый респираторный дистресс требовать интубация дальнейший обследование кт грудной клетка выявить признак некротический пневмония морфология картина чувствительность микроорганизм обнаружить бронхоальвеолярный лаважа посев кровь соответствовать mrsa пребывание пациент стационар осложниться острый почечный недостаточность вследствие рабдомиолиз уровень кфк 9995 ед л пациент назначить диализ состояние улучшиться случай проливать свет ca mrsa становиться проблема развивающийся страна антибиотик часто применяться эмпирически особый лабораторный контроль также редко сообщаться рабдомиолиз вызвать ca mrsa | внебольничный пневмония вызвать метициллина резистентный золотистый стафилококк приводить рабдомиолиз описание случай |
howix091 | Связывание вирионов вируса простого герпеса типа 1 приводит к индукции внутриклеточной сигнализации при отсутствии проникновения вируса | Оболочка вируса HSV-1 содержит ряд гликопротеинов, четыре из которых необходимы для проникновения вируса. Вирусные частицы, в которых отсутствуют gB, gD, gH или gL, являются дефектными по входу, хотя эти вирусы сохраняют способность связываться с плазматической мембраной через оставшиеся гликопротеины. Было показано, что растворимые формы gD запускают ядерную транслокацию транскрипционного комплекса NF-κB, а также стимулируют выработку интерферона I типа. Представленные здесь результаты, основанные на использовании дефектного по проникновению фенотипа вирусных частиц HSV-1 с дефицитом гликопротеина, показывают, что связывание вирионов с клеточными рецепторами на плазматической мембране достаточно для стимуляции изменения экспрессии клеточных генов. Предварительные исследования с использованием микрочипов, подтвержденные количественной ПЦР в реальном времени, выявили дифференциальную экспрессию клеточных генов, связанных с путями NF-κB, PI3K/Akt, Jak/Stat и связанными с ними путями Jak/Src, в вирионах, лишенных gB или gH, но не gD. Генная индукция происходила при концентрации нескольких частиц на клетку, что соответствовало физиологическим условиям во время первичной инфекции. Исследования с использованием репортерного анализа показали, что транскрипционная активность NF-κB стимулируется в течение часа после связывания с HSV-1, достигает пика через два-три часа после связывания и снижается до фонового уровня через пять часов после индукции. Непосредственный, преходящий характер этих сигнальных событий предполагает, что гликопротеины ВПГ-1, в частности gD, могут изменять клеточную среду до проникновения, подготавливая клетку к репликации вируса. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2832691/",
"pubmed_id": "20221426"
} | оболочка вирус hsv 1 содержать ряд гликопротеин четыре необходимый проникновение вирус вирусный частица отсутствовать gb gd gh gl являться дефектный вход хотя вирус сохранять способность связываться плазматический мембрана остаться гликопротеин показать растворимый форма gd запускать ядерный транслокация транскрипционный комплекс nf κb также стимулировать выработка интерферон i тип представить результат основать использование дефектный проникновение фенотип вирусный частица hsv 1 дефицит гликопротеин показывать связывание вирион клеточный рецептор плазматический мембрана достаточно стимуляция изменение экспрессия клеточный ген предварительный исследование использование микрочип подтвердить количественный пцр реальный время выявить дифференциальный экспрессия клеточный ген связанный путь nf κb pi3k akt jak stat связанный путь jak src вирион лишённый gb gh gd генный индукция происходить концентрация несколько частица клетка соответствовать физиологический условие время первичный инфекция исследование использование репортерный анализ показать транскрипционный активность nf κb стимулироваться течение час связывание hsv 1 достигать пик час связывание снижаться фоновый уровень пять час индукция непосредственный преходящий характер сигнальный событие предполагать гликопротеин впг 1 частность gd мочь изменять клеточный среда проникновение подготавливать клетка репликация вирус | связывание вирион вирус простой герпес тип 1 приводить индукция внутриклеточный сигнализация отсутствие проникновение вирус |
0tqwjdhd | Риск сезонного гриппа среди работников здравоохранения больниц в большей степени связан с бытовыми, чем с профессиональными контактами: результаты проспективного когортного исследования в Берлине, Германия, 2006/07 гг. | ПРЕДЫСТОРИЯ: Иммунизация работников здравоохранения против гриппа рекомендуется для защиты их часто уязвимых пациентов, но также и из-за предполагаемого более высокого риска заболевания гриппом. Нашей целью было сравнить риск заражения гриппом среди медицинских работников, находящихся в отделении интенсивной терапии в больнице, с риском заражения гриппом среди лиц, не являющихся медицинскими работниками, в течение того же сезона. МЕТОДЫ: Мы провели проспективное многоцентровое когортное исследование во время сезона гриппа 2006/07 в Берлине, Германия. Отобранные участники сдавали образцы сыворотки до и после сезона, а также заполняли анкеты для определения соответствующих уровней воздействия и возможных сопутствующих факторов. Основным критерием результата была серологически подтвержденная инфекция гриппа (SCII), определяемая как четырехкратное или более увеличение титров антител ингибиции гемагглютинации к циркулирующему штамму гриппа (с постсезонным титром не менее 1:40). Участникам еженедельно рассылались текстовые сообщения на мобильные телефоны с просьбой сообщать о респираторных заболеваниях во время сезона гриппа. Для оценки влияния потенциальных факторов риска использовалась модель логистической регрессии. РЕЗУЛЬТАТЫ: Мы набрали 250 работников здравоохранения больниц (средний возраст 35,7 года) и 486 работников немедицинского сектора (средний возраст 39,2 года) из административных центров, доноров крови и колледжей. Общий уровень атак SCII составил 10,6%. Работа в сфере здравоохранения не являлась фактором риска развития SCII (относительный риск 1,1, p = 0,70). Окончательная многомерная модель включала три значимых фактора: проживание с детьми (коэффициент шансов [OR] 3,7, p = 0,005), иммунизация (OR 0,50, p = 0,02) и — среди лиц, живущих в домохозяйствах без детей — наличие автомобиля (OR 3,0, p = 0,02). Проживание с тремя и более детьми (OR 13,8, p < 0,01) было сопряжено с большим риском, чем проживание с одним или двумя детьми (OR 5,3, p = 0,02). У 30% участников с SCII не было выявлено никаких респираторных заболеваний. Риск сообщения о респираторной инфекции у работников здравоохранения был немного выше, чем у лиц контрольной группы (скорректированный ОШ 1,3, p = 0,04, n = 850). ВЫВОДЫ: Наши результаты показывают, что работники здравоохранения в больницах не подвергаются более высокому риску заболевания гриппом, чем работники других сфер, хотя риск возникновения у них любой респираторной инфекции несколько повышен. Бытовые контакты, по-видимому, более важны, чем контакты с пациентами. Владение автомобилем — неожиданный вывод, требующий дальнейшего изучения. Распространены бессимптомные инфекции, на долю которых приходится около трети серологически подтвержденных инфекций. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2836320/",
"pubmed_id": "20067628"
} | предыстория иммунизация работник здравоохранение против грипп рекомендоваться защита часто уязвимый пациент также предполагать высокий риск заболевание грипп наш цель сравнить риск заражение грипп среди медицинский работник находиться отделение интенсивный терапия больница риск заражение грипп среди лицо являться медицинский работник течение сезон метод провести проспективный многоцентровой когортный исследование время сезон грипп 2006 07 берлин германия отобрать участник сдавать образец сыворотка сезон также заполнять анкета определение соответствующий уровень воздействие возможный сопутствовать фактор основный критерий результат серологически подтвердить инфекция грипп scii определять четырёхкратный увеличение титр антитело ингибиция гемагглютинация циркулировать штамм грипп постсезонный титр менее 1 40 участник еженедельно рассылаться текстовый сообщение мобильный телефон просьба сообщать респираторный заболевание время сезон грипп оценка влияние потенциальный фактор риск использоваться модель логистический регрессия результат набрать 250 работник здравоохранение больница средний возраст 35 7 год 486 работник немедицинский сектор средний возраст 39 2 год административный центр донор кровь колледж общий уровень атака scii составить 10 6 работа сфера здравоохранение являться фактор риск развитие scii относительный риск 1 1 p 0 70 окончательный многомерный модель включать значимый фактор проживание ребёнок коэффициент шанс or 3 7 p 0 005 иммунизация or 0 50 p 0 02 среди лицо жить домохозяйство ребёнок наличие автомобиль or 3 0 p 0 02 проживание ребёнок or 13 8 p 0 01 сопрячь больший риск проживание ребёнок or 5 3 p 0 02 30 участник scii выявить никакой респираторный заболевание риск сообщение респираторный инфекция работник здравоохранение немного выше лицо контрольный группа скорректировать ош 1 3 p 0 04 n 850 вывод наш результат показывать работник здравоохранение больница подвергаться высокий риск заболевание грипп работник сфера хотя риск возникновение любой респираторный инфекция несколько повысить бытовой контакт видимый важный контакт пациент владение автомобиль неожиданный вывод требовать дальнейший изучение распространить бессимптомный инфекция доля приходиться около треть серологически подтвердить инфекция | риск сезонный грипп среди работник здравоохранение больница больший степень связать бытовой профессиональный контакт результат проспективный когортный исследование берлин германия 2006 07 год |
ni6iyzdn | Прогнозирование сетей взаимодействия лекарств и мишеней на основе функциональных групп и биологических особенностей | ПРЕДЫСТОРИЯ: Изучение сетей взаимодействия лекарственных средств с мишенями является важной темой для разработки лекарственных средств. Определение взаимодействий соединений и белков или потенциальных взаимодействий лекарственных препаратов с мишенями исключительно экспериментальным путем требует больших затрат времени и средств. В качестве дополнения методы прогнозирования in silico могут своевременно предоставить нам очень полезную информацию. МЕТОДЫ/ОСНОВНЫЕ ВЫВОДЫ: Для реализации этого лекарственные соединения кодируются функциональными группами и белками, кодируемыми биологическими характеристиками, включая биохимические и физико-химические свойства. Оптимальные процедуры выбора признаков принимаются с помощью метода mRMR (максимальная релевантность, минимальная избыточность). Вместо классификации белков как целого семейства, целевые белки делятся на четыре группы: ферменты, ионные каналы, рецепторы, сопряженные с G-белком, и ядерные рецепторы. Таким образом, создаются четыре независимых предиктора, использующих в качестве операционного механизма алгоритм ближайшего соседа, каждый из которых предсказывает взаимодействие между лекарственными средствами и одной из четырех групп белков. В результате общие показатели успешности перекрестных проверок методом складного ножа, достигнутые с четырьмя предикторами, составляют 85,48%, 80,78%, 78,49% и 85,66% соответственно. ВЫВОД/ЗНАЧЕНИЕ: Наши результаты показывают, что созданная таким образом система сетевого прогнозирования является весьма многообещающей и обнадеживающей. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2836373/",
"pubmed_id": "20300175"
} | предыстория изучение сеть взаимодействие лекарственный средство мишень являться важный тема разработка лекарственный средство определение взаимодействие соединение белок потенциальный взаимодействие лекарственный препарат мишень исключительно экспериментальный путём требовать больший затрата время средство качество дополнение метод прогнозирование in silico мочь своевременно предоставить очень полезный информация метод основной вывод реализация это лекарственный соединение кодироваться функциональный группа белок кодировать биологический характеристика включая биохимический физико химический свойство оптимальный процедура выбор признак приниматься помощь метод mrmr максимальный релевантность минимальный избыточность вместо классификация белок целое семейство целевой белка делиться четыре группа фермент ионный канал рецептор сопрячь g белок ядерный рецептор образ создаваться четыре независимый предиктор использовать качество операционный механизм алгоритм близкий сосед каждый предсказывать взаимодействие лекарственный средство четыре группа белок результат общий показатель успешность перекрёстный проверка метод складный нож достигнутый четыре предиктор составлять 85 48 80 78 78 49 85 66 соответственно вывод значение наш результат показывать создать образ система сетевой прогнозирование являться весьма многообещающий обнадёживать | прогнозирование сеть взаимодействие лекарство мишень основа функциональный группа биологический особенность |
8gnn6l4b | Межмолекулярный триплекс РНК дает представление о структурных детерминантах псевдоузлового стимулятора −1 рибосомального сдвига рамки считывания | Эффективный сигнал рибосомального сдвига рамки считывания (PRF) с программированием −1 требует скользящей последовательности РНК и РНК-стимулятора ниже по потоку, а псевдоузел шпилечного типа является наиболее распространенным стимулятором. Однако псевдоузла недостаточно для повышения PRF до −1. hTPK-DU177, псевдоузел, полученный из человеческой теломеразной РНК, имеет структурное сходство с несколькими псевдоузлами −1 PRF и используется для анализа ролей различных структурных особенностей в стимуляторе −1 PRF. Мутагенез на основе структуры hTPK-DU177 показывает, что эффективность −1 PRF этого стимулятора можно модулировать путем последовательного удаления взаимодействий основания с тройным основанием, окружающих спиральное соединение. Дальнейший анализ тройных оснований, фланкирующих соединение, показывает, что специфические взаимодействия стебля и петли и их относительное положение по отношению к спиральному соединению играют решающую роль в активности −1 PRF этого псевдоузла. Интересно, что подход с использованием бимолекулярного псевдоузла, основанный на hTPK-DU177, показывает, что продолжающаяся триплексная структура, охватывающая спиральное соединение, лишенная одной из особенностей замыкания петли, встроенной в топологию псевдоузла, может стимулировать −1 PRF. Таким образом, структура триплекса является важнейшим фактором, определяющим способность псевдоузла DU177 стимулировать −1 PRF. Более того, это предполагает, что −1 PRF, индуцированный ин-транс-РНК посредством специфических тройных взаимодействий с матричными РНК, может быть вероятной регуляторной функцией для некодирующих РНК. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2836554/",
"pubmed_id": "20007152"
} | эффективный сигнал рибосомальный сдвиг рамка считывание prf программирование 1 требовать скользящий последовательность рнк рнк стимулятор ниже поток псевдоузел шпилечный тип являться наиболее распространить стимулятор однако псевдоузел недостаточно повышение prf 1 htpk du177 псевдоузел получить человеческий теломеразный рнк иметь структурный сходство несколько псевдоузел 1 prf использоваться анализ роль различный структурный особенность стимулятор 1 prf мутагенез основа структура htpk du177 показывать эффективность 1 prf это стимулятор модулировать путём последовательный удаление взаимодействие основание тройной основание окружающий спиральный соединение дальнейший анализ тройной основание фланкировать соединение показывать специфический взаимодействие стебель петля относительный положение отношение спиральный соединение играть решающий роль активность 1 prf это псевдоузел интересно подход использование бимолекулярный псевдоузел основать htpk du177 показывать продолжаться триплексный структура охватывать спиральный соединение лишённый особенность замыкание петля встроить топология псевдоузел мочь стимулировать 1 prf образ структура триплекс являться важный фактор определять способность псевдоузел du177 стимулировать 1 prf это предполагать 1 prf индуцировать ин транс рнк посредством специфический тройной взаимодействие матричный рнк мочь вероятный регуляторный функция некодировать рнк | межмолекулярный триплекс рнк давать представление структурный детерминант псевдоузловой стимулятор 1 рибосомальный сдвиг рамка считывание |
zuvy8htp | Ранние годы пищевой и экологической вирусологии | В июле 1962 года автор поступил на работу в Институт исследований пищевых продуктов (FRI), тогда входивший в состав Чикагского университета, на должность пищевого вирусолога. В то время имелось ограниченное количество данных о вспышках вирусных заболеваний, передающихся через воду; зарегистрированных данных о вспышках заболеваний, передающихся через пищу, было еще меньше. Лабораторная вирусология окружающей среды (воды и сточных вод) находилась в зачаточном состоянии, а пищевая вирусология находилась в стадии становления. Чаще всего вирусы пытались обнаружить путем инокуляции первичных культур клеток приматов с наблюдением за образованием бляшек или цитопатическими эффектами. Первоначально основное внимание уделялось энтеровирусам и реовирусам. Образцы окружающей среды и продуктов питания необходимо было разжижить, если они еще не находились в жидкой форме; очистить от твердых частиц, бактерий и грибков; и сконцентрировать до объема, который можно было бы исследовать в клеточной культуре. Цитотоксичность также вызывала беспокойство. Исследования, проведенные в FRI и некоторых других лабораториях, были направлены на решение всех этих проблем. Группа FRI на протяжении многих лет была сотрудничающим центром Всемирной организации здравоохранения по пищевой вирусологии. Другими изучаемыми темами были инактивация вирусов в зависимости от температуры, времени, матрицы, дезинфицирующих средств и микробного воздействия; пероральная и ex-vivo инфекционность; а также пригодность различных суррогатов вирусов для мониторинга окружающей среды и экспериментов по инактивации. Для обнаружения норовирусов и вируса гепатита А использовались молекулярные методы, чаще всего ОТ-ПЦР. Когда было обнаружено, что инактивированный вирус часто дает тот же сигнал ОТ-ПЦР, что и инфекционный вирус, был проведен поиск методов обработки образцов, которые позволили бы предотвратить ложноположительные результаты тестов. С 1962 года многие лаборатории по всему миру занялись изучением вирусологии пищевых продуктов и окружающей среды, в результате чего был запущен специальный журнал. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2837245/",
"pubmed_id": "20234839"
} | июль 1962 год автор поступить работа институт исследование пищевой продукт fri входить состав чикагский университет должность пищевой вирусолог время иметься ограниченный количество данные вспышка вирусный заболевание передаваться вода зарегистрировать данные вспышка заболевание передаваться пища ещё маленький лабораторный вирусология окружающий среда вода сточный вода находиться зачаточный состояние пищевой вирусология находиться стадия становление частый весь вирус пытаться обнаружить путём инокуляция первичный культура клетка примат наблюдение образование бляшка цитопатический эффект первоначально основный внимание уделяться энтеровирус реовирус образец окружающий среда продукт питание необходимо разжижить ещё находиться жидкий форма очистить твёрдый частица бактерия грибок сконцентрировать объём исследовать клеточный культура цитотоксичность также вызывать беспокойство исследование провести fri некоторый лаборатория направить решение весь проблема группа fri протяжение многий год сотрудничать центр всемирный организация здравоохранение пищевой вирусология изучать тема инактивация вирус зависимость температура время матрица дезинфицировать средство микробный воздействие пероральный ex vivo инфекционность также пригодность различный суррогат вирус мониторинг окружающий среда эксперимент инактивация обнаружение норовирус вирус гепатит использоваться молекулярный метод частый весь пцр обнаружить инактивированный вирус часто давать сигнал пцр инфекционный вирус провести поиск метод обработка образец позволить предотвратить ложноположительный результат тест 1962 год многие лаборатория весь мир заняться изучение вирусология пищевой продукт окружающий среда результат запустить специальный журнал | ранний год пищевой экологический вирусология |
25v5mr3c | Меры по смягчению последствий пандемии гриппа | Борьба с пандемией гриппа является постоянной проблемой для медицинского сообщества с незапамятных времен. За последнее столетие передача вируса от животного к человеку наблюдалась трижды, средний период антигенной рециркуляции составлял 11–39 лет. Недавняя вспышка гриппа A (H1N1, также называемого свиным гриппом), впервые зарегистрированная в Мексике 26 апреля 2009 года, произошла на сорок первом году с момента последней зарегистрированной пандемии гриппа (июль 1968 года). Менее чем за 50 дней болезнь достигла масштабов пандемии (фаза VI), охватив более 76 стран, при этом число смертей составило 163, а число случаев заражения — 35 928 (по состоянию на 15 июня 2009 г.). Это указывает на повторное появление генетически измененного вируса, имеющего штаммы, эндемичные для человека, свиней и птиц (H5N1). Государства-члены Всемирной организации здравоохранения (ВОЗ) уже подготовились к борьбе с подобными критическими ситуациями. Более ранние вспышки птичьего гриппа (H5N1) в разных странах побудили ВОЗ разработать стратегии готовности к пандемии с национальными/региональными планами по готовности к пандемии. Многочисленные факторы, связанные с климатическими условиями, социально-экономическими слоями, управлением и обменом информацией/логистикой на всех уровнях, считаются критически важными индикаторами при мониторинге динамики эскалации ситуации в сторону пандемии. Национальное управление по борьбе со стихийными бедствиями (NDMA) правительства Индии при активном сотрудничестве с агентствами ООН и другими заинтересованными сторонами/экспертами в апреле 2008 года разработало концептуальный документ о роли поставщиков немедицинских услуг во время пандемий и в июле 2008 года опубликовало национальные руководящие принципы по управлению биологическими катастрофами. В этих рекомендациях указано, что успех медицинских мероприятий, таких как фармацевтическая (противовирусная терапия осельтамивиром и занамивиром), нефармацевтические вмешательства и разработка вакцин и т. д., во многом зависит от уровня резистентности, оказываемой мутагенным штаммом вируса, и рационального использования фармакотерапевтических вмешательств. В статье описывается подход к смягчению последствий пандемии гриппа и его эффективная реализация на национальном, государственном и местном уровнях. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2840954/",
"pubmed_id": "20300402"
} | борьба пандемия грипп являться постоянный проблема медицинский сообщество незапамятный время последний столетие передача вирус животное человек наблюдаться трижды средний период антигенный рециркуляция составлять 11 39 год недавний вспышка грипп a h1n1 также называть свиной грипп впервые зарегистрировать мексика 26 апрель 2009 год произойти сорок первый год момент последний зарегистрировать пандемия грипп июль 1968 год менее 50 день болезнь достигнуть масштаб пандемия фаза vi охватить 76 страна это число смерть составить 163 число случай заражение 35 928 состояние 15 июнь 2009 г это указывать повторный появление генетически изменить вирус иметь штамм эндемичный человек свинья птица h5n1 государство член всемирный организация здравоохранение воз подготовиться борьба подобный критический ситуация ранний вспышка птичий грипп h5n1 разный страна побудить воз разработать стратегия готовность пандемия национальный региональный план готовность пандемия многочисленный фактор связанный климатический условие социально экономический слой управление обмен информация логистика весь уровень считаться критически важный индикатор мониторинг динамика эскалация ситуация сторона пандемия национальный управление борьба стихийный бедствие ndma правительство индия активный сотрудничество агентство оон заинтересованный сторона эксперт апрель 2008 год разработать концептуальный документ роль поставщик немедицинский услуга время пандемия июль 2008 год опубликовать национальный руководящий принцип управление биологический катастрофа рекомендация указать успех медицинский мероприятие фармацевтический противовирусный терапия осельтамивир занамивир нефармацевтический вмешательство разработка вакцина далее многое зависеть уровень резистентность оказывать мутагенный штамм вирус рациональный использование фармакотерапевтический вмешательство статья описываться подход смягчение последствие пандемия грипп эффективный реализация национальный государственный местный уровень | мера смягчение последствие пандемия грипп |
sw4wtxdk | NSs, кодируемый вирусом некроза почек арахиса, является бифункциональным ферментом | Вирус некроза почек арахиса (GBNV), представитель рода Tospovirus семейства Bunyaviridae, поражает большое количество растений семейства бобовых и пасленовых в Индии. С целью выяснения функции неструктурного белка, NSs, кодируемого геномом малой РНК (S РНК), белок NSs томата GBNV (Карнатака) [1] был сверхэкспрессирован в E. coli и очищали хроматографией Ni-NTA. Очищенный белок rNSs проявил РНК-стимулированную активность NTPase. Кроме того, эта активность зависела от ионов металлов и ингибировалась аденозин 5′ (β, γ имидо) трифосфатом, аналогом АТФ. РНС также могут гидролизовать дАТФ. Интересно, что в дополнение к активности НТФазы и дАТФазы, rNS проявляли АТФ-независимую 5' РНК/ДНК фосфатазную активность, которая полностью ингибировалась АМФ. 5′ α фосфат может быть удален из одноцепочечной ДНК, одноцепочечной РНК, двухцепочечной ДНК и двухцепочечной РНК, что подтверждает, что rNSs обладают новой активностью 5′ α фосфатазы. Мутация K189A в мотиве Уокера A (GxxxxGKT) привела к полной потере активности АТФазы, но активность 5'-фосфатазы не изменилась. С другой стороны, мутация D159A в мотиве Уокера B (DExx) привела к частичной потере обеих активностей. Эти результаты впервые демонстрируют, что NSs является бифункциональным ферментом, который может участвовать в перемещении вируса, репликации или в подавлении защитного механизма хозяина. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2841200/",
"pubmed_id": "20305786"
} | вирус некроз почка арахис gbnv представитель род tospovirus семейство bunyaviridae поражать большой количество растение семейство бобовый паслёновый индия цель выяснение функция неструктурный белок nss кодировать геном малый рнк s рнк белок nss томат gbnv карнатака 1 сверхэкспрессировать e coli очищать хроматография ni nta очистить белок rnss проявить рнк стимулировать активность ntpase кроме активность зависеть ион металл ингибироваться аденозина 5 β γ имидо трифосфат аналог атф рнс также мочь гидролизовать датф интересно дополнение активность нтфаза датфаза rns проявлять атф независимый 5 рнк днк фосфатазный активность полностью ингибироваться амф 5 α фосфат мочь удалённый одноцепочечный днк одноцепочечный рнк двухцепочечный днк двухцепочечный рнк подтверждать rnss обладать новый активность 5 α фосфатаз мутация k189a мотив уокер a gxxxxgkt привести полный потеря активность атфаза активность 5 фосфатаз измениться сторона мутация d159a мотив уокер b dexx привести частичный потеря оба активность результат впервые демонстрировать nss являться бифункциональный фермент мочь участвовать перемещение вирус репликация подавление защитный механизм хозяин | nss кодировать вирус некроз почка арахис являться бифункциональный фермент |
soi3bn6y | Смертность среди больных туберкулезом, нуждающихся в интенсивной терапии: ретроспективное когортное исследование | ПРЕДЫСТОРИЯ: Описать характеристики пациентов с туберкулезом (ТБ), которым требуется интенсивная терапия, и выявить факторы, прогнозирующие внутрибольничную смертность в городе развивающейся страны со средней и высокой эндемичностью по туберкулезу. МЕТОДЫ: Мы провели ретроспективное когортное исследование в период с ноября 2005 года по ноябрь 2007 года. В исследование были включены пациенты с туберкулезом, которым требовалась интенсивная терапия. Была проведена оценка предиктора смертности. Первичным результатом была смертность в больнице. РЕЗУЛЬТАТЫ: За период исследования 67 пациентов с туберкулезом нуждались в интенсивной терапии. Из них у 62 (92,5%) наблюдалась острая дыхательная недостаточность, и им требовалась искусственная вентиляция легких. Умерли 44 (65,7%) пациента. У 46 (68,7%) пациентов имелась коинфекция вирусом иммунодефицита человека. Ранняя госпитализация в отделение интенсивной терапии и пневмония, связанная с искусственной вентиляцией легких, были независимо связаны с внутрибольничной смертностью. ВЫВОДЫ: В этом исследовании мы обнаружили высокий уровень смертности среди больных туберкулезом, нуждающихся в интенсивной терапии, особенно среди тех, кто был рано помещен в отделение интенсивной терапии. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2843613/",
"pubmed_id": "20205952"
} | предыстория описать характеристика пациент туберкулёз тб требоваться интенсивный терапия выявить фактор прогнозировать внутрибольничный смертность город развивающийся страна средний высокий эндемичность туберкулёз метод провести ретроспективный когортный исследование период ноябрь 2005 год ноябрь 2007 год исследование включить пациент туберкулёз требоваться интенсивный терапия провести оценка предиктор смертность первичный результат смертность больница результат период исследование 67 пациент туберкулёз нуждаться интенсивный терапия 62 92 5 наблюдаться острый дыхательный недостаточность требоваться искусственный вентиляция лёгкий умереть 44 65 7 пациент 46 68 7 пациент иметься коинфекция вирус иммунодефицит человек ранний госпитализация отделение интенсивный терапия пневмония связать искусственный вентиляция лёгкий независимо связать внутрибольничный смертность вывод это исследование обнаружить высокий уровень смертность среди больной туберкулёз нуждаться интенсивный терапия особенно среди рано поместить отделение интенсивный терапия | смертность среди больной туберкулёз нуждаться интенсивный терапия ретроспективный когортный исследование |
6wu024ng | Сравнительная эффективность вакцинации против гриппа H5N1 у мышей и хорьков на основе генов гемагглютинина, нуклеопротеина и белка матрикса 2 | Усилия по разработке вакцины с широким спектром защиты от высокопатогенного вируса птичьего гриппа A (HPAI) H5N1 были сосредоточены на высококонсервативных генных продуктах гриппа. Вирусный нуклеопротеин (NP) и белок матрикса ионного канала (M2) высококонсервативны среди различных штаммов и различных подтипов гриппа А. В данной работе мы исследуем относительную эффективность NP и M2 по сравнению с HA в защите от вируса HPAI H5N1. Предыдущие исследования на мышах показали, что вакцинация NP и M2 в рекомбинантных ДНК и/или аденовирусных векторах или с адъювантами обеспечивает защиту от летального заражения в отсутствие HA. Однако мы обнаружили, что защитная эффективность NP и M2 снижается по мере увеличения вирулентности и дозы вируса-заразителя. Чтобы изучить этот вопрос в модели, применимой к человеческим заболеваниям, хорьков иммунизировали вакцинами ДНК/rAd5, кодирующими NP, M2, HA, NP+M2 или HA+NP+M2. Только вакцинация HA или HA+NP+M2 обеспечивала защиту от жесткого вирусного заражения. Таким образом, хотя генная вакцинация с использованием NP и M2 может обеспечить умеренный уровень защиты от низких доз заражения, ее недостаточно для формирования защитного иммунитета против высоких доз заражения H5N1 у хорьков. Эти иммуногены могут потребовать комбинированной вакцинации с ГА, которая обеспечивает защиту даже от очень высоких доз летального вирусного заражения. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2843722/",
"pubmed_id": "20352112"
} | усилие разработка вакцина широкий спектр защита высокопатогенный вирус птичий грипп a hpai h5n1 сосредоточить высококонсервативный генный продукт грипп вирусный нуклеопротеин np белок матрикс ионный канал m2 высококонсервативный среди различный штамм различный подтип грипп дать работа исследовать относительный эффективность np m2 сравнение ha защита вирус hpai h5n1 предыдущий исследование мышь показать вакцинация np m2 рекомбинантный днк аденовирусный вектор адъюванта обеспечивать защита летальный заражение отсутствие ha однако обнаружить защитный эффективность np m2 снижаться мера увеличение вирулентность доза вирус заразитель изучить вопрос модель применимый человеческий заболевание хорьковый иммунизировать вакцина днк rad5 кодировать np m2 ha np m2 ha np m2 вакцинация ha ha np m2 обеспечивать защита жёсткий вирусный заражение образ хотя генный вакцинация использование np m2 мочь обеспечить умеренный уровень защита низкий доза заражение недостаточно формирование защитный иммунитет против высокий доза заражение h5n1 хорьковый иммуноген мочь потребовать комбинированный вакцинация га обеспечивать защита очень высокий доза летальный вирусный заражение | сравнительный эффективность вакцинация против грипп h5n1 мышь хорьковый основа ген гемагглютинин нуклеопротеин белок матрикс 2 |
vexwisnz | Влияние отслеживания контактов в кластерных группах населения | Отслеживание потенциально инфекционных контактов стало важной частью стратегии борьбы со многими инфекционными заболеваниями: от ранних случаев новых инфекций до эндемичных инфекций, передающихся половым путем. Здесь мы используем математические модели для рассмотрения случая уведомления партнера о наличии инфекции, передающейся половым путем, однако эти модели достаточно просты, чтобы позволить сделать более общие выводы. Мы показываем, что если в дополнение к отслеживанию контактов учитывать структуру контактной сети, стандартные модели «массовых действий» обычно оказываются неадекватными. Чтобы учесть влияние взаимных контактов (в частности, кластеризации), мы разрабатываем усовершенствование существующих парных сетевых моделей, которое используем для демонстрации того, что при прочих равных условиях кластеризация повышает эффективность отслеживания контактов для большой области пространства параметров. Однако в случае высокоэффективного отслеживания контактов этот результат иногда оказывается обратным. Мы также разрабатываем стохастические симуляции для сравнения, используя простые методы перекомпоновки, которые позволяют генерировать соответствующие сети компараторов. Таким образом, мы вносим вклад в общую теорию сетевых вмешательств против инфекционных заболеваний. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2845652/",
"pubmed_id": "20361048"
} | отслеживание потенциально инфекционный контакт стать важный часть стратегия борьба многий инфекционный заболевание ранний случай новый инфекция эндемичный инфекция передаваться половой путём использовать математический модель рассмотрение случай уведомление партнёр наличие инфекция передаваться половой путём однако модель достаточно простой позволить сделать общий вывод показывать дополнение отслеживание контакт учитывать структура контактный сеть стандартный модель массовый действие обычно оказываться неадекватный учесть влияние взаимный контакт частность кластеризация разрабатывать усовершенствование существующий парный сетевой модель использовать демонстрация прочий равный условие кластеризация повышать эффективность отслеживание контакт большой область пространство параметр однако случай высокоэффективный отслеживание контакт результат оказываться обратный также разрабатывать стохастический симуляция сравнение использовать простой метод перекомпоновка позволять генерировать соответствующий сеть компаратор образ вносить вклад общий теория сетевой вмешательство против инфекционный заболевание | влияние отслеживание контакт кластерный группа население |
8trsa6o6 | Серологическое профилирование белкового микрочипа Candida albicans выявляет постоянное взаимодействие хозяина и патогена и стадиально-специфические реакции во время кандидемии | Candida albicans в иммунокомпетентном хозяине является доброкачественным представителем микробиоты человека. Однако при нарушении физиологии хозяина это взаимодействие комменсала и хозяина может дегенерировать и привести к оппортунистической инфекции. Относительно мало известно о динамике C. albicans колонизация и патогенез. Мы разработали C. Микрочип белков поверхности клеток albicans для профилирования реакции иммуноглобулина G во время комменсальной колонизации и кандидемии. Реакция антител в сыворотке пациентов с кандидемией и в наших группах отрицательного контроля указывает на то, что иммунокомпетентный хозяин находится в постоянном взаимодействии хозяина и патогена с комменсалом C. альбиканс. В этом отчете также идентифицированы антигены клеточной поверхности, специфичные для различных фаз (т. е. острый, ранний и средний этапы выздоровления) кандидемии. Мы идентифицировали набор из тринадцати антигенов клеточной поверхности, способных отличить острую кандидемию от здорового человека и неинфицированных пациентов больницы с комменсальной колонизацией. Интересно, что значительная часть этих антигенов клеточной поверхности участвует либо в окислительном стрессе, либо в устойчивости к лекарственным препаратам. Кроме того, мы идентифицировали 33 антигенных белка, которыми обогащена сыворотка выздоравливающих больных кандидемией. Интересно, что в этой подгруппе мы обнаружили увеличение антигенов, связанных с усвоением железа, связанного с гемом. Эти результаты имеют важное значение для механизмов C. колонизации albicans, а также развития системной инфекции. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2845659/",
"pubmed_id": "20361054"
} | candida albicans иммунокомпетентный хозяин являться доброкачественный представитель микробиота человек однако нарушение физиология хозяин это взаимодействие комменсать хозяин мочь дегенерировать привести оппортунистический инфекция относительно мало известно динамика c albicans колонизация патогенез разработать c микрочип белок поверхность клетка albicans профилирование реакция иммуноглобулин g время комменсальный колонизация кандидемия реакция антитело сыворотка пациент кандидемия наш группа отрицательный контроль указывать иммунокомпетентный хозяин находиться постоянный взаимодействие хозяин патоген комменсалом c альбиканс это отчёт также идентифицировать антиген клеточный поверхность специфичный различный фаза острый ранний средний этап выздоровление кандидемия идентифицировать набор тринадцать антиген клеточный поверхность способный отличить острый кандидемия здоровый человек неинфицированный пациент больница комменсальный колонизация интересно значительный часть антиген клеточный поверхность участвовать либо окислительный стресс либо устойчивость лекарственный препарат кроме идентифицировать 33 антигенный белок обогатить сыворотка выздоравливать больной кандидемия интересно подгруппа обнаружить увеличение антиген связанный усвоение железо связанный гем результат иметь важный значение механизм c колонизация albicans также развитие системный инфекция | серологический профилирование белковый микрочип candida albicans выявлять постоянный взаимодействие хозяин патоген стадиальный специфический реакция время кандидемия |
epkw6222 | ДНК-вакцины: разработка новых стратегий борьбы с раком | Благодаря быстрому и широкому распространению ДНК-вакцины прошли ряд клинических испытаний на людях в качестве вакцин против различных заболеваний, включая рак. Доказательства того, что ДНК-вакцины хорошо переносятся и имеют превосходный профиль безопасности, оказались полезными, поскольку многие клинические испытания объединяют первую фазу со второй, что экономит время и деньги. Из результатов, полученных в ходе клинических испытаний, становится ясно, что для того, чтобы такие ДНК-вакцины стали достаточно эффективными в клинических условиях, необходимо значительно усовершенствовать методы экспрессии и доставки антигенов. Аналогичным образом, очевидно, что необходимы дополнительные стратегии для активации эффективного иммунитета против слабоиммуногенных опухолевых антигенов. Разработка вакцины для манипулирования путями презентации и процессинга антигена является одним из наиболее важных аспектов, который можно легко реализовать в технологии ДНК-вакцин. Было исследовано несколько подходов, включая разработку ДНК-вакцины, совместную доставку иммуномодулирующих молекул, безопасные пути введения, режим «прайм-буст» и стратегии, направленные на разрушение механизмов иммуносупрессивных сетей, используемых злокачественными клетками для предотвращения функционирования иммунных клеток. Комбинированные или отдельные стратегии повышения эффективности и иммуногенности ДНК-вакцин применяются в завершенных и текущих клинических испытаниях, где обосновываются безопасность и переносимость ДНК-платформы. В этом обзоре ДНК-вакцин рассматриваются основные аспекты этой темы, начиная с фундаментальных исследований и заканчивая клинической практикой. Также обсуждаются некоторые репрезентативные исследования ДНК-вакцин против рака. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2846346/",
"pubmed_id": "20368780"
} | благодаря быстрый широкий распространение днк вакцина пройти ряд клинический испытание человек качество вакцина против различный заболевание включая рак доказательство днк вакцина переноситься иметь превосходный профиль безопасность оказаться полезный поскольку многие клинический испытание объединять первый фаза второй экономить время деньга результат получить ход клинический испытание становиться ясно днк вакцина стать достаточно эффективный клинический условие необходимо значительно усовершенствовать метод экспрессия доставка антиген аналогичный образ очевидный необходимый дополнительный стратегия активация эффективный иммунитет против слабоиммуногенный опухолевый антиген разработка вакцина манипулирование путь презентация процессинг антиген являться наиболее важный аспект легко реализовать технология днк вакцина исследовать несколько подход включая разработка днк вакцина совместный доставка иммуномодулировать молекула безопасный путь введение режим прайма буста стратегия направить разрушение механизм иммуносупрессивный сеть использовать злокачественный клетка предотвращение функционирование иммунный клетка комбинированный отдельный стратегия повышение эффективность иммуногенность днк вакцина применяться завершить текущий клинический испытание обосновываться безопасность переносимость днк платформа это обзор днк вакцина рассматриваться основной аспект тема начинать фундаментальный исследование заканчивать клинический практика также обсуждаться некоторый репрезентативный исследование днк вакцина против рак | днк вакцина разработка новый стратегия борьба рак |
d2mb2b3d | Конъюгаты агониста TLR–siRNA Stat3: подавление клеточно-специфических генов и усиление противоопухолевых иммунных реакций | Эффективная доставка siRNA в определенные популяции клеток in vivo остается серьезной проблемой для ее успешного терапевтического применения. Мы описываем новый подход на основе siRNA — синтетическое связывание siRNA с олигонуклеотидным агонистом TLR9 — который воздействует на гены и подавляет их в миелоидных клетках TLR9(+) и В-клетках, которые являются ключевыми компонентами микроокружения опухоли. Поскольку Stat3 в опухолеассоциированных иммунных клетках подавляет противоопухолевые иммунные реакции и препятствует иммунной стимуляции, вызванной TLR9, мы протестировали конъюгаты CpG-Stat3siRNA на противоопухолевые эффекты. При местном введении в опухоль или системном внутривенном введении конъюгаты CpG-Stat3siRNA проникают в опухолеассоциированные дендритные клетки, макрофаги и В-клетки, ингибируют экспрессию Stat3, что приводит к активации опухолеассоциированных иммунных клеток и, в конечном итоге, к мощным противоопухолевым иммунным реакциям. Наши результаты демонстрируют потенциал конъюгатов агониста TLR-siRNA для целенаправленного подавления генов в сочетании со стимуляцией TLR и активацией иммунной системы в микроокружении опухоли. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2846721/",
"pubmed_id": "19749770"
} | эффективный доставка sirna определённый популяция клетка in vivo оставаться серьёзный проблема успешный терапевтический применение описывать новый подход основа sirna синтетический связывание sirna олигонуклеотидный агонист tlr9 воздействовать ген подавлять миелоидный клетка tlr9 клетка являться ключевой компонент микроокружение опухоль поскольку stat3 опухолеассоциировать иммунный клетка подавлять противоопухолевый иммунный реакция препятствовать иммунный стимуляция вызвать tlr9 протестировать конъюгата cpg stat3sirna противоопухолевый эффект местный введение опухоль системный внутривенный введение конъюгата cpg stat3sirna проникать опухолеассоциировать дендритный клетка макрофаг клетка ингибировать экспрессия stat3 приводить активация опухолеассоциировать иммунный клетка конечный итог мощный противоопухолевый иммунный реакция наш результат демонстрировать потенциал конъюгат агонист tlr sirna целенаправленный подавление ген сочетание стимуляция tlr активация иммунный система микроокружение опухоль | конъюгата агонист tlr sirna stat3 подавление клеточный специфический ген усиление противоопухолевый иммунный реакция |
o4k7auph | Быстрое накопление вирулентного вируса лихорадки долины Рифт у мышей из ослабленного вируса, несущего замену одного нуклеотида в РНК М | ПРЕДЫСТОРИЯ: Вирус лихорадки Рифт-Валли (RVFV), представитель рода Phlebovirus семейства Bunyaviridae, представляет собой РНК-вирус с отрицательной цепью и трехкомпонентным геномом. Вирус RVFV передается комарами и вызывает лихорадку и тяжелое геморрагическое заболевание у людей, а у скота — лихорадку и высокий уровень абортов. МЕТОДОЛОГИЯ/ОСНОВНЫЕ ВЫВОДЫ: Анализ последовательности показал, что препарат дикого типа RVFV ZH501 состоял из двух основных вирусных субпопуляций с единственной нуклеотидной гетерогенностью в нуклеотиде 847 сегмента M (M847); у одной был остаток G в M847, кодирующий глицин в основном белке Gn оболочки вируса, в то время как другая содержала остаток A, кодирующий глутаминовую кислоту в соответствующем сайте. Два вируса, полученных из ZH501, rZH501-M847-G и rZH501-M847-A, несли идентичные геномные последовательности, за исключением того, что первый и последний имели G и A соответственно в M847, которые были восстановлены с помощью системы обратной генетики. Внутрибрюшинная инокуляция rZH501-M847-A мышам вызвала быстрое и эффективное накопление вируса в сыворотке, печени, селезенке, почках и мозге и убила большинство мышей в течение 8 дней, тогда как rZH501-M847-G вызвал низкие титры виремии, не размножался так же эффективно, как rZH501-M847-A в этих органах, и ослабил вирулентность для мышей. Примечательно, что уже через 2 дня после заражения rZH501-M847-G появились вирусы, несущие A в M847, и впоследствии стали основной популяцией вирусов, в то время как реплицирующиеся вирусы сохранили входной остаток A в M847 у мышей, инфицированных rZH501-M847-A. ВЫВОДЫ/ЗНАЧЕНИЕ: Эти данные продемонстрировали, что замена одного нуклеотида в белке Gn существенно повлияла на вирулентность мышей RVFV и что популяция вируса, несущая вирулентный вирусный генотип, быстро возникла и стала основной вирусной популяцией в течение нескольких дней у мышей, которым был введен ослабленный вирус. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2848673/",
"pubmed_id": "20376320"
} | предыстория вирус лихорадка рифт валли rvfv представитель род phlebovirus семейство bunyaviridae представлять рнк вирус отрицательный цепь трехкомпонентный геном вирус rvfv передаваться комар вызывать лихорадка тяжёлый геморрагический заболевание человек скот лихорадка высокий уровень аборт методология основной вывод анализ последовательность показать препарат дикий тип rvfv zh501 состоять основный вирусный субпопуляция единственный нуклеотидный гетерогенность нуклеотид 847 сегмент m m847 остаток g m847 кодировать глицин основное белка gn оболочка вирус время содержать остаток a кодировать глутаминовый кислота соответствовать сайт вирус получить zh501 rzh501 m847 g rzh501 m847 a нести идентичный геномный последовательность исключение первый последний иметь g a соответственно m847 восстановить помощь система обратный генетика внутрибрюшинный инокуляция rzh501 m847 a мышь вызвать быстрый эффективный накопление вирус сыворотка печень селезёнка почка мозг убить большинство мышь течение 8 день rzh501 m847 g вызвать низкий титр виремия размножаться эффективно rzh501 m847 a орган ослабить вирулентность мышь примечательно 2 день заражение rzh501 m847 g появиться вирус несущий a m847 впоследствии стать основной популяция вирус время реплицироваться вирус сохранить входной остаток a m847 мышь инфицировать rzh501 m847 a вывод значение дать продемонстрировать замена нуклеотид белка gn существенно повлиять вирулентность мышь rvfv популяция вирус несущий вирулентный вирусный генотип быстро возникнуть стать основной вирусный популяция течение несколько день мышь ввести ослабить вирус | быстрый накопление вирулентный вирус лихорадка долина рифт мышь ослабить вирус несущий замена нуклеотид рнк м |
cwzpb8fu | Противостояние потенциальной пандемии гриппа A (H5N1) с помощью более эффективных вакцин | Вирусы гриппа A (H5N1) являются вероятными кандидатами на то, чтобы вызвать следующую пандемию гриппа, если они приобретут способность эффективно передаваться от человека к человеку. Одной из основных целей общественного здравоохранения является создание эффективных вакцин против этих вирусов с использованием новых подходов, включая систему культивирования клеток, обратную генетику и разработку адъювантов. Важным фактором при разработке стратегии является подготовка вакцин из циркулирующего в настоящее время штамма для индукции широкого спектра иммунитета к вновь появляющимся штаммам H5 у человека. Эта стратегия будет хорошим решением на ранней стадии пандемии, пока не будет создана антигенно соответствующая и одобренная вакцина. Подчеркивается важность концепции терапевтических вакцин (например, противовирусных вакцин), направленных на уменьшение цитокинового шторма, часто наблюдаемого у лиц, инфицированных подтипом H5N1. Лучшее понимание взаимодействия хозяина и вируса необходимо для определения инструментов для создания эффективных вакцин против гриппа (H5N1). | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2851514/",
"pubmed_id": "18258000"
} | вирус грипп a h5n1 являться вероятный кандидат вызвать следующий пандемия грипп приобрести способность эффективно передаваться человек человек основный цель общественный здравоохранение являться создание эффективный вакцина против вирус использование новый подход включая система культивирование клетка обратный генетик разработка адъювант важный фактор разработка стратегия являться подготовка вакцина циркулировать настоящий время штамм индукция широкий спектр иммунитет вновь появляться штамм h5 человек стратегия хороший решение ранний стадия пандемия пока создать антигенный соответствовать одобрить вакцина подчёркиваться важность концепция терапевтический вакцина например противовирусный вакцина направить уменьшение цитокиновый шторм часто наблюдать лицо инфицировать подтип h5n1 хороший понимание взаимодействие хозяин вирус необходимо определение инструмент создание эффективный вакцина против грипп h5n1 | противостояние потенциальный пандемия грипп a h5n1 помощь эффективный вакцина |
ge5iri3v | Глобальная безопасность общественного здравоохранения | Национальные институты общественного здравоохранения будут играть ключевую роль в реализации пересмотренных Международных медико-санитарных правил. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2851539/",
"pubmed_id": "18257985"
} | национальный институт общественный здравоохранение играть ключевой роль реализация пересмотреть международный медико санитарный правило | глобальный безопасность общественный здравоохранение |
lkoyrv3s | Динамика и контроль заболеваний в сетях с общественной структурой | Динамика распространения инфекционных заболеваний, передающихся напрямую от человека к человеку (например, грипп, оспа, ВИЧ/СПИД и т. д.), зависит от базовой сети контактов хозяина. Сети человеческих контактов демонстрируют сильную структуру сообщества. Понимание того, как такая структура сообщества влияет на эпидемии, может дать представление о том, как предотвратить распространение заболеваний между сообществами путем изменения структуры контактной сети посредством фармацевтических или нефармацевтических вмешательств. Мы используем эмпирические и моделируемые сети для исследования распространения заболеваний в сетях с общественной структурой. Мы обнаружили, что структура сообщества оказывает большое влияние на динамику заболеваний, и показали, что в сетях с сильной структурой сообщества мероприятия по иммунизации, нацеленные на отдельных лиц, объединяющих сообщества, более эффективны, чем те, которые нацелены просто на тесно связанных между собой людей. Поскольку структура соответствующих контактных сетей, как правило, неизвестна, а поставки вакцин часто ограничены, существует большая потребность в эффективных алгоритмах вакцинации, не требующих полного знания сети. Мы разработали алгоритм, который действует только на основе локально доступной сетевой информации и способен быстро определять цели для успешного вмешательства в иммунизацию. Алгоритм обычно превосходит существующие алгоритмы в условиях ограниченного запаса вакцины, особенно в сетях с сильной структурой сообщества. Понимание распространения инфекционных заболеваний и разработка оптимальных стратегий контроля являются важнейшей целью общественного здравоохранения. Социальные сети демонстрируют выраженные закономерности структуры сообщества, и наши результаты, основанные на эмпирических и моделируемых данных, демонстрируют, что структура сообщества сильно влияет на динамику заболеваний. Эти результаты имеют значение для разработки стратегий контроля. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2851561/",
"pubmed_id": "20386735"
} | динамика распространение инфекционный заболевание передаваться напрямую человек человек например грипп оспа вич спид далее зависеть базовый сеть контакт хозяин сеть человеческий контакт демонстрировать сильный структура сообщество понимание структура сообщество влиять эпидемия мочь дать представление предотвратить распространение заболевание сообщество путём изменение структура контактный сеть посредством фармацевтический нефармацевтический вмешательство использовать эмпирический моделировать сеть исследование распространение заболевание сеть общественный структура обнаружить структура сообщество оказывать большой влияние динамика заболевание показать сеть сильный структура сообщество мероприятие иммунизация нацелить отдельный лицо объединять сообщество эффективный нацелить просто тесно связанный человек поскольку структура соответствующий контактный сеть правило неизвестный поставка вакцина часто ограничить существовать больший потребность эффективный алгоритм вакцинация требовать полный знание сеть разработать алгоритм действовать основа локально доступный сетевой информация способный быстро определять цель успешный вмешательство иммунизация алгоритм обычно превосходить существующий алгоритм условие ограниченный запас вакцина особенно сеть сильный структура сообщество понимание распространение инфекционный заболевание разработка оптимальный стратегия контроль являться важный цель общественный здравоохранение социальный сеть демонстрировать выраженный закономерность структура сообщество наш результат основать эмпирический моделировать данные демонстрировать структура сообщество сильно влиять динамика заболевание результат иметь значение разработка стратегия контроль | динамика контроль заболевание сеть общественный структура |
zizfgz7d | Создание трансгенных мышей с человеческим CEACAM1 и связывание белка Neisseria Opa с их нейтрофилами | ПРЕДЫСТОРИЯ: Человеческий CEACAM1 представляет собой молекулу межклеточной адгезии с множеством функций, включая клиренс инсулина в печени, васкулогенез в эндотелиальных клетках, формирование просвета в молочной железе и связывание некоторых человеческих патогенов. ОСНОВНЫЕ РЕЗУЛЬТАТЫ: Три геномных клона BAC, содержащих ген человека CEACAM1, были микроинъецированы в пронуклеусы оплодотворенных ооцитов мышей FVB. Эмбрионы были имплантированы в яйцеводы ложнобеременных самок и оставлены для развития до положенного срока. ДНК новорожденных мышей была исследована методом ПЦР на наличие человеческого гена CEACAM1. Кал потомства с положительным результатом ПЦР исследовали на экспрессию человеческого CEACAM1. При использовании этого анализа одна из пяти линий с положительным результатом ПЦР оказалась положительной на экспрессию человеческого CEACAM1 и продемонстрировала стабильную передачу поколению F1 с ожидаемой частотой передачи (0,5) для гетерозигот. Печень, легкие, кишечник, почки, молочная железа и простата показали выраженную положительную двойную экспрессию как мышиного, так и человеческого CEACAM1 и имитировали ту, что наблюдается в тканях человека. Гранулоциты периферической крови и костного мозга, интенсивно окрашенные на человеческий CEACAM1, связывали белки Neisseria Opa, сходные с таковыми в человеческих нейтрофилах. ЗАКЛЮЧЕНИЕ: Эти трансгенные животные могут служить моделью связывания человеческих патогенов с человеческим CEACAM1. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2852402/",
"pubmed_id": "20404914"
} | предыстория человеческий ceacam1 представлять молекула межклеточный адгезия множество функция включая клиренс инсулин печень васкулогенез эндотелиальный клетка формирование просвет молочный железа связывание некоторый человеческий патоген основной результат геномный клон bac содержать ген человек ceacam1 микроинъецировать пронуклеус оплодотворить ооцит мышь fvb эмбрион имплантировать яйцевод ложнобеременная самка оставить развитие положить срок днк новорождённый мышь исследовать метод пцр наличие человеческий ген ceacam1 кал потомство положительный результат пцр исследовать экспрессия человеческий ceacam1 использование это анализ пять линия положительный результат пцр оказаться положительный экспрессия человеческий ceacam1 продемонстрировать стабильный передача поколение f1 ожидать частота передача 0 5 гетерозигота печень лёгкий кишечник почка молочный железо простата показать выраженный положительный двойной экспрессия мышиный человеческий ceacam1 имитировать наблюдаться ткань человек гранулоцит периферический кровь костный мозг интенсивно окрасить человеческий ceacam1 связывать белка neisseria opa сходный таковой человеческий нейтрофил заключение трансгенный животное мочь служить модель связывание человеческий патоген человеческий ceacam1 | создание трансгенный мышь человеческий ceacam1 связывание белок neisseria opa нейтрофил |
cge5uve3 | ТУБЕРКУЛЕЗНЫЙ САРКОИДОЗ: СУЩЕСТВУЕТ ЛИ ОН? | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2853046/",
"pubmed_id": "20396660"
} | туберкулёзный саркоидоз существовать |
||
q26f8pv4 | DotKnot: прогнозирование псевдоузла с использованием вероятностной точечной диаграммы в рамках уточненной энергетической модели | Псевдоузлы РНК — это функциональные структурные элементы, играющие ключевую роль в вирусных и клеточных процессах. Предсказание псевдоузловой структуры с минимальной свободной энергией является NP-полной задачей. Практические алгоритмы прогнозирования структуры РНК, включая ограниченные классы псевдоузлов, страдают от большого времени выполнения и низкой точности для длинных последовательностей. Эвристический подход заключается в поиске перспективных кандидатов на псевдоузлы в последовательности и их проверке. После этого обнаруженные псевдоузлы могут быть подвергнуты дальнейшему анализу с использованием биоинформатических или лабораторных методов. Мы представляем новый метод обнаружения псевдоузлов, называемый DotKnot, который извлекает области стержня из точечной диаграммы вероятности вторичной структуры и собирает кандидатов на псевдоузлы конструктивным образом. Мы оцениваем свободную энергию псевдоузлов, используя новые параметры, которые недавно стали доступны. Мы показываем, что обычная точечная диаграмма вероятности позволяет явно управлять широким классом псевдоузлов, включая псевдоузлы с выпуклыми стержнями. Параметры энергии теперь становятся ограничивающим фактором в прогнозировании псевдоузлов. DotKnot — эффективный метод для длинных последовательностей, который находит псевдоузлы с более высокой точностью по сравнению с другими известными алгоритмами прогнозирования. DotKnot доступен как веб-сервер по адресу http://dotknot.csse.uwa.edu.au. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2853144/",
"pubmed_id": "20123730"
} | псевдоузел рнк это функциональный структурный элемент играть ключевой роль вирусный клеточный процесс предсказание псевдоузловой структура минимальный свободный энергия являться np полный задача практический алгоритм прогнозирование структура рнк включая ограниченный класс псевдоузел страдать большой время выполнение низкий точность длинный последовательность эвристический подход заключаться поиск перспективный кандидат псевдоузел последовательность проверка это обнаружить псевдоузел мочь подвергнуть дальнейший анализ использование биоинформатический лабораторный метод представлять новый метод обнаружение псевдоузел называть dotknot извлекать область стержень точечный диаграмма вероятность вторичный структура собирать кандидат псевдоузел конструктивный образ оценивать свободный энергия псевдоузел использовать новый параметр недавно стать доступный показывать обычный точечный диаграмма вероятность позволять явно управлять широкий класс псевдоузел включая псевдоузел выпуклый стержень параметр энергия становиться ограничивать фактор прогнозирование псевдоузел dotknot эффективный метод длинный последовательность находить псевдоузел высокий точность сравнение известный алгоритм прогнозирование dotknot доступный веб сервер адрес http dotknot csse uwa edu au | dotknot прогнозирование псевдоузел использование вероятностный точечный диаграмма рамка уточнить энергетический модель |
y6di4ver | Риск импорта зоонозных заболеваний через торговлю дикими животными, США | Соединенные Штаты являются крупнейшим в мире импортером диких животных, а импортируемые дикие животные представляют собой потенциальный источник зоонозных патогенов. Используя данные о млекопитающих, импортированных в период 2000–2005 гг., мы оценили их потенциальную возможность переноса 27 отдельных опасных зоонозов и создали оценку риска, которая может быть использована при разработке политики в отношении импорта диких животных и надзора за зоонозами. Всего было импортировано 246 772 млекопитающих 190 родов (68 семейств). Наиболее распространенными возбудителями зоонозов риска оказались вирус бешенства (у 78 родов млекопитающих), Bacillus anthracis (57), Mycobacterium tuberculosis complex (48), Echinococcus spp. (41) и Leptospira spp. (35). Родами, способными переносить наибольшее количество опасных зоонозов, были Canis и Felis (по 14), Rattus (13), Equus (11), а также Macaca и Lepus (по 10). Полученные результаты демонстрируют многочисленные возможности для завоза зоонозных патогенов и свидетельствуют о том, что для обеспечения общественной безопасности необходимы немедленные упреждающие изменения на многих уровнях. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2857234/",
"pubmed_id": "19891857"
} | соединить штат являться крупный мир импортёр дикий животное импортировать дикий животное представлять потенциальный источник зоонозный патоген использовать дать млекопитающее импортировать период 2000 2005 год оценить потенциальный возможность перенос 27 отдельный опасный зооноз создать оценка риск мочь использовать разработка политика отношение импорт дикий животное надзор зооноз весь импортировать 246 772 млекопитающее 190 роды 68 семейство наиболее распространить возбудитель зооноз риск оказаться вирус бешенство 78 роды млекопитающее bacillus anthracis 57 mycobacterium tuberculosis complex 48 echinococcus spp 41 leptospira spp 35 род способный переносить больший количество опасный зооноз canis felis 14 rattus 13 equus 11 также macaca lepus 10 получить результат демонстрировать многочисленный возможность завоз зоонозный патоген свидетельствовать обеспечение общественный безопасность необходимый немедленный упреждающий изменение многий уровень | риск импорт зоонозный заболевание торговля дикий животное сша |
sboumuy9 | Архитектура зарождающейся вирусной поры слияния | Вирусы с оболочкой используют специализированный белковый аппарат для слияния вирусной мембраны с мембраной клетки-хозяина во время вторжения в клетку. У вируса гриппа сотни копий гликопротеина слияния гемагглютинина (ГА) выступают из поверхности вируса. Несмотря на интенсивное изучение HA и его активности в реакции слияния, механизм действия белка при манипулировании вирусными и целевыми мембранами с целью катализа их слияния изучен недостаточно. В данной работе методом электронной криотомографии была исследована трехмерная архитектура комплексов вируса гриппа и липосомы при pH 5,5. Томографические реконструкции показывают, что ранние стадии ремоделирования мембраны происходят целенаправленно, ориентированно на мембрану, прогрессируя от точечных ямок до образования сдавленной липосомальной воронки, которая может сталкиваться с внешне нетронутой вирусной оболочкой. Результаты показывают, что матричный слой M1 служит эндоскелетом для вируса и основой для HA во время слияния мембран. Флуоресцентная спектроскопия, контролирующая слияние липосом и вирионов, показывает, что утечка содержимого липосом происходит быстрее, чем смешивание липидов при pH 5,5. Обсуждается связь «протекающего» слияния с наблюдаемыми предслиятельными структурами. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2857459/",
"pubmed_id": "20168302"
} | вирус оболочка использовать специализировать белковый аппарат слияние вирусный мембрана мембрана клетка хозяин время вторжение клетка вирус грипп сотня копия гликопротеин слияние гемагглютинин га выступать поверхность вирус несмотря интенсивный изучение ha активность реакция слияние механизм действие белок манипулирование вирусный целевой мембрана цель катализ слияние изучить недостаточно дать работа метод электронный криотомография исследовать трёхмерный архитектура комплекс вирус грипп липосома ph 5 5 томографический реконструкция показывать ранний стадия ремоделирование мембрана происходить целенаправленно ориентированный мембрана прогрессировать точечный ямка образование сдавленный липосомальный воронка мочь сталкиваться внешне нетронутый вирусный оболочка результат показывать матричный слой m1 служить эндоскелет вирус основа ha время слияние мембрана флуоресцентный спектроскопия контролировать слияние липосома вирион показывать утечка содержимое липосома происходить быстрый смешивание липид ph 5 5 обсуждаться связь протекать слияние наблюдать предслиятельный структура | архитектура зарождаться вирусный пора слияние |
igo8c5kb | Влияние вакцинации на эволюцию и динамику популяции птичьего парамиксовируса-1 | Вирус болезни Ньюкасла (NDV) — патогенный штамм парамиксовируса птиц (aPMV-1), который представляет собой одну из самых серьезных угроз для птицеводческой отрасли во всем мире. Разнообразие вируса aPMV-1 велико; на основе филогенетической реконструкции последовательностей генов выделено восемь генотипов. Для снижения экономических потерь, вызванных этим вирусом, были разработаны модифицированные живые вакцины. Вакцины, полученные из авирулентных штаммов генотипа II, были разработаны в 1950-х годах и используются во всем мире, тогда как австралийские штаммы, принадлежащие к генотипу I, были разработаны в качестве вакцин в 1970-х годах и используются в основном в Азии. В этом исследовании мы оценили влияние вакцинации ослабленным живым вирусом на эволюцию генотипов aPMV-1. Было обнаружено филогенетическое несоответствие между деревьями, основанное на отдельных генах и полной кодирующей области 54 полноразмерных геномов aPMV-1, что позволяет предположить наличие рекомбинантных последовательностей в наборе данных. Впоследствии было идентифицировано пять рекомбинантных геномов, четыре из которых содержали последовательности либо генотипа I, либо генотипа II. История популяции штаммов генотипа II, связанных с вакциной, отличалась от других генотипов aPMV-1; генотип II появился в конце 19 века и развивается медленнее, чем другие генотипы, которые появились в 1960-х годах. Несмотря на усилия по вакцинации, популяция вирусов генотипа II до сих пор постоянно растет. Напротив, другие современные генотипы продемонстрировали снижение численности популяции в конце 1990-х годов. Кроме того, вирусы генотипов I и II, циркулирующие в условиях давления гомотипической вакцины, имеют уникальные профили селекции по сравнению со штаммами, не связанными с вакциной. В совокупности эти данные показывают, что вакцинация живыми ослабленными вирусами изменила эволюцию aPMV-1, поддерживая большую эффективную численность популяции генотипа, связанного с вакциной, допуская коинфекцию и рекомбинацию вакцинных и диких штаммов, а также применяя уникальное селективное давление на вирусные гликопротеины. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2858710/",
"pubmed_id": "20421950"
} | вирус болезнь ньюкасл ndv патогенный штамм парамиксовирус птица apmv 1 представлять самый серьёзный угроза птицеводческий отрасль весь мир разнообразие вирус apmv 1 большой основа филогенетический реконструкция последовательность ген выделить восемь генотип снижение экономический потеря вызвать это вирус разработать модифицированный живой вакцина вакцина получить авирулентный штамм генотип ii разработать 1950 х год использоваться весь мир австралийский штамм принадлежащий генотип i разработать качество вакцина 1970 х год использоваться основное азия это исследование оценить влияние вакцинация ослабить живой вирус эволюция генотип apmv 1 обнаружить филогенетический несоответствие дерево основать отдельный ген полный кодировать область 54 полноразмерный геном apmv 1 позволять предположить наличие рекомбинантный последовательность набор данные впоследствии идентифицировать пять рекомбинантный геном четыре содержать последовательность либо генотип i либо генотип ii история популяция штамм генотип ii связанный вакцина отличаться генотип apmv 1 генотип ii появиться конец 19 век развиваться медленный генотип появиться 1960 х год несмотря усилие вакцинация популяция вирус генотип ii сей пора постоянно расти напротив современный генотип продемонстрировать снижение численность популяция конец 1990 х год кроме вирус генотип i ii циркулировать условие давление гомотипический вакцина иметь уникальный профиль селекция сравнение штамм связанный вакцина совокупность дать показывать вакцинация живой ослабить вирус изменить эволюция apmv 1 поддерживать больший эффективный численность популяция генотип связанный вакцина допускать коинфекция рекомбинация вакцинный дикий штамм также применять уникальный селективный давление вирусный гликопротеин | влияние вакцинация эволюция динамика популяция птичий парамиксовирус 1 |
gzxu7nkh | Участие Китая в глобальной дипломатии в области здравоохранения: стал ли атипичная пневмония переломным моментом? | В рамках серии PLoS Medicine по глобальной дипломатии в области здравоохранения Лай-Хан Чан и его коллеги представляют исследование растущего участия Китая в глобальной дипломатии в области здравоохранения после эпидемии атипичной пневмонии. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2860492/",
"pubmed_id": "20436959"
} | рамка серия plos medicine глобальный дипломатия область здравоохранение лай хан чан коллега представлять исследование расти участие китай глобальный дипломатия область здравоохранение эпидемия атипичный пневмония | участие китай глобальный дипломатия область здравоохранение стать атипичный пневмония переломный момент |
lfvso15k | Электронная томография раскрывает этапы почкования филовируса | Филовирусы Марбург и Эбола — это несегментированные вирусы с отрицательной цепью РНК, вызывающие тяжелую геморрагическую лихорадку с высоким уровнем смертности у людей и нечеловекообразных приматов. Последовательность событий, приводящая к высвобождению частиц филовируса из клеток, изучена недостаточно. Было предложено два противоположных механизма: один из них реализуется посредством почкования, напоминающего «подводную лодку», при котором спиральный нуклеокапсид выходит параллельно плазматической мембране, а другой — посредством перпендикулярного «ракетоподобного» выпячивания. В данной работе мы инфицировали клетки вирусом Марбург в условиях содержания BSL-4 и реконструировали последовательность этапов процесса почкования в трех измерениях с помощью электронной томографии клеток, заключенных в пластик. Мы обнаружили, что на ранних стадиях инфекции выделяются высокоинфекционные нитевидные частицы. Почкование происходит посредством латеральной ассоциации внутриклеточного нуклеокапсида по всей его длине с плазматической мембраной, за которой следует быстрое обволакивание, начинающееся на одном конце нуклеокапсида, что приводит к образованию выступающего промежуточного образования. Разрыв приводит к локальной нестабильности мембраны в задней части вируса. После продолжительной инфекции повышенная везикуляция плазматической мембраны коррелирует с изменениями формы и инфекционности высвобождаемых вирусов. Наши наблюдения демонстрируют клеточную детерминанту формы вируса. Они примиряют противоположные модели почкования филовирусов и позволяют нам описать последовательность событий, происходящих во время почкования и высвобождения вируса Марбург. Мы предполагаем, что это представляет собой общую последовательность событий, которой следуют и другие нитевидные и палочковидные вирусы. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2861712/",
"pubmed_id": "20442788"
} | филовирус марбург эбола это несегментировать вирус отрицательный цепь рнк вызывающий тяжёлый геморрагический лихорадка высокий уровень смертность человек нечеловекообразный примат последовательность событие приводить высвобождение частица филовирус клетка изучить недостаточно предложить противоположный механизм реализоваться посредством почкование напоминать подводный лодка спиральный нуклеокапсида выходить параллельно плазматический мембрана посредством перпендикулярный ракетоподобный выпячивание дать работа инфицировать клетка вирус марбург условие содержание bsl 4 реконструировать последовательность этап процесс почкование измерение помощь электронный томография клетка заключить пластик обнаружить ранний стадия инфекция выделяться высокоинфекционный нитевидный частица почкование происходить посредством латеральный ассоциация внутриклеточный нуклеокапсида весь длина плазматический мембрана следовать быстрый обволакивание начинаться конец нуклеокапсида приводить образование выступать промежуточный образование разрыв приводить локальный нестабильность мембрана задний часть вирус продолжительный инфекция повышенный везикуляция плазматический мембрана коррелировать изменение форма инфекционность высвобождать вирус наш наблюдение демонстрировать клеточный детерминант форма вирус примирять противоположный модель почкование филовирус позволять описать последовательность событие происходить время почкование высвобождение вирус марбург предполагать это представлять общий последовательность событие следовать нитевидный палочковидный вирус | электронный томография раскрывать этап почкование филовирус |
hd12p867 | Пептид-опосредованная липосомальная система доставки лекарств, нацеленная на кровеносные сосуды опухоли в противораковой терапии | Известно, что солидные опухоли для поддержки своего роста привлекают новые кровеносные сосуды. Таким образом, уникальные молекулы, экспрессируемые на эндотелиальных клетках опухолей, могут выступать в качестве мишеней для антиангиогенной терапии рака. В настоящее время усилия сосредоточены на разработке терапевтических агентов, способных целенаправленно воздействовать на раковые клетки и опухолеассоциированную микросреду, включая кровеносные сосуды опухоли. Эти методы лечения обещают высокую эффективность и низкую токсичность. Одной из признанных стратегий повышения терапевтической эффективности традиционных химиотерапевтических средств является инкапсуляция противораковых препаратов в таргетные липосомы, которые связываются с рецепторами клеточной поверхности, экспрессируемыми на эндотелиальных клетках, ассоциированных с опухолью. Эти системы доставки антиангиогенных препаратов могут быть использованы как для воздействия на кровеносные сосуды опухоли, так и на сами опухолевые клетки. В данной статье рассматриваются механизмы и преимущества различных существующих и потенциальных методов использования липосом, конъюгированных с пептидами, для специфического разрушения кровеносных сосудов опухолей в противораковой терапии. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2864512/",
"pubmed_id": "20454584"
} | известно солидный опухоль поддержка свой рост привлекать новый кровеносный сосуд образ уникальный молекула экспрессировать эндотелиальный клетка опухоль мочь выступать качество мишень антиангиогенный терапия рак настоящий время усилие сосредоточить разработка терапевтический агент способный целенаправленно воздействовать раковый клетка опухолеассоциировать микросреда включая кровеносный сосуд опухоль метод лечение обещать высокий эффективность низкий токсичность признанный стратегия повышение терапевтический эффективность традиционный химиотерапевтический средство являться инкапсуляция противораковый препарат таргетный липосома связываться рецептор клеточный поверхность экспрессируть эндотелиальный клетка ассоциированный опухоль система доставка антиангиогенный препарат мочь использовать воздействие кровеносный сосуд опухоль опухолевый клетка дать статья рассматриваться механизм преимущество различный существующий потенциальный метод использование липосома конъюгировать пептид специфический разрушение кровеносный сосуд опухоль противораковый терапия | пептид опосредовать липосомальный система доставка лекарство нацелить кровеносный сосуд опухоль противораковый терапия |
sbxqwfmy | Повышение уровня интактных и протеолитических фрагментов белков острой фазы представляет собой самый ранний системный противовирусный ответ при инфекции ВИЧ-1 | Самые ранние иммунные реакции, активируемые при остром инфицировании вирусом иммунодефицита человека 1-го типа (ОВИ), оказывают решающее влияние на последующее распространение или сдерживание вируса. В этот период времени компоненты врожденной иммунной системы, такие как макрофаги и ДК, NK-клетки, β-дефензины, комплемент и другие антимикробные факторы, которые участвуют в модуляции ВИЧ-инфекции, могут играть особенно важную роль. Скрининг на основе протеомики проводился на группе, у которой были доступны образцы в моменты времени, предшествовавшие самому раннему положительному результату теста на ВИЧ. Способность отдельных факторов, повышенных в плазме во время ИАГ, ингибировать репликацию ВИЧ-1 была проанализирована с использованием моделей инфицирования мононуклеарными клетками периферической крови (МНК) и дендритными клетками (ДК) in vitro. Анализ уникальных панелей доноров плазмы, охватывающих фазы затмения и вирусной экспансии, выявил очень ранние изменения в белках плазмы при ИАГ. Индукция острофазового белка сывороточного амилоида А (A-SAA) произошла уже за 5–7 дней до первого обнаружения вирусной РНК в плазме, значительно раньше любого повышения уровня системных цитокинов. Кроме того, в плазме одновременно с виремией был обнаружен протеолитический фрагмент альфа-1-антитрипсина (ААТ), называемый вирус-ингибиторным пептидом (ВИРИП). Как A-SAA, так и VIRIP обладают противовирусной активностью in vitro, а количественное определение их уровней в плазме показало, что циркулирующие концентрации, вероятно, находятся в пределах их ингибирующей активности. Наши результаты свидетельствуют о том, что первая волна противовирусной защиты хозяина происходит в фазе затмения ИАГ до системной активации других иммунных реакций. Полученные знания о механизме действия реагентов острой фазы и других врожденных молекул против ВИЧ, а также о том, как они индуцируются, могут быть использованы для будущей разработки более эффективных стратегий профилактической вакцинации. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2865525/",
"pubmed_id": "20463814"
} | самый ранний иммунный реакция активировать острый инфицирование вирус иммунодефицит человек 1 го тип ови оказывать решающий влияние последующий распространение сдерживание вирус период время компонент врождённый иммунный система макрофаг дк nk клетка β дефензина комплемент антимикробный фактор участвовать модуляция вич инфекция мочь играть особенно важный роль скрининг основа протеомик проводиться группа доступный образец момент время предшествовать ранний положительный результат тест вич способность отдельный фактор повышенный плазма время иаг ингибировать репликация вич 1 проанализировать использование модель инфицирование мононуклеарный клетка периферический кровь мнк дендритный клетка дк in vitro анализ уникальный панель донор плазма охватывать фаза затмение вирусный экспансия выявить очень ранний изменение белок плазма иаг индукция острофазовый белок сывороточный амилоид a saa произойти 5 7 день первый обнаружение вирусный рнк плазма значительно ранний любой повышение уровень системный цитокин кроме плазма одновременно виремия обнаружить протеолитический фрагмент альфа 1 антитрипсин аат называть вирус ингибиторный пептид вирипа a saa virip обладать противовирусный активность in vitro количественный определение уровень плазма показать циркулировать концентрация вероятно находиться предел ингибировать активность наш результат свидетельствовать первый волна противовирусный защита хозяин происходить фаза затмение иаг системный активация иммунный реакция получить знание механизм действие реагент острый фаза врождённый молекула против вич также индуцироваться мочь использовать будущий разработка эффективный стратегия профилактический вакцинация | повышение уровень интактный протеолитический фрагмент белок острый фаза представлять самый ранний системный противовирусный ответ инфекция вич 1 |
se4unhi8 | Синтез и фармакологическая оценка оснований Шиффа 4-(2-аминофенил)-морфолинов | В настоящем исследовании была синтезирована и охарактеризована новая серия 4-(2-аминофенил)морфолинов с помощью ИК-, (1)Н-ЯМР, (13)С ЯМР и масс-спектрального анализа. Синтезированные соединения были исследованы на предмет анальгезирующей (100 и 200 мг/кг), противовоспалительной (200 и 400 мг/кг), антибактериальной (Bacillus subtilis, Bacillus cereus, Staphylococcus epidermidis, Staphylococcus aureus, Klebsiella pneumoniae, Pseudomonas aeruginosa и Escherichia coli) и противогрибковой (Candida albicans и Aspergillus niger) активности. Минимальные ингибирующие концентрации соединений также были установлены методом разведения штрихом в агаре. N-бензилидин-2-морфолинобензоламин (1) и N-(3-нитробензилидин)-2-морфолинобензоламин (3) проявили значительную анальгетическую, противовоспалительную и противомикробную активность. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2865815/",
"pubmed_id": "20502549"
} | настоящий исследование синтезировать охарактеризовать новый серия 4 2 аминофенил морфолин помощь ик 1 н ямр 13 ямр масса спектральный анализ синтезировать соединение исследовать предмет анальгезирующий 100 200 мг кг противовоспалительный 200 400 мг кг антибактериальный bacillus subtilis bacillus cereus staphylococcus epidermidis staphylococcus aureus klebsiella pneumoniae pseudomonas aeruginosa escherichia coli противогрибковый candida albicans aspergillus niger активность минимальный ингибировать концентрация соединение также установить метод разведение штрих агар n бензилидин 2 морфолинобензоламин 1 n 3 нитробензилидин 2 морфолинобензоламин 3 проявить значительный анальгетический противовоспалительный противомикробный активность | синтез фармакологический оценка основание шифф 4 2 аминофенил морфолин |
a0pzw26l | Правильные метрики расстояний для филогенетического анализа с использованием полных геномов без выравнивания последовательностей | Недостатком большинства методов корреляционного расстояния, основанных на композиционных векторах без выравнивания, разработанных для филогенетического анализа с использованием полных геномов, является то, что «расстояния» не являются надлежащими метриками расстояния в строгом математическом смысле. В этой статье мы предлагаем два новых связанных с корреляции метрики расстояния, чтобы заменить старый в нашем динамическом языковом подходе. Для оценки эффектов этой замены с биологической точки зрения используются четыре набора геномных данных. Мы обнаружили, что две правильные метрики расстояния дают деревья с такой же или похожей топологией, что и деревья, использующие старое «расстояние», и согласуются с деревом жизни, основанным на 16S рРНК в большинстве основных ветвей. Таким образом, две предложенные здесь метрики расстояния, основанные на корреляции, улучшают наш динамический языковой подход к филогенетическому анализу. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2869232/",
"pubmed_id": "20480005"
} | недостаток большинство метод корреляционный расстояние основать композиционный вектор выравнивание разработать филогенетический анализ использование полный геном являться расстояние являться надлежащий метрика расстояние строгий математический смысл статья предлагать новый связанный корреляция метрика расстояние заменить старый наш динамический языковой подход оценка эффект замена биологический точка зрение использоваться четыре набор геномный данные обнаружить правильный метрика расстояние давать дерево похожий топология дерево использовать старое расстояние согласоваться дерево жизнь основать 16s ррнк большинство основный ветвь образ предложить метрика расстояние основать корреляция улучшать наш динамический языковой подход филогенетический анализ | правильный метрика расстояние филогенетический анализ использование полный геном выравнивание последовательность |
th0wddvc | Однократная иммунизация растворимым рекомбинантным тримерным гемагглютинином защищает кур от высокопатогенного вируса птичьего гриппа H5N1 | ПРЕДЫСТОРИЯ: Высокопатогенный вирус гриппа птиц (HPAI) H5N1 вызывает полиорганное заболевание и гибель домашней птицы, что приводит к значительным экономическим потерям в птицеводческой отрасли. Кроме того, он представляет серьезную угрозу общественному здоровью, поскольку может передаваться непосредственно от инфицированной птицы человеку с очень высоким уровнем смертности (60%). Эффективная вакцинация против вируса HPAI H5N1 защитит коммерческую птицу и, таким образом, станет важной мерой контроля, снижающей вероятность передачи вируса от птицы к птице и от птицы к человеку. МЕТОДОЛОГИЯ/ОСНОВНЫЕ ВЫВОДЫ: В настоящем исследовании мы оценили вакцинный потенциал рекомбинантного растворимого тримерного гемагглютинина подтипа 5 (sH5(3)), полученного в клетках млекопитающих. Выделенный очищенный sH5(3) был биологически активен, о чем свидетельствует его связывание с лигандами зависимым от сиаловой кислоты образом. Было показано, что вакцина защищает цыплят дозозависимым образом от летального заражения вирусом H5N1 после однократной вакцинации. Защищенные животные не выделяли вирус, что было определено с помощью количественной ОТ-ПЦР на РНК, выделенной из мазков из трахеи и клоаки. Также у мышей вакцинация sH5(3) обеспечивала полную защиту от заражения HPAI H5N1. ВЫВОДЫ/ЗНАЧЕНИЕ: Наши результаты показывают, что sH5(3) представляет собой привлекательный вакцинный антиген для защиты кур и млекопитающих от HPAI H5N1. Поскольку эти рекомбинантные растворимые препараты гемагглютинина могут быть получены с высоким выходом и в относительно короткие сроки, они позволяют быстро реагировать на циркулирующие и потенциально пандемические вирусы гриппа. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2871037/",
"pubmed_id": "20498717"
} | предыстория высокопатогенный вирус грипп птица hpai h5n1 вызывать полиорганный заболевание гибель домашний птица приводить значительный экономический потеря птицеводческий отрасль кроме представлять серьёзный угроза общественный здоровье поскольку мочь передаваться непосредственно инфицировать птица человек очень высокий уровень смертность 60 эффективный вакцинация против вирус hpai h5n1 защитить коммерческий птица образ стать важный мера контроль снижать вероятность передача вирус птица птица птица человек методология основной вывод настоящий исследование оценить вакцинный потенциал рекомбинантный растворимый тримерный гемагглютинин подтип 5 sh5 3 получить клетка млекопитающее выделить очистить sh5 3 биологически активный свидетельствовать связывание лиганд зависимый сиаловой кислота образ показать вакцина защищать цыплёнок дозозависимый образ летальный заражение вирус h5n1 однократный вакцинация защитить животное выделять вирус определить помощь количественный пцр рнк выделить мазок трахея клоака также мышь вакцинация sh5 3 обеспечивать полный защита заражение hpai h5n1 вывод значение наш результат показывать sh5 3 представлять привлекательный вакцинный антиген защита кура млекопитающее hpai h5n1 поскольку рекомбинантный растворимый препарат гемагглютинин мочь получить высокий выход относительно короткий срок позволять быстро реагировать циркулировать потенциально пандемический вирус грипп | однократный иммунизация растворимый рекомбинантный тримерный гемагглютинин защищать кура высокопатогенный вирус птичий грипп h5n1 |
fec4kt20 | Система сортировки пациентов в больнице для взрослых с использованием системы оценки гриппоподобных заболеваний во время пандемии 2009 года — Мексика | ПРЕДЫСТОРИЯ: Пандемический вирус гриппа A (H1N1) появился в 2009 году. Чтобы помочь врачам в сортировке взрослых с острыми респираторными заболеваниями, в Гражданской больнице Гвадалахары (Мексика) была внедрена система оценки гриппоподобных заболеваний (ГПЗ). МЕТОДЫ: Для расчета индекса ОРЗ у пациентов отделения неотложной помощи с острыми респираторными заболеваниями собирались анамнез, результаты лабораторных и рентгенологических исследований. При поступлении пациентов оценивали по шкале ОРВИ и оценке риска развития осложнений, проведенной врачами. У пациентов из групп среднего и высокого риска были взяты мазки из носа и горла для тестирования на грипп методом ОТ-ПЦР. Распределение и показатель ОРВИ у пациентов, получавших осельтамивир, по сравнению с нелечеными, клинические характеристики пациентов с пандемическим гриппом A (H1N1) 2009 года по сравнению с пациентами с отрицательными результатами теста сравнивались с помощью критерия Χ(2) Пирсона, точного критерия Фишера и критерия суммы рангов Вилкоксона. РЕЗУЛЬТАТЫ: Из 1840 пациентов отделения неотложной помощи 230 были первоначально госпитализированы (средний балл по шкале ОРВИ = 15), а остальные были выписаны, включая 286 амбулаторных пациентов, получавших осельтамивир (средний балл по шкале ОРВИ = 11), и 1324 не проходивших лечение (средний балл по шкале ОРВИ = 5). Четырнадцать (1%) пациентов, не проходивших лечение, вернулись, а трое были госпитализированы для лечения осельтамивиром (медианная оценка ОРВИ = 19). Из 371 пациента, прошедших тестирование методом ОТ-ПЦР, у 104 (28%) был выявлен пандемический грипп, а у 42 (11%) — сезонный грипп А. У двадцати (91%) из 22 госпитализированных пациентов с пандемическим гриппом, которым была сделана визуализация, были выявлены двусторонние инфильтраты по сравнению с 23 (38%) из 61 госпитализированного пациента с отрицательными результатами тестов (p < 0,001). Один пациент с подтвержденным пандемическим гриппом поступил через 6 дней после появления симптомов, нуждался в искусственной вентиляции легких и умер. ВЫВОДЫ: Система сортировки, использующая показатель ОРВИ, дополнила суждение врачей о том, кому необходим осельтамивир и стационарное лечение, и помогла персоналу больницы справиться с резким ростом спроса на услуги. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2871038/",
"pubmed_id": "20498718"
} | предыстория пандемический вирус грипп a h1n1 появиться 2009 год помочь врач сортировка взрослый острый респираторный заболевание гражданский больница гвадалахара мексика внедрить система оценка гриппоподобный заболевание гпз метод расчёт индекс орз пациент отделение неотложный помощь острый респираторный заболевание собираться анамнез результат лабораторный рентгенологический исследование поступление пациент оценивать шкала орви оценка риск развитие осложнение провести врач пациент группа среднее высокий риск взять мазка нос горло тестирование грипп метод пцр распределение показатель орви пациент получать осельтамивир сравнение нелеченый клинический характеристика пациент пандемический грипп a h1n1 2009 год сравнение пациент отрицательный результат тест сравниваться помощь критерий χ 2 пирсон точный критерий фишер критерий сумма ранг вилкоксон результат 1840 пациент отделение неотложный помощь 230 первоначально госпитализировать средний балл шкала орви 15 остальной выписать включая 286 амбулаторный пациент получать осельтамивир средний балл шкала орви 11 1324 проходить лечение средний балл шкала орви 5 четырнадцать 1 пациент проходить лечение вернуться трое госпитализировать лечение осельтамивир медианный оценка орви 19 371 пациент прошедшее тестирование метод пцр 104 28 выявить пандемический грипп 42 11 сезонный грипп двадцать 91 22 госпитализировать пациент пандемический грипп сделать визуализация выявить двусторонний инфильтрат сравнение 23 38 61 госпитализировать пациент отрицательный результат тест p 0 001 пациент подтвердить пандемический грипп поступить 6 день появление симптом нуждаться искусственный вентиляция лёгкий умереть вывод система сортировка использовать показатель орви дополнить суждение врач необходимый осельтамивир стационарный лечение помочь персонал больница справиться резкий рост спрос услуга | система сортировка пациент больница взрослый использование система оценка гриппоподобный заболевание время пандемия 2009 год мексика |
34sy55hi | Острая энцефалопатия, связанная с инфекцией гриппа А у взрослых | Мы сообщаем об острой энцефалопатии, связанной с инфекцией гриппа А, у 3 взрослых. Мы обнаружили высокие концентрации CXCL8/IL-8 и CCL2/MCP-1 в спинномозговой жидкости (СМЖ) и плазме (соотношение СМЖ/плазма >3), а также интерлейкина-6, CXCL10/IP-10, но никаких признаков вирусной нейроинвазии не обнаружено. Пациенты выздоровели без последствий. Гиперактивированный ответ цитокинов может играть роль в патогенезе. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2874350/",
"pubmed_id": "20031062"
} | сообщать острый энцефалопатия связанный инфекция грипп 3 взрослый обнаружить высокий концентрация cxcl8 il 8 ccl2 mcp 1 спинномозговой жидкость смж плазма соотношение смж плазма 3 также интерлейкина 6 cxcl10 ip 10 никакой признак вирусный нейроинвазия обнаружить пациент выздороветь последствие гиперактивированный ответ цитокин мочь играть роль патогенез | острый энцефалопатия связать инфекция грипп взрослый |
1rhy8td0 | Масштабное эволюционное наблюдение за вирусом гриппа А (H1N1) 2009 года с использованием массивов повторного секвенирования | В апреле 2009 года появился новый вирус гриппа A (H1N1 2009), который быстро распространился по всему миру. Хотя существующие варианты этого вируса стали причиной широкомасштабного заболевания, особенно среди уязвимых групп, сохраняется вероятность того, что будущие варианты могут привести к повышению вирулентности, лекарственной устойчивости или «ускользанию» от вакцины. Раннее обнаружение этих вариантов вируса может дать шанс на более эффективное сдерживание и потенциальное предотвращение распространения вируса. Мы разработали и провели полевые испытания набора для повторного секвенирования, который способен исследовать все восемь сегментов генома вируса гриппа A(H1N1) 2009 года и его вариантов, уделяя особое внимание критическим областям, таким как сайты связывания лекарственных препаратов, структурные компоненты и очаги мутаций. Сопутствующее программное обеспечение для распознавания оснований (EvolSTAR) представляет новые методы, которые используют профили интенсивности гибридизации соседей и смещение замещения зондов на микрочипе для подтверждения мутаций и восстановления неоднозначных запросов оснований. Наши результаты показывают, что EvolSTAR отличается высокой точностью и значительно повышает частоту вызовов. Высокая производительность и короткое время от взятия образца до секвенирования и результатов анализа (30 часов для 24 образцов) делают этот набор эффективным инструментом для крупномасштабного эволюционного биологического надзора. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2874996/",
"pubmed_id": "20185568"
} | апрель 2009 год появиться новый вирус грипп a h1n1 2009 быстро распространиться весь мир хотя существующий вариант это вирус стать причина широкомасштабный заболевание особенно среди уязвимый группа сохраняться вероятность будущий вариант мочь привести повышение вирулентность лекарственный устойчивость ускользание вакцина ранний обнаружение вариант вирус мочь дать шанс эффективный сдерживание потенциальный предотвращение распространение вирус разработать провести полевой испытание набор повторный секвенирование способный исследовать всё восемь сегмент геном вирус грипп a h1n1 2009 год вариант уделять особый внимание критический область сайт связывание лекарственный препарат структурный компонент очаг мутация сопутствовать программный обеспечение распознавание основание evolstar представлять новый метод использовать профиль интенсивность гибридизация сосед смещение замещение зонд микрочип подтверждение мутация восстановление неоднозначный запрос основание наш результат показывать evolstar отличаться высокий точность значительно повышать частота вызов высокий производительность короткий время взятие образец секвенирование результат анализ 30 час 24 образец делать набор эффективный инструмент крупномасштабный эволюционный биологический надзор | масштабный эволюционный наблюдение вирус грипп h1n1 2009 год использование массив повторный секвенирование |
yvgzkt8a | Журналы, академические статьи и пандемии | После эпидемии атипичной пневмонии и пандемии гриппа H1N1 редакторы PLoS Medicine задаются вопросом, является ли публикация журналов достаточно эффективным механизмом обмена информацией. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2876121/",
"pubmed_id": "20520802"
} | эпидемия атипичный пневмония пандемия грипп h1n1 редактор plos medicine задаваться вопрос являться публикация журнал достаточно эффективный механизм обмен информация | журнал академический статья пандемия |
wcyv6w47 | Возрастные группы и распространение гриппа: значение для стратегии вакцинации | ПРЕДЫСТОРИЯ: Непредсказуемый характер потенциально разрушительного воздействия пандемии гриппа pH1N1 2009 года подчеркивает необходимость планирования готовности к пандемии, где модельные исследования могут оказаться наиболее полезными для моделирования возможных будущих сценариев. МЕТОДЫ: Предлагается компартментальная модель с предсимптомными и бессимптомными инфекциями гриппа, которая включает возрастные группы, а также меры вмешательства, такие как вакцинация в зависимости от возраста, с целью изучения распространения гриппа в сообществе. РЕЗУЛЬТАТЫ: Мы выводим базовое репродуктивное число и другие эффективные репродуктивные числа при различных мерах вмешательства. Для иллюстрации мы используем данные о смертности от пневмонии и гриппа (P&I), а также данные о вакцинации очень молодых (в возрасте 0–2 лет) и очень пожилых (возраст >64 лет) людей в течение зимнего сезона гриппа на Тайване 2004–2005 годов, чтобы подогнать нашу модель и вычислить соответствующие показатели воспроизводства. По оценкам, репродуктивное число для этого зимнего сезона гриппа немного превышает единицу (~1,0001). ВЫВОДЫ: Сравнительно большие ошибки в подгонке данных о смертности от простудных заболеваний среди пожилых людей (>64) были отмечены вскоре после зимнего закрытия школ в январе, что может указывать на влияние более молодых и активных возрастных групп на передачу гриппа другим возрастным группам за пределами школьных учреждений; в частности, пожилым людям в домохозяйствах. Предсимптомные инфекции, по-видимому, не оказали существенного влияния на соответствие модели, в то время как бессимптомное инфицирование бессимптомными возбудителями оказало более выраженное влияние на соответствие модели смертности среди пожилых людей, что, возможно, указывает на большую роль бессимптомной инфекции в передаче заболевания. Моделирование показывает, что влияние вакцинации на заболеваемость может не полностью проявиться в изменении (или отсутствии такового) эффективного числа воспроизводства при вмешательствах, но все равно может быть существенным. Расчетная вероятность передачи инфекции при контакте среди восприимчивых пожилых людей значительно выше, чем среди любой другой возрастной группы, что, возможно, подчеркивает уязвимость пожилых людей из-за тесных контактов с ухаживающими за ними лицами из других возрастных групп. Относительное воздействие вакцинации на самых маленьких и самых старых людей было ослаблено их относительной неактивностью, что свидетельствует об отсутствии воздействия вакцинации этих двух групп на общую заразность заболевания в обществе. Это еще раз подчеркивает необходимость разработки стратегии, основанной на показателях заболеваемости, для предотвращения смертности среди пожилых людей. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2876165/",
"pubmed_id": "20429954"
} | предыстория непредсказуемый характер потенциально разрушительный воздействие пандемия грипп ph1n1 2009 год подчёркивать необходимость планирование готовность пандемия модельный исследование мочь оказаться наиболее полезный моделирование возможный будущий сценарий метод предлагаться компартментальный модель предсимптомный бессимптомный инфекция грипп включать возрастной группа также мера вмешательство вакцинация зависимость возраст цель изучение распространение грипп сообщество результат выводить базовый репродуктивный число эффективный репродуктивный число различный мера вмешательство иллюстрация использовать дать смертность пневмония грипп p i также дать вакцинация очень молодой возраст 0 2 год очень пожилой возраст 64 год человек течение зимний сезон грипп тайвань 2004 2005 год подогнать наш модель вычислить соответствующий показатель воспроизводство оценка репродуктивный число это зимний сезон грипп немного превышать единица 1 0001 вывод сравнительно больший ошибка подгонка данные смертность простудный заболевание среди пожилой человек 64 отметить вскоре зимний закрытие школа январь мочь указывать влияние молодой активный возрастной группа передача грипп возрастной группа предел школьный учреждение частность пожилой человек домохозяйство предсимптомный инфекция видимый оказать существенный влияние соответствие модель время бессимптомный инфицирование бессимптомный возбудитель оказать выраженный влияние соответствие модель смертность среди пожилой человек возможно указывать больший роль бессимптомный инфекция передача заболевание моделирование показывать влияние вакцинация заболеваемость мочь полностью проявиться изменение отсутствие таковой эффективный число воспроизводство вмешательство всё равно мочь существенный расчётный вероятность передача инфекция контакт среди восприимчивый пожилой человек значительно выше среди любой возрастной группа возможно подчёркивать уязвимость пожилой человек тесный контакт ухаживать лицо возрастной группа относительный воздействие вакцинация самый маленький самый старый человек ослабить относительный неактивность свидетельствовать отсутствие воздействие вакцинация группа общий заразность заболевание общество это ещё подчёркивать необходимость разработка стратегия основать показатель заболеваемость предотвращение смертность среди пожилой человек | возрастной группа распространение грипп значение стратегия вакцинация |
8d4f4gmw | Влияние внутреннего пограничного контроля на распространение пандемического гриппа | Мы изучили способность внутреннего пограничного контроля ограничивать распространение гриппа в условиях надвигающейся пандемии в Австралии — стране с низкой плотностью населения и геополитическими границами, которые могут способствовать введению ограничений. Математические модели использовались для изучения временной задержки между эпидемиями в двух населенных пунктах, когда были введены ограничения на поездки. Модели продемонстрировали, что численность населения, скорость передвижения и места проживания путешественников могут существенно влиять на задержки. Моделирование модели показало, что умеренные задержки в географическом распространении возможны при строгих ограничениях и низком числе воспроизводства, но результаты будут чувствительны к числу воспроизводства и срокам ограничений. Ограничения модели включают отсутствие дальнейшего импорта и дополнительных мер контроля. Внутренний пограничный контроль может сыграть определенную роль в защите внутренних центров на ранних этапах пандемии, когда импорт невелик. Наши результаты могут быть полезны для политиков. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2878213/",
"pubmed_id": "18214176"
} | изучить способность внутренний пограничный контроль ограничивать распространение грипп условие надвигаться пандемия австралия страна низкий плотность население геополитический граница мочь способствовать введение ограничение математический модель использоваться изучение временной задержка эпидемия населить пункт ввести ограничение поездка модель продемонстрировать численность население скорость передвижение место проживание путешественник мочь существенно влиять задержка моделирование модель показать умеренный задержка географический распространение возможный строгий ограничение низкий число воспроизводство результат чувствительный число воспроизводство срок ограничение ограничение модель включать отсутствие дальнейший импорт дополнительный мера контроль внутренний пограничный контроль мочь сыграть определённый роль защита внутренний центр ранний этап пандемия импорт небольшой наш результат мочь полезный политик | влияние внутренний пограничный контроль распространение пандемический грипп |
wg6nh1vt | Экстракорпоральная поддержка жизнедеятельности при лечении рефрактерной сердечной или дыхательной недостаточности: первый опыт в центре третьего уровня оказания помощи | ВВЕДЕНИЕ: Экстракорпоральная поддержка жизнедеятельности (ECLS) и экстракорпоральная мембранная оксигенация (ЭКМО) показаны в качестве лечения острой дыхательной и/или сердечной недостаточности. Здесь мы описываем наш первый год работы по организации ECLS в условиях стационара, алгоритм работы и протокол централизации взрослых пациентов из районных больниц. МЕТОДЫ: В специализированном травматологическом центре (учебная больница Кареджи, Флоренция, Италия) с 2008 года отделением неотложной помощи и отделением интенсивной терапии сердца и сосудов была разработана программа ECLS. Команда ECLS состоит из врача-реаниматолога, кардиохирурга, кардиолога и перфузиолога, прошедших обучение по методике ECLS. Поддержка ЭКМО применялась в случае тяжелого острого респираторного дистресс-синдрома (ОРДС), не поддающегося лечению традиционными методами. Использование вено-артериальной (ВА) ECLS для поддержки сердца было зарезервировано для случаев сердечного шока, рефрактерного к стандартному лечению, и остановки сердца, не поддающейся традиционной реанимации. РЕЗУЛЬТАТЫ: Всего в течение первого года деятельности методом ECLS было пролечено 21 пациент. Среди них 13 человек получили ЭКМО в связи с ОРДС (5 из них были связаны с вирусом H1N1), при этом выживаемость составила 62%. В одном случае посттравматического ОРДС поддержка V-A ECLS позволила провести множественное донорство органов после подтверждения смерти мозга. У пациентов, получавших лечение методом V-A ECLS по поводу кардиогенного шока (N = 4), показатель выживаемости составил 50%. Ни один пациент, получавший V-A ECLS-поддержку после остановки сердца, не выжил (N = 4). ВЫВОДЫ: В нашем центре служба ECLS была создана в течение относительно короткого периода времени. Тесное взаимодействие между различными специалистами можно считать ключевым фактором эффективной реализации процесса. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2879235/",
"pubmed_id": "20487571"
} | введение экстракорпоральный поддержка жизнедеятельность ecls экстракорпоральный мембранный оксигенация экмо показать качество лечение острый дыхательный сердечный недостаточность описывать наш первый год работа организация ecls условие стационар алгоритм работа протокол централизация взрослый пациент районный больница метод специализировать травматологический центр учебный больница кареджи флоренция италия 2008 год отделение неотложный помощь отделение интенсивный терапия сердце сосуд разработать программа ecls команда ecls состоять врач реаниматолог кардиохирург кардиолог перфузиолог прошедшее обучение методика ecls поддержка экмо применяться случай тяжёлый острый респираторный дистресс синдром ордс поддаваться лечение традиционный метод использование вено артериальный ва ecls поддержка сердце зарезервировать случай сердечный шок рефрактерный стандартный лечение остановка сердце поддаваться традиционный реанимация результат весь течение первый год деятельность метод ecls пролечить 21 пациент среди 13 человек получить экмо связь ордс 5 связать вирус h1n1 это выживаемость составить 62 случай посттравматический ордс поддержка v a ecls позволить провести множественный донорство орган подтверждение смерть мозг пациент получать лечение метод v a ecls повод кардиогенный шок n 4 показатель выживаемость составить 50 пациент получать v a ecls поддержка остановка сердце выжить n 4 вывод наш центр служба ecls создать течение относительно короткий период время тесный взаимодействие различный специалист считать ключевой фактор эффективный реализация процесс | экстракорпоральный поддержка жизнедеятельность лечение рефрактерный сердечный дыхательный недостаточность первый опыт центр третий уровень оказание помощь |
sfshosp0 | Насколько необходим быстрый набор тестов для смягчения последствий пандемического гриппа? | Широко распространены опасения, что может появиться новый, высокопатогенный, передающийся человеку вирус гриппа, который может вызвать следующую глобальную пандемию. Для сдерживания распространения такой пандемии гриппа потребуется не только своевременное введение противовирусных препаратов инфицированным, но и реализация соответствующих мер вмешательства для сдерживания распространения вируса. В этом отношении математическое моделирование и имитационные исследования имеют решающее значение, поскольку они позволяют нам оценить прогнозируемую эффективность различных мер вмешательства до их реализации. Диагностика играет жизненно важную роль в общей системе управления пандемией, выявляя и отличая патогенный штамм от менее опасных сезонных штаммов и других гриппоподобных заболеваний. Это позволяет эффективно проводить лечение и вмешательство, учитывая ограниченные запасы противовирусных препаратов и других ресурсов. Однако время, необходимое для разработки быстрого и точного набора для тестирования новых штаммов, может ограничить роль диагностики. В данной работе мы намерены изучить стоимость и эффективность различных методов диагностики с использованием стохастической агентной модели городского масштаба, а затем рассмотреть вопрос о том, могут ли традиционные подходы к тестированию при использовании с соответствующими мерами вмешательства быть столь же эффективными, как наборы для быстрого тестирования в сдерживании вспышки пандемии. Мы обнаружили, что для смягчения последствий быстрые и точные тест-наборы не являются необходимыми, если назначается достаточное количество лекарств, и, как правило, рекомендуются только при условии тщательного отслеживания контактов и профилактики. Кроме того, в случае недостаточного количества лекарств и быстрых тест-наборов, использование более медленных обычных тест-наборов в сочетании с надлежащими мерами изоляции во время ожидания результатов диагностики может стать столь же эффективной заменой. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2880075/",
"pubmed_id": "20022897"
} | широко распространить опасение мочь появиться новый высокопатогенный передаваться человек вирус грипп мочь вызвать следующий глобальный пандемия сдерживание распространение пандемия грипп потребоваться своевременный введение противовирусный препарат инфицировать реализация соответствующий мера вмешательство сдерживание распространение вирус это отношение математический моделирование имитационный исследование иметь решающий значение поскольку позволять оценить прогнозировать эффективность различный мера вмешательство реализация диагностика играть жизненно важный роль общий система управление пандемия выявлять отличать патогенный штамм менее опасный сезонный штамм гриппоподобный заболевание это позволять эффективно проводить лечение вмешательство учитывать ограниченный запас противовирусный препарат ресурс однако время необходимый разработка быстрый точный набор тестирование новый штамм мочь ограничить роль диагностика дать работа намерить изучить стоимость эффективность различный метод диагностика использование стохастический агентной модель городской масштаб затем рассмотреть вопрос мочь традиционный подход тестирование использование соответствующий мера вмешательство столь эффективный набор быстрый тестирование сдерживание вспышка пандемия обнаружить смягчение последствие быстрый точный тест набор являться необходимый назначаться достаточный количество лекарство правило рекомендоваться условие тщательный отслеживание контакт профилактика кроме случай недостаточный количество лекарство быстрый тест набор использование медленный обычный тест набор сочетание надлежащий мера изоляция время ожидание результат диагностика мочь стать столь эффективный замена | насколько необходимый быстрый набор тест смягчение последствие пандемический грипп |
waf4n6u8 | Структурные белки ротавируса и дцРНК необходимы для ответа IFNα первичных плазмацитоидных дендритных клеток человека | Ротавирусы являются основной причиной тяжелой диареи, вызывающей обезвоживание, у детей во всем мире. Иммунные реакции, вызванные ротавирусом, особенно реакции Т- и В-клеток, были подробно описаны; однако мало что известно о врожденных иммунных механизмах, участвующих в контроле ротавирусной инфекции. Хотя повышенные уровни системного интерферона I типа (IFNα и β) коррелируют с ускоренным разрешением ротавирусной инфекции, было показано, что многочисленные штаммы ротавируса, включая ротавирус-резус (RRV), подавляют выработку IFN I типа в различных типах эпителиальных и фибробластных клеток посредством нескольких механизмов, включая деградацию многочисленных факторов регуляции интерферона вирусным неструктурным белком. В этом отчете показано, что стимуляция высокоочищенных первичных периферических плазмоцитоидных дендритных клеток человека (pDC) живым или инактивированным RRV вызывает значительную продукцию IFNα подгруппой pDC, в которой RRV не реплицируется. Характеристика реакций pDC на вирусную стимуляцию с помощью проточной цитометрии и Luminex показала, что RRV реплицируется в небольшой подгруппе первичных pDC человека, и в этой небольшой подгруппе, допускающей RRV, продукция IFNα снижается. Активация и созревание pDC наблюдались независимо от репликации вируса и усиливались в клетках, в которых реплицируется вирус. Продукция IFNα pDC после воздействия RRV требовала вирусной дцРНК и поверхностных белков, но не вирусной репликации или активации путем расщепления трипсином VP4. Полученные результаты демонстрируют, что небольшая часть очищенных первичных периферических pDC человека восприимчива к инфекции RRV и что pDC сохраняют функциональность после стимуляции RRV. Кроме того, данное исследование демонстрирует трипсин-независимое инфицирование первичных периферических клеток ротавирусом, что может привести к возникновению внекишечной виремии и антигенемии. Важно отметить, что эти данные являются первым доказательством индукции IFNα в первичных человеческих pDC вирусом dsRNA, одновременно демонстрируя нарушение продукции IFNα в первичных человеческих клетках, в которых реплицируется RRV. Ротавирусная инфекция первичных человеческих pDCs обеспечивает мощную экспериментальную систему для изучения механизмов, лежащих в основе врожденного иммунитета, опосредованного pDC, к вирусной инфекции, и раскрывает потенциально новый путь индукции IFNα, зависящий от dsRNA. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2880586/",
"pubmed_id": "20532161"
} | ротавирус являться основной причина тяжёлый диарея вызывающий обезвоживание ребёнок весь мир иммунный реакция вызвать ротавирус особенно реакция клетка подробно описать однако мало известно врождённый иммунный механизм участвовать контроль ротавирусный инфекция хотя повышенный уровень системный интерферон i тип ifnα β коррелировать ускоренный разрешение ротавирусный инфекция показать многочисленный штамм ротавирус включая ротавирус резус rrv подавлять выработка ifn i тип различный тип эпителиальный фибробластной клетка посредством несколько механизм включая деградация многочисленный фактор регуляция интерферон вирусный неструктурный белок это отчёт показать стимуляция высокоочищенный первичный периферический плазмоцитоидный дендритный клетка человек pdc живой инактивированный rrv вызывать значительный продукция ifnα подгруппа pdc rrv реплицироваться характеристика реакция pdc вирусный стимуляция помощь проточный цитометрия luminex показать rrv реплицироваться небольшой подгруппа первичный pdc человек небольшой подгруппа допускать rrv продукция ifnα снижаться активация созревание pdc наблюдаться независимо репликация вирус усиливаться клетка реплицироваться вирус продукция ifnα pdc воздействие rrv требовать вирусный дцрнк поверхностный белок вирусный репликация активация путём расщепление трипсин vp4 получить результат демонстрировать небольшой часть очистить первичный периферический pdc человек восприимчивый инфекция rrv pdc сохранять функциональность стимуляция rrv кроме данный исследование демонстрировать трипсин независимый инфицирование первичный периферический клетка ротавирус мочь привести возникновение внекишечный виремия антигенемия важно отметить дать являться первый доказательство индукция ifnα первичный человеческий pdc вирус dsrna одновременно демонстрировать нарушение продукция ifnα первичный человеческий клетка реплицироваться rrv ротавирусный инфекция первичный человеческий pdcs обеспечивать мощный экспериментальный система изучение механизм лежать основа врождённый иммунитет опосредовать pdc вирусный инфекция раскрывать потенциально новый путь индукция ifnα зависеть dsrna | структурный белка ротавирус дцрнк необходимый ответ ifnα первичный плазмацитоидный дендритный клетка человек |
chd9ezba | Роль CD14 в воспалении и инфекции легких | Эта статья является одним из десяти обзоров, выбранных из Ежегодника интенсивной терапии и неотложной медицины 2010 года (издательство Springer Verlag) и опубликованных в виде серии в журнале Critical Care. Другие статьи этой серии можно найти на сайте http://ccforum.com/series/yearbook. Дополнительную информацию о Ежегоднике интенсивной терапии и неотложной медицины можно получить по адресу http://www.springer.com/series/2855. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2887102/",
"pubmed_id": "20236452"
} | статья являться десять обзор выбрать ежегодник интенсивный терапия неотложный медицина 2010 год издательство springer verlag опубликовать вид серия журнал critical care статья серия найти сайт http ccforum com series yearbook дополнительный информация ежегодник интенсивный терапия неотложный медицина получить адрес http www springer com series 2855 | роль cd14 воспаление инфекция лёгкий |
unotv53r | Неинвазивная вентиляция легких для пациентов в критическом состоянии с инфекцией вируса гриппа А пандемического H1N1 2009 | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2887117/",
"pubmed_id": "20346097"
} | неинвазивный вентиляция лёгкий пациент критический состояние инфекция вирус грипп пандемический h1n1 2009 |
||
o2kzb94o | Иммунный ответ на Lactobacillus plantarum, экспрессирующий Borrelia burgdorferi OspA, модулируется липидной модификацией антигена | ПРЕДЫСТОРИЯ: За последнее десятилетие возрос интерес к использованию молочнокислых бактерий в качестве средств доставки через слизистую оболочку вакцинных антигенов, микробицидов и терапевтических средств. Мы исследовали механизм, посредством которого мукозальная вакцина на основе рекомбинантных молочнокислых бактерий нарушает иммунологическую толерантность кишечника, чтобы вызвать защитный иммунный ответ. МЕТОДОЛОГИЯ/ОСНОВНЫЕ ВЫВОДЫ: Мы проанализировали, как липидная модификация OspA влияет на локализацию антигена в нашем средстве доставки, используя ряд биохимических методов. Кроме того, мы изучили, как экспрессирующие OspA штаммы L. Plantarum нарушает оральную толерантность кишечника, стимулируя эпителиальные клетки кишечника человека, мононуклеарные клетки периферической крови и дендритные клетки, полученные из моноцитов, а также измеряя выработку цитокинов. Мы показываем, что лидерный пептид OspA направляет белок к клеточной оболочке L. plantarum, который отвечает за экспорт белка через мембрану. Мутация участка липидизации в OspA изменяет локализацию белка внутри клеточной оболочки. Кроме того, мы показываем, что L., экспрессирующие липидированный OspA. Плантарум не вызывает секрецию провоспалительного цитокина ИЛ-8 эпителиальными клетками кишечника. Кроме того, он нарушает оральную толерантность кишечника через иммунитет, опосредованный клетками Th1/Th2, о чем свидетельствует продукция про- и противовоспалительных цитокинов дендритными клетками человека, а также продукция антител IgG2a и IgG1 соответственно. ВЫВОДЫ/ЗНАЧЕНИЕ: Липидная модификация OspA, экспрессируемая в L. плантарум модулирует иммунный ответ на этот антиген посредством иммунного ответа Th1/Th2. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2887847/",
"pubmed_id": "20585451"
} | предыстория последний десятилетие возрасти интерес использование молочнокислый бактерия качество средство доставка слизистая оболочка вакцинный антиген микробицид терапевтический средство исследовать механизм посредством мукозальный вакцина основа рекомбинантный молочнокислый бактерия нарушать иммунологический толерантность кишечник вызвать защитный иммунный ответ методология основной вывод проанализировать липидный модификация ospa влиять локализация антиген наш средство доставка использовать ряд биохимический метод кроме изучить экспрессировать ospa штамм l plantarum нарушать оральный толерантность кишечник стимулировать эпителиальный клетка кишечник человек мононуклеарный клетка периферический кровь дендритный клетка получить моноцит также измерять выработка цитокин показывать лидерный пептид ospa направлять белок клеточный оболочка l plantarum отвечать экспорт белок мембрана мутация участок липидизация ospa изменять локализация белок внутри клеточный оболочка кроме показывать l экспрессировать липидировать ospa плантарум вызывать секреция провоспалительный цитокина ил 8 эпителиальный клетка кишечник кроме нарушать оральный толерантность кишечник иммунитет опосредовать клетка th1 th2 свидетельствовать продукция противовоспалительный цитокин дендритный клетка человек также продукция антитело igg2a igg1 соответственно вывод значение липидный модификация ospa экспрессировать l плантарум модулировать иммунный ответ антиген посредством иммунный ответ th1 th2 | иммунный ответ lactobacillus plantarum экспрессировать borrelia burgdorferi ospa модулироваться липидный модификация антиген |
01wsevuu | Нейтрализация X4- и R5-тропных вариантов ВИЧ-1 NL4-3 сывороточными альбуминами, модифицированными HOCl | ПРЕДЫСТОРИЯ: Миелопероксидаза (МПО), важный элемент микробицидной активности нейтрофилов, генерирует хлорноватистую кислоту (HOCl) из H(2)O(2) и хлорида, которая выделяется в жидкости организма. Помимо своей прямой микробицидной активности, HOCl может реагировать с остатками аминокислот, а модифицированные HOCl белки можно обнаружить in vivo. РЕЗУЛЬТАТЫ: Этот отчет основан на исследованиях связывания модифицированных HOCl сывороточных альбуминов с gp120 ВИЧ-1 и трех различных анализах нейтрализации с использованием инфекционного вируса. Исследования связывания проводились с помощью спектроскопии поверхностного плазмонного резонанса и стандартных методов ИФА. Анализы нейтрализации вируса проводились с использованием вируса ВИЧ-1 NL4-3 и рекомбинантных штаммов с использованием корецепторов CXCR4 и CCR5. Вирусную инфекцию контролировали с помощью стандартного анализа окрашивания p24 или X-gal. Наши данные показывают, что модифицированные HOCl мышиные, бычьи и человеческие сывороточные альбумины связываются с гликопротеином ВИЧ-1 NL4-3 gp120 (LAV) в отличие от немодифицированного альбумина. Связывание альбумина, модифицированного HOCl, с gp120 коррелировало с блокадой CD4, а также со связыванием моноклональных антител, специфичных к петле V3. В экспериментах по нейтрализации модифицированные HOCl сывороточные альбумины ингибировали репликацию и образование синцития X4- и R5-тропных изолятов NL4-3 в зависимости от дозы. ВЫВОДЫ: Наши данные указывают на то, что модифицированный HOCl сывороточный альбумин скрывает место связывания CD4 и петлю V3 на gp120. Такая маскировка комплекса вирусной оболочки gp120/gp41 может быть простой, но многообещающей стратегией для инактивации ВИЧ-1 и, следовательно, предотвращения инфекции при применении модифицированного HOCl сывороточного альбумина, например, в качестве местного микробицида. | {
"url": "https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2887905/",
"pubmed_id": "20525179"
} | предыстория миелопероксидаза мпо важный элемент микробицидной активность нейтрофил генерировать хлорноватистый кислота hocl h 2 o 2 хлорид выделяться жидкость организм помимо свой прямой микробицидной активность hocl мочь реагировать остаток аминокислота модифицированный hocl белка обнаружить in vivo результат отчёт основать исследование связывание модифицированный hocl сывороточный альбумин gp120 вич 1 различный анализ нейтрализация использование инфекционный вирус исследование связывание проводиться помощь спектроскопия поверхностный плазмонный резонанс стандартный метод ифа анализ нейтрализация вирус проводиться использование вирус вич 1 nl4 3 рекомбинантный штамм использование корецептор cxcr4 ccr5 вирусный инфекция контролировать помощь стандартный анализ окрашивание p24 x gal наш дать показывать модифицированный hocl мышиный бычий человеческий сывороточный альбумин связываться гликопротеин вич 1 nl4 3 gp120 lav отличие немодифицированный альбумин связывание альбумин модифицированный hocl gp120 коррелировать блокада cd4 также связывание моноклональный антитело специфичный петля v3 эксперимент нейтрализация модифицированный hocl сывороточный альбумин ингибировать репликация образование синцитий x4 r5 тропный изолят nl4 3 зависимость доза вывод наш дать указывать модифицированный hocl сывороточный альбумин скрывать место связывание cd4 петля v3 gp120 маскировка комплекс вирусный оболочка gp120 gp41 мочь простой многообещающий стратегия инактивация вич 1 следовательно предотвращение инфекция применение модифицированный hocl сывороточный альбумин например качество местный микробицида | нейтрализация x4 r5 тропный вариант вич 1 nl4 3 сывороточный альбумин модифицированный hocl |